A via de processamento semiautomatizada descrita neste protocolo permite o processamento eficiente e a criopreservação de espermatozoides de coral para garantir a genética de espécies ameaçadas e apoiar os esforços de restauração e adaptação de recifes. A motivação para o desenvolvimento deste protocolo foi a falta de sistemas existentes adequados aos requisitos de rendimento da criopreservação de espermatozóides de coral e ao uso de criogeniais, uma vez que os sistemas de processamento de alto rendimento para criopreservação de espermatozóides são normalmente baseados em embalagens de amostras em canudos franceses de 0,25 mL ou 0,5 mL21,22. Em comparação, os criogeniais são geralmente usados em pequena escala para processamento de baixo rendimento (por exemplo, criopreservação de amostras de laboratório para pesquisa23,24) ou em sistemas de processamento de alto rendimento para amostras a granel usando equipamentos caros e não portáteis (por exemplo, processamento de cultura de células para a indústria18,25). Também investigamos o potencial de uso de um sistema de decapagem automática para agilizar a remoção e substituição de tampas criogeniais, mas os sistemas estavam disponíveis apenas para criogeniais individuais ou para racks crioviais inteiros, portanto, não forneciam uma solução econômica. Atualmente, existem vários grupos em todo o mundo que estão usando o protocolo de criopreservação desenvolvido por Hagedorn et al.4 para garantir a diversidade genética dos corais, e é importante que esse trabalho continue a se expandir para mais recifes ao redor do mundo. Portanto, uma consideração importante no desenvolvimento do protocolo atual foi a necessidade de utilizar tecnologias econômicas e acessíveis que pudessem ser prontamente implementadas por esses outros grupos e que não fossem proibitivas em termos de custo para novos grupos que desejam iniciar a criopreservação de espermatozóides de coral.
Um componente-chave do protocolo descrito é o manuseio aprimorado de metadados de amostra por meio de planilhas vinculadas no Microsoft Excel. A entrada de dados geralmente é direta, mas deve-se observar que a edição de informações nas planilhas de dados automáticas só deve ser feita excluindo e reinserindo informações, pois funções rápidas (por exemplo, Ctrl + C, Ctrl + V) para editar dados afetarão potencialmente as entradas simultâneas de outros usuários e podem causar problemas com a vinculação de dados entre planilhas. Um componente de metadados importante é um identificador exclusivo (ou seja, ID da colônia) que está vinculado à colônia doadora e que é anexado à amostra em todos os estágios da via de processamento. É essencial que os tubos de amostra sejam claramente rotulados com o ID da colônia no momento da coleta do pacote e que essas informações sejam transcritas com precisão em quaisquer novos tubos para os quais a amostra seja transferida durante a preparação (por exemplo, durante a filtragem para separar óvulos e espermatozóides ou para adição de criodiluente). Embora o protocolo permita a transferência automática de informações de qualidade da amostra do operador CASA para a estação de trabalho de criopreservação, podem ser encontrados problemas quando a cobertura de internet ou Wi-Fi é ruim. Se forem encontrados atrasos na transferência de dados, é recomendável que as duas estações de trabalho trabalhem offline e mantenham folhas de dados automáticas separadas que possam ser reconciliadas posteriormente. As principais informações exigidas pelo operador de criopreservação são o ID da colônia e a concentração da amostra, portanto, é recomendável que o operador CASA escreva a concentração da amostra no tubo de amostra como um backup para garantir que essas informações estejam disponíveis para a preparação da criopreservação se houver um atraso no upload ou download de metadados entre computadores.
A escolha do leitor de código de barras e dos criogeniais com código de barras usados para este protocolo pode ser variada para se adequar ao orçamento e à disponibilidade do produto; No entanto, existem alguns elementos-chave que devem ser considerados em sua seleção. O leitor de código de barras deve ter a capacidade de configurações personalizadas, especificamente a capacidade de alterar as especificações de entrada de dados e a direção da entrada de dados. As folhas de dados automáticas usadas para este protocolo usam entrada horizontal, mas em algumas ocasiões (por exemplo, acesso ao biobanco ou para outros usos laboratoriais) a entrada vertical pode ser necessária, por isso é importante que esse recurso seja personalizável. Embora o protocolo possa ser usado com códigos de barras 1D e 2D, recomenda-se que os criotubos selecionados tenham um componente legível por humanos (por exemplo, os códigos de barras 1D normalmente incluem um número exclusivo) para permitir a verificação cruzada da entrada da amostra durante a criopreservação. Além da entrada de amostras, o leitor de código de barras pode ser usado para automatizar a entrada de alguns campos de metadados, criando e imprimindo códigos QR para informações repetidas nas amostras (por exemplo, nomes de espécies, datas e locais de recifes) antes da desova. Essas informações podem ser inseridas de forma rápida e fácil nas folhas de dados automáticas, digitalizando com o leitor de código de barras. Além disso, ao anexar códigos de barras de número de série a cada rack criogênico e sonda de termopar, também é possível vincular cada execução de criopreservação a um conjunto específico de equipamentos dentro do banco de dados, o que é útil para controle de qualidade e para identificar componentes que requerem reparo ou substituição.
Os fatores limitantes no processamento são muitas vezes o tempo gasto esperando que os feixes se quebrem e o tempo necessário para filtrar e separar o esperma dos óvulos antes do CASA e da criopreservação. Sempre que possível, recomenda-se processar as amostras na ordem em que os feixes se quebram; no entanto, ganhos adicionais de eficiência podem ser obtidos por meio do gerenciamento estratégico de pedidos de processamento de amostras. Por exemplo, se houver 5 ou menos criogeniais por colônia devido a baixos volumes de amostra (ou seja, menos de 3 mL de espermatozóides por colônia) ou baixa concentração de espermatozóides que requerem uma diluição de 2:1 com criodiluente (ou seja, menos de 2 × 109/mL), então é melhor adicionar criodiluente a duas amostras de colônia ao mesmo tempo para que possam ser executadas juntas no mesmo rack criogênico (total # slots disponíveis = 11), em vez de executá-los separadamente com manequins preenchendo os espaços vazios. Além disso, é possível executar vários racks criogênicos simultaneamente (para amostras >6 mL de volume), desde que seja tomado cuidado para garantir que todos os processos possam ser concluídos dentro do tempo de equilíbrio do criodiluente de 10 minutos, o que pode aumentar ainda mais o rendimento da amostra. No entanto, ao executar vários racks criogênicos ou combinar várias colônias em um único rack criogênico, deve-se tomar cuidado para garantir que os metadados de criopreservação sejam atribuídos à amostra correta na folha de dados automática, especialmente se as amostras forem criopreservadas em uma ordem diferente de sua avaliação CASA.
Além do desenvolvimento do fluxo de trabalho semiautomatizado, a presente descrição do protocolo também fornece duas comparações metodológicas relacionadas à concentração de espermatozoides que visam melhorar a análise de espermatozoides e os resultados da criopreservação. Em geral, a coleta de 5 mL de feixes de gametas em 5 mL de água do mar (volume total de 10 mL) resultará em uma concentração de espermatozóides igual ou superior a 2 × 109 células/mL, mas há ocasiões em que a concentração de espermatozoides pode ser menor devido a diferenças de espécies ou feixes que se rompem durante a coleta. O uso de um criodiluente DMSO de concentração mais alta (30% v/v) reduz a quantidade pela qual os espermatozoides são diluídos para ajudar a minimizar a variação de lote para lote na concentração de espermatozoides no criogenial. É importante ressaltar que o uso de 30% de DMSO para atingir a concentração final de DMSO não afeta a concentração pós-descongelamento ou os parâmetros de motilidade, conforme mostrado pelos dados representativos na Figura 3. A segunda comparação metodológica fornece uma alternativa às lâminas de câmara de lamínula fixa de uso único normalmente usadas para CASA. O principal desafio com o uso de lâminas disponíveis comercialmente para a análise de espermatozóides de coral é que elas podem afetar a precisão da avaliação da motilidade devido à aderência dos espermatozoides ao revestimento da lâmina. O uso da solução de ativação supera esse problema em muitas, mas não em todas as amostras, portanto, ainda é recomendável realizar uma análise CASA separada para motilidade usando uma lâmina simples para garantir confiabilidade e consistência. O uso de uma câmara de contagem de Makler supera a necessidade de analisar a concentração e a motilidade separadamente e, potencialmente, melhora a precisão das medidas de concentração (Figura 2), por isso é recomendado para uso com o protocolo atual. Dada essa discrepância nas medições de concentração, um achado que foi relatado anteriormente20, é importante sempre registrar os detalhes da lâmina no banco de dados juntamente com os dados de qualidade do esperma e, sempre que possível, ser consistente no tipo de lâmina da câmara usada para minimizar a variação de lote para lote e ajudar a garantir cálculos confiáveis das proporções espermatozoide: óvulo para fertilizações.
O processo semiautomatizado aqui descrito fornece um caminho padronizado e eficiente para criopreservação e biobanco de espermatozóides de espécies de corais ameaçadas, mantendo a biossegurança e a qualidade da amostra. O protocolo descrito é facilmente transferível e relativamente barato para implementar em programas em todo o mundo que estão trabalhando para garantir a diversidade de corais existente usando a criopreservação, que será essencial para prevenir extinções e maximizar os recursos disponíveis para os esforços de restauração de recifes agora e no futuro.