Com base em uma matriz de peptídeos derivadas do vírus da hepatite B (HBV), as respostas de células T CD4 específicas do HBV poderiam ser avaliadas em paralelo com a identificação de epítopos de células T CD4 específicas do HBV.
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Artigo de método
Com base em uma matriz de peptídeos derivadas do vírus da hepatite B (HBV), as respostas de células T CD4 específicas do HBV poderiam ser avaliadas em paralelo com a identificação de epítopos de células T CD4 específicas do HBV.
As células CD4 T desempenham papéis importantes na patogênese da hepatite crônica B. Como uma população celular versátil, as células CD4 T foram classificadas como subconjuntos funcionais distintos com base nas citocinas que secretaram: por exemplo, IFN-γ para células auxiliares CD4 T 1, IL-4 e IL-13 para cd4 T helper 2 células, IL-21 para células auxiliares foliculares CD4 T e IL-17 para células auxiliares CD4 T 17. A análise das células CD4 T específicas do vírus da hepatite B (HBV) baseadas na secreção de citocinas após a estimulação de peptídeos derivados do HBV poderia fornecer informações não apenas sobre a magnitude da resposta cd4 t-cell específica do HBV, mas também sobre os subconjuntos funcionais das células CD4 T específicas do HBV. Novas abordagens, como transcrição e análise de metabolômica, poderiam fornecer informações funcionais mais detalhadas sobre células CD4 T específicas do HBV. Essas abordagens geralmente requerem isolamento de células CD4 T específicas do HBV viáveis com base em multimers complexos de histocompatibilidade de peptídeos-maior-ii, enquanto atualmente as informações sobre epítopos de células T CD4 específicas do HBV são limitadas. Baseado em uma matriz de peptídeos derivadas do HBV, um método foi desenvolvido para avaliar as respostas de células T CD4 específicas do HBV e identificar epítopos de células T específicas do HBV simultaneamente usando amostras de células mononucleares de sangue periféricos de pacientes crônicos de infecção por HBV.
Atualmente, existem 3 abordagens principais para analisar células T específicas de antígeno. A primeira abordagem é baseada na interação entre o receptor de células T e o peptídeo (epítope). As células T específicas de antígenos podem ser diretamente manchadas com multimers complexos de histocompatibilidade (MHC) de peptídeos. A vantagem deste método é que ele poderia obter células T viáveis específicas de antígeno, adequadas para análise de transcrição/metabolômica a jusante. Uma limitação deste método é que ele não poderia fornecer informações sobre toda a resposta de células T a um antígeno específico, pois requer peptídeos de epítope validados enquanto o número de epítopos identificados para um antígeno específico é limitado por enquanto. Em comparação com os epítopos de células T CD8 específicas do vírus da hepatite B (HBV), foram identificados menos epítopos de células T específicas do HBV, foram identificados simptos de células T específicas do HBVatualmente.
A segunda abordagem baseia-se na regulação de uma série de marcadores induzidos por ativação após a estimulação do peptídeo de antígeno3. Os marcadores comumente usados incluem CD69, CD25, OX40, CD40L, PD-L1, 4-1BB4. Este método tem sido usado agora para analisar respostas de células T específicas de antígeno em indivíduos vacinados5,6, pacientes com infecção por vírus da imunodeficiência humana7, e síndrome respiratória aguda grave Coronavirus 2 pacientes infecção8,9. Ao contrário do ensaio baseado em multimers peptídeo-MHC, este método não é restrito por epítopos validados e poderia obter células viáveis para análise a jusante. Uma limitação deste método é que ele não poderia fornecer informações sobre o perfil citocina de células T específicas de antígeno. Além disso, a expressão desses marcadores induzidos por ativação por algumas células não específicas de antígeno ativado pode contribuir para os sinais de fundo na análise, o que pode ser um problema especialmente quando as células T específicas de antígeno alvo são raras. Atualmente, há uma aplicação limitada deste método em células CD4 T específicas do HBV4. Se esse método poderia ser utilizado para analisar células CD4 T específicas do HBV de forma confiável, precisa de uma investigação mais aprofundada.
A terceira abordagem é baseada na secreção de citocinas após a estimulação do peptídeo de antígeno. Como a análise baseada em marcadores induzidos por ativação, este método não é restrito por epítopos validados. Este método poderia revelar diretamente o perfil de citocinas de células T específicas de antígeno. A sensibilidade deste método é menor do que o método baseado em marcador induzido por ativação, pois se baseia na secreção de citocinas de células T específicas de antígeno e o número de citocinas testadas é geralmente limitado. Atualmente, este método é amplamente utilizado na análise de células T específicas do HBV. Como citocinas que secretam células T específicas do HBV dificilmente poderiam ser detectadas pela estimulação direta de peptídeo ex vivo10,11, o perfil citocina das células T específicas do HBV é geralmente analisado após 10 dias de expansão estimulada por peptídeo in vitro12,13,14,15,16. O arranjo de piscinas de peptídeos em forma matricial tem sido utilizado para facilitar a identificação de epítopos específicos de antígeno17,18. Com a combinação de matriz de peptídeos e análise de secreção de citocinas, um método foi desenvolvido para avaliar as respostas específicas das células T CD4 específicas do HBV e identificar epítopos de células T específicas do HBV simultaneamente16. Neste protocolo, os detalhes deste método são descritos. O antígeno núcleo HBV é escolhido como um exemplo de demonstração neste protocolo.
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O consentimento informado por escrito foi obtido de cada paciente incluído no estudo. O protocolo de estudo está de acordo com as diretrizes éticas da Declaração de Helsinque de 1975, refletida na aprovação de a priori pelo comitê de ética médica do Hospital Southwest.
1. Projeto da matriz de peptídeos derivadas do HBV
2. Isolamento de células mononucleares de sangue periféricos (PBMCs)
3. Expansão in vitro de PBMCs usando uma matriz de peptídeo HBV
4. Análise das respostas cd4 t-cell específicas do HBV por citometria de fluxo intracelular

5. Identificação de Epítopos de células T T restritos HLA-DR específicos do HBV
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A frequência de citocinas secretando células CD4 T são calculadas como a soma de produtores individuais e produtores duplos. Como demonstrado na Figura 1,a frequência de células T4 T secretantes de TN α F e a frequência de células T DE Γ de IFN em controle de fundo (DMSO) são de 0,154% e 0,013%, respectivamente. A frequência de células CD4 T secretantes T α TNF e a frequência de células CD4 T secretas ifn-γ específicas para o pool de peptídeos Core11 são 0,206 e 0,017, respectivamente, de mo...
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As etapas mais críticas deste protocolo estão listadas da seguinte forma: 1) PBMCs suficientes de alta viabilidade para iniciar a expansão dos PBMCs; 2) ambiente adequado para expansão de PBMCs; e 3) remoção completa de piscinas de peptídeos residuais na cultura pbmcs antes da identificação do epítope.
Toda a análise neste protocolo depende da proliferação robusta das células CD4 T. Em geral, o número de PBMCs após a expansão de 10 dias será de 2 a 3 vezes o número inicial. O número do celular...
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Os autores não têm nada a revelar.
Este trabalho foi apoiado pela National Natural Science Foundation of China (81930061), Chongqing Natural Science Foundation (cstc2019jcyj-bshX0039, cstc2019jcyj-zdxmX0004) e Chave Chinesa
Projeto Especializado em Doenças Infecciosas (2018ZX10723203).
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Albumina bovina V (BSA) | Beyotime | ST023 | |
| APC-conjugado Anti-humano TNF-α | eBioscience | 17-7349-82 | Mantenha-se protegido da luz |
| Benzonase Nuclease | Sigma-Aldrich | E1014 | Limite as |
| linhas celulares linfoblastóides B aglomeradas de células (BLCLs) | FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER | HLA-DRB1 * 0803 | |
| linhas celulares linfoblastóides homozigóticas B (BLCLs) | FRED HUTCHINSON CANCER RESEARCH CENTER | HLA-DRB1 * 1202 homozigoto | |
| Frasco de Cultura de Células (T75) | Corning | 430641 | |
| Placa de Cultura de Células (96 poços, fundo plano) | Corning | 3599 | Placa de Cultura de Células de fundo plano |
| (96 poços, fundo redondo) | Corning | 3799 | Coador de Células de fundo redondo |
| Corning | CLS431751 | Tamanho dos poros 70 μ m, branco, tubo de | |
| centrífuga estéril (15 mL) | KIRGEN | KG2611 | estéril |
| (50 mL) | estéril | Corning | 430829 |
| refrigerada | Eppendorf | 5804R | |
| refrigerada | Thermo | ST16R | |
| , Termolenda | |||
| refrigeradaKit Cytofix/Cytoperm (Conjunto de Tampão de Fator de Transcrição) | BD Biosciences | 562574 | Prepare a solução antes |
| de usar Dimetilsulfóxido (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650 | Mantenha em temperatura ambiente para evitar a cristalização |
| Dulbecco' s Preparação salina | ddH2O (1000 ml) contendo NaCl (8000 mg), KCl (200 mg), KH2PO4 (200 mg) e Na2HPO4.7H2O (2160 mg). Ajuste o PH para 7.4. Esterilize através de autoclave. | ||
| Pontas de filtro Ficoll-Paque Premium | GE Healthcare | 17-5442-03 | |
| (0.5-10)Pontas de | estéreis | Kirgen | KG5131 |
| (100-1000) | estéreis | Kirgen | KG5333 |
| (1-200) | Kirgen | KG5233 | Estéril |
| conjugado com FITC Anti-humano | CD4 BioLegend | 300506 | Manter protegido da luz |
| Corante de Viabilidade Fixável eFluor780 | eBioscience | 65-0865-14 | Mantenha-se protegido da luz |
| Inibidor de Transporte de Proteína GolgiStop (Contendo Monensina) | BD Biosciences | 554724 | Inibidor de Transporte de Proteína |
| Hemocitômetro | Marca | 718620 | |
| Peptídeos Derivados do Antígeno do Núcleo HBV | ChinaPeptídeos | ||
| HEPES | Gibco | 15630080 | 100 ml |
| de soro humano AB | Gemini Bio-Products | 100-51 | 100 ml |
| de ionomicina | Sigma-Aldrich | I0634 | |
| KCl | Sangon Biotech | A100395-0500 | |
| KH2PO4 | Sangon Biotech | A100781-0500 | |
| LSRFortessa Citômetro de fluxo | BD | ||
| L-glutamina | Gibco | 25030081 | |
| Tubo de Microcentrífuga de 100 ml (1,5 mL) | Corning | MCT-150-C | Esterilização autoclavada antes de usar |
| Microplate Shakers | Scientific Industries | MicroPlate Genie | |
| Mitomicina C | Roche | 10107409001 | |
| Na2HPO4.7H2O | Sangon Biotech | A100348-0500 | |
| NaCl | Sangon Biotech | Tubos de PCR A100241-0500 | |
| (0,2 mL) | Kirgen | KG2331 | |
| PE / Cy7 conjugado Anti-humano CD8 | BioLegend | 300914 | Manter protegido da luz |
| PE conjugado Anti-humano IFN-&gama; | eBioscience | 12-7319-42 | Manter protegido da luz |
| Penicilina Estreptomicina | Gibco | 15140122 | 100 ml |
| PerCP-Cy5.5-conjugado Anti-humano CD3 | eBioscience | 45-0037-42 | Manter protegido da luz |
| Phorbol 12-miristato 13-acetato (PMA) | Sigma-Aldrich | P1585 | |
| Humano Recombinante IL-2 | PeproTech | 200-02 | |
| Humano recombinante IL-7 | PeproTech | 200-07 | |
| RPMI Médio 1640 | Gibco | C11875500BT | 500 ml |
| de piruvato de sódio, 100mM | Gibco | 15360070 | |
| Trypan Blue Stain (0,4%) | Gibco | 15250-061 | |
| Ultra-LEAF Purificado Anti-humano HLA-DR | BioLegend | 307648 | |
| Wizard Genomic DNA Kit de Purificação | Promega | A1125 |
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