Neste método, simulações específicas do assunto são realizadas para prever e avaliar possíveis efeitos térmicos e mecânicos resultantes da aplicação de UST no cérebro. Os conjuntos de dados entre os participantes devem permanecer separados e cuidadosamente documentados, pois o uso de uma varredura ou arquivo de dados incorreto levará a simulações imprecisas. Quando várias digitalizações de participantes são coletadas e o planejamento é realizado em conjunto, é importante garantir a rotulagem adequada de imagens e pastas e proceder com cuidado ao classificar e salvar arquivos.
Para realizar simulações com precisão, o crânio deve ser modelado corretamente para obter uma compreensão específica do assunto das propriedades acústicas e geométricas. O BabelBrain, portanto, requer a conclusão de uma tomografia computadorizada ou ZTE; se nenhum estiver disponível, o BabelBrain pode usar uma máscara simplificada do osso do crânio obtida com a ferramenta de charme. As tomografias computadorizadas fornecem as informações mais precisas sobre as características do crânio para prever como o ultrassom se propagará no cérebro assim que entrar em contato com o crânio. Isso é conseguido usando informações voxelizadas do osso do crânio, embora a estimativa do volume ósseo ainda seja difícil de prever devido à sua natureza heterogênea51. No entanto, mais recentemente, sequências de ressonância magnética TE ultracurtas, como a varredura ZTE, têm sido usadas para determinar as propriedades acústicas do crânio e realizar simulações de UST. A resolução e o contraste de pixels ósseos não são tão altos em uma imagem ZTE quanto na TC; no entanto, em comparação com máscaras simplificadas derivadas de apenas ressonância magnética T1-w e T2-w, as imagens ZTE ainda fornecem uma estimativa aprimorada do aquecimento com simulações de TUS52 com previsões semelhantes às feitas com tomografias computadorizadas53. O uso de varreduras ZTE em simulações elimina qualquer exposição desnecessária à radiação e o tempo adicional necessário para obter imagens de tomografia computadorizada de raios-X, pois as sequências ZTE podem ser adicionadas à sessão original de varredura de ressonância magnética. No entanto, os protocolos ZTE não são um produto padrão na maioria dos scanners de ressonância magnética, e pesquisas adicionais são necessárias para melhorar o pós-processamento baseado em ZTE para uso na modelagem TUS. Se nem as imagens CT nem ZTE estiverem disponíveis, a ferramenta charm utilizada com o BabelBrain cria uma máscara simplificada de imagens T1 e T2-w para prever as características do crânio. Uma comparação das simulações realizadas com uma TC versus uma máscara simplificada mostrou diferenças mínimas na direção (1,00 mm ± 1,3 mm) e no reposicionamento mecânico (direção x 0,2 mm ± 0,4 mm; direção y 0,1 mm ± 0,5 mm) necessária para atingir o alvo, porém distribuição de intensidade ligeiramente diferente (comprimento do foco 6% ± 8%; largura do foco 2,7% ± 2%; volume do foco 10,4% ± 16%; pressão de pico -0,5% ± 15% para máscara simplificada em relação à TC)36. Isso revela que a TC fornece simulações mais precisas; no entanto, se não for possível utilizar uma tomografia computadorizada ou ZTE, a máscara simplificada é adequada para completar simulações para experimentação de UST em humanos.
Os métodos de mapeamento de propriedades acústicas continuam sendo uma área necessária de pesquisa, pois a previsão da velocidade do som e a atenuação de imagens de TC e RM ainda exigem uma melhor compreensão e um fluxo de trabalho simplificado. Portanto, permanece uma ressalva de desvio potencial nos efeitos térmicos ou mecânicos do que é previsto na simulação. A modelagem de efeitos acústicos no BabelBrain é obtida usando uma biblioteca BabelViscoFDTD54,55 de código aberto, que permite a modelagem de transmissão de ondas de compressão linear e cisalhamento. Este modelo foi validado em relação a vários outros modelos para posição, tamanho e magnitude do foco, diferindo menos de 10% na pressão focal e menos de 1 mm no posicionamento focal56. As simulações acústicas estão, portanto, de acordo com outros modelos de simulação. As previsões térmicas são mais difíceis e não foram validadas experimentalmente, uma vez que a termometria de RM não pode ser realizada no crânio e espera-se que as mudanças de temperatura sejam muito pequenas, o que cria uma fonte de incerteza. A modelagem térmica utilizada no BabelBrain é consistente entre os artigos, resolvendo a Equação de Transferência de Biocalor (BHTE) para simular o aquecimento do crânio por meio da modelagem de difusão térmica, efeitos de perfusão e potência acústica36,51. Estimativas de aumento térmico a partir de modelos de atenuação e absorção são usadas para prever os efeitos no crânio com UST com base em outra literaturapublicada 57, servindo como a melhor alternativa até o momento para simular o aquecimento do crânio. Conforme visto nos métodos descritos, o usuário especifica a duração do ultrassom, o tempo de folga após o ultrassom, o ciclo de trabalho e a intensidade média do pulso de pico espacial desejado em condições cerebrais, cujos parâmetros de segurança são calculados em função da seleção de parâmetros. O usuário deve, portanto, inspecionar todos os parâmetros a serem empregados para garantir que estejam dentro dos requisitos de segurança. Vários sistemas de neuronavegação usados para posicionar o transdutor sobre a região de interesse também apresentaram um erro de registro de alvo de aproximadamente 3 mm 38,58,59. No entanto, dependendo da frequência empregada e do tamanho do alvo, o ponto focal ainda pode ser grande o suficiente para cobrir o alvo, mesmo com 3 mm de erro. Embora isso possa ser uma limitação, ainda oferece um benefício maior sobre os sistemas de navegação alternativos devido à invasividade dos métodos de localização estereotáxica.
O BabelBrain simplifica as etapas de planejamento necessárias para concluir os experimentos de TUS em humanos, pois é eficiente, fácil de usar e é a única ferramenta de planejamento acessível de código aberto até o momento. Isso permite transparência nos métodos experimentais na literatura publicada, pois os scripts usados são de acesso aberto. O método descrito conclui as etapas de preparação de dados e processamento de imagens, eliminando a necessidade de scripts personalizados ou qualquer colaboração externa para executar simulações. Portanto, remove uma grande barreira para os experimentadores, permitindo que eles concluam o planejamento e as simulações diretamente e permitindo que mais laboratórios concluam a experimentação bem-sucedida do TUS. Além do planejamento prospectivo de experimentos, esse método também tem aplicações potenciais no planejamento da terapia FUS mediada por cavitação36, como a abertura da barreira hematoencefálica59. No geral, este método fornece uma abordagem eficaz e simplificada para planejar e implementar a experimentação de UST em humanos e o desenvolvimento de UST para uso em ambientes clínicos.