O zebrafish (Danio rerio) tornou-se um organismo modelo muito popular em pesquisas cardiovasculares, incluindo doenças cardíacas humanas, em grande parte devido à sua transparência embrionária, trabilidade genética e amenidade a estudos rápidos e de alto nível. No entanto, a perda de transparência limita a análise da função cardíaca na fase adulta, o que complica a modelagem das condições cardíacas relacionadas à idade. Para superar tais limitações, a ecocardiografia de ultrassom de alta frequência em zebrafish está emergindo como uma opção viável. Aqui, apresentamos um protocolo detalhado para avaliar a função cardíaca em zebrafish adultos por ecocardiografia não invasiva usando ultrassom de alta frequência. O método permite a visualização e análise da dimensão cardíaca do zebrafish e a quantificação de parâmetros funcionais importantes, incluindo freqüência cardíaca, volume de derrame, saída cardíaca e fração de ejeção. Neste método, os peixes são anestesiados e mantidos debaixo d'água e podem ser recuperados após o procedimento. Embora o ultrassom de alta frequência seja uma tecnologia cara, a mesma plataforma de imagem pode ser usada para diferentes espécies (por exemplo, murina e zebrafish) adaptando diferentes transdutores. A ecocardiografia do zebrafish é um método robusto para fenotipagem cardíaca, útil na validação e caracterização de modelos de doenças, particularmente doenças de início tardio; telas de drogas; e estudos de lesão cardíaca, recuperação e capacidade regenerativa.