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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
O objetivo geral deste procedimento é obter informações microestruturais quantitativas do hipocampo em um rato com lesão cerebral traumática leve. Isto é feito usando um protocolo avançado difusão-tornado mais pesado da imagem latente de ressonância magnética e a análise baseada região--interesse de mapas paramétricos da difusão.
A lesão cerebral traumática leve (mTBI) é o tipo mais comum de lesão cerebral adquirida. Como os pacientes com lesão cerebral traumática apresentam uma tremenda variabilidade e heterogeneidade (idade, sexo, tipo de trauma, outras patologias possíveis, etc.), os modelos animais desempenham um papel fundamental nos fatores que são limitações na pesquisa clínica. Fornecem um ajuste padronizado e controlado para investigar os mecanismos biológicos do ferimento e do reparo depois de TBI. No entanto, nem todos os modelos animais imitam a natureza difusa e sutil do mTBI efetivamente. Por exemplo, o impacto cortical controlado comumente usado (CCI) e os modelos de lesão de percussão de fluido lateral (LFPI) fazem uso de uma craniotomia para expor o cérebro e induzir trauma focal generalizado, que não são comumente vistos no mTBI. Portanto, esses modelos experimentais não são válidos para imitar o mTBI. Assim, um modelo apropriado deve ser usado para investigar o mTBI. O modelo de queda de peso de Marmarou para ratos induz alterações microestruturais e deficiências cognitivas semelhantes, como observado em pacientes que sustentam trauma leve; Portanto, esse modelo foi selecionado para este protocolo. As varreduras convencionais do tomography computado e da imagem latente de ressonância magnética (MRI) mostram geralmente nenhum dano que segue uma lesão suave, porque o mTBI induz frequentemente somente as lesões subtis e difusas. Com o MRI tornado mais pesado da difusão, é possível investigar Propriedades microestrutural do tecido de cérebro, que pode fornecer mais introspecção nas alterações microscópicas que seguem o traumatismo suave. Portanto, o objetivo deste estudo é obter informações quantitativas de uma região de interesse selecionada (ou seja, hipocampo) para acompanhar a progressão da doença após a obtenção de uma lesão cerebral leve e difusa.
A lesão cerebral traumática (TCE) tem ganhado mais atenção nos últimos anos, pois tornou-se evidente que essas lesões cerebrais podem resultar em consequências cognitivas, físicas, emocionais e sociais ao longo da vida1. Apesar desta consciência crescente, o TBI leve (mTBI, ou concussão) ainda é frequentemente subrelatado e não diagnosticado. O MTBI foi referido como uma epidemia silenciosa, e indivíduos com história de mTBI apresentam taxas mais elevadas de abuso de substâncias ou problemas psiquiátricos2. Diversos pacientes com mTBI vão undiagnosed cada ano devido à natureza difusa e subtil das lesões, que não são frequentemente visíveis em varreduras convencionais do tomography computado (CT) ou da imagem latente de ressonância magnética (MRI). Esta falta de evidência radiológica de ferimento de cérebro conduziu ao desenvolvimento de umas técnicas mais avançadas da imagem latente tais como a difusão MRI, que são mais sensíveis às mudanças microestrutural3.
A difusão MRI permite o mapeamento in vivo da microestrutura, e esta técnica de MRI tem sido usada extensivamente em estudos de TBI4,5,6. A partir do tensor de difusão, a anisotropia fracionária (FA) e a difusividade média (MD) são computadas para quantificar a alteração na organização microestrutural após lesão. Comentários recentes em pacientes com mTBI relatam aumentos na FA e diminuem em MD após lesão, o que pode ser indicativo de inchaço axonal7. Ao contrário, aumentos na MD e diminuições na FA também são encontrados e têm sido sugeridos para fundamentam rupturas na estrutura parenquimatosa após a formação de edema, degeneração axonal, ou desalinhamento de fibra/ruptura8. Esses achados mistos podem ser parcialmente explicados pela heterogeneidade clínica significativa do mTBI causada por diferentes tipos de impacto e severidade (por exemplo, rotação-aceleração, trauma de força bruta, lesão de jateamento ou combinação do primeiro). No entanto, atualmente não há um consenso claro sobre a patologia subjacente e base biológica/celular que sustentam alterações na organização microestrutural.
Os modelos animais fornecem um ajuste padronizado e controlado para investigar mecanismos biológicos de ferimento e reparar depois de TBI mais detalhadamente. Vários modelos experimentais para TBI foram desenvolvidos e representam diferentes aspectos da TBI humana (por exemplo, trauma focal vs. difuso ou trauma causado por forças rotacionais)9,10. Os modelos animais comumente usados incluem os modelos de impacto cortical controlado (CCI) e lesão de percussão de fluido lateral (lfpi)11,12. Embora os parâmetros experimentais possam ser bem controlados, estes modelos fazem uso de uma craniotomia para expor o cérebro. Craniotomias ou fraturas do crânio não são comumente observadas no mTBI; Portanto, esses modelos experimentais não são válidos para imitar o mTBI. O modelo de aceleração de impacto desenvolvido por Marmarou et al.13 faz uso de um peso que é retirado de uma certa altura para a cabeça do rato, que é protegida por um capacete. Este modelo animal induz alterações microestruturais e deficiências cognitivas semelhantes, como observado em pacientes que sustentam trauma leve. Portanto, este modelo de queda de peso de marmarou é apropriado para investigar biomarcadores de imagem para MTBI difuso14,15.
Este relatório demonstra a aplicação de MRI avançado da difusão em um modelo do rato do mTBI usando o modelo da gota do peso de Marmarou. Mostrado primeiramente é como induzir um traumatismo suave e difuso, e a análise usando o modelo da imagem latente do tensor da difusão (DTI) é fornecida então. A informação biológica específica é obtida com o uso de modelos de difusão mais avançados [isto é, imagem de curtose de difusão (DKI) e modelo de integridade do trato de matéria branca (WMTI)]. Especificamente, o traumatismo suave é infligido e as mudanças microestruturais são avaliadas então no hipocampo usando MRI convencional de T2-weighted e um protocolo avançado da imagem latente da difusão.
O protocolo foi aprovado pelo Comitê de ética animal da Universidade de Ghent (ECD 15/44Aanv), e todos os experimentos foram conduzidos de acordo com as diretrizes da Comissão Européia (diretiva 2010/63/UE).
1. preparação animal e acessório do capacete
2. indução de traumatismo cranioencefálico (TBI)
3. imagem latente de ressonância magnética da difusão (MRI)
Observação: a imagem ponderada por difusão é realizada antes e 1 dia após a indução do trauma.
4. processamento de imagem
Observação: nas seções a seguir, o processamento das imagens de difusão é descrito em MRtrix3, ExploreDTI19 e Amida software20 que são caixas de ferramentas de acesso aberto. No entanto, as etapas de pré-processamento podem ser executadas em outras caixas de ferramentas (por exemplo, FSL, MedInria, DTIStudio).
5. análise estatística
Nota: nas seções a seguir, descrevemos o processamento das imagens de difusão no SPSS Statistics 24; no entanto, a análise estatística pode ser realizada em outras caixas de ferramentas estatísticas.
No estudo, todos os ratos TBI (n = 10) sobreviveram ao impacto e conseguiram recuperar do impacto e da anestesia dentro de 15 min após o descolamento da anestesia23. Nas imagens tomográficas, não houve evidência de fraturas cranianas e as imagens T2 não mostraram anormalidades como sangramento, ventrículos aumentados ou formação de edema no local da contusão 1 dia após o trauma (Figura 5). Assim, com base nessas inspeções visuais das imagens anatômicas, grandes lesões focais não foram detectadas, confirmando a natureza difusa e leve da lesão.
A qualidade da etapa de coregistração (não rígida) entre a imagem T2 e o conjunto de dados de difusão (etapa 4,4) foi examinada adicionando uma sobreposição da imagem T2 ao mapa de FA codificado por cores (Figura 6). Em seguida, foram calculados os mapas paramétricos FA, MD, AD e RD (Figura 1) e carregados no software Amida. Com base no mapa de FA, foi desenhado um ROI, incluindo a estrutura hipocampal (Figura 4). Os valores estatísticos das métricas de difusão foram calculados em média em todos os voxels dentro da região de interesse e os valores médios de cada métrica DTI foram exportados para posterior análise. Uma outra verificação da qualidade dos dados da difusão pode ser executada inspecionando os outliers nas métricas DTI. Por exemplo, os valores de FA no hipocampo devem ser em torno de 0,15; Conseqüentemente, os valores de < 0.10 (que denotam a difusão isotrópico) ou > 0.30 (os valores são considerados na matéria branca) podem ser considerados como valores biologicamente implausíveis. Estes pontos dados devem ser rejeitados de uma análise mais aprofundada. Foram calculados também os valores médios de AK, RK e MK do modelo de curtose de difusão, assim como o AWF, AxEAD, RadEAD e TORT do modelo WMTI (Figura 2, Figura 3).
Em nosso estudo, a análise das métricas de DTI revelou aumento significativo dos valores de FA (p = 0, 7) e diminuição dos valores de difusividade (MD e RD) (p = 0, 7 e p = 0, 7, respectivamente) após o impacto no grupo mTBI (Figura 7). Essas reduções na RD e MD foram significativamente diferentes do grupo Sham (p = 0, 5 e p = 0, 4, respectivamente). As métricas de curtose de difusão mostraram uma diminuição significativa da RK (p = 0, 5) após o impacto, mas não houve alterações na AK ou MK (Figura 8). Usando o modelo de WMTI, RadEAD (p = 0, 7) e TORT (p = 0, 7) exibiu uma diminuição significativa e aumento, respectivamente, no grupo mTBI 1 dia após o impacto (Figura 9C, D). Os valores no grupo Sham não mostraram alterações significativas.

Figura 1: mapas paramétricos representativos para anisotropia fracionária (FA), difusividade média (MD), difusividade axial (AD) e difusividade radial (RD). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: mapas paramétricos representativos para curtose média (MK), curtose axial (AK) e curtose radial (RK). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: mapas paramétricos representativos para fração de água axonal (AWF), difusividade axial e radial extra axonal (AxEAD, RadEAD) e tortuosidade (TORT). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: criando uma máscara em MRtrix3. Um ROI é desenhado em torno do hipocampo em todas as fatias contendo o volume do hipocampo, e o volume é salvo como um arquivo de máscara. Isso pode ser feito para cada rato individualmente ou usando um arquivo de máscara de modelo específico de estudo para o qual cada um dos mapas paramétricos pode ser coregistrado. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: imagens ponderadas de TC e T2 de um animal representativo do mTBI 1 dia após o impacto. As imagens do CT (fileira superior) não mostram nenhumas fraturas do crânio. Nas imagens de T2-weighted (fileira inferior) nenhum sangramento, ventrículos aumentados, ou formação do edema foram demonstrados. Da nota, a formação do edema é claramente visível como uma área do hyperintense em torno da área da ferida da intervenção cirúrgica. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6: mapa de FA codificado por cores do conjunto de dados de difusão sobreposto com a imagem anatômica após correção para EPI, movimento e correção de correntes parasitas no ExploreDTI. Mostrado é uma má correção e coregistro à esquerda e bons exemplos à direita. Deve-se garantir que a codificação de cores esteja correta: direção esquerda-direita em vermelho (por exemplo, corpo caloso), direção ântero-posterior em verde e direção inferior-superior em azul (por exemplo, cingulum). Adicionalmente, a cor codificou a imagem do FA deve perfeitamente ser alinhada com a imagem anatômica. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 7: alterações nas métricas de tensor de difusão do hipocampo para os animais Sham (n = 10) e mTBI (n = 10). Após o impacto, houve aumento significativo da FA (a) e diminuição significativa da difusividade média (b) e da difusividade radial (d) nos animais do MTBI (b, d). Não foram observadas diferenças significativas para a difusividade axial (C) nos ratos MTBI. Os animais simulados não mostraram alterações significativas na DTI (* p < 0, 125). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 8: alterações na métrica de curtose de difusão do hipocampo para os animais Sham (n = 10) e mTBI (n = 10). Após o impacto, houve uma diminuição significativa da RK (C) dos animais do MTBI, mas não houve alterações na AK (B) ou MK (a). Os animais simulados não mostraram alterações (* p < 0, 166). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 9: alterações nas métricas de integridade do trato de matéria branca do hipocampo para os animais Sham (n = 10) e mTBI (n = 10). Após o impacto, houve uma diminuição significativa na RadEAD (C) e aumento significativo no Tort (D) dos animais MTBI, mas nenhuma alteração na AWF ou axead (a, B). Os animais simulados não mostraram alterações (* p < 0, 125). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm conflitos de interesse para divulgar.
O objetivo geral deste procedimento é obter informações microestruturais quantitativas do hipocampo em um rato com lesão cerebral traumática leve. Isto é feito usando um protocolo avançado difusão-tornado mais pesado da imagem latente de ressonância magnética e a análise baseada região--interesse de mapas paramétricos da difusão.
Os autores gostariam de agradecer à Fundação de pesquisa-Flandres (FWO) por apoiar este trabalho (número de subvenção: G027815N).
| 0,9% NaCl solução fisiológica | B Braun | 394496 | |
| latão peso 450g | personalizado personalizado | feito sobmedida | 18mm e 210mm de altura |
| cateter | Terumo | Versatus-W | 26G |
| ethilon II | Ethicon | EH7824 FS-3 | , 4-0, 3/8, 16mm |
| Espuma Matrass | para Tamanho | Tipo E | |
| Tubo de Plexiglas | ISPA Plastics | 416564 | M1 Tubo PMMA XT GOO 25x19 mm (diâmetro interno 19 mm, comprimento mínimo de 1,50 m) |
| Scanner de tomografia computadorizada pré-clínica | Molecubes | X-cube | |
| Capacete de aço | feito sob medida feito sob medida | diâmetro 10 mm e 3 mm de espessura | |
| Adesivo de tecido Vetbond 3M | 1469SB | ||
| Veterinário (buprenorfina) | EcuPhar | VETERG20 | 0,05 mk/kg |
| Xilocaína 2% gel | AstraZeneca | Xilocaína 2% | gel |
| Xilocaína (lidocaína 2%) | Aspen/AstraZeneca | Xilocaína 2% gel | 100 μ l injeção |
| ressonância magnética pré-clínica | Bruker Biospin MRI GmbH | Z400_PV51_CENTOS55 | ParaVision 5.1 Software |
| ressonância magnética pré-clínica | Bruker Biospin MRI GmbH | PharmaScan 70/16 | 7T Scanner de ressonância magnética |
| Bobina de volume em quadratura | Bruker Biospin MRI GmbH | RF RES 300 1H 075/040 QSN TR | Nº do modelo: 1P T13161C3 |
| Unidade de monitoramento fisiológico de pequenos animais | Rapid Biomedical | EKGHR02-0571-043C01 | Unidade para monitoramento respiratório |
| Unidade de aquecimento à base de água | Thermo Fisher Scientific | Haake S 5P | Nº do modelo: 1523051 |
| Anaesthesia | |||
| Anaesthesia unidade móvel | Técnicas veterinárias | BDO - Medipass, Ijmuiden | |
| isoflurano: Isoflo | Zoetis | B506 | |
| Gerador de oxigênio | Técnicas veterinárias | 7F-3 | BDO - Medipass, Ijmuiden |
| Processamento de imagem de difusão | |||
| Amida | http://amide.sourceforge.net | Versão 1.0.5. | Caixa de ferramentas do examinador de dados de imagens médicas (Loening AM, Gambhir SS, "AMIDE: uma ferramenta de software livre para análise de imagens médicas multimodalidades", Imagem molecular, 2(3):131-137, 2003) |
| ExploreDTI | http://www.exploredti.com | Version 4.8.6 | Caixa de ferramentas para (pré-)processamento e análise de imagens de RM ponderadas por difusão (Leemans A, Jeurissen B, Sijbers J e Jones DK. ExploreDTI: uma caixa de ferramentas gráfica para processamento, análise e visualização de dados de RM de difusão. In: 17ª Reunião Anual da Intl Soc Mag Reson Med, p. 3537, Havaí, EUA, 2009) |
| MRtrix3 | http://www.mrtrix.org | Versão 3.0_RC3-86-g4b523b41 | Caixa de ferramentas para (pré-)processamento e análise de imagens de RM ponderadas por difusão |