Este protocolo fornece um protocolo de modelo abrangente e direto para avaliar a função mitocondrial em fibras musculares esqueléticas permeabilizadas para amostras humanas e de camundongos. Existem várias vantagens em usar fibras permeabilizadas em vez de mitocôndrias isoladas. Uma vantagem importante é que o uso de fibras permeabilizadas requer pequenas quantidades (2-5 mg) de tecido, tornando esse método adequado tanto para amostras de biópsia muscular humana quanto para músculo de camundongo. Outra vantagem sobre as mitocôndrias isoladas é que a arquitetura celular permanece intacta, garantindo a preservação das interações estruturais e funcionais entre as mitocôndrias e os componentes celulares 12,21,22,23.
O uso de piruvato, malato e glutamato em nosso protocolo glicolítico aeróbico fornece uma avaliação abrangente e de amplo espectro do fornecimento de NADH para o Complexo I 24,25,26,27,28. Embora essa abordagem abrangente forneça uma avaliação da atividade do Complexo I em condições metabólicas holísticas e fisiologicamente relevantes, o uso de piruvato-malato ou glutamato-malato pode ser uma abordagem experimental mais apropriada. Por exemplo, o uso de glutamato-malato pode revelar diferenças na função mitocondrial relacionadas ao catabolismo de aminoácidos29. Incentivamos os investigadores a considerar cuidadosamente a abordagem apropriada a ser usada para seu modelo de pesquisa específico.
Embora este protocolo se concentre no uso de substratos para avaliar a atividade mitocondrial, o uso de inibidores específicos pode ser necessário para atingir objetivos experimentais. Por exemplo, a rotenona pode ser usada para inibir o Complexo I 12,21,30, a oligomicina usada para inibir o Complexo V (ATP Sintase)12,21 e a antimicina A para bloquear o Complexo III12,21 para avaliação da respiração não mitocondrial. O protocolo fornecido acima pode ser facilmente adaptado para incluir o uso de inibidores específicos. É importante notar que uma ressalva em relação ao uso de inibidores é que esses compostos são pegajosos e requerem limpeza extensiva para serem removidos da câmara do instrumento. Descobrimos que o uso de uma solução de 10% de BSA por 60 min é suficiente para a remoção de inibidores residuais.
A respiração LEAK refere-se à taxa de consumo de oxigênio que é independente da síntese de ATP. Essa taxa representa o fluxo de prótons de volta para a matriz mitocondrial através da membrana mitocondrial interna. Existem três métodos aceitos para avaliar o consumo de oxigênio independente da síntese de ATP (LEAK). O primeiro, LEAK(n), mede a taxa de consumo de oxigênio na presença de substratos, mas sem a adição de adenilatos (ADP ou ATP)31,32,33. Este estado LEAK representa o vazamento intrínseco da membrana mitocondrial. O segundo método, LEAK(t), é medido na presença de ATP34 e o terceiro, LEAK(o), é medido na presença do inibidor de ATP-sintase oligomicina 35,36,37. Este protocolo usa LEAK(n) para esta avaliação, mas dependendo dos objetivos e modelos experimentais, outros métodos para medir o fluxo de oxigênio LEAK podem ser apropriados.
Para este ensaio, o MiR05 é suplementado com creatina (3 mg / mL) e blebbitatina (10 μM). O transporte mitocondrial de ADP é facilitado pela creatina quinase (CK), e a creatina é adicionada à solução respiratória para saturar a atividade da CK38,39. As fibras musculares podem se contrair espontaneamente e também são sensíveis à contração induzida pelo ADP. Para avaliar a atividade respiratória mitocondrial sem a influência da contração, a blebbitatina foi adicionada para inibir a atividade contrátil das fibras38. Além disso, estudos em músculo humano sugerem que a capacidade respiratória pode ser influenciada pelo método de biópsia (microbiópsia versus agulha de Bergstrom) e que essa diferença pode ser devida a diferenças no comprimento das fibras obtidas 40,41. Fibras mais curtas podem ser mais suscetíveis a danos durante a preparação, e o uso de blebbitatina ajuda a preservar a função. Pode haver certas condições em que o relaxamento das fibras não se encaixa nos objetivos da pesquisa e, nesse caso, a blebbitatina pode ser excluída da solução MiR05.
A permeabilização das fibras musculares esqueléticas com saponina gera poros na membrana plasmática e permite que substratos e inibidores entrem livremente na célula. A saponina tem alta afinidade pelo colesterol, que é rico e abundante nas membranas plasmáticas celulares, enquanto as membranas mitocondriais são pobres em colesterol42,43. Espera-se que o tratamento com saponina usado para preparação de fibras neste protocolo preserve a integridade da membrana mitocondrial. Danos às mitocôndrias também podem ocorrer devido a forças de cisalhamento que resultam da separação mecânica do tecido em fibras. Sugerimos que a separação do tecido em feixes de fibras seja realizada rapidamente e com o mínimo de manuseio. Para avaliar o potencial dano mitocondrial, incluímos a titulação do citocromo C no protocolo de respiração. O citocromo C não pode passar por uma membrana mitocondrial externa intacta12, portanto, qualquer aumento no fluxo de O2 após a adição do citocromo C indica que ocorreu dano à membrana mitocondrial externa durante o processo de preparação da amostra. Em um de nossos estudos recentes, descobrimos que o fluxo de O2 aumentou 8%15 após a adição do citocromo C, validando que o uso de saponina sugerido neste protocolo não provoca danos mitocondriais. Sugerimos que qualquer amostra que demonstre um aumento superior a 15% no fluxo de O2 após a adição do citocromo C deve ser excluída da análise44. Esta etapa é incluída estritamente como uma medida de controle de qualidade e não como uma avaliação da atividade do Complexo IV.
Embora a respirometria de alta resolução se destaque por fornecer medições altamente sensíveis e confiáveis do consumo de oxigênio, uma limitação notável da instrumentação é que apenas duas amostras podem ser medidas simultaneamente por instrumento. Isso requer uma consideração cuidadosa ao projetar estudos envolvendo coortes com múltiplas amostras. Embora possa haver a tentação de realizar medições em vários conjuntos de amostras ao longo do dia, aconselhamos fortemente os investigadores a considerar a influência do ritmo circadiano no metabolismo. Pesquisas sobre o músculo esquelético humano e de roedores revelaram uma influência do relógio biológico na função mitocondrial45,46. Consequentemente, recomendamos a realização de medições ao longo de vários dias na mesma hora do dia para levar em conta essas flutuações circadianas.
Por fim, para garantir medições de respirometria reprodutíveis e robustas, o respirômetro deve receber limpeza, manutenção e calibração regulares. A calibração do ar, conforme detalhado no protocolo, deve ser realizada diariamente. Aconselhamos os usuários a também realizar uma calibração mensal completa (ar e zero) dos sensores polarográficos de oxigênio. Os usuários devem consultar a documentação e o site do fabricante para obter mais informações sobre este método de calibração e para obter instruções sobre a manutenção de rotina do instrumento.
A respirometria de alta resolução continua sendo o padrão-ouro para medir a respiração mitocondrial. O método detalhado neste protocolo facilita a avaliação robusta da capacidade mitocondrial em músculos esqueléticos de roedores e humanos. Esse protocolo tem sido aplicado a estudos que avaliam a função mitocondrial associada a modelos genéticos de camundongos15,16, no contexto de doença renal crônica19, após administração de suplemento dietético14,20 e exercício17,18.