Aniridia é um raro distúrbio congênito dos olhos marcado pela ausência parcial ou completa da íris, e frequentemente está associado à opacificação da córnea e à deficiência de células-tronco limbares. As mutações genéticas subjacentes, que afetam principalmente o gene PAX6, interrompem tanto o desenvolvimento quanto a função da córnea. As características oculares mais comuns, além dos defeitos da íris, são nistagmo, hipoplasia foveal, catarata, glaucoma e ceratopatia associada à anirídia (AAK). Embora os modelos in vivo ofereçam insights valiosos sobre a patologia da anirídia, modelos in vitro derivados de pacientes são cruciais para investigar os mecanismos da doença e avaliar terapias potenciais. Neste estudo, apresentamos um modelo AAK in vitro usando células-tronco pluripotentes induzidas (iPSCs) derivadas do paciente. Nosso protocolo envolve a diferenciação gradual de iPSCs em células semelhantes a epiteliais corneanas, dentro de organoides tridimensionais auto-montados, que imitam o microambiente corneano nativo. Por meio da otimização das condições de cultura diferenciada, geramos com sucesso organoides corneanos que abrigam populações celulares corneanas distintas, recapitulando os principais atributos estruturais e funcionais da córnea humana.