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Artigo de método

Hibridização da Reação em Cadeia de RNA Fluorescência de Monte Inteiro Hibridização in situ de Genes Quimiossensoriais em Apêndices Olfativos de Mosquitos

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DOI:

10.3791/65933

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17 de novembro de 2023

 , 

Neste artigo

Resumo

O artigo descreve os métodos e reagentes necessários para realizar a hibridização em cadeia de reação em cadeia de hibridização por fluorescência completa de RNA (HCR, RNA, WM-FISH) para revelar informações sobre a resolução espacial e celular de genes de receptores quimiossensoriais na antena do mosquito e palpo maxilar.

Resumo

Os mosquitos são vetores eficazes de doenças mortais e podem navegar em seu ambiente químico usando receptores quimiossensoriais expressos em seus apêndices olfativos. Compreender como os receptores quimiossensoriais estão organizados espacialmente nos apêndices olfativos periféricos pode oferecer insights sobre como o odor é codificado no sistema olfatório do mosquito e informar novas maneiras de combater a disseminação de doenças transmitidas por mosquitos. O surgimento da hibridização de terceira geração de reação em cadeia de RNA, hibridação in situ de montagem total de RNA (HCR, RNA, WM-FISH) permite o mapeamento espacial e o perfil de expressão simultânea de múltiplos genes quimiossensoriais. Aqui, descrevemos uma abordagem passo a passo para a realização do HCR RNA WM-FISH na antena do mosquito Anopheles e palpo maxilar. Investigamos a sensibilidade desta técnica examinando o perfil de expressão dos receptores olfatórios ionotrópicos. Perguntamos se a técnica de HCR WM-FISH descrita era adequada para estudos multiplexados por meio da ligação de sondas de RNA a três fluoróforos espectralmente distintos. Os resultados forneceram evidências de que o HCR RNA WM-FISH é robustamente sensível para detectar simultaneamente múltiplos genes quimiossensoriais na antena e apêndices olfativos palpos maxilares. Investigações posteriores atestam a adequação do HCR WM-FISH para o perfil de co-expressão de alvos de RNA duplo e triplo. Esta técnica, quando aplicada com modificações, pode ser adaptável para localizar genes de interesse nos tecidos olfativos de outras espécies de insetos ou em outros apêndices.

Introdução

Mosquitos vetores como Anopheles gambiae dependem de um rico repertório de genes quimiossensoriais expressos em seus apêndices olfativos periféricos para prosperar em um mundo químico complexo e identificar odores comportamentalmente relevantes emanados de hospedeiros humanos, detectar fontes de néctar e localizar sítios de oviposição1. A antena do mosquito e o palpo maxilar são enriquecidos com genes quimiossensoriais que conduzem a detecção de odor nesses apêndices olfativos. Três classes principais de canais iônicos ligados a ligantes conduzem a detecção de odor nos apêndices olfativos de mosquitos: os receptores odorantes (ORs), qu....

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Protocolo

1. Considerações e preparação dos materiais

  1. Decida se a montagem completa ou a criossecção do tecido serão apropriadas. Este protocolo é otimizado para imagens in situ de RNA na antena do mosquito Anopheles e palpo maxilar sem criossecção. Se as amostras tiverem espessura superior a 5 mm, recomenda-se a criossecção para permitir a penetração da sonda.
  2. Identifique os genes de interesse e copie as sequências, incluindo íntrons e éxons de um banco de dados adequado. Transcreva a sequência gênica em RNA para síntese.
  3. Determine se as sondas devem ser compradas de fornecedores comerciais ou se as sondas serão ....

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Resultados

Detecção robusta de genes quimiossensoriais em antena de anofelinos
Investigamos a sensibilidade do método HCR FISH (Figura 1) para detectar a expressão de receptores quimiossensoriais em tecidos olfativos de mosquitos. Guiados pelos dados de transcrição de RNA relatados anteriormente na antena fêmea do mosquito Anopheles, geramos sondas para atingir uma variedade de IRs. Os valores médios de transcrição de quatro estudos independentes de transcriptoma a.......

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Discussão

A terceira geração da reação em cadeia de hibridização (HCR) é notável por sua sensibilidade e robustez para visualizar vários alvos deRNA8. O HCR WM-FISH tem sido utilizado com sucesso em embriões de Drosophila, galinhas, camundongos e zebrafish, bem como em larvas de nematoides e zebrafish 10,16,17. Antenas de mosquito e palpos maxilares são tipicamente propensos a alta autofluorescência e frac.......

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Divulgações

Os autores não têm nada a revelar.

Agradecimentos

Agradecemos a Margo Herre e ao laboratório Leslie Vosshall por compartilharem seu protocolo de hibridização in situ para apêndices olfativos do Aedes aegypti . Este trabalho foi apoiado por subsídios dos Institutos Nacionais de Saúde para C.J.P. (NIAID R01Al137078), uma bolsa HHMI Hanna Gray para J.I.R, um Johns Hopkins Postdoctoral Accelerator Award para J.I.R, e uma bolsa de pós-doutorado do Johns Hopkins Malaria Research Institute para J.I.R. Agradecemos ao Johns Hopkins Malaria Research Institute e à Bloomberg Philanthropies pelo apoio.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Tampão de amplificaçãoMolecular InstrumentsMolecular Instruments, Inc. | Hibridização In Situ + Imunofluorescência50 mL
Cloreto de Cálcio (CaCl2) 1M Sigma-Aldrich 21115-100ML
ChitinaseSigma-AldrichC6137-50UN
QuimotripsinaSigma-AldrichCHY5S-10VL 
Dimetilsulfóxido (DMSO)Sigma-Aldrich472301
Eppendorf tuboVWR20901-5511.5 mL
FórcepsDumont11251Número 5
Ponta de carregamento de gelCostar48531-200 µ Ponta L
Grampos de cabelo InstrumentosMoleculares Instrumentos Moleculares, Inc. | Hibridização In Situ + Imunofluorescênciah1 e h2 iniciador divide HEPES
(1M)Sigma-AldrichH0887
IR25a sondaMolecular InstrumentsConjunto de Sondas ID: PRK149 AGAP010272
Sonda IR41t.1Molecular Instruments  ID do conjunto de sondas: PRK978AGAP004432
sonda IR64aMolecular InstrumentsID do conjunto de sondas: PRK700 AGAP004923
Sonda IR75dMolecular InstrumentsID do conjunto de sondas: PRK976AGAP004969
Sonda IR76bMolecular InstrumentsID do conjunto de sondas: PRI998AGAP011968
Sonda IR7tMolecular InstrumentsID do conjunto de sondas: PRL355AGAP002763
Sonda IR8aMolecular InstrumentsID do conjunto de sondas: PRK150AGAP010411
LoBind TubesVWR80077-2360.5 mL DNA/RNA LoBind Tubos Cloreto de
Magnessium (MgCl2) 1MThermo FisherAM9530G
MetanolFisher A412-500
Água livre de nucleaseThermo Fisher43-879-36
NutatorDenville ScientificModelo 1353-D Mini rocker
Sonda OrcoInstrumentos MolecularesConjunto de sondas ID PRD954AGAP002560
Paraformaldeído (20%) Serviços deMicroscopia Eletrônica 15713-S
Phosphate Buffered Saline (10X PBS)Thermo FisherAM9625
Sonda de hibridização MolecularInstrumentshttps://www.molecularinstruments.com/50 mL
Buffer de lavagem da sondaMolecular InstrumentsMolecular Instruments, Inc. | Hibridização In Situ + Imunofluorescência100 mL
Proteinase-KThermo FisherAM2548
Salino-Citrato de Sódio (SSC) 20x Thermo Fisher15-557-044
Diamante SlowFade ThermoFisher Solução de montagemS36972
Cloreto de Sódio (NaCl) 5MInvitrogenAM9760G
Triton X-100  (10%)Sigma-Aldrich 93443
Tween-20 (10%)TeknovaT0027
Vidro de relógioCarolina742300  1 5/8" quadrado; transparente

Referências

  1. Konopka, J. K., et al. Olfaction in Anopheles mosquitoes. Chem Senses. 46, (2021).
  2. Raji, J. I., Potter, C. J. Chemosensory ionotropic receptors in human host-seeking mosquitoes. Curr Opin Insect Sci. 54, 100967(2022).
  3. Young, A. P., Jackson, D. J., Wyeth, R. C.

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Reimpressões e permissões

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