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Research Article
Santos Ramírez-Carreto1, Sandra I. Salazar-García1, Giovanni Macías Martínez1, Claudia Rodríguez-Almazán1,2
1Instituto de Biotecnología,Universidad Nacional Autónoma de México, 2Departamento de Micro y Nanotecnologías,Instituto de Ciencias Aplicadas y Tecnología, Universidad Nacional Autónoma de México
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui, descrevemos um protocolo para obter extrato de veneno bruto da anêmona do mar e detectar sua atividade hemolítica e fosfolipase.
A composição do veneno de anêmona do mar inclui moléculas de polipeptídeos e não-proteínas. Os componentes citólticos têm um alto potencial biotecnológico e biomédico para projetar novas ferramentas moleculares. O veneno de anêmona marinha se localiza em células glandulares a partir de ectoderme e estruturas subcelulares chamadas nematocistos, ambas distribuídas por todo o corpo de anêmona do mar. Essa característica implica desafios porque as células e o nematócito devem ser lícitos para liberar os componentes do veneno com outras moléculas não tóxicas. Portanto, primeiro, o veneno é derivado de um extrato bruto (mistura de moléculas diferentes e diversas e detritos teciduais). O próximo passo é detectar polipeptídeos com bioatividades específicas. Aqui, descrevemos uma estratégia eficiente para obter o extrato bruto de anêmona do mar e bioensaio para identificar a presença de citolises. O primeiro passo envolve técnicas baratas e simples (ciclo agitado e degelo) para liberar citolísinas. Obtivemos a maior atividade citolítica e proteína (~500 mg de proteína a partir de 20 g de peso seco). Em seguida, a complexidade do polipeptídeo do extrato foi analisada pelo gel SDS-PAGE detectando proteínas com pesos moleculares entre 10 kDa e 250 kDa. No ensaio hemollítico, utilizamos glóbulos vermelhos ovelhas e determinamos hu50 (11,1 ± 0,3 μg/mL). Em contraste, a presença de fosfolipases no extrato bruto foi determinada utilizando gema de ovo como substrato em um meio sólido com agarose. No geral, este estudo utiliza um protocolo eficiente e barato para preparar o extrato bruto e aplica bioensações replicáveis para identificar citolysinas, moléculas com interesses biotécnicos e biomédicos.
Animais marinhos são uma rica fonte de compostos biologicamente ativos. Nas últimas décadas, a composição do veneno de anêmona marinha tem atraído atenção científica, pois compreende uma diversidade de polipeptídeos com hemolítica, citotóxica, enzimática (fosfolipase, protease, quitinase) e atividade neurotóxica e efeitos inibitórios na atividade proteolítica1. Além disso, esses polipeptídeos são fontes potenciais para o desenvolvimento de ferramentas moleculares no uso biotecnológico e terapêutico 2,3.
Há poucos relatos sobre o veneno de anêmona marinha e seus componentes moleculares devido à complexidade da obtenção do veneno, até mesmo do isolamento e caracterização de toxinas. Os métodos de extração utilizados nos relatórios envolveram a lise e o esvaziamento do conteúdo das células relacionadas e não relacionadas à produçãode veneno 1.
Uma característica particular em todos os cnidários é a ausência de um sistema de produção e liberação do veneno centralizado em uma única região anatômica. Em vez disso, os nematocistos são estruturas que mantêm o veneno 4,5. Outros tipos de células, chamadas células da glândula epidérmica, também secretam toxinas e também são distribuídas por todo o corpo de anêmonas do mar6.
O primeiro e mais crucial desafio na obtenção do veneno é a geração de um extrato com manipulação suficiente em processos subsequentes, sem a inativação ou degradação de proteínas labile. Em seguida, as células devem ser liseadas, e os componentes - neste caso, os polipeptídeos devem ser extraídos de forma eficiente e rápida, evitando a proteólise e a hidrólise ao eliminar outros componentes celulares7.
Diferentes métodos são utilizados para obter o extrato bruto de uma anêmona marinha; alguns envolvem sacrificar o organismo, enquanto outros permitem que ele seja mantido vivo. Métodos que implicam o uso de todo o corpo do organismo permitem a liberação da maioria das toxinas do veneno8, em comparação com métodos que mantêm os organismos vivos, que extraem apenas alguns componentes do veneno9. A elaboração de um extrato requer avaliar a presença e potência de uma substância de interesse por meio de um bioensaio específico, que inclui estratégias para observar os efeitos farmacológicos pelos métodos in vivo ou in vitro 10.
O veneno de anêmona do mar contém polipeptídeos citólíticos, toxinas formadoras de poros (PFTs)11 e fosfolipases12; essas moléculas são modelos no estudo da interação proteína-lipídica, ferramentas moleculares na terapia do câncer e biosensores à base de nanoporos3. A classificação de PFTs de anêmona marinha é realizada de acordo com seu tamanho ou peso molecular, de 5 kDa a 80 kDa. O PFT de 20 kDa, o mais estudado e conhecido como actinoporinas11, é de particular interesse por seu potencial biomédico no desenvolvimento de ferramentas moleculares para possíveis aplicações como biosensores anticancerígenos, antimicrobianos e à base de nanoporos. Outra citolisina, incluindo fosfolipases, especificamente fosfolipase A2 (PLA2)13, libera um ácido graxo devido e hidrolisa fosfolipídios, desestabilizando a membrana celular. Devido a esse mecanismo de ação, o PLA2 promete ser um modelo essencial para o estudo e aplicações em doenças inflamatórias. Poderia servir de modelo para estudos de comportamento lipídudo na membranacelular 14.
Aqui, descrevemos um protocolo eficiente para a obtenção do extrato bruto da anêmona anthopleura dowii Verrill, 1869, e a detecção de hemolises e fosfolipases. Ambas são toxinas relevantes que poderiam ser usadas como modelo para projetar novas ferramentas moleculares.
As anêmonas do mar foram coletadas de acordo com as diretrizes da Comissão Nacional de Aquicultura, Pesca e Alimentação do Governo Federal do México (número de licença PPF/DGOPTA 07332.250810.4060). O Comitê de Bioética do Instituto de Biotecnologia da Universidade Nacional Autônoma do México aprovou todos os experimentos com anêmonas do mar. A amostra de sangue de ovelha foi adquirida no Centro de Ensino Prático e Pesquisa em Produção e Saúde Animal (CEPIPSA, Universidade Nacional Autônoma do México).
1. Coleta de organismos
2. Hidratação tecidual
3. Liberação de toxinas
4. Quantitação da proteína total
Equação 1
Equação 2
5. Determine a complexidade do veneno de polipeptídeo
6. Coloração de proteínas
7. Prepare a solução de glóbulos vermelhos
Equação 3
Equação 48. Ensaio de hemólise
9. Ensaio de fosfolipase
Os resultados representativos do protocolo utilizado para a obtenção do extrato bruto da anêmona do mar mostraram que a combinação de duas técnicas (agitação e ciclos de congelamento e descongelamento) produziu uma descarga eficiente de nematocistos, e a quantidade total de proteína foi de 500 mg (8 mg/mL) (Figura 3).
A complexidade proteica do extrato bruto poderia ser observada a partir de 10 kDa e maior que 250 kDa através da eletroforese SDS-PAGE. Além disso, citolises foram detectadas na zona de peso molecular de 15 kDa e 20 kDa, uma gama de pesos moleculares que podem corresponder a fosfolipases13 ou actinoporinas3 (Figura 4).
A atividade hemolítica do extrato antes e durante os ciclos de congelamento e descongelamento aumentou até que 100% da hemólise foi atingida com 50 μg da proteína total do extrato bruto nos dois últimos ciclos. A quantidade necessária para lise 50% de ovinos eritrócitos (HU50) é de 11,1 ± 0,3 μg/mL (Figura 5). A atividade de fosfolipase foi detectada pela formação de halos claros nas áreas da placa de ágar, onde a amostra de extrato bruto foi aplicada. Os resultados mostram a presença de atividade fosfolipase a partir de 15 μg de proteína total. O diâmetro do halo aumentou de forma dependente de dose, ou seja, se a quantidade de extrato bruto aumentou, o diâmetro do halo aumentou (Figura 6A e Tabela 4).

Figura 1: Coleção de anêmonas do mar. (A) Zona Intertidal em El Sauzal, Baja California Norte, México. (B) Anêmona marinha coletada. (C) Anthoplerua dowii Verrill, 1869. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Deslizamento do hemacítômetro. (A) No centro de deslizamento, há duas placas de pé prateadas. (B) São contadas células em quadrados com perímetro vermelho. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Descarga de nematocisto. Nematoctost (A) antes e (B) após estímulos. Em B, o túbulo nematocisto é exposto e indica liberação de toxinas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Perfil eletroforético do extrato bruto de anêmona marinha. O extrato bruto de anêmona marinha foi analisado pelo gel de poliacrilamida de 15% da SDS-PAGE e mostrou proteína de 10 kDa a 250 kDa de peso molecular. Pista 1: escada de proteína, faixa 2: veneno de anêmona marinha. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Ensaio de hemólise em eritrócitos de ovelhas. A liberação da hemoglobina foi detectada a 415 nm. Diferente quantidade de proteína foi avaliada para determinar o HU50, equivalente a 11,1 ± 0,3 μg/mL. Ensaios de hemólise foram realizados em triplicado. As barras representam o desvio padrão. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6: Ensaio de Phospholipase. Diferentes quantidades de proteína total foram avaliadas em agarose com gema de ovo na presença de Ca2+. A atividade de fosfolipase pode ser observada em cada poço como uma auréola. Controles: tampão fosfato (Fosf.) e um PLA2 de uma cobra (F.A). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| Tubo | Água destilada | BSA | Corante (μL) | Volume final | |
| (μL) | (μg) | (μL) | (μL) | ||
| 1 | 800 | - | - | 200 | 1000 |
| 2 | 799 | 1 | 1 | 200 | 1000 |
| 3 | 797 | 3 | 3 | 200 | 1000 |
| 4 | 795 | 5 | 5 | 200 | 1000 |
| 5 | 793 | 7 | 7 | 200 | 1000 |
| 6 | 790 | 10 | 10 | 200 | 1000 |
| Extrato bruto (μL) | |||||
| 7 | 798-790 | de 2 a 10 | 200 | 1000 |
Tabela 1: Quantitação de proteína por ensaio de Bradford.
| Solução | Resolvendo gel | Empilhamento de gel |
| Água destilada | 1,1 mL | 1,4 mL |
| Mistura de acrilamida (30%) | 2,5 mL | 0,33 mL |
| Tris (1,5 M, pH 8.8), ajuste pH com HCl. | 1,3 mL | |
| Tris (0,5 M, pH 6.8), ajuste pH com HCl. | 0,25 mL | |
| Sulfato de dodecyl de sódio (SDS) 10% (w/v) | 0,5 mL | 0,1 mL |
| Persulfito de amônio (APS) (10%) | 0,5 mL | 0,1 mL |
| N,N,Nə,Nə-tetrametilenediamina (TEMED) | 0,005 mL | 0,005 mL |
Tabela 2: Soluções para a preparação de um gel de eletroforese SDS-PAGE de 15% acrilamida.
| Poço | Solução de alserver (μL) | Água destilada | Extrato bruto | Solução de eritrócito (μL) | Volume final | Absorvância esperada |
| (μL) | (μL) | (μL) | (415 nm) | |||
| 1 | 180 | - | - | 20 | 200 | ≤0.1 |
| 2 | - | 180 | - | 20 | 200 | ≤1.0 |
| 3 | 177–170 | - | 3–10 | 20 | 200 | 0.1–1.0 |
Tabela 3: Ensaio de hemólise para calibrar eritrócitos.
| Amostra | Diâmetro do halo (mm) |
| 15 μg de F.A | 0 |
| 30 μL de Fosf. | 6.3 ± 0,5 |
| 5 μg | 0 |
| 15 μg | 2.3 ± 0,5 |
| 25 μg | 3.5 ± 0,5 |
| 35 μg | 4.1 ± 1 |
| 45 μg | 4.6 ± 0.8 |
Tabela 4: Diâmetro dos halos em diferentes quantidades de proteína do extrato bruto.
Os autores declaram que não têm interesse em relação à publicação deste artigo.
Aqui, descrevemos um protocolo para obter extrato de veneno bruto da anêmona do mar e detectar sua atividade hemolítica e fosfolipase.
Este trabalho foi apoiado pelo Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), com um número de subvenção IT200819. Os autores reconhecem a Tom Musselman, Edição de Papel de Rock, LLC, por verificar a gramática inglesa deste manuscrito; e assistência técnica de Samanta Jiménez (CICESE, Ensenada) e Juan Manuel Barbosa Castillo (Instituto de Fisiología Celular, UNAM). Agradecemos também ao Dr. Augusto César Lizarazo Chaparro (CEPIPSA) pela obtenção de sangue de ovelha. Agradecemos especialmente ao Dr. José Saniger Blesa, ICAT-UNAM, pelas instalações em seu laboratório para a gravação de vídeo.
| Tubo de centrífuga cônico de 15 mL | Corning | 430766 | |
| azul de 2-bromofenol | Sigma | B75808 | |
| 2-mercaptoetanol | Sigma-Aldrich | M6250-100ML | |
| Tubos de centrífuga cônicos de 50 mL Corning | 430828 | ||
| Ácido Acético Glacial | J.T. Baker | 9515-03 | |
| Acrilamida | Promega | V3115 | |
| Agarose | Promega | V3125 | |
| Bisacrilamida | Promega | V3143 | |
| Soro Bovino Albumina Fração V | Sigma | A3059-100G | |
| Ensaios de Proteína Bradford | Bio-Rad | 5000006 | |
| Cloreto de cálcio | Sigma-Aldrich | C3306 | |
| Placas de cultura celular 96 bem, Centrífuga | Corning | 3894 | com fundo em V |
| Eppendorf | 5804R | ||
| Tubos de centrífuga | Corning | CLS430829 | |
| sistema ChemiDoc MP | Bio-Rad | 1708280 | |
| Ácido cítrico | Sigma-Aldrich | 251275 | |
| Placas transparentes de 96 poços de fundo plano | Thermo Scientific | 3855 | |
| Coomassie Brilliant Blue G-250 | Bio-Rad | #1610406 | |
| Coomassie brilliant blue R-250 | Bio-Rad | 1610400 | |
| Dextrose | J.T. Baker | 1916-01 | |
| Gabinete sem dutos | Labconco | Vertical | https://imagej.nih.gov/ij ImageJ 1.53c |
| Gel Doc EZ | Bio Rad. | Sistema de Documentação de Gel | |
| Glicerol | Sigma-Aldrich | G5516-4L | |
| Hemocitômetro | Marienfeld | 650030 | |
| ImageJ (Software) | NIH, EUA | Versão 1.53c | |
| Incubadora 211 | Labnet | I5211 DS | |
| Metanol | J.T. Baker | 9049-03 | |
| Mini-PROTEAN tetra cell | Bio-Rad | 1658000EDU | |
| Na2HPO4 | J.T. Baker | 3824-01 | |
| NaCl | J.T. Baker | 3624-01 | |
| NaH2PO4. H2O | J.T. Baker | 3818-05 | |
| Software | de origem | versão 9 | Para projetar o gráfico com ajustes sigmoidais |
| Kit Petridish | Falcon | 351007 | |
| Pipetman | Gilson | F167380 | |
| Mini gel pré-moldado | BioRad | 1658004 | |
| Prestained Protein Ladder | Thermo Scientific | 26620 | |
| Coquetel Inibidor de Protease | Roche | 11836153001 | |
| Ensaio de Proteína Reagente Reagente Concentrado | Bio-Rad | 5000006 | |
| Rodamina 6G | Sigma-Aldrich | 252433 | |
| SDS | Sigma-Aldrich | L4509 | |
| Citrato de sódio di-hidratado | JT Baker | 3646-01 | |
| Espectrofotômetro | THERMO SCIENTIFIC | G10S UV-VIS | |
| Tris Base | Sigma-Aldrich | 77-86-1 | |
| Volt Fonte de Alimentação | Hoefer | PS300B |