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Artigo de método

Investigando a Motilidade Impulsionada por Flagella em Escherichia coli aplicando três técnicas estabelecidas em uma série

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DOI:

10.3791/61364

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10 de maio de 2020

Neste artigo

Resumo

Muitas bactérias usam motilidade impulsionada por flagela para navegar em seu ambiente e colonizar ambientes favoráveis tanto individualmente quanto como coletivos. Demonstrado aqui é o uso de três métodos estabelecidos que exploram a motilidade como ferramenta de seleção para identificar componentes/caminhos que contribuem para a natação e a motilidade.

Resumo

A motilidade é crucial para a sobrevivência e o sucesso de muitas espécies bacterianas. Existem muitas metodologias para explorar a motilidade para entender caminhos de sinalização, para elucidar a função e montagem de partes flageladoras, e para examinar e entender padrões de movimento. Aqui demonstramos uma combinação de três dessas metodologias. A motilidade no ágar macio é a mais antiga, oferecendo uma forte seleção para isolar mutações supressoras de ganho de função em cepas prejudicadas pela motilidade, onde a motilidade é restaurada através de uma segunda mutação. A técnica de amarração celular, primeiramente empregada para demonstrar a natureza rotativa do motor flagelador, pode ser usada para avaliar o impacto dos efeitos de sinalização na velocidade do motor e sua capacidade de alternar a direção rotacional. O ensaio de "travessia de fronteiras" é mais recente, onde bactérias nadando podem ser preparadas para a transição para se mover coletivamente como um enxame. Em combinação, esses protocolos representam uma abordagem sistemática e poderosa para identificar componentes da maquinaria de motilidade, e para caracterizar seu papel em diferentes facetas da natação e do enxame. Eles podem ser facilmente adaptados para estudar motilidade em outras espécies bacterianas.

Introdução

As bactérias empregam muitos apêndices para movimentação e dispersão em seus nichos ecológicos1. A motilidade conduzida por Flagella é a mais rápida delas, promovendo a colonização de locais favoráveis em resposta aos sinais ambientais, contribuindo significativamente para a capacidade patogênica de algumas espécies2,3. Bactérias flageladas podem nadar individualmente em líquido a granel, ou enxame como um coletivo sobre uma superfície semissólida4. A flagela extracelular se prende e é conduzida por motores rotativos embutidos na membrana, que aproveitam a potênc....

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Protocolo

1. Isolamento de mutantes supressores em cepas deficientes de motilidade

NOTA: Use este método como um amplo "catch-all" para identificar a natureza geral do defeito de motilidade.

  1. Preparação de placas de ágar macio
    NOTA: O ágar macio, também chamado de ágar de motilidade ou natação, é um ágar de baixa porcentagem (~0,2-0,35% w/v), muito usado para avaliarquimiotaxis 31,32.
    1. Adicione 3 g de bacto-agar (0,3% w/v) e 20 g de LB a um frasco fundo redondo de 2 L. Adicione 1 L de ddH2O (água duplamente destilada) ao frasco e misture uniforme....

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Resultados

O isolamento de pseudo-revertentes em uma cepa de E. coli cuja motilidade é prejudicada por altos níveis da molécula de sinalização c-di-GMP, foi detalhado em trabalhos recentes do nosso laboratório34. Esta cepa (JP1442) abrigava duas mutações: ΔyhjH e ΔycgR. YhjH é o fosfodiesterase mais ativo que degrada c-di-GMP em E. coli. A ausência de YhjH leva a níveis elevados de c-di-GMP e inibição da motilidade. YcgR é um efeito c-di-GMP. Em complexo com c-di-GMP, YcgR.......

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Discussão

O isolamento e a caracterização das mutações supressoras contribuíram com sucesso para identificar componentes-chave do sistema de quimioterapia35,36,37, bem como da própria máquina motora38,39,40. Ao usar o Protocolo 1, é importante incluir múltiplas réplicas independentes para garantir o isolamento de um grande espectro de possíveis m.......

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Divulgações

Os autores não têm nada a revelar.

Agradecimentos

Este trabalho foi apoiado pelo Instituto Nacional de Saúde de subvenção GM118085 e em parte pela Fundação Robert Welch (conceder F-1811 a R.M.H.).

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Reagents
Bacto Ágar DesidratadoFisher ScientificDF0140-15-4
EDTA Dissódico Sal, DihidratadoFisher Scientific02-002-786
Eiken AgarEiken Chemical Co. JapãoE-MJ00Essencial para E. coli enxameando
Glicose D (+)Fisher Scientific
LB (Lennox) CaldoFisher ScientificBP1427-500
Solução de Poli-L-lisina (0,1%)Sigma-AldrichP8920
Cloreto de potássio (KCl)Fisher Scientific18-605-496
Fosfato de potássio monobásico (KH2PO4)Fisher ScientificBP362-500
Fosfato de potássio dibásico (K2HPO4)Fisher ScientificBP363-500
Cloreto de sódio (NaCl)Fisher ScientificS271-500
Materiais e Equipamentos
CellSense software de imagem de microscópio (V. 1.6)OlympusOu software equivalente para microscópio usado
Fita Adesiva Doube Scotch 666 Fisher50-285-28
Lâminas de microscópio fosco 3x1x1mmFisher12-550-343
Microscópio Olympus BX53OlympusBX53Qualquer microscópio de fase vertical ou invertida pode ser usado
em placas de Petri (100 mm de diâmetro)Fisher ScientificFB0875712Para ensaios de ágar macio
Nebulizador de polietileno Tubo capilar (0,58 mm x 99 mm 3,0 m)Perkin Elmer
Placa de Petri redonda com 2 compartimentosVWR89200-944Para ensaios de travessia de fronteiras
Agulhas hipodérmicas de segurança (23G)Fisher Scientific14-826A
Seringa estéril - 1 mLFisher scientific14-955-450
Toalhetes de tarefas/tecidosFisher scientific06-666Ou toalhetes de tecido de uso único equivalentes
VWR micro vidro de cobertura 18x18mmVWR48366205
XM10 câmeraOlympusXM10Ou câmera de microscópio equivalente
4109550009908265

Referências

  1. Jarrell, K. F., McBride, M. J. The surprisingly diverse ways that prokaryotes move. Nature Reviews in Microbiology. 6 (6), 466-476 (2008).
  2. Harshey, R. M. Bacterial motility on a surface: many ways to a common goal. Annual Reviews Microbiology. 57

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Reimpressões e permissões

Etiquetas

Motilidade BacterianaEnsaio de Ágar MacioTécnica de Ancoragem CelularEnsaio de Travessia de FronteiraMicroscopia de Contraste de FaseProtocolo de CentrifugaçãoPreparação de Ágar de EnxamePreparação de Tampão de MotilidadeCisalhamento de Flagelos