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Artigo de método

Medindo as alterações dinâmicas do pH glicossomal em Trypanosoma brucei vivo

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DOI:

10.3791/66279

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19 de janeiro de 2024

* These authors contributed equally

Neste artigo

Resumo

Descrevemos um método para estudar como o pH responde a pistas ambientais nos glicossomas da forma sanguínea de tripanossomas africanos. Essa abordagem envolve um sensor de proteína hereditária sensível ao pH em combinação com citometria de fluxo para medir a dinâmica do pH, tanto como um ensaio de curso de tempo quanto em um formato de tela de alto rendimento.

Resumo

O metabolismo da glicose é crítico para o tripanossoma africano, Trypanosoma brucei, como um processo metabólico essencial e regulador do desenvolvimento do parasita. Pouco se sabe sobre as respostas celulares geradas quando os níveis de glicose ambiental se alteram. Tanto na corrente sanguínea quanto na forma pró-cíclica (estágio de inseto) parasitas, os glicossomas abrigam a maior parte da glicólise. Essas organelas são rapidamente acidificadas em resposta à privação de glicose, o que provavelmente resulta na regulação alostérica de enzimas glicolíticas como a hexoquinase. Em trabalhos anteriores, localizar a sonda química usada para fazer medições de pH foi um desafio, limitando sua utilidade em outras aplicações.

Este trabalho descreve o desenvolvimento e o uso de parasitas que expressam pHluorina glicossomicamente localizada2, um biossensor de pH de proteína hereditária. A pHluorina2 é uma variante ratiométrica da pHluorina que apresenta uma diminuição da excitação dependente do pH (ácido) a 395 nm, ao mesmo tempo que produz um aumento da excitação a 475 nm. Parasitas transgênicos foram gerados pela clonagem do quadro de leitura aberta pHluorin2 no vetor de expressão de tripanossomas pLEW100v5, permitindo a expressão de proteínas induzíveis em ambos os estágios do ciclo de vida. A imunofluorescência foi utilizada para confirmar a localização glicossomal do biossensor pHluorin2, comparando a localização do biossensor com a aldolase da proteína residente no glicossomo. A responsividade do sensor foi calibrada em diferentes níveis de pH incubando as células em uma série de tampões que variaram em pH de 4 a 8, uma abordagem que usamos anteriormente para calibrar um sensor de pH baseado em fluoresceína. Em seguida, medimos a fluorescência da pHluorina2 a 405 nm e 488 nm usando citometria de fluxo para determinar o pH glicossomal. Validamos o desempenho dos parasitas transgênicos vivos que expressam pHluorina2, monitorando o pH ao longo do tempo em resposta à privação de glicose, um conhecido gatilho da acidificação glicossomal em parasitas PF. Esta ferramenta tem uma gama de aplicações potenciais, incluindo potencialmente ser usada na triagem de drogas de alto rendimento. Além do pH glicossomal, o sensor pode ser adaptado a outras organelas ou usado em outros tripanosomatídeos para entender a dinâmica do pH no ambiente de células vivas.

Introdução

Os cinetoplastídeos parasitas, como a maioria dos organismos vivos, dependem da glicose como um componente fundamental do metabolismo central do carbono. Este grupo inclui organismos medicamente importantes, como o tripanossoma africano, Trypanosoma brucei; o tripanossoma americano, T. cruzi; e parasitas do gênero Leishmania. O metabolismo da glicose é crítico para o crescimento do parasita nos estágios do ciclo de vida patogênico. Por exemplo, quando privado de glicose, a forma sanguínea (BSF) do tripanossoma africano morre rapidamente. Notadamente, a glicólise serve como única fonte de ATP durante esse estágio da infecção....

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Protocolo

O uso de tripanossomas de T. brucei brucei 90-13 BSF, uma linhagem de parasitas monomórficos, requer consideração de segurança, pois são considerados organismos do Grupo de Risco 2 que devem ser manuseados em instalações de nível de biossegurança 2.

1. Cultura e transfecção de tripanossomas

  1. Cultura de tripanossomas de T. brucei brucei 90-13 BSF em meio HMI-9 suplementado com 10% de SFB inativado pelo calor e 10% de Nu-soro a 37 °C em 5% de CO2 10.
    NOTA: Para manter a cultura saudável, mantenha a densidade celular entre 2 × 104 e 5 × 106 ....

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Resultados

Localização de pHLuorin2-PTS1 em glicossomas em FSB de T. brucei
Para avaliar a localização subcelular da pHluorina2-PTS1, os parasitas foram submetidos a ensaios de imunofluorescência. Sinal do transgene colocalizado com antissoros levantados contra uma proteína residente em glicossoma, aldolase (TbAldolase) (Figura 2A). O coeficiente de correlação médio de Pearson de colocalização entre anti-TbAldolase e pHluorina2-PTS1 foi de 0,895, indicando que a pHluorina2-.......

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Discussão

A percepção ambiental e os mecanismos de resposta no tripanossoma africano são pouco compreendidos. Sabe-se que alterações na disponibilidade de nutrientes desencadeiam diversas respostas no parasita, incluindo acidificação de glicossomas. Aqui, descrevemos um método para estudar a resposta do pH glicossomal a perturbações ambientais em células vivas usando um sensor de proteína hereditária, pHluorin2, e citometria de fluxo.

Existem várias etapas críticas no uso do sensor. Primeiro, a caracter.......

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Divulgações

Os autores declaram não haver conflitos de interesse.

Agradecimentos

pHluorin2-PTS1 foi clonado em pLEW100v5 pela Twist Bioscience que forneceu a construção em um vetor de clonagem de alta cópia; pLEW100v5 foi um presente do Dr. George Cross. Antissoro levantado contra T. brucei aldolase está disponível na Dr. Meredith T. Morris, Clemson University, mediante solicitação. O trabalho dos laboratórios JCM e KAC foi parcialmente apoiado por um prêmio do National Institutes of Health (R01AI156382). O SSP foi suportado pelo NIH 3R01AI156382.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Balões de Cultura de Tecidos de 50 mL (Não tratados, estéreis)VWR10861-572
75 cm2 Frasco de Cultura de Tecidos (Não Tratado, estéril)Corning431464U
80 µ L placa de fundo plano de 384 poçosBrandTech 781620
Amaxa Nucleofector de Células T Humanas KitLonzaVPA-1002
Attune NxT Citômetro de Fluxoinvitrogen da Thermo Fisher ScientificA24858Software FlowJo
BRANDplates 96-Well, placa de fundo planoMillipore SigmaBR781662
Coloc 2 plugin do ImageJhttps://imagej.net/plugins/coloc-2
CytKick Max Auto Samplerinvitrogen da Thermo Fisher ScientificA42973
Citômetro de Fluxo CytoFLEXBeckman-Coulter
Microscopia Eletrônica Ciências 16% Paraformaldeído Solução Aquosa, Grau EM, Ampola de 10 mLFisher Scientific50-980-487
GraphPad Prismsoftware estatístico
Nigericina (sal de sódio)Cayman Chemical11437
Nucleofector 2bLonzaDescontinuado
OP2 Manipulador de LíquidosopentronsOP2
poli-L-lisina, 0,1% (p/v) em H2OSigma Life ScienceCAS:25988-63-0Robô de pipetagem para ensaio HTS
Thiazole Red (TO-PRO-3)biotium#40087Usinamos um suporte de placa de acrílico personalizado para que esta marca de placa pudesse ser detectada e usada em nosso CytKick Max Auto Amostrador
valinomicinaCayman Chemical10009152Robô de pipetagem para ensaio HTS
         Para calibração de pH
         Para calibração de pH
Produto

Referências

  1. Coley, A. F., Dodson, H. C., Morris, M. T., Morris, J. C. Glycolysis in the African trypanosome: Targeting enzymes and their subcellular compartments for therapeutic development. Molecular Biology International. 2011, 123702(2011).
  2. Mcconville, M. J., Saunders, E. C., Kloehn, J., Dagley, M. J.

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Reimpressões e permissões

Etiquetas

Metabolismo da GlicoseBiossensor pHluorin2Citometria de FluxoAcidificação do GlicossomoImagem de Células VivasGlicólise do ParasitaCalibração de Sensor de pHParasitas Transgênicos