Os parasitas protozoários infectam humanos e muitos animais de sangue quente. O Toxoplasma gondii, um dos principais parasitas protozoários, é comumente encontrado em pacientes HIV-positivos, receptores de transplante de órgãos e mulheres grávidas, resultando na grave condição de saúde, Toxoplasmose. Outro protozoário importante, Neospora caninum, que tem muitas semelhanças com o Toxoplasma gondii, causa doenças graves em animais, assim como a encefalomielite e a miostite-polirradiculite em cães e vacas, resultando em bezerros natimortos. Todos estes exibiram nucleosídeos trifosfato hidrolases semelhantes (NTPase). Neospora caninum tem uma NcNTPase, enquanto Toxoplasma gondii tem uma TgNTPase-I. Acredita-se que as enzimas desempenhem papéis cruciais na propagação e sobrevivência. A fim de estabelecer compostos e/ou extratos que previnam a infecção por protozoários, direcionamos essas enzimas para a descoberta de medicamentos. O próximo passo foi estabelecer um ensaio novo, altamente sensível e altamente preciso, combinando um ensaio enzimático bioquímico convencional com um ensaio fluorescente para determinar o conteúdo de ADP. Também validamos que o novo ensaio preenche os critérios para realizar triagem de alto rendimento (HTS) nas duas enzimas protozoárias. Realizamos HTS, identificamos 19 compostos e seis extratos de duas bibliotecas de compostos sintéticos e uma biblioteca de extratos derivados de bactérias marinhas, respectivamente. Neste estudo, foi introduzida uma explicação detalhada sobre como realizar o HTS, incluindo informações sobre a preparação de reagentes, dispositivos, braço robótico, etc.