Um desafio em estudos biológicos é detectar com precisão materiais de construção biológicos em seus estados nativos e dentro da arquitetura intacta de células e tecidos. A espectroscopia Raman mostra um potencial sem precedentes para detectar metabólitos intrínsecos e espécies químicas em espécimes biológicos e foi recentemente reconhecida como uma ferramenta emergente para o perfil metabólico de espécimes biológicos1. Ao analisar os picos de vários grupos metabólicos mostrados nos espectros de impressão digital Raman, evidências crescentes mostram que as características da impressão digital podem ser usadas para detectar os estágios iniciais de doenças como câncer 2,3,4, distúrbios cardíacos 5,6 e doenças neurodegenerativas 7,8 e é particularmente útil para abordar problemas biológicos fundamentais 9,10 incluindo imagens de estruturas intracelulares sem qualquer perturbação de marcação11, diferenciando vários estados celulares12,13 e classificação do tipo de célula 14,15,16. A maioria das informações químicas (> 90%) codificadas nos espectros Raman está na região da impressão digital (500 a 1800 cm-1), tornando esta região de longe a mais útil para discriminar composições químicas em amostras biológicas17. No entanto, o sinal Raman fraco nesta faixa de frequência torna desafiadoras as aplicações da espectroscopia de impressão digital Raman para estudos biológicos, particularmente para espécimes biológicos vivos e intactos1.
As abordagens de imagem Raman coerente (CRI) reduzem significativamente o tempo de aquisição dos sinais Raman, mas a maioria delas adquire segmentos espectrais relativamente estreitos e são otimizadas para os fortes sinais de estiramento CH entre 2800 - 3100 cm-1. CARS de banda estreita e espalhamento Raman estimulado (SRS) (Figura 1A, B) usam pulsos de dois picossegundos, geralmente para adquirir uma porção estreita do forte sinal CH 18,19,20,21,22,23. As abordagens multiplex CRI, como o CARS multiplex (Figura 1C), usam uma combinação de pulsos de picossegundo e ~ 100 fs para obter uma faixa espectral moderada (geralmente ≤ 400 cm-1), geralmente na região CH 24,25,26,27,28,29,30. A aquisição de todo um espectro Raman biologicamente relevante (de 600 a 3200 cm-1) por pixel usando essas abordagens de imagem geralmente é proibitiva porque a maioria dos sinais de impressão digital é 10 a 100 vezes mais fraca do que os sinais de alongamento CH31. Ao contrário da maioria das abordagens CRI, o espalhamento Raman anti-Stokes coerente de banda larga (BCARS) é otimizado para aquisição de banda larga de disparo único que cobre as regiões de impressão digital e alongamento CH 31,32,33. O BCARS usa interações intra-pulso de um pulso de ~ 10 fs para excitar eficientemente vibrações de baixa frequência (impressão digital) (Figura 1D) e usa o mesmo mecanismo do CARS multiplex, a combinação do pulso fs com um pulso ps para gerar coerência vibracional na região de estiramento CH (Figura 1C) 32 , 33. Além disso, os sinais BCARS são intrinsecamente calibrados devido à sua interação com o fundo não ressonante (NRB), resultando em um espectro Raman completo quantitativo e invariante do instrumento por pulso de laser em cada pixel31, com a capacidade de adquirir rapidamente dados de alto conteúdo de informação de células, tecidos intactos e organismos biológicos vivos 32,34,35,36,37,38,39.
Os espectros BCARS brutos adquiridos contêm um forte chamado "fundo não ressonante" (NRB). O NRB é a contribuição da resposta eletrônica aos pulsos de laser que não é quimicamente específica. O NRB interfere coerentemente no sinal vibracionalmente ressonante, atuando como um amplificador heteródino32. O NRB também distorce o espectro Raman subjacente (Figura 2A), mas o espectro Raman pode ser recuperado desde que seções espectrais contíguas significativas sejam adquiridas. Atualmente, não há método de pós-processamento disponível para separar o sinal CARS ressonante do componente não ressonante usando uma abordagem CARS de banda estreita. A recuperação do sinal Raman do sinal CARS de banda larga pode ser alcançada utilizando a relação Kramers-Kronig no domínio do tempo (ou transformada de Hilbert) 33 , 40 ( Figura 2B ), entropia máxima41 , 42 ou aprendizado de máquina43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 Abordagens. Observe que os dois primeiros métodos recuperam analiticamente a fase (o sinal Raman ressonante) dos espectros brutos do BCARS, as abordagens de aprendizado de máquina podem ser altamente dependentes da instrumentação e dos modelos de treinamento.
Embora a microscopia BCARS permita a caracterização sem rótulos do perfil metabólico de espécimes biológicos, o mesmo laser supercontínuo (950 - 1200 nm para a configuração BCARS apresentada neste trabalho) usado para geração de sinal BCARS também pode excitar uma ampla gama de corantes, como corantes à base de rodamina, Bodipy, Alexa Fluor e cianina, e várias proteínas fluorescentes, incluindo GFP e mCherry49, 50. Em comparação com a excitação de fóton único usando lasers de onda contínua (CW) visível, a microscopia de fluorescência multifotônica, como microscopia de imagem de fluorescência de dois fótons (2p-FLIM) e microscopia de fluorescência de excitação de dois fótons (TPEF), usando luz infravermelha próxima (NIR) oferece uma profundidade de penetração de amostra mais profunda, capacidade de seccionamento 3D intrínseca, imagens de alto contraste e boa resolução comparável à microscopia confocal de última geração, tornando-a uma ferramenta atraente para microscopia biológica Pesquisa 51,52. A microscopia de imagem de fluorescência ao longo da vida (FLIM) usando uma abordagem de contagem de fótons únicos correlacionada ao tempo (TCSPC) detecta os sinais de decaimento de fluorescência repetidamente excitados por uma fonte de laser modulada no tempo53,54. O espectro de fluorescência de um determinado fluoróforo pode mudar com fatores ambientais, como a polaridade do solvente, mas essas mudanças geralmente são sutis. Por outro lado, os tempos de vida de fluorescência geralmente variam por fatores de dois ou mais com mudanças ambientais, como valores de pH55, viscosidade56, polaridade57 e concentração de espécies iônicas58,59, interações de ligação, presença de supressores ou mudanças estruturais53,54. Essa propriedade única do tempo de vida da fluorescência fornece um contraste de sinal adicional na imagem de fluorescência e abordou com sucesso os problemas de interferência de autofluorescência na imagem de células e tecidos60, desmisturando vários fluoróforos usando uma abordagem FLIM espectralmente resolvida61, diagnóstico de câncer e monitoramento de tratamento62, detecção sem rótulo de heterogeneidade celular63 e alterações metabólicas64,65.
Neste trabalho, apresentamos uma plataforma de imagem multimodal combinando BCARS, 2p-FLIM e TPEF. Até onde sabemos, esta é a primeira vez que apresentamos uma plataforma de imagem que permite imagens simultâneas de BCARS e 2p-FLIM/TPEF. Demonstramos as capacidades de imagem in vivo deste instrumento usando um organismo modelo geneticamente tratável amplamente utilizado, Caenorhabditis elegans (C. elegans). Mostramos que os espectros BCARS, os decaimentos 2p-FLIM do Vermelho do Nilo (um corante lipídico vital) e os sinais GFP de fluorescência de dois fótons de um marcador lipídico relatado (DHS-3 :: GFP) podem ser adquiridos simultaneamente in vivo de vermes corados com Vermelho do Nilo. Um guia prático para a abordagem de imagem aqui apresentado inclui (i) a amostra deve ser opticamente transparente e com uma espessura normalmente inferior a 100 μm; (ii) a condição de coloração pode ser diferente dependendo dos corantes e amostras. Nos resultados da coloração Nilo-Vermelho de C. elegans mostrados aqui, a concentração de Vermelho do Nilo está no nível ~μM, e o tempo de coloração pode variar de algumas horas a durante a noite66; iii) é necessário um ambiente de amostra escuro para evitar fugas de luz visível para os detectores 2p-FLIM/TPEF. Essas condições de imagem são idênticas às condições de imagem da maioria das microscopias ópticas e de fluorescência não lineares. Além disso, nosso sistema demonstrado aqui pode ser aplicado para detectar outros corantes e repórteres fluorescentes, além de Nile Red e GFP, introduzindo um laser adicional Ti: Sapphire fs que cobre a faixa de 700 a 950 nm para a excitação de fluorescência de dois fótons. Assim, enquanto os resultados representativos descritos neste protocolo são a imagem in vivo de C. elegans corado com corante expressando GFP, a plataforma de bioimagem química de conteúdo de informação ultra-alta tem aplicações que são amplas e de longo alcance.