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Artigo de método

Vírus pseudotipados como uma ferramenta molecular para monitorar respostas imunes humorais contra SARS-CoV-2 via ensaio de neutralização

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DOI:

10.3791/65658

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21 de novembro de 2023

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* These authors contributed equally

Neste artigo

Resumo

Vírus pseudotipados (PVs) são virions defeituosos de replicação que são usados para estudar interações vírus-hospedeiro em condições mais seguras do que manusear vírus autênticos. Apresentado aqui é um protocolo detalhado que mostra como os PVs SARS-CoV-2 podem ser usados para testar a capacidade de neutralização do soro dos pacientes após a vacinação COVID-19.

Resumo

Vírus pseudotipados (PVs) são ferramentas moleculares que podem ser usadas para estudar interações vírus-hospedeiro e testar a capacidade neutralizante de amostras de soro, além de seu uso mais conhecido em terapia gênica para a entrega de um gene de interesse. Os PVs são defeituosos de replicação porque o genoma viral é dividido em diferentes plasmídeos que não são incorporados aos PVs. Este sistema seguro e versátil permite o uso de PVs em laboratórios de nível 2 de biossegurança. Aqui, apresentamos uma metodologia geral para produzir PVs lentivirais baseada em três plasmídeos como mencionado aqui: (1) o plasmídeo da espinha dorsal que carrega o gene repórter necessário para monitorar a infecção; (2) o plasmídeo de embalagem que carrega os genes de todas as proteínas estruturais necessárias para gerar os PVs; (3) plasmídeo de expressão de glicoproteínas na superfície do envelope que determina o tropismo viral e medeia a entrada viral na célula hospedeira. Neste trabalho, a Spike de SARS-CoV-2 é a glicoproteína do envelope usada para a produção de lentivírus pseudotipados SARS-CoV-2 não replicativos.

Resumidamente, as células de embalagem (HEK293T) foram co-transfectadas com os três diferentes plasmídeos usando métodos padrão. Após 48 h, o sobrenadante contendo as VVPP foi colhido, filtrado e armazenado a -80 °C. A infectividade dos PVs SARS-CoV-2 foi testada estudando a expressão do gene repórter (luciferase) em uma linhagem celular alvo 48 h após a infecção. Quanto maior o valor das unidades de luminescência relativa (RLUs), maior a taxa de infecção/transdução. Além disso, os PVs infecciosos foram adicionados às amostras de soro diluídas em série para estudar o processo de neutralização da entrada de pseudovírus nas células-alvo, medido como a redução na intensidade da RLU: valores mais baixos correspondentes à alta atividade neutralizante.

Introdução

Vírus pseudotipados (PVs) são ferramentas moleculares utilizadas em microbiologia para estudar interações vírus-hospedeiro e patógeno-patógeno 1,2,3,4. Os PVs consistem em uma parte interna, o núcleo viral que protege o genoma viral, e uma parte externa, as glicoproteínas do envelope na superfície do vírus que definem o tropismo5. Um pseudovírus é incompetente em replicação na célula-alvo porque não contém toda a informação genética para gerar novas partículas virais. Essa combinação de características peculiares torn....

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Protocolo

O presente protocolo foi aprovado e segue as diretrizes do Comitê de Ética da Universidade de Verona (protocolo de aprovação número 1538). Consentimento informado por escrito foi obtido dos sujeitos humanos participantes do estudo. Amostras de sangue total foram coletadas de voluntários de profissionais de saúde que estavam no processo de receber vacinas anti-SARS-CoV-2. Essas amostras foram coletadas em tubos plásticos contendo anticoagulantes para posterior isolamento do soro15.

Todos os processos a seguir devem ser realizados em uma capa biológica Classe 2, trabalhando em condições estéreis. O manuseio do vírus de....

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Resultados

Este protocolo descreve a produção de PVs SARS-CoV-2 e uma aplicação a jusante destes PVs para analisar a actividade da neutralização do soro/plasma dos indivíduos que recebem a vacinação anti-COVID-1917. Além disso, este protocolo pode ser aplicado para produzir pseudotipos de cada variante de preocupação SARS-CoV-2 (VOC) para testar a evolução da resposta neutralizante. Apesar desse protocolo facilitar o estudo da resposta imune humoral após a vacinação contra a COVID-19, ele pode ser adaptado p.......

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Discussão

Embora o uso de um vírus selvagem simule a infecção real, os PVs lentivirais são uma opção mais segura para estudar os mecanismos associados à entrada e infecção viral sem os rígidos requisitos de segurança necessários para trabalhar com vírus patogênicos 4,20,21. Os PVs são compostos por um núcleo viral defeituoso de replicação circundado pela glicoproteína do envelope de superfície de um vírus patogênico, que é o objetivo do e.......

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Divulgações

Os autores declaram não haver conflitos de interesse.

Agradecimentos

Reconhecemos a contribuição dos profissionais de saúde voluntários. Este projeto foi apoiado pelo Departamento de Excelência 2023/2027, MUR, Itália. A AR e a DZ foram apoiadas pela PRIN2022 (fundos da UE; NextGenerationEU)

....

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
0,45 μ filtro mSARSTEDT83 1826
placa de 6 poçosSARSTEDT83 3920
placa de 96 poçosSARSTEDT8,33,924
Unidades de Filtro Centrífugo Amicon Ultra-15Merck10403892
Preto Opaco Microplaca de 96 poçosPerkin Elmer 60005270
Dulbecco's Modified Eagle Medium SIGMA-ALDRICHD6546 - 500ML
Solução salina tamponada com fosfato de Dulbecco (PBS 1x)AUROGENEAU-L0615-500
Soro fetal bovinoAUROGENEAU-S1810-500
Graphpad Prism versão 7graphpad dotmaticsNANo manuscrito, substituímos o nome comercial por 'programa de análise de dados'HEK293T
célulasATCCCélulas CRL-3216
HEK293T/ACE2ATCCCRL-3216HEK293T foi transduzido para superexpressar ACE2 com um vetor lentiviral.
L-glutamina AUROGENEAU-X0550-100
Luminômetro - Victor3Perkin ElmerHH35000500No manuscrito, substituímos o nome comercial por  'luminômetro' 
Opti-MEMThermo Fisher Scientific11058021No manuscrito, substituímos o nome comercial por 'meio de soro reduzido' 
p8.91 plasmídeo de embalagemDi Genova et al., 2021Um gentil presente do Prof. Nigel Temperton (ref 16.)
plasmídeo repórter pCSFLWDi Genova et al., 2021Um gentil presente do Prof. Nigel Temperton (ref 16.)
Penicilina/estreptomicinaAUROGENEAU-L0022-100
Polietilenimina ramificada (PEI) (25 kDa)SIGMA-ALDRICH408727
RRL.sin.cPPT.SFFV/Ace2.IRES-puro.WPRE (MT126)Addgene145839Este plasmídeo foi usado para gerar HEK293Tcells/ACE2
SARS-CoV-2 Spike expressando plasmídeoAddgenepGBW-m4137382
steadylite plus Sistema de ensaio de gene repórterPerkin Elmer6066759No manuscrito, substituímos o nome comercial por 'reagente de leitura de luciferase'Tripsina
EDTA 1xAUROGENEAU-L0949-100

Referências

  1. Ozaki, D. A., et al. International technology transfer of a GCLP-compliant HIV-1 neutralizing antibody assay for human clinical trials. Plos One. 7 (1), e30963(2012).
  2. Pouget, M., et al.

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Reimpressões e permissões

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