Os cnidários, incluindo anêmonas do mar, corais e águas-vivas, exibem morfologia e estilos de vida diversos que se manifestam em pólipos sésseis e medusas de natação livre. Como exemplificado em modelos estabelecidos, como Hydra e Nematostella, as células-tronco e/ou células proliferativas contribuem para o desenvolvimento e regeneração de pólipos cnidários. No entanto, os mecanismos celulares subjacentes na maioria das águas-vivas, particularmente no estágio de medusa, são em grande parte obscuros e, portanto, o desenvolvimento de um método robusto para identificar tipos específicos de células é crítico. Este trabalho descreve um protocolo para a visualização de células-tronco proliferantes na água-viva hidrozoária Cladonema pacificum. Cladonema medusae possuem tentáculos ramificados que crescem continuamente e mantêm a capacidade regenerativa durante toda a sua fase adulta, fornecendo uma plataforma única com a qual estudar os mecanismos celulares orquestrados por células proliferantes e / ou semelhantes a troncos. A hibridização in situ fluorescente de montagem completa (FISH) usando um marcador de células-tronco permite a detecção de células-tronco, enquanto a marcação de pulso com 5-etil-2'-desoxiuridina (EdU), um marcador de fase S, permite a identificação de células em proliferação. Combinando a rotulagem FISH e EdU, podemos detectar células-tronco em proliferação ativa em animais fixos, e essa técnica pode ser amplamente aplicada a outros animais, incluindo espécies de águas-vivas não modelo.