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Research Article
Datta Singh Goolaub1,2, Davide Marini3,4, Mike Seed4,5, Christopher K. Macgowan1,2
1Department of Medical Biophysics,University of Toronto, 2Division of Translational Medicine,The Hospital for Sick Children, 3Labatt Family Heart Centre,The Hospital for Sick Children, 4Department of Pediatrics,University of Toronto, 5Division of Pediatric Cardiology,The Hospital for Sick Children
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui apresentamos um protocolo para medir rapidamente o fluxo sanguíneo fetal com RM e realizar retrospectivamente a correção de movimento e o gating cardíaco.
A ressonância magnética (RM) é uma importante ferramenta para a avaliação clínica da morfologia cardiovascular e da função cardíaca. É também o padrão de tratamento reconhecido para quantificação do fluxo sanguíneo com base na ressonância magnética com contraste de fase. Embora essa medição do fluxo sanguíneo tenha sido possível em adultos por décadas, métodos para estender essa capacidade ao fluxo sanguíneo fetal só recentemente foram desenvolvidos.
A quantificação do fluxo sanguíneo fetal nos principais vasos é importante para o monitoramento de patologias fetais, como cardiopatia congênita (DCC) e restrição do crescimento fetal (RCF). A DCC causa alterações na estrutura cardíaca e na vasculatura que alteram o curso do sangue no feto. Na RCF, o caminho do fluxo sanguíneo é alterado através da dilatação dos shunts, de modo que o suprimento de sangue oxigenado para o cérebro é aumentado. A quantificação do fluxo sanguíneo permite a avaliação da gravidade da patologia fetal, o que, por sua vez, permite o manejo e o planejamento adequados do paciente no útero para o pós-natal.
Os principais desafios da aplicação da ressonância magnética de contraste de fase ao feto humano incluem tamanho de vasos sanguíneos pequenos, alta frequência cardíaca fetal, potencial corrupção de dados de ressonância magnética devido à respiração materna, movimentos fetais imprevisíveis e falta de métodos convencionais de bloqueio cardíaco para sincronizar a aquisição de dados. Aqui, descrevemos desenvolvimentos técnicos recentes de nosso laboratório que permitiram a quantificação do fluxo sanguíneo fetal usando ressonância magnética com contraste de fase, incluindo avanços em imagens aceleradas, compensação de movimento e bloqueio cardíaco.
A avaliação abrangente da circulação fetal é necessária para o monitoramento de patologias fetais como restrição do crescimento fetal (RCF) e cardiopatia congênita (DCC)1,2,3. No útero, o manejo e o planejamento da paciente para a assistência pós-natal dependem da gravidade da patologia fetal 4,5,6,7. A viabilidade da quantificação do fluxo sanguíneo fetal com RM e suas aplicações na avaliação de patologias fetais tem sido demonstrada recentemente 3,8,9. O método de imagem, no entanto, enfrenta desafios, como o aumento dos tempos de imagem para alcançar alta resolução espaço-temporal, a falta de métodos de sincronização cardíaca e o movimento fetal imprevisível10.
A vasculatura fetal compreende pequenas estruturas (~5 mm de diâmetro para os principais vasos sanguíneos que compreendem a aorta descendente, o canal arterial, a aorta ascendente, a artéria pulmonar principal e a veia cava superior11,12,13). Para resolver essas estruturas e quantificar o fluxo, são necessárias imagens em alta resolução espacial. Além disso, a frequência cardíaca fetal é cerca de duas vezes a de um adulto. Uma alta resolução temporal é, portanto, também necessária para resolver o movimento cardíaco dinâmico e o fluxo sanguíneo através do ciclo cardíaco fetal. A imagem convencional nesta alta resolução espaço-temporal requer tempos de aquisição relativamente longos. Para resolver essa questão, a RM fetal acelerada14,15,16 foi introduzida. Resumidamente, essas técnicas de aceleração envolvem subamostragem no domínio da frequência durante a aquisição de dados e reconstrução retrospectiva de alta fidelidade usando técnicas iterativas. Uma dessas abordagens é a reconstrução por sensoriamento comprimido (CS), que permite a reconstrução de imagens a partir de dados fortemente subamostrados quando a imagem reconstruída é esparsa em um domínio conhecido e os artefatos de subamostragem são incoerentes17.
O movimento na imagem fetal apresenta um grande desafio. A corrupção do movimento pode surgir do movimento respiratório materno, do movimento do volume materno ou do movimento fetal grosseiro. A respiração materna leva a traduções periódicas do feto, enquanto os movimentos fetais são mais complexos. Os movimentos fetais podem ser classificados em localizados ou brutos10,18. Os movimentos localizados envolvem o movimento de apenas segmentos do corpo. Eles normalmente duram cerca de 10-14 s e sua frequência aumenta com a gestação (~ 90 por hora a termo)10. Esses movimentos geralmente causam pequenas corrupções e não afetam a área de imagem de interesse. No entanto, os movimentos fetais grosseiros podem levar a uma grave corrupção da imagem com componentes de movimento plano. Esses movimentos são movimentos de corpo inteiro mediados pela coluna vertebral e duram de 60 a 90 s.
Para evitar artefatos do movimento fetal, primeiro são tomadas medidas para minimizar os movimentos maternos. As gestantes tornam-se mais relaxadas com travesseiros de apoio na cama do scanner e vestidas com aventais confortáveis, podendo ter seus parceiros presentes ao lado do scanner para reduzir a claustrofobia19,20. Para mitigar os efeitos do movimento respiratório materno, estudos têm realizado exames de RM fetal sob apneia materna21,22,23. No entanto, tais aquisições devem ser curtas (~ 15 s), dada a tolerância reduzida à apneia de indivíduos grávidas. Recentemente, métodos retrospectivos de correção de movimento têm sido introduzidos para a RM fetal14,15,16. Esses métodos rastreiam o movimento fetal usando kits de ferramentas de registro e corrigem o movimento ou descartam partes incorrigíveis dos dados adquiridos.
Finalmente, as imagens de RM cardíaca pós-natal são adquiridas convencionalmente usando o bloqueio por eletrocardiograma (ECG) para sincronizar a aquisição de dados com o ciclo cardíaco. Sem o gating, o movimento cardíaco e o fluxo pulsátil de todo o ciclo cardíaco são combinados, produzindo artefatos. Infelizmente, o sinal do ECG fetal sofre interferência do sinal do ECG materno24 e distorções do campo magnético25. Assim, abordagens alternativas não invasivas para o gating cardíaco fetal têm sido propostas, incluindo auto-gating, metric optimized gating (MOG) e doppler ultrasound gating21,26,27,28.
Conforme descrito nas seções a seguir, nossa abordagem de ressonância magnética para quantificar o fluxo sanguíneo fetal aproveita um novo método de gating, o MOG, desenvolvido em nosso laboratório e combinado com correção de movimento e reconstrução iterativa de aquisições aceleradas de ressonância magnética. A abordagem é baseada em um pipeline em um estudo publicado anteriormente14 e é composta pelos seguintes cinco estágios: (1) aquisição do fluxo sanguíneo fetal, (2) reconstruções em tempo real, (3) correção de movimento, (4) bloqueio cardíaco e (5) reconstruções fechadas.
Todas as ressonâncias magnéticas foram realizadas com o consentimento informado dos voluntários, como parte de um estudo aprovado pelo nosso conselho de ética em pesquisa institucional.
NOTA: Os métodos descritos abaixo foram utilizados num sistema de RM 3T. A aquisição é realizada por meio de uma sequência de ressonância magnética com contraste de fase radial. Esta sequência foi preparada modificando a trajetória de leitura (para atingir um padrão estrelado) da RM de contraste de fase cartesiana do fabricante. Os protocolos de sequência e amostra estão disponíveis mediante solicitação através da nossa plataforma de troca C2P. Todas as reconstruções neste trabalho foram realizadas em um computador desktop padrão com as seguintes especificações: memória de 32 GB, processador de 3,40 GHz com 8 núcleos e placa gráfica de 2 GB com 1024 núcleos de arquitetura de dispositivo unificado de computação (CUDA). A reconstrução da imagem foi realizada no MATLAB. A transformada rápida de Fourier não uniforme (NUFFT)29 foi realizada na unidade de processamento gráfico (GPU). Os parâmetros de correção de movimento foram calculados utilizando-se o elastix30. A Figura 1 mostra o protocolo em ordem cronológica, rastreando como as codificações de velocidade adquiridas (codificadas por cores na Figura 1) são processadas com imagens representativas em cada etapa da reconstrução. O código de reconstrução está disponível em https://github.com/datta-g/Fetal_PC_MRI. Embora forneçamos as etapas no protocolo aqui, a maioria dessas etapas do algoritmo é automatizada em nosso pipeline.
1. Posicionamento do assunto e exames de localização
2. Aquisição de dados de fluxo sanguíneo fetal
3. Correção do movimento das medidas fetais


4. Resolvendo a frequência cardíaca fetal


5. Reconstrução de CINEs fetais
Em geral, os exames de RM de fase do fluxo têm como alvo seis grandes vasos fetais: aorta descendente, aorta ascendente, artéria pulmonar principal, canal arterial, veia cava superior e veia umbilical. Esses vasos são de interesse do clínico, pois muitas vezes estão implicados na DCC e na RCF, influenciando a distribuição do sangue por todo o feto9. Uma duração típica de varredura com a ressonância nuclear magnética (RNM) com contraste de fase radial é de 17 s por vaso, de modo que os exames sejam curtos, ao mesmo tempo em que permitem tempo suficiente para a aquisição de dados suficientes para a reconstrução do CINE. O tempo total de aquisição, incluindo localizadores e ressonância nuclear magnética (RNM) com contraste de fase, para os resultados representativos foi de 3 min. Neste estudo, resultados representativos são apresentados utilizando dados de aquisição de fluxo da aorta descendente em dois fetos humanos: Feto 1 e Feto 2 com idades gestacionais (semana + dias) de 35+4 e 37+3, respectivamente.
Como na Figura 1, as reconstruções iniciais em tempo real (resolução temporal: 370 ms) realizadas para rastreamento de movimento levaram 45 s por fatia reconstruída. O rastreamento de movimento de tradução levou 2 minutos para cada fatia. Os parâmetros de movimento extraídos para Feto 1 (Figura 2 A1, deslocamento máximo: 1,6 mm) e Feto 2 (Figura 2 A2, deslocamento máximo: 1,3 mm) retratam o movimento da aorta descendente durante a duração da varredura. As informações mútuas compartilhadas de cada período em tempo real com todos os outros quadros co-registrados são mostradas na Figura 2 B1 (Feto 1) e na Figura 2 B2 (Feto 2). Nesses casos, todos os quadros compartilhavam informações mútuas acima dos critérios de corte, portanto, nenhum dado foi rejeitado. As segundas reconstruções em tempo real (resolução temporal: 46 ms), usadas para derivar informações de bloqueio cardíaco, levaram 10 minutos para cada fatia. O MOG derivou os intervalos dos batimentos cardíacos fetais (RR) utilizando um modelo multiparâmetro, como mostra a Figura 2 C1 (Feto 1, intervalo RR: 521 ± 20 ms) e a Figura 2 C2 (Feto 2 , intervalo RR: 457 ± 9 ms).
As reconstruções finais do CINE usando os dados corrigidos retrospectivamente por movimento e fechados levaram 3 min por fatia. As reconstruções anatômicas e de velocidade para o Feto 1 e Feto 2 no pico da sístole são mostradas na Figura 3. Reconstruções com correção de movimento mostram vasos com paredes mais nítidas. Sem correção de movimento, a aorta descendente é mais borrada e menos visível. As curvas de fluxo medidas de cada feto (Figura 4) mostram maiores fluxos de pico e média nas reconstruções sem correção de movimento ([pico médio]: Feto 1 [25,2 9,8] ml/s, Feto 2 [34,6 10,3] ml/s]) do que naqueles com correção de movimento ([média de pico]: Feto 1 [23,5 9,2] ml/s, Feto 2 [28,7 9,7] ml/s]).

Figura 1: Pipeline para reconstruir os dados de ressonância magnética de contraste de fase fetal. (A) Etapa 1: Dados de ressonância magnética de contraste de fase radial de ângulo dourado (codificados por cores como: compensação de fluxo = vermelho e através de codificação plana = azul). As cores alternadas descrevem que as aquisições codificadas por fluxo e através do plano ocorrem nas mesmas frequências espaciais. (B) Passo 2: Janelas temporais de 370 ms para reconstrução em tempo real usando CS com restrições de esparsidade (STV e TTV). A correção de movimento e a rejeição de dados são realizadas. (C) Passo 3: Janelas temporais de 46 ms são criadas para reconstrução em tempo real com CS (com restrições de esparsidade STV e TTV) para MOG. (D) Passo 4: Os dados são agrupados em fases cardíacas (PC), e o CS é usado para criar um CIN de fluxo fetal, com restrições de esparsidade (STV e TTV). As reconstruções representativas de cada etapa do CS são mostradas na coluna Reconstruções. As reconstruções para as etapas 3 e 4 são mostradas para um ponto de tempo correspondente ao pico de sístole. Barras de escala no canto superior esquerdo das imagens anatômicas denotam 10 mm na imagem. As especificações de tempo, em segundos, destacadas em cinza representam as durações das etapas correspondentes. STV: variação total espacial, TTV: variação total temporal, CS: sensoriamento comprimido, MOG: gating, CINE: reconstrução dinâmica fechada. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Deslocamento representativo e curvas de frequência cardíaca. A1 e A2 retratam a curva de deslocamento rastreada retrospectivamente para os exames no Feto 1 e no Feto 2, respectivamente. B1 e B2 mostram a soma das informações mútuas de um determinado quadro com todos os outros quadros para o Feto 1 e o Feto 2, respectivamente. As linhas pontilhadas vermelhas representam um intervalo interquartil de 1,5x abaixo do qual os dados são rejeitados. C1 e C2 representam os intervalos RR derivados com MOG no Feto 1 e no Feto 2, respectivamente. Intervalo RR: tempo entre batimentos cardíacos consecutivos, MOG: gating. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Reconstruções CINE sensíveis à velocidade representativa no pico da sístole. Cada quadrante retrata as reconstruções anatômicas e de velocidade. A linha superior mostra o CINE com correção de movimento no Feto 1 e no Feto 2, respectivamente. A linha inferior mostra o CINE sem correção de movimento no Feto 1 e no Feto 2, respectivamente. As setas vermelhas e azuis retratam a aorta descendente. Barras de escala no canto superior esquerdo das imagens anatômicas denotam 10 mm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Curvas de fluxo representativas na aorta descendente fetal. As linhas de dados sólidas e tracejadas retratam as curvas de fluxo obtidas a partir de reconstruções CINE com e sem correção de movimento, respectivamente, no Feto 1 (esquerda) e no Feto 2 (direita). Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Nenhum.
Aqui apresentamos um protocolo para medir rapidamente o fluxo sanguíneo fetal com RM e realizar retrospectivamente a correção de movimento e o gating cardíaco.
Nenhum.
| elastix | Image Sciences Institute, University Medical Center Utrecht | Software de registro de imagem | |
| Geforce GTX 960 | Nvidia | 04G-P4-3967-KR | |
| gpuNUFFT | CAI² R | Transformada de Fourier rápida não uniforme | |
| MAGNETOM Prisma | Siemens | 10849583 | |
| MATLAB | MathWorks | ||
| Contraste de fase radial Sequência | de ressonância magnética | Modificação da trajetória da sequência de contraste de fase cartesiana do fabricante | |
| Segmento | Medvisio | Análise de dados | |
| VENGEANCE | Corsair | LPX DDR4-2666 |