O presente relatório descreve o procedimento de realização de imagens PET in vivo em camundongos com os moldes BCAM e análise de dados com a ferramenta SaaS automatizada. São fornecidas instruções passo a passo sobre preparação do mouse, aquisição de imagens e processamento de dados. Esse fluxo de trabalho de automação também gerou dados consistentes com a análise manual. Algumas considerações técnicas importantes são destacadas abaixo.
Embora um tumor não seja um dos órgãos definidos pelo OPM, uma etapa crítica neste protocolo é a implantação adequada de tumores subcutâneos para, em última análise, garantir o alinhamento ideal de todos os órgãos do camundongo dentro da cavidade do corpo e BCAM. O OPM só pode produzir dados precisos quando a coluna vertebral de um camundongo é relativamente reta e os órgãos internos estão posicionados de forma neutra. Tumores excessivamente grandes ou mal colocados podem afetar a postura do camundongo e pressionar sua cavidade corporal, deslocando assim os órgãos internos. Essa mudança, por sua vez, distorcerá a análise quantitativa resultante do algoritmo OPM. Outros relataram o impacto de uma coluna não reta no alinhamento dos órgãos internos usando várias modalidades de imagem e algoritmos de segmentação13,14. Portanto, é crucial usar o modelo para orientar a implantação do tumor e monitorar o crescimento do tumor de perto para garantir que os tumores estejam posicionados corretamente e na faixa de tamanho ideal.
Outra área de possível desvio é a seleção de um BCAM de tamanho adequado. Os BCAMs são criados em integrais de 2 g, com um intervalo de 18-26 g. No entanto, como camundongos com diferentes composições corporais (por exemplo, mais músculo versus mais gordura) podem ter o mesmo peso corporal, mas tamanhos físicos diferentes, é importante escolher o BCAM mais adequado usando seu peso corporal como referência geral. Suba ou desça de nível por tentativa e erro e lembre-se de que o alinhamento adequado é fundamental. Escolher um BCAM muito grande fará com que os órgãos internos do camundongo "afundem" mais perto do fundo da cama, o que afetará particularmente a precisão da análise dos órgãos dorsais, como os rins e a coluna. Em contraste, colocar um camundongo em BCAM muito pequeno pode pressionar suas cavidades corporais, distorcer o posicionamento dos órgãos e potencialmente causar dificuldade na respiração. Usar fita adesiva para garantir que os membros estejam presos nas plataformas das patas ajudará na configuração e no posicionamento.
Embora esse fluxo de trabalho relatado permita a análise padronizada e automatizada de imagens PET, vale ressaltar que o OPM atual é construído com base na cepa de camundongo C57BL/6 imunocompetente e em camundongos saudáveis. Outras cepas e condições de saúde de camundongos podem apresentar diferentes características anatômicas que requerem ajuste, otimização e validação adicionais do algoritmo. Por exemplo, cepas imunodeficientes, como NSG ou NCG, têm baços menores. Da mesma forma, camundongos portadores de implantes tumorais ortotópicos podem ter diferentes tamanhos, formas e localizações de órgãos internos, dependendo do estado da doença. Outra limitação desse fluxo de trabalho é a taxa de transferência geral durante a fase de aquisição de um experimento. Isso se deve principalmente ao tempo adicional necessário para configurar um mouse corretamente no BCAM. O treinamento e a prática podem aumentar a eficiência do operador na colocação adequada. A adição de uma segunda estação de acoplamento também pode aumentar a taxa de transferência geral, onde um dock pode servir para configuração de BCAM e o outro pode servir para remover um mouse para uma gaiola de recuperação. No entanto, mesmo com o aumento do tempo necessário para a configuração do BCAM antes da digitalização, o investimento em tempo compensa economizando tempo no final da análise de dados. Por exemplo, no presente estudo, levou menos de 10 minutos para o OPM analisar dez imagens (com 4 ROIs), enquanto levou de 3 a 4 horas para um analista altamente experiente segmentar e analisar manualmente o mesmo conjunto de imagens e ROIs. Um analista inexperiente exigiria ainda mais tempo para análise manual. A plataforma SaaS permite a análise de exames de PET em grandes lotes, onde a análise completa de biodistribuição in vivo pode ser concluída em minutos após o upload dos dados. Esse é um recurso extremamente útil ao lidar com grandes quantidades de dados de vários grupos e/ou em vários pontos de tempo, conforme discutido abaixo.
A segmentação manual de órgãos para um único sujeito pode ser demorada e geralmente requer treinamento inicial significativo do operador. Mesmo com treinamento adequado, as análises manuais inevitavelmente enfrentam variabilidades entre os operadores, o que pode distorcer os resultados quantitativos15,16. Por outro lado, a segmentação automatizada e a análise de dados podem determinar com precisão e eficiência a biodistribuição geral de um radiotraçador e eliminar variabilidades enraizadas nas operações humanas. Esses benefícios da automação foram observados tanto na análise de imagens clínicas quanto no espaço pré-clínico. Por exemplo, Sluis et al. demonstraram que uma única varredura exigia 4 h para segmentar os órgãos de interesse em comparação com 30 min por métodos baseados em nuvem de IA17. Outro estudo de Nazari et al. também relatou que a análise baseada em algoritmos do fígado e dos rins demonstrou resultados precisos em 7,0% quando comparados a dois físicos médicos humanos18. Os dados na Figura 4 também mostraram claramente a confiabilidade do fluxo de trabalho de análise de imagem PET baseado em SaaS e que a análise automatizada produziu resultados consistentes quando comparada à análise manual.
Em resumo, este artigo ilustra o fluxo de trabalho do uso de moldes BCAM para facilitar a aquisição padronizada de imagens PET/CT pré-clínicas, bem como a análise automatizada de dados PET habilitada para SaaS. É demonstrado que essa tecnologia de plataforma é relativamente simples de empregar e a qualidade dos dados gerados pela automação é consistente com a análise manual, mas possui benefícios significativos de economia de tempo. Portanto, esse fluxo de trabalho pode economizar centenas de horas de análise de dados para os pesquisadores e ajudar a padronizar e reduzir a variabilidade entre operadores. Este procedimento pode auxiliar no desenvolvimento de uma infinidade de compostos de medicamentos em todas as modalidades e indicações. Particularmente, modalidades de moléculas grandes, como anticorpos terapêuticos, engajadores de células imunes de anticorpos biespecíficos, conjugados anticorpo-droga e até nanopartículas podem ser prontamente marcadas com radiometais (por exemplo, Zr-89,-64) para permitir a avaliação da biodistribuição mediada por imagens PET19,20. Da mesma forma, essa tecnologia de plataforma pode ajudar a determinar a dosimetria de novas radioterapias em camundongos21. A aplicação deste procedimento será um grande valor agregado ao desenvolvimento de medicamentos.