Um método de co-registro de imagens multimodais que não requer marcadores fiduciais para varreduras de produção é apresentado. A abordagem baseada em fantasmas gera uma transformação diferencial entre os sistemas de coordenadas de duas modalidades de imagem.
Resíduo de fusão e validação da transformação diferencial
Ao calcular a transformação diferencial, o software exibe um resíduo de fusão em milímetros, representando a raiz quadrada média do erro19 da transformação. Se esse resíduo exceder a ordem de magnitude do tamanho do voxel, é aconselhável inspecionar os conjuntos de dados em busca de problemas gerais. No entanto, como todas as imagens têm pequenas distorções, o resíduo não pode se tornar arbitrariamente pequeno; reflete apenas o ajuste dos marcadores usados. Por exemplo, um co-registro com três marcadores pode resultar em um resíduo menor nos mesmos conjuntos de dados do que uma transformação com quatro marcadores bem distribuídos. Isso ocorre porque os próprios marcadores podem ser sobreajustados quando menos fiduciais são empregados. A precisão em todo o conjunto de dados melhora com um número maior de marcadores.
A precisão quantitativa do método depende do par específico de dispositivos utilizados. A transformação diferencial calculada entre os sistemas de coordenadas de dois dispositivos pode ser validada seguindo estas etapas: Aderindo à etapa 4 do protocolo, mas usando o simulador com marcadores fiduciais como "amostra" novamente. Colocar o simulador em qualquer posição, garantindo que seja diferente daquele usado para estimar a transformação diferencial. Também é possível usar um simulador diferente adequado para as respectivas modalidades, se houver um disponível. Em seguida, aplicando a transformação diferencial determinada anteriormente (etapa 4.2.5) para alinhar as duas modalidades. Em seguida, colocando marcadores nas imagens de ambas as modalidades conforme etapa 3.2 do protocolo. Para calcular o resíduo de fusão para esses marcadores, clique no menu Fusão > Registrar sobreposição para subjacência > Mostrando pontuação residual.
O erro residual descreve o deslocamento médio do sinal e deve estar na ordem do tamanho do voxel. Os limiares de aceitação do concreto dependem da aplicação e podem depender de vários fatores, como a rigidez e a precisão dos sistemas de imagem, mas também podem ser afetados por artefatos de reconstrução de imagem.
Solução de problemas de autoconsistência
Muitas vezes, as dificuldades com a autoconsistência surgem de uma colocação não confiável. Um erro comum é colocar o transportador em uma posição invertida lateralmente. Idealmente, ele deve ser inserido mecanicamente no dispositivo de imagem em apenas uma direção. Se isso não for viável, marcações compreensíveis devem ser adicionadas para o usuário. Outro problema frequente é a possibilidade de movimento no eixo longitudinal, tornando o posicionamento axial pouco confiável. Recomenda-se o uso de um espaçador que possa ser fixado em uma extremidade para prender a cama do mouse no lugar. Espaçadores personalizados podem, por exemplo, ser criados de forma rápida e fácil imprimindo-os em 3D. No entanto, alguns dispositivos não podem fornecer autoconsistência com campos de visão variados. Nesses casos, é aconselhável entrar em contato com o fornecedor, que deve confirmar a incompatibilidade e potencialmente resolvê-la em uma atualização futura. Caso contrário, o método permanece confiável se um campo de visão idêntico for mantido para todas as varreduras, incluindo calibração e imagens de produção.
Para algumas digitalizações de produção com posicionamento desviante, a transformação para a posição calibrada é possível, se for discernível uma estrutura de suporte suficiente. Para imagens in vivo , o animal sedado deve permanecer em um portador, e a construção de um único portador que se encaixe com segurança em ambos os dispositivos nem sempre é possível. Freqüentemente, uma cama de camundongo para uma modalidade baseada em traçador é usada e, em seguida, a colocação é improvisada em um dispositivo de TC. Por exemplo, na Figura 5A, uma cama de camundongo MPI foi colocada em cima de uma cama de camundongo TC devido a restrições mecânicas. A margem de manobra axial e a possibilidade de rolamento tornam esse posicionamento pouco confiável. Nesses casos, é recomendável projetar um adaptador que substitua a cama inferior do mouse e permita um ajuste de intertravamento. Pode, por exemplo, usar munhões presos à parte inferior e orifícios adicionais na parte inferior da cama superior do rato.
No entanto, a correção retrospectiva para imagens existentes é possível, pois o leito do camundongo é detectável na imagem de TC. O protocolo requer varreduras de calibração, seguidas pelo cálculo de uma transformação diferencial da sobreposição para a base. O procedimento é semelhante, mas também deve mapear cada tomografia computadorizada de produção individual para a varredura de calibração, usando as estruturas da cama do mouse como fiduciais.

Figura 5: Solução de problemas de colocação. (A) Uma cama de mouse MPI é colocada em cima de uma cama de mouse CT. Portanto, a posição na TC não pode ser reproduzida de forma confiável. A autoconsistência pode ser alcançada fundindo cada imagem de TC com a imagem de TC de referência usada para estimar a transformação diferencial. (BD) Simplificado para 2D. (B) Cada imagem de TC de produção é carregada como uma sobreposição e registrada na imagem de TC de referência (underlay) usando estruturas da cama do mouse visíveis na TC. A imagem de TC de produção corrigida agora é consistente com a TC de referência e pode ser usada com a transformação diferencial T. (C) Uma sobreposição de MPI é registrada na imagem de TC de referência usando os marcadores fiduciais de um fantasma. (D) As imagens multimodais são montadas. Para isso, cada imagem de TC é mapeada para a posição de referência com sua transformação diferencial individual. Posteriormente, a sobreposição de MPI também é registrada na posição de referência usando a transformação diferencial, que é válida para todas as imagens do dispositivo. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Para mapear as tomografias computadorizadas de produção para a varredura de calibração, consulte a seção 3 do protocolo, incorporando as seguintes modificações. Para maior clareza, a descrição continua usando o exemplo de uma base de TC e sobreposição de MPI: Na etapa 3.1, carregue a varredura de calibração de TC (imagem A) como a base e a TC a ser corrigida como a sobreposição. Utilize as estruturas da cama do mouse MPI como marcadores para a etapa 3.2 ou como referências visuais para a etapa 3.3. Ignore a etapa 3.4, mas salve a sobreposição representa o volume de CT corrigido (Arquivo de menu > sobreposição > Salvando sobreposição como). Na caixa de diálogo subsequente, insira um novo nome e clique em salvar. Feche a sobreposição navegando até Arquivo de menu > Sobreposição > Sobreposição de fechamento. Carregue a próxima tomografia computadorizada que requer correção como sobreposição e retome o procedimento a partir da etapa 3.2 do protocolo. O conceito subjacente a esta etapa é ilustrado na Figura 5B.
A cama do mouse agora está virtualmente alinhada de forma idêntica à varredura de calibração em todos os volumes de TC salvos recentemente. Como parte do procedimento padrão, a varredura de calibração é registrada nas imagens MPI usando a transformação diferencial T (Figura 5C). Para posteriormente mesclar a imagem da TC com o MPI, sempre use o volume da TC corrigido (Figura 5D).
Solução de problemas de imagens invertidas e dimensionamento
O método de registro apresentado aqui pressupõe uma qualidade de imagem razoavelmente precisa e apenas ajusta a rotação e a translação. Ele não corrige imagens invertidas ou dimensionamento incorreto. No entanto, esses dois problemas podem ser resolvidos manualmente antes de calcular a transformação diferencial.
Inconsistências entre formatos de dados de diferentes fabricantes podem fazer com que alguns conjuntos de dados, particularmente aqueles no formato DICOM, sejam exibidos como espelho invertido no software. Como os fantasmas e as camas de camundongos costumam ser simétricos, esse problema pode não ser imediatamente aparente. A detecção de imagens invertidas é mais fácil quando a varredura contém letras reconhecíveis na respectiva modalidade, como as letras em relevo na orientação correta vistas no simulador na Figura 3H. No exemplo ilustrado na Figura 6, os dados de TC são carregados como a subjacência e os dados MPI são carregados como a sobreposição. É uma varredura in vivo de um camundongo colocado em uma cama de camundongo MPI com marcadores fiduciais anexados. A cama do mouse MPI está situada em cima de uma cama de mouse μCT (Figura 6A). Ao aderir ao protocolo e marcar os fiduciais tanto na base quanto na sobreposição em uma direção consistente de rotação, um resultado visivelmente incongruente é produzido (Figura 6B). Após uma inspeção mais detalhada, no entanto, o problema pode ser identificado. Os fiduciais formam um triângulo assimétrico. Observando os lados do triângulo na vista axial (Figura 6C, D) do mais curto para o médio para o mais longo, uma rotação no sentido horário é evidente nos dados de TC, enquanto uma rotação no sentido anti-horário é aparente nos dados de MPI. Isso demonstra que uma das imagens está invertida lateralmente. Nesse caso, assumimos que os dados da TC são precisos. Para retificar a sobreposição de MPI, a imagem é invertida: para fazer isso, mude a camada selecionada para sobreposição e clique no Menu Editar > Inverter > Inverter X. A transformação diferencial calculada pelo software abrange todas as rotações necessárias, portanto, "Flip X" é suficiente mesmo que a imagem apareça invertida em outra direção.

Figura 6: Solução de problemas de transformação. Os dados de TC são carregados como underlay com um tamanho de voxel de 0,240 mm e os dados MPI como sobreposição com um tamanho de voxel de 0,249 mm. A cama do rato contém marcadores fiduciais. (A) Visualização 3D da imagem de sobreposição não corrigida. Os fiduciais na base do TC são indicados por setas. Os fiduciais na sobreposição MPI são visíveis como esferas na tabela de cores do NIH. (B) Resultado incompatível de uma transformação realizada sem correções apropriadas. Resíduo de fusão = 6,94 mm. (C) Medição das distâncias entre os fiduciais em CT. Rotação no sentido horário da menor para a maior distância. (D) Medição das distâncias entre os fiduciais no MPI. Rotação no sentido anti-horário da distância mais curta para a mais longa. A comparação com as medidas de TC resulta em um fator de escala de 0,928774. (E) Sobreposição corrigida após inversão e dimensionamento. (F) Transformação com resultados correspondentes na visualização 3D. (G) Transformação com resultados correspondentes na vista axial. Resíduo de fusão = 0,528 mm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Conjuntos de dados com tamanhos de voxel incorretos também podem ser corrigidos manualmente. Como as dimensões do simulador devem ser conhecidas, isso pode ser verificado na imagem. O método mais simples é usar uma aresta de comprimento conhecido. Pressione [Ctrl + botão direito do mouse] em uma extremidade de uma borda e, enquanto mantém o botão pressionado, mova o ponteiro do mouse para a outra extremidade da borda e solte o botão. Na caixa de diálogo subsequente, o software exibe o comprimento da distância medida na imagem. No exemplo ilustrado na Figura 6, é evidente que os tamanhos não são congruentes ao comparar as distâncias entre os fiduciais em ambas as modalidades (Figura 6C,D). Novamente, os dados do TC são considerados precisos. Para modificar o dimensionamento, um fator de escala (SF) é calculado. Como a razão dos comprimentos (CT/MPI) não é precisamente idêntica para cada lado do triângulo, o quociente médio é calculado: SF = ((l1CT/l1MPI) + (l2CT/l2MPI) + (l2CT/l2MPI)) / 3.
Em seguida, ajuste o tamanho do voxel da sobreposição multiplicando cada dimensão por SF. Para conseguir isso, alterne a camada selecionada para sobreposição e abra o Menu Editar > Alterar tamanhos de voxel. Calcule cada dimensão, insira o valor e clique em OK. O resultado de ambas as correções é mostrado na Figura 6E. Depois disso, a sobreposição é registrada na subjacência de acordo com o protocolo. O alinhamento resultante é exibido na Figura 6F,G. Embora isso forneça uma solução rápida para corrigir uma varredura existente, recomendamos calibrar o dispositivo de imagem para uso em produção.
Limitações
Este método é limitado ao co-registro espacial de dados volumétricos existentes compostos por voxels em forma de cubo. Não inclui um processo de reconstrução que calcula o volume a partir de dados brutos gerados pelo dispositivo de imagem (por exemplo, projeções na TC). Várias técnicas de aprimoramento de imagem estão associadas a essa etapa, como métodos iterativos20,21 e a aplicação de inteligência artificial21. Embora o método descrito seja, em princípio, aplicável a todas as modalidades que produzem imagens 3D com voxels em forma de cubo, ele não pode ser empregado para fundir dados 3D com dados 2D, como um volume de ressonância magnética combinado com termografia infravermelha2D 22 ou imagem de fluorescência, que pode ser relevante em aplicações de cirurgia guiada por imagem. O registro de dados 3D não corrige distorções, como as que ocorrem em imagens de ressonância magnética na borda da bobina. Embora não seja obrigatório, os melhores resultados são alcançados quando as distorções são corrigidas durante o processo de reconstrução. A transformação automatizada também não aborda imagens invertidas ou dimensionamento incorreto. No entanto, esses dois problemas podem ser resolvidos manualmente, conforme descrito na seção de solução de problemas.
Significado do método
O método proposto elimina a necessidade de marcadores fiduciais em varreduras de produção, oferecendo várias vantagens. Beneficia modalidades para as quais é necessária manutenção de marcadores ou substituição frequente. Por exemplo, a maioria dos marcadores de ressonância magnética é baseada na umidade, mas tende a secar com o tempo, e os marcadores radioativos de PET decaem. Ao eliminar a necessidade de fiduciais nas digitalizações de produção, o campo de visão pode ser reduzido, levando a tempos de aquisição mais curtos. Isso é útil em ambientes de alto rendimento para reduzir custos e minimizar a dose de raios-x na tomografia computadorizada. Uma dose reduzida é desejável porque a radiação pode afetar as vias biológicas dos animais de teste em estudos de imagem longitudinais23.
Além disso, o método não se limita a modalidades específicas. A desvantagem dessa versatilidade é que menos etapas são automatizadas. Um método publicado anteriormente para fundir dados μCT e FMT emprega marcadores embutidos em uma cama de mouse para cada varredura e pode realizar detecção automatizada de marcadores e correção de distorção durante a reconstrução24. Outros métodos eliminam a necessidade de marcadores utilizando similaridade de imagem. Embora essa abordagem produza bons resultados e também possa corrigir distorções25, ela só é aplicável se as duas modalidades fornecerem imagens semelhantes o suficiente. Este geralmente não é o caso na combinação de uma modalidade anatomicamente detalhada e uma modalidade baseada em traçador. No entanto, essas combinações são necessárias para avaliar a farmacocinética de agentes direcionados26, que têm aplicações em áreas como a nanoterapia anticâncer27,28.
Como o controle de qualidade é menos rigoroso em aplicações pré-clínicas em comparação com aplicações clínicas, o desalinhamento de dispositivos de imagem combinados é um problema reconhecido29. Os dados afetados por esse desalinhamento podem ser melhorados retrospectivamente digitalizando um simulador e determinando a transformação diferencial, potencialmente reduzindo custos e minimizando danos aos animais. Além do método demonstrado que emprega marcadores fiduciais para calcular uma transformação diferencial, que é então aplicada a varreduras de produção, outras possibilidades de fusão de imagens são descritas e usadas. Uma visão geral, que inclui referências a vários softwares disponíveis, pode ser encontrada em Birkfellner et al.30.
Em conclusão, o método apresentado oferece uma solução eficaz para o co-registro de imagens multimodais. O protocolo é prontamente adaptável para várias modalidades de imagem, e as técnicas de solução de problemas fornecidas aumentam a robustez do método contra problemas típicos.