Os procedimentos envolvendo animais foram conduzidos de acordo com as leis dos Estados Unidos e os regulamentos do Departamento de Agricultura. Todos os experimentos com animais foram conduzidos de acordo com protocolos aprovados pelo Comitê de Cuidados e Uso de Animais do National Eye Institute do National Institutes of Health. Esquilos terrestres machos e fêmeas de 13 linhas (idades de 6 a 8 meses) usados neste estudo foram comprados da Colônia de Esquilos Oshkosh da Universidade de Wisconsin. Os camundongos (rd10: 1 mês, CX3CR1GFP/+: 6,5 meses) usados neste estudo foram criados em nosso biotério. Os animais e suas gaiolas foram selecionados aleatoriamente e distribuídos em grupos experimentais.
1. Preparação da plataforma protótipo e túnel de manuseio modificado
NOTA: Plataformas planas redondas são comumente empregadas em sistemas projetados para medir a resposta optomotora13. No entanto, modelos de roedores hiperativos, como esquilos, muitas vezes lutam para manter a estabilidade nessas plataformas. Este design fornece um espaço semi-fechado, que ajuda os animais a se habituarem rapidamente e reduz comportamentos semelhantes à ansiedade. Essa melhoria aumenta a capacidade de concentração do animal e minimiza os casos de desequilíbrio ou quedas durante as gravações.
- No software de desenho CAD (por exemplo, OpenSCAD ou FreeCAD), projete a plataforma (cinza) e o gabinete (vermelho) conforme mostrado na Figura 1.
- Certifique-se de que as principais dimensões da plataforma do esquilo sejam mantidas como comprimento e largura (C x L): 129 mm x 81 mm, espessura: 7 mm e altura da parede que se estende ao redor do perímetro: 8 mm. Use o arquivo de documento padrão CAD gratuito fornecido para a plataforma de protótipo (esquilo) usada neste estudo de prova de conceito (Arquivo de Codificação Suplementar 1).
- Certifique-se de que as principais dimensões do gabinete superior removível (olhando de cima para baixo) sejam mantidas como comprimento (119.5 cm) e largura (76.2 cm), altura das laterais (50.8 mm) e espessura da peça (3 mm). Use o arquivo de documento padrão CAD gratuito fornecido para replicar o gabinete superior removível (esquilo) empregado neste estudo de prova de conceito (Arquivo de Codificação Suplementar 2).
- Ajuste o diâmetro do orifício de passagem na base da plataforma conforme necessário para encaixar o pedestal usado para elevar a plataforma. O diâmetro na foto é de 40 mm.
- Imprima a plataforma usando um filamento branco opaco. Isso fornece contraste máximo para a câmera, permitindo que o software de rastreamento detecte corretamente o contorno do animal na plataforma.
- Imprima o invólucro superior removível com filamento escuro opaco (por exemplo, vermelho). Isso proporciona uma sensação de abrigo para os roedores, o que facilita guiá-los para o túnel antes de serem levantados e transferidos para a arena.
- Peça a um maquinista que corte o tubo quadrado transparente extrudado de acrílico usando uma serra de mesa de modo que a extremidade longa tenha ~ 101,6 mm de comprimento. Certifique-se de usar óculos de proteção e uma vara de empurrar para guiar o acrílico pela lâmina, mantendo as mãos protegidas contra possíveis ferimentos.
- Usando a serra de mesa ou uma ferramenta rotativa portátil equipada com um disco de corte abrasivo, remova uma das faces retangulares longas. Isso cria uma parte superior aberta através da qual a câmera montada acima terá uma visão desobstruída da posição do animal e dos movimentos da cabeça.
- Limpe todas as bordas com uma lima manual ou lixa. Monte o túnel de manuseio modificado usando o tubo quadrado transparente extrudado de acrílico cortado no comprimento com o invólucro superior removível impresso em 3D, colocando o invólucro em cima da face aberta.
2. Configurando a arena OMR
- Desinfete a plataforma e o conjunto do invólucro do tubo quadrado com um limpador/desinfetante antes e entre os animais para remover sinais olfativos indesejados.
NOTA: Embora luvas de couro sejam usadas para manusear os animais e entrar em contato direto com eles, elas não são usadas durante as gravações e não causam efeitos de confusão duradouros ou observáveis.
- Rasgue um pequeno pedaço de papel toalha medindo aproximadamente 50 mm x 50 mm e dobre-o para cobrir a superfície superior do pedestal. Coloque a plataforma impressa em 3D no pedestal (14 polegadas de altura) com o pedaço de papel toalha no lugar.
NOTA: O papel ajusta o ajuste de pressão da plataforma, evita movimentos não intencionais, fornece um fundo branco uniforme para imagens (se a superfície do pedestal não for branca) e atua como uma camada absorvente caso o animal urine durante a gravação, evitando que a plataforma fique escorregadia.
- Usando luvas de trabalho de couro, guie suavemente o animal para dentro do conjunto do invólucro do tubo quadrado.
- Transfira o animal para a arena colocando o conjunto do recinto na plataforma (Figura 1J).
- Retire cuidadosamente o invólucro superior removível, deixando o animal no tubo quadrado transparente extrudado de acrílico na plataforma. Feche a porta para o sistema OMR
3. Configurando os parâmetros do software OMR
NOTA: O sistema OMR retratado usa uma câmera industrial compacta com um sensor CMOS de 1/3" sensível a IR com um obturador global a 25 quadros por segundo (fps). A câmera está equipada com uma lente grande angular F1.6, permitindo uma visão completa de cima para baixo da arena. Testes preliminares de acuidade visual realizados em esquilos usando a configuração padrão de contraste de 100% revelaram que a acuidade visual dos esquilos excedeu os limites de resolução do hardware. As telas Full HD In-Plane Switching de 23,8" usadas na configuração têm uma resolução de apenas 1920 pixels de largura e, portanto, o software é codificado com uma frequência espacial máxima de 2 cyc/°. Para comparação, a acuidade visual de camundongos C57Bl / 6 é de aproximadamente 0,3-0,5 cyc / °. A 2 cyc/°, cada faixa tem em média 5,3 pixels de largura. Com uma velocidade de rotação de 12 ° / s e uma taxa de quadros de 60 quadros por segundo, o padrão muda em 0,2 ° por quadro, equivalente a 4,2 pixels por quadro, assumindo uma velocidade de pixel uniforme. Em frequências espaciais próximas a 2 cyc/°, o padrão de listras se aproxima do limite de resolução onde pode ocorrer aliasing, fazendo com que o padrão pareça estar se movendo para trás. Para evitar esse artefato, o software é codificado para limitar a frequência espacial em 2 cyc/°.
Assim, para os esquilos, criamos um protocolo em que realizamos o teste de acuidade, mas com um contraste muito menor. Selecionamos uma configuração de contraste (12,78%) em que os esquilos não conseguiam ver o padrão listrado a 2 ciclos/°.
- No painel de vídeo ao vivo, certifique-se de que o animal está se adaptando bem ao novo ambiente e está começando a se mover menos e se acalmando.
- A 2 cyc/°, cada faixa tem em média 5,3 pixels de largura. Defina a velocidade de rotação para 12°/s e uma taxa de quadros de 60 quadros por segundo; O padrão muda em 0,2° por quadro, equivalente a 4,2 pixels por quadro, assumindo uma velocidade de pixel uniforme. Defina as frequências espaciais perto de 2 cyc/° para que o padrão de listras se aproxime do limite de resolução onde o aliasing pode ocorrer, fazendo com que o padrão apareça como se estivesse se movendo para trás. Para evitar esse artefato, codifique o software para limitar a frequência espacial em 2 cyc/°.
NOTA: Para esquilos, criamos um protocolo em que realizamos o teste de acuidade, mas com um contraste muito menor. Selecionamos uma configuração de contraste (12,78%) na qual os esquilos não conseguiam ver o padrão listrado a 2 ciclos/°.
- Baixe o arquivo de codificação suplementar 3. Abra o software OptoDrum.
- Na guia Configurações, clique em Configurações de importação. Carregue o arquivo de codificação suplementar 3.
- Na guia Configurações, defina o deslocamento do limite de fundo como 17, o tamanho mínimo do animal [px] como 30 e a largura máxima da cauda [% do tamanho] como 1.
- Nas configurações da câmera, deixe Inverter vídeo e controle manual da câmera desmarcado e Luz IR desligada.
- Amplie a posição e o tamanho da região de interesse para rastreamento para acomodar o esquilo se ele se inclinar para fora da abertura do tubo. Os valores sugeridos são Posição: X: 359, Y: 237, Tamanho: X: 570, Y: 455. Não estenda o ROI pela tela de estímulos, pois isso pode levar a falsos positivos.
- Selecione Configuração da sessão no painel superior (Figura 2A).
- Para a escada, defina a acuidade espacial estimada da seguinte forma. Defina a acuidade esperada para 1.800 cyc/° (648 ciclos); defina a resolução ideal do estímulo para 0,5 cic / ° (180 ciclos); Defina a resolução de medição para 0.100 Cyc/° (36 ciclos).
- Para a escada, defina o número de confirmações necessárias da seguinte forma. Definido para tentativas fracassadas para 3; definido para testes bem-sucedidos para 2.
NOTA: O número de testes bem-sucedidos pode ser aumentado para reduzir ainda mais a ocorrência de confirmações de falsos positivos. No entanto, com o uso dessa plataforma e do túnel de manipulação modificado, a taxa de erro permanece aceitavelmente baixa. Isso se deve principalmente à relativa quietude dos esquilos e à raridade de movimentos rotacionais da cabeça, além daqueles provocados por estímulos evocados visualmente.
- Na guia Escada (Figura 2B), defina o antialiasing para width como 3 px e deixe sinusoidal desmarcado.
- Para os critérios de teste, trave o contraste em 12,78% e bloqueie a velocidade de rotação em 12 °/s.
NOTA: Na configuração de contraste de 12.78%, a acuidade espacial dos esquilos é limitada a aproximadamente 1.5-1.8 cyc/°. Não excedendo mais as configurações máximas de hardware, essa configuração permite a avaliação da acuidade espacial em resposta a doenças ou lesões.
- Assim que dois dos três parâmetros estiverem bloqueados, a opção Definir automaticamente os parâmetros ficará ativa (não mais esmaecida). Marque a caixa ao lado de Definir automaticamente os parâmetros.
- Defina a direção de rotação dependendo se a deficiência visual deve ocorrer em um ou ambos os olhos. Observe que, para cada olho, apenas o movimento na direção temporal-nasal provoca rastreamento. Consequentemente, avalie a lesão do olho esquerdo usando estimulação no sentido horário (CW), pois espera-se que a estimulação no sentido anti-horário (CCW) provoque respostas normais. Para degeneração ou lesão esperada em ambos os olhos, a rotação do estímulo em ambas as direções pode ser usada.
- Clique em Iniciar teste para iniciar a apresentação do estímulo. A câmera acima começará a gravar e rastrear os movimentos da cabeça dos animais. Enquanto o estímulo está sendo apresentado, clique na guia Análise para visualização em tempo real dos parâmetros Velocidades angulares (rotação da cabeça), Qualidade da faixa e Pontuação. No final de cada apresentação de estímulo, o software determinará automaticamente se deve avançar (indicado pela marca de seleção verde) para o próximo Cyc/°, repetir a tentativa ou reduzir o Cyc/° (indicado pelo X vermelho).
- Durante a gravação, se o software de rastreamento inverter incorretamente os marcadores de nariz (vermelho) e cauda (verde), pressione Ctrl no teclado para permitir a substituição manual para corrigir a orientação cabeça-cauda.
- Se o animal cair da plataforma, pause o teste pressionando Pausar avaliação ou clicando na barra de espaço. Remova o túnel de manuseio da plataforma e use-o com a tampa para manuseio seguro do animal para colocá-lo de volta na plataforma. Quando o animal estiver pronto, clique em Retomar Avaliação para continuar o teste.
- Depois que todos os testes forem concluídos, clique na guia Resumo para mostrar os testes bem-sucedidos em verde e os testes malsucedidos em vermelho. O teste circulado em verde indica o limiar de acuidade visual para o esquilo usando o contraste de 12,78%. Devolva o animal com cuidado à gaiola de origem.