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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui, nós apresentamos um protocolo que use tinturas near-infrared conjuntamente com a exploração immunohistochemistry e de alta resolução às proteínas do ensaio em regiões do cérebro.
A neurociência é o estudo de como as células do cérebro mediam várias funções. A expressão da proteína de medição nos neurônios e na glia é fundamental para o estudo da neurociência, pois a função celular é determinada pela composição e atividade das proteínas celulares. Neste artigo, nós descrevemos como Immunocytochemistry pode ser combinado com a exploração de alta resolução infravermelho próximo para fornecer uma medida semiquantitativa da expressão da proteína em regiões distintas do cérebro. Esta técnica pode ser usada para a única ou expressão dobro da proteína na mesma região do cérebro. A medição de proteínas desta forma pode ser usada para obter uma mudança relativa na expressão protéica com uma manipulação experimental, assinatura molecular de aprendizado e memória, atividade em vias moleculares e atividade neural em várias regiões cerebrais. Usando as proteínas corretas e a análise estatística, a conectividade funcional entre as regiões cerebrais também pode ser determinada. Dada a facilidade de implementação de imunocitoquímica em um laboratório, usando Immunocytochemistry com varredura de alta resolução infravermelho próximo pode expandir a capacidade do neurocientista para examinar os processos neurobiológicos em um nível de sistemas.
O estudo da neurociência diz respeito a uma investigação de como as células do cérebro mediam funções específicas1. Estes podem ser de natureza celular, como a forma como as células glia conferem imunidade no sistema nervoso central ou podem envolver experimentos que visam explicar como a atividade dos neurônios no hipocampo dorsal leva à navegação espacial. Em um sentido amplo, a função celular é determinada pelas proteínas que são expressas em uma célula e a atividade dessas proteínas2. Como resultado, medir a expressão e/ou atividade de proteínas nas células cerebrais são críticas para o estudo da neurociência.
Um número de técnicas estão disponíveis para medir a expressão da proteína no cérebro. Estes incluem métodos in vivo, como topografia de emissão de pósitrons para densidades de receptores3 e microdiálise para pequenos peptídeos4. Mais comumente, os métodos ex vivo são usados para examinar a função e a expressão protéica. Estes incluem técnicas de espectrometria de massas5, Western blot e ensaio imunoenzimático (ELISA)6, e Immunocytochemistry7. Immunocytochemistry é amplamente utilizado no campo da neurociência. Esta técnica envolve o uso de um anticorpo preliminar para detectar uma proteína (ou o antígeno) do interesse (por exemplo, c-fos) e um anticorpo secundário conjugado para detectar o complexo proteína-preliminar do anticorpo (Figura 1). Para permitir a deteção do complexo anticorpo-secundário da proteína-preliminar do Antibody, os anticorpos secundários têm agentes oxidantes tais como o peroxidase do rábano (HRP) conjugados a eles. Isso permite a formação de precipitados em células que podem ser detectadas por meio de microscopia de luz7. Os anticorpos secundários podem igualmente ter fluorescência dos produtos químicos conjugados a eles (isto é, Fluorophores). Quando estimulados estes produtos químicos emitem a luz, que pode ser usada para detectar complexos anticorpo-secundários proteína-primários do anticorpo7. Por fim, os anticorpos primários, por vezes, têm agentes redutores e produtos químicos de fluorescência anexados a eles, negando diretamente a necessidade de anticorpos secundários7 (Figura 1).
Curiosamente, muitos métodos Immunocytochemistry permitem a visualização de proteínas em células cerebrais, mas não a capacidade de quantificar a quantidade de proteína em uma determinada região da célula ou do cérebro. Usar a microscopia de luz para detectar precipitados das reações da redução permite o visualização dos neurônios e do glia, mas este método não pode ser usado para quantificar a expressão da proteína nas pilhas ou em uma região específica do cérebro. Na teoria, a microscopia de fluorescência pode ser usada para esta, porque a luz emitida do anticorpo secundário fluorescente é uma medida do complexo anticorpo-secundário proteína-preliminar do anticorpo. No entanto, a autofluorescência no tecido cerebral pode dificultar a utilização da microscopia de fluorescência para quantificar a expressão protéica no tecido cerebral8. Em conseqüência, a luz emitida das imagens fluorescentes do tecido de cérebro é usada raramente para quantificar a expressão da proteína no cérebro.
Muitas destas edições podem ser endereçadas usando Immunocytochemistry near-infrared conjuntamente com a exploração de alta resolução9,10. Neste artigo, nós descrevemos como o Immunocytochemistry acoplado com os fluoróforos nos espectros de emissão do próximo-infravermelho pode ser combinado com a exploração de alta resolução (por exemplo, 10 – 21 μm) para obter as imagens afiadas que permitem a semiquantificação da proteína em distinto regiões cerebrais.
O seguinte protocolo foi aprovado pelo Comitê institucional de cuidados e uso de animais (IACUC) da Universidade de Delaware. Os ratos masculinos de Sprague Dawley aproximadamente 55 – 75 dias velhos foram usados para este protocolo.
1. extração cerebral e preparação de tecidos
2. única reacção imuno-histoquímica
Nota: Para a reação immunohistochemical dobro, o protocolo é o mesmo que a única reação immunohistochemical exceto esta reação tem dois anticorpos preliminares de anfitriões diferentes (por exemplo, coelho e rato) e dois anticorpos secundários para o correspondente primárias devem ser de um único hospedeiro (por exemplo, anticoelho de cabra e antimouse de cabra). Os anticorpos secundários também têm de ser de dois espectros diferentes que estão disponíveis em scanners de alta resolução. Por exemplo, um anticorpo secundário com um pico de espectro de emissão a 680 nm e um anticorpo secundário 800CW (pico de espectro de emissão a 780 nm).
3. imagem latente
4. análise da expressão protéica
Antes de usar a varredura de alta resolução para immunohistochemistry, uma deve verificar que o protocolo trabalha. Isto pode ser conseguido usando um ensaio de validação onde seções cerebrais do mesmo animal são incubadas com anticorpos primários e secundários, anticorpo secundário sozinho, ou nenhum anticorpo primário ou secundário. Os resultados para tal ensaio de validação são mostrados na Figura 2. Nesta reação nós estávamos detectando o gene adiantado imediato c-Jun no hipocampo dorsal e no amygdala. A expressão de C-Jun só foi observada quando os anticorpos primários e secundários foram aplicados ao tecido cerebral.
A Figura 3 mostra a detecção de proteínas duplas em núcleos de amígdala. Neste experimento nós ensaiamos a subunidade GluR1 do receptor de ácido α-amino-3-hidroxi-5-metil-4-isoxazolepropiônico (AMPA) e a subunidade NR2A do receptor de N-metil-D-aspartato (NMDA) no mesmo tecido cerebral. Isso nos permitiu examinar a proporção de receptores AMPA/NMDA em subnúcleos da amígdala. Esta relação é uma assinatura Neurobiológica da aprendizagem e da memória11,12. Como pode ser visto na Figura 3, sinal para GluR2 (780 nm luz pseudo colorido em verde) e NR2A (680 nm luz pseudo colorido em vermelho) só pode ser observado no tecido cerebral que foi exposto a anticorpos primários e secundários.
A Figura 4 mostra como as medidas médias e normalizadas de expressão protéica podem ser obtidas a partir de varreduras de alta resolução no hipocampo ventral. Usando o software de análise de imagem, um retângulo é colocado na região de interesse (camada molecular de CA1) e a intensidade média da luz da forma pode ser usada como uma medida de expressão de fluoróforo (figura 4a). Por sua vez, esta é uma medida de expressão protéica (i.e., o complexo anticorpo-primário anticorpo-secundário de antígeno). A forma também pode ser colocada em uma região que expresse sinal alto e baixo sinal para obter uma curva normalizada (Figura 4B). Neste exemplo, um retângulo foi colocado através da camada molecular de CA1, mas cobriu os campos dendríticos também, que não expresse quantidades significativas de c-Jun neste ensaio. A área a curva pode então ser usada como uma medida da expressão da proteína. Se a configuração em um experimento envolver grupos de tratamento (por exemplo, exposição ao estresse) e um controle, podem ser obtidas alterações relativas na expressão protéica no cérebro.

Figura 1 : Ilustração da reação immunohistochemical usando anticorpos preliminares (1St) e secundários (2ND) ou apenas o anticorpo preliminar. Círculos pretos preenchidos representam um rótulo, que pode ser um agente oxidante, como a peroxidase de rábano ou um fluoróforo, como o boro-dipirrometeno (BODIPY). Os quadrados verdes representam o antígeno (na proteína do interesse) que está sendo detectado na reação immunohistochemical.

Figura 2 : Imagens de um ensaio de validação para a detecção de c-Jun. Neste ensaio, o tecido do mesmo animal foi tratado com um anticorpo preliminar do coelho que reconheça o anticorpo secundário do antirabbit de c-Jun e da cabra com o fluoróforo Unido com emissão em 780 nanômetro (pseudo colorido no painel verde, esquerdo). O tecido adjacente foi tratado com um ou outro anticorpo secundário sozinho (painel médio) ou nenhum anticorpo (painel direito). Barra de escala = 1 mm.

Figura 3 : Ensaio de validação para reação imuno-histoquímica de dupla rotulagem na amígdala. As seções do cérebro do Triplicate do mesmo rato foram expor ao anticorpo do coelho que reconhece o anticorpo do GluR1 e do rato que reconhece NR2A (painéis esquerdos), anticorpo secundário (painéis médios), ou nenhum anticorpo (painéis direito). GlurR1 foi visualizado com o anticorpo secundário do coelho 800cw da cabra (780 nanômetro, pseudo colorido no verde) e o NR2A foi visualizado usando um anticorpo secundário do da 680rd da cabra (680 nanômetro, pseudo colorido no vermelho). Barra de escala = 1 mm. OT = trato óptico; IC = cápsula interna; EC = cápsula externa. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4 : Obtenção de medidas Semiquantitativas de expressão protéica no tecido cerebral. (A e B) capturas de tela de imagens pontuadas no software de análise de imagem que é usado para analisar imagens do scanner. O tecido era do hipocampo ventral e tratado para visualizar c-Jun. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a revelar.
Aqui, nós apresentamos um protocolo que use tinturas near-infrared conjuntamente com a exploração immunohistochemistry e de alta resolução às proteínas do ensaio em regiões do cérebro.
A pesquisa neste relatório foi financiada por uma subvenção-alvo dos NIGMS (1P20GM103653) concedido à DK.
| de extração | cerebral | ||
| Kent Scientific | VetFlo-0530SM | ||
| Kleine Guillotine | Harvard Apparatus | 73-1920 | |
| Friedman Rongeur | Fine Science Tools | 16000-14 | usado para remover a parte de trás do crânio |
| Tesoura de dissecação delicada | Fischer Scientific | 08-951-5 | usado para cortar para cima ao longo da linha média do crânio |
| Micro Espátula | Fischer Scientific | 21-401-5 | usado para retirar o cérebro |
| Lâminas de Microscópio de Vidro | Fischer Scientific | 12-549-6 | |
| Reação | Imunohistoquímica | ||
| Triton X-100 | Usado como detergente suave para permeabilizar células após fixação em Paraformaldeído, também usado como detergente suave em combinação com soro do hospedeiro e anticorpo secundário | ||
| Tween-20 | Usado como uma pequena quantidade de detergente adicionado ao TBS para processar TBS-T após lâminas de lamínula com anticorpo primário | ||
| Scanner Licor Odyssey | Licor Biotechnology Inc. | ||
| Estúdio de Imagem | Licor Biotechnology Inc. |