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As células epiteliais que revestem a mucosa intestinal criam uma barreira física que separa o conteúdo luminal do interstício. O comprometimento da barreira epitelial tem sido associado ao desenvolvimento de várias patologias, como doenças inflamatórias intestinais (DII). Na mucosa inflamada, erosões superficiais ou microerosões que corrompem as monocamadas epiteliais correspondem a locais de alta permeabilidade. Vários mecanismos têm sido implicados na formação de microerosões, incluindo derramamento celular e apoptose. Essas microerosões geralmente representam lacunas epiteliais microscópicas distribuídas aleatoriamente no cólon. A visualização e quantificação dessas lacunas epiteliais emergiu como uma ferramenta importante para investigar a função da barreira epitelial intestinal. Aqui, descrevemos um novo método para visualizar a localização específica de onde a permeabilidade transcelular e paracelular é aumentada na mucosa colônica inflamada. Neste ensaio, aplicamos um corante fluorescente de 10 kDa conjugado a um dextrano fixável em lisina para visualizar regiões de alta permeabilidade (HPR) na mucosa colônica. O uso adicional de marcadores de morte celular revelou que o HPR abrange focos apoptóticos onde ocorre extrusão/derramamento epitelial. O protocolo aqui descrito fornece uma abordagem simples, mas eficaz, para visualizar e quantificar microerosões no intestino, o que é uma ferramenta muito útil em modelos de doenças, nos quais a barreira epitelial intestinal está comprometida.