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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
DetectSyn é um ensaio fluorescente rápido e imparcial que mede mudanças no número de sinapse relativa (engajamento pré e pós-sináptico) entre os estados de tratamento ou doença. Esta técnica utiliza uma técnica de ligadura de proximidade que pode ser usada tanto em neurônios cultivados quanto em tecido fixo.
Sinapses são o local de comunicação entre neurônios. A força do circuito neuronal está relacionada à densidade sináptica, e a quebra das sinapses é característica de estados da doença como transtorno depressivo grave (MDD) e doença de Alzheimer. Técnicas tradicionais para investigar números de sinapse incluem expressão genética de marcadores fluorescentes (por exemplo, proteína fluorescente verde (GFP)), corantes que preenchem um neurônio (por exemplo, corante de carbocianina, DI) e detecção imunofluorescente de marcadores de coluna (por exemplo, densidade pós-sináptica 95 (PSD95)). Uma grande ressalva a essas técnicas de proxy é que elas só identificam alterações postsináspticas. No entanto, uma sinapse é uma conexão entre um terminal pré-sináptico e uma coluna postsintáptica. O padrão-ouro para medir a formação/eliminação da sinapse requer técnicas demoradas de microscopia eletrônica ou tomografia de matriz. Essas técnicas exigem treinamento especializado e equipamentos caros. Além disso, apenas um número limitado de neurônios pode ser avaliado e são usados para representar alterações em toda uma região cerebral. DetectSyn é uma técnica fluorescente rápida que identifica alterações na formação ou eliminação da sinapse devido a um estado da doença ou atividade medicamentosa. DetectSyn utiliza um ensaio de ligadura de proximidade rápida para detectar proteínas pré e pós-sináptica justtaposed e microscopia fluorescente padrão, uma técnica prontamente disponível para a maioria dos laboratórios. A detecção fluorescente do puncta resultante permite uma análise rápida e imparcial dos experimentos. DetectSyn fornece resultados mais representativos do que microscopia eletrônica porque áreas maiores podem ser analisadas do que um número limitado de neurônios fluorescentes. Além disso, a DetectSyn trabalha para neurônios in vitro cultivados e fatias de tecido fixo. Finalmente, é fornecido um método para analisar os dados coletados dessa técnica. No geral, o DetectSyn oferece um procedimento para detectar alterações relativas na densidade de sinapse em tratamentos ou estados de doença e é mais acessível do que as técnicas tradicionais.
As sinapses são a unidade fundamental de comunicação entre os neurônios1. Muitas sinapses entre neurônios dentro das mesmas regiões dão origem a circuitos que mediam o comportamento2. As sinapses consistem em um terminal pré-sináptico de um neurônio que libera neurotransmissores ou neuropeptídeos que retransmitem informações para receptores postsináspicos de outro neurônio. A soma dos sinais pré-sinápticos determina se o neurônio postsinásptico disparará um potencial de ação e propagará a mensagem para outros neurônios.
A sinaptopatologia, a quebra das sinapses, surge em doenças e distúrbios marcados pela diminuição do volume neural, como a doença de Alzheimer e o transtorno depressivo grave, resultando em circuitos que não funcionam maisde forma ideal 3,4,5. Restaurar a densidade da sinapse provavelmente está por trás da eficácia de tratamentos potenciais para esses distúrbios. Por exemplo, foi recentemente demonstrado que o aumento das sinapses está por trás da eficácia comportamental dos antidepressivos rápidos6. Para testar rapidamente possíveis tratamentos de sinaptopatologia, os pesquisadores exigem técnicas que identifiquem rapidamente mudanças nos números da sinapse.
As metodologias atuais são demoradas e caras (microscopia eletrônica, tomografia de matriz), ou examinam apenas alterações postsináspticas sem incorporar engajamento pré-sináptico (análises da coluna vertebral, imunofluorescência/colocalização). Corantes como dii ou proteínas fluorescentes como gfp ajudam a visualizar neurônios e caracterizam espinhas pós-sinápticas. No entanto, a análise da coluna vertebral utiliza razões definidas pelo pesquisador para determinar a morfologia, o que pode diminuir a reprodutibilidade7. Além disso, como as diferentes classes de coluna vertebral se relacionam com sinapses funcionais ainda está sendo descoberto8. A formação da coluna vertebral pode ser transitória e pode refletir plasticidade post-sináptica, mas essas espinhas podem ser eliminadas antes de estabilizar em uma sinapse com um neurônio pré-sináptico9.
A colocalização fornece um proxy melhor para sinapses do que a análise da coluna vertebral, porque pode-se imunossuer proteínas pré-sinápticas e pós-sinápticas. No entanto, as proteínas sinápticas podem produzir baixos valores de colocalização porque as proteínas são justapostas e podem não se sobrepor consistentemente. Assim, como as proteínas não são totalmente sobrepostas, as técnicas de colocação podem não medir com precisão as alterações na formação de sinapse devido a essa informação perdida. Finalmente, embora tanto a microscopia eletrônica (EM) quanto a tomografia de matriz forneçam imagens de alta resolução de sinapses, elas são demoradas. A EM requer ainda equipamentos especializados, e os pesquisadores estão limitados a pequenos volumes de tecido para qualquer experimento. Embora a tomografia de array forneça elegantemente a capacidade de tela para muitas proteínas em seções ultrathin e possa ser combinada com o EM10, essa técnica pode ser muito trabalhosa e além do escopo de experimentos que precisam digitalizar rapidamente para mudanças na formação de sinapsia.
DetectSyn é uma aplicação específica do Ensaio de Ligadura de Proximidade duolink. O ensaio PLA permite a detecção geral de interações proteína-proteína. Detecta as pontes proxy medidas pós-sinápticas amplificando um sinal fluorescente emitido por proteínas pré e pós-sináptica marcadas dentro de 40 nm uma da outra. Se as proteínas sinápticas estiverem dentro de 40 nm, como dentro de uma fenda sináptica, então os anticorpos secundários, que contêm sondas de DNA, hibridizarão em DNA circular. Este DNA circular hibridizado expressa uma sonda fluorescente, que é então amplificada e detectada com técnicas padrão de microscopia fluorescente (ver Figura 1). Crucialmente, ao contrário da em e tomografia de matriz, esta técnica não requer equipamento especializado e leva cerca da mesma quantidade de tempo que a imunohistoquímica padrão. A acessibilidade dessa técnica, assim, permite que pesquisadores fora de instituições intensivas em pesquisa participem de pesquisas sinaptopológicas. Além disso, essa técnica pode examinar alterações na densidade sináptica em múltiplas regiões cerebrais dentro de um único experimento, oferecendo uma representação mais holística de mudanças sinápticas devido a doenças ou tratamento.
O isolamento de células e tecidos de animais foi de acordo com o Guia nacional de Cuidados e Uso de Animais de Laboratório e aprovado pelo Comitê institucional de Cuidados e Uso de Animais da Floresta de Despertar
NOTA: Este protocolo é utilizado em amostras já tratadas e fixas por paradigmas e requisitos experimentais específicos. Para fins de demonstração, a formação de sinapse devido ao tratamento antidepressivo rápido é usada para destacar esta técnica de detecção de sinapse6. Neurônios previamente cultivados em tampas, tratados, fixados em 4% de paraformaldeído (PFA), e armazenados em 1x salina tamponada com fosfato (PBS) serão usados para destacar os procedimentos in vitro. Tecido hipocampal anteriormente fatiado (25 μm de espessura) de camundongos tratados, transcardialmente perfumado com PBS gelado e 4% PFA, e depois armazenado em crioprotetor será usado para destacar os procedimentos de fatia. Consulte11,12 para obter mais informações sobre como cultivar neurônios ou roedores transcárdio perfumados. Consulte a Figura 1 para uma representação gráfica deste procedimento.

Figura 1: Representação gráfica do ensaio DetectSyn. Após a permeabilização das membranas celulares, os anticorpos primários para Synapsin1 e PSD95 se ligam a essas proteínas sinápticas. Secundários com etiquetas de oligonucleotídeos, em seguida, ligam-se aos anticorpos primários. Se Synapsin1 e PSD95 estiverem dentro de 40 nm, como em uma sinapse, então os oligonucleotídeos interagem, e uma tag fluorescente é amplificada. Este sinal fluorescente pode então ser imageado através de microscopia padrão e analisado. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
1. Enxágüe amostras
2. Bloquear e permeabilize amostras
3. Incubar amostras em anticorpos primários
4. Lave amostras e incuba em anticorpos secundários
5. Ligadura
6. Amplificação
7. Montagem
8. Obtenha imagens digitais com um microscópio confocal
9. Análise
Os dados modificados de Heaney et al.6 são apresentados para demonstrar um experimento onde é esperada maior formação de sinapse (consulte6 para obter mais informações e uma discussão mais aprofundada do mecanismo). Anteriormente, foi demonstrado que antidepressivos rápidos requerem ativação do receptor metabotrópico inibidor, GABAB (subtipo B de ácido gama-aminobutírico), para ser eficaz13. Além disso, dados anteriores indicaram que antidepressivos rápidos aumentam os marcadores post-sinápticos14; assim, detectsyn foi utilizado para testar a hipótese de que antidepressivos rápidos aumentam os números de sinapse para serem eficazes.
Em neurônios cultivados, quatro condições são testadas. Primeiro, no painel superior da Figura 2A, os neurônios cultivados foram tratados com o veículo nas mesmas condições do controle experimental. No entanto, o anticorpo primário PSD95 é omitido para fornecer um controle técnico para o ensaio DetectSyn (ver Figura 1 para como cada componente contribui para o sinal). Em seguida, no painel de Controle, os neurônios são novamente tratados com o veículo, mas recebem tanto as primárias PSD95 quanto Synapsin1. Em seguida, os neurônios cultivados são tratados apenas com o antidepressivo rápido Ro-25-6981 (Ro) ou Ro mais o agonista GABAB, baclofen (Bac). Como demonstrado anteriormente13, tanto o antidepressivo rápido Ro-25-6981 quanto o baclofen agonista GABAB são necessários para a eficácia in vitro de Ro-25-6981. Assim, um aumento na formação de sinapse é demonstrado pelo aumento da puncta branca (Figura 2A). Sem baclofen, não é visto aumento na formação de sinapse in vitro .
In vivo, os níveis de GABA basal são suficientes para o antidepressivo rápido funcionar13, por isso apenas o antidepressivo rápido Ro-25-6981 é administrado via injeção intraperitoneal em camundongos (Figura 2B). O painel esquerdo do Fig. 2B representa outro controle técnico para o ensaio DetectSyn. O tecido hipocampal de um rato tratado com soro fisiológico foi sondado com ambas as primárias para PSD95 e Synapsin1, mas um dos secundários foi omitido. Um aumento na formação de sinapse devido ao tratamento com o antidepressivo rápido Ro-25-6981 em comparação com camundongos tratados com soro fisiológico é demonstrado nos painéis médio e direito da Figura 2B.
Imagens representativas para controles técnicos in vitro e ex vivo são mostradas. Na Figura 2A, uma das primárias para os pares sinápticos é omitida (ou seja, PSD95), e na Figura 2B, um dos secundários é omitido. Embora alguns puncta apareçam nas imagens de controle técnico, geralmente não são do mesmo tamanho, como demonstrado pelo grão branco no painel superior da Figura 2A em comparação com o grande puncta nos outros painéis. Além disso, estes puncta não estão no mesmo local que o puncta quantificou, como demonstrado por alguns puncta que aparecem dentro da soma do controle técnico na Figura 2B. Normalmente, puncta não específica ocorrem dentro dos núcleos, talvez devido à presença de DNA.
Para analisar os resultados representativos na Figura 2A, os dendritos (visualizados pela coloração MAP2 e representados aqui em um contorno cinza) foram rastreados utilizando uma ferramenta de desenho à mão livre para criar regiões de interesse (ROIs). Primeiro, a área dos ROIs MAP2 foi obtida utilizando a função NIS Elements, ROI Data na guia Resultados de Medição Automatizada . Em seguida, foram detectados puncta utilizando a função Thresholding em Elementos NIS. Esta função cria uma máscara binária de objetos que se enquadram em um limiar de intensidade definido. Em seguida, o número de objetos binários dentro dos ROIs MAP2 foram detectados usando a função NIS Elements, Binário em ROI, sob a guia Resultados de Medição Automatizada . Os dados apresentados no gráfico à direita da Figura 2A são os valores normalizados da puncta dividido pela área do ROI.
Para analisar os resultados representativos na Figura 2B, o radiador estrato do CA1 foi rastreado utilizando uma ferramenta de desenho à mão livre para criar um ROI. Em primeiro lugar, a área do ROI foi obtida utilizando-se a função de dados do ROI, conforme descrito no parágrafo acima. Em seguida, puncta foram detectados usando a função Spot Detection - Bright Spots , localizada sob o menu Binário . Em seguida, os valores de diâmetro e contraste foram escolhidos com base na inspeção visual de múltiplas fatias de todos os tratamentos. Uma vez decididos esses valores, eles foram aplicados uniformemente em todas as imagens analisadas. A função de detecção de manchas cria máscaras binárias de objetos dentro do conjunto de parâmetros de diâmetro e contraste definidos. Em seguida, o número de objetos binários dentro dos ROIs MAP2 foram detectados usando a função NIS Elements, Binário em ROI, sob a guia Resultados de Medição Automatizada . Os dados apresentados no gráfico à direita da Figura 2B são os valores normalizados da puncta dividido pela área do ROI.

Figura 2: Detecção de sinapses usando o ensaio DetectSyn. Puncta branca representam sinapses detectadas com detectsyn PSD95-Synapsin1 ensaio de ligadura de proximidade (pontas de flecha amarela) em (A) neurônios hipocampais primários in vitro cultivados e (B) ex vivo CA1 estrato radiatum. Em (A), o contorno cinza representa a coloração MAP2. Em (A), o painel superior rotulado de controle PLA representa amostras tratadas apenas com veículo, como o Controle. No entanto, as primárias do PSD95 não foram incluídas na reação. Nos dois últimos painéis, os neurônios foram tratados com o antidepressivo rápido Ro-25-6981 (Ro, 10 μM) ou Ro mais o baclofen agonista GABAB (Bac, 50 μM) por 90 min. O aumento do número de puncta (identificado com pontas de flecha amarela) indica que , in vitro, a formação de sinapse só aumenta quando o antidepressivo rápido Ro-25-6981 é administrado com o agonista GABAB. Em (B), o verde representa dendritos manchados com MAP2, e o azul representa núcleos manchados com DAPI. Dendritos únicos, delineados em retângulos amarelos nas imagens mescladas, são isolados sob imagens representativas para demonstrar que puncta localiza para dendritos. Os animais foram tratados com Ro-25-6981 (10 mg/kg), e o tecido foi coletado 45 min após o tratamento. O aumento do número de punctas (identificados por pontas de flecha amarela) indica que in vivo, o número de sinapses aumenta com a sinalização gaba basal e o antidepressivo rápido Ro-25-6981. A quantificação dos resultados representativos é representada pelos gráficos da barra e indica o número médio de DetectSyn puncta dividido pela área MAP2. Os resultados são normalizados para o controle experimental. As imagens foram obtidas usando um microscópio confocal Nikon A1plus. Barras de escala = (A) 10 μm; (B, superior) 50 μm; (B, inferior) 5 μm. As barras representam o erro médio +/- padrão da média. Resultados analisados pela ANOVA unidirecional: * p < 0,05, ** p < 0,01, *** p < 0,001, **** p < 0,0001 pela análise pós-hoc. O número foi modificado de Heaney et al.6. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não relatam conflito de interesses.
DetectSyn é um ensaio fluorescente rápido e imparcial que mede mudanças no número de sinapse relativa (engajamento pré e pós-sináptico) entre os estados de tratamento ou doença. Esta técnica utiliza uma técnica de ligadura de proximidade que pode ser usada tanto em neurônios cultivados quanto em tecido fixo.
Este trabalho foi apoiado pelos Institutos Nacionais de Saúde NINDS R01 NS105005 (KRG) e NS105005-03S1 (KRG), Departamento de Defesa USAMRMC W81XWH-14-1-0061 (KRG), NIAAA R01AA016852, NIAAA T32AA007565 (CFH), e uma bolsa da FRAXA Research (CFH) e da Associação de Alzheimer, AARG-NTF-21-852843 (KRG), AARF-19-614794-RAPID (KRG).
| 10x PBS | Fisher Scientific | BP39920 | PBS feito em obras domésticas também. |
| Placas de 24 poços | Fisher Scientific | FB012929 | Para fatias de tecido, placas pré-esterilizadas podem ser desnecessárias. |
| Tubos cônicos de 50 mL | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
| Folha de alumínio | Fisher Scientific | 15-078-290 | |
| Anticorpo anti-MAP2 de frango | Abcam | ab5392 | |
| Esmalte transparente | Fisher Scientific | NC1849418 | Outros esmaltes transparentes também funcionam. |
| Bloco frio | Fisher Scientific | 13131012 | |
| Estação de trabalho de computador | HP | ||
| Microscópio confocal ou fluorescente | Nikon | A1R HD25 | |
| Burro anti-frango FITC | Fisher Scientific | SA1-72000 | |
| Duolink burro anti-Mouse PLUS | Sigma | DUO92001 | |
| Duolink burro anti-Coelho MENOS | Reagentes | de detecção in situ Sigma DUO92005 | |
| Duolink Far Red | Sigma | DUO92013 | Contém estoque de ligação, estoque de amplificação, ligase e polimerase. |
| Meio de montagem in situ Duolink com DAPI | Sigma | DUO82040 | |
| Duolink Tampões de lavagem in situ, Sigma de fluorescência | DUO82049 | Contém tampão de lavagem A e tampão de lavagem B; dilua o tampão de lavagem B a 1% em diH20 para tampão de lavagem B a 1%. | |
| Pincel de ponta fina | Fisher Scientific | NC9691026 | Cabelo de zibelina, tamanho 00 ou 000, também pode ser encontrado em lojas de artesanato |
| Fisherbrand Cover Glasses: Retângulos | Fisher Scientific | 12545MP | O vidro de cobertura é desnecessário para neurônios cultivados já em lamínulas de vidro. |
| Lâminas de microscópio Superfrost Plus da marca Fisher | 1255015 | Científica Para neurônios cultivados já em lamínulas de vidro, as lâminas Superfrost podem ser desnecessárias. | |
| Congelador, -20° C | VWR | 76449-108 | |
| Lamínulas de vidro | Fisher Scientific | 125480 | |
| Glicina | Fisher Scientific | BP381-1 | |
| Software de processamento de imagem | , por exemplo, NIS Elements, Incubadora ImageJ | ||
| Fisher Scientific | 15-015-2633 | ||
| Placa de Petri grande, 100 mm | Fisher Scientific | FB0875712 | |
| Água de grau molecular | Fisher Scientific | BP24701 | |
| Mouse anti-Synapsin1 anticorpo | Synaptic Systems | 106-011 | |
| Soro de burro normal | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| Agitador orbital | Fisher Scientific | 02-106-1013 | |
| Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-10 | |
| Ponteiras de Pipeta | Fisher Scientific | 02-707-025 | |
| Pipetas | Fisher Scientific | 14-388-100 | Volumes de trabalho variam de 3 µ L a 500 µ L |
| Pipeta de pasteur de plástico | Fisher Scientific | 02-708-006 | |
| Pinças/foreceps de precisão | Fisher Scientific | 12-000-122 | |
| Anticorpo anti-PSD95 de coelho | Abcam | ab18258 | Outros pares de anticorpos também podem funcionar com otimização. |
| Frigorífico | VWR | 76470-402 | |
| Placa de Petri pequena, 60 mm | Fisher Scientific | FB0875713A | |
| Timer | Fisher Scientific | 14-649-17 | |
| Tween 20 | Fisher Scientific | BP337-100 |