No passado, os sistemas de modelo epitelial intestinal limitavam-se a linhas celulares transformadas e tecido primário. Esses sistemas de modelos têm limitações inerentes, pois os primeiros não representam fielmente a fisiologia do tecido original, e a disponibilidade deste último é limitada. Assim, sua aplicação dificulta pesquisas fundamentais e de desenvolvimento de medicamentos. Organoides adultos à base de células-tronco (a partir de agora referidos como organoides) são miniaturas de tecido epitelial normal ou doente do qual são derivados. Eles podem ser estabelecidos de forma muito eficiente a partir de diferentes regiões gastrointestinais (GI), têm expansão a longo prazo e simulam respostas específicas de tecidos e pacientes para tratamentos in vitro. Aqui, o estabelecimento de monocamadas epiteliais derivadas de organoides intestinais tem sido demonstrado juntamente com métodos para medir a integridade da barreira epitelial, permeabilidade e transporte, secreção de proteína antimicrobiana, bem como histologia. Além disso, as monocamadas derivadas de organoides intestinais podem ser enriquecidas com células de tronco e amplificadores de trânsito, bem como com células epiteliais diferenciadas. Portanto, eles representam um sistema modelo que pode ser adaptado para estudar os efeitos dos compostos nas células alvo e seu modo de ação. Embora as culturas organoides sejam tecnicamente mais exigentes do que as linhas celulares, uma vez estabelecidas, elas podem reduzir falhas nos estágios posteriores do desenvolvimento de medicamentos, pois representam verdadeiramente a complexidade do epitélio vivo e a heterogeneidade interpatente.