Artigo de método

Família Sirtuin em Pesquisa de Células-Tronco Mesíquimas de Medula Óssea: Uma Análise Bibliométrica com Web of Science e R

DOI:

10.3791/68913

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30 de dezembro de 2025

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1Department of Prosthodontics, Tianjin Stomatological Hospital, School of Medicine, Nankai University, 2Tianjin Key Laboratory of Oral and Maxillofacial Function Reconstruction, 3Department of Periodontics, Tianjin Stomatological Hospital, School of Medicine, Nankai University

Neste artigo

Resumo

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Este estudo fornece um protocolo bibliométrico para identificar tendências de pesquisa da família Sirtuin em estudos de células-tronco mesenquimatosas da medula óssea usando Web of Science e R.

Resumo

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Este estudo apresenta um protocolo bibliométrico abrangente para mapear sistematicamente tendências de pesquisa e estruturas de conhecimento da família Sirtuínas (SIRTs) na pesquisa com células-tronco mesenquimais da medula óssea. O protocolo envolve a recuperação estruturada de literatura da Web of Science Core Collection usando termos de busca pré-definidos, a aplicação de critérios explícitos de inclusão e exclusão para triar artigos e revisões em inglês e análise bibliométrica aprofundada via o pacote bibliometrix em R. Etapas metodológicas chave incluem recuperação e limpeza de dados, análise estatística descritiva, avaliação de coocorrência de palavras-chave, mapeamento de redes colaborativas e geração de temas temáticos mapas de evolução e estrutura conceitual. Nossa análise de 496 artigos elegíveis (2009-2024) revelou um aumento significativo nas publicações anuais, com a China emergindo como o principal contribuidor. A Universidade Soochow e o autor LI Y foram identificados, respectivamente, como a instituição e o autor mais produtivos. Palavras-chave de alta frequência incluíam 'células-tronco mesenquimatos', 'estresse oxidativo' e 'SIRT1', com mapeamento temático destacando temas motores como senescência e estresse oxidativo. Esse arcabouço metodológico reproduzível e transparente não apenas delimita os pontos críticos atuais da pesquisa, mas também oferece uma abordagem rigorosa e escalável para a síntese bibliográfica em larga escala, apoiando avaliações científicas futuras e avaliações de tendências no campo com maior clareza e reprodutibilidade.

Introdução

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As células-tronco são células indiferenciadas capazes de autorrenovação e diferenciação, oferecendo considerável potencial terapêutico. Células-tronco adultas, como as células-tronco mesenquimais da medula óssea (BMSCs), são amplamente utilizadas na regeneração de tecidos devido à sua acessibilidade e falta de questões éticas em comparação com as células-troncoembrionárias 1. São células não hematopoiéticas da medula óssea capazes de se diferenciar em vários tipos celulares e estão envolvidas na reparação de tecidos e no tratamentode doenças 2,3.

Células-tronco adultas estão presentes em vários tecidos, incluindo medula óssea, gordura e pele, e elas evitam as preocupações éticas associadas às células-troncoembrionárias 4. Essas células mantêm o pool de células-tronco e apoiam a regeneração dos tecidos por meio dadiferenciação 5,6. A medula óssea, em particular, contém células-tronco mesenquimatosas que migram para tecidos danificados e contribuem para aregeneração 7,8. As aplicações incluem tratamento para câncer, degeneração do disco intervertebral e distúrbiosimunológicos 9,10.

A família Sirtuin (SIRTs) consiste em sete enzimas dependentes de NAD+ (SIRT1-SIRT7) que regulam diversas funções celulares, incluindo expressão gênica e reparação e metabolismodo DNA 11. Importante destacar que sua atividade é modulada por vários ativadores específicos (por exemplo, resveratrol para SIRT1, precursores de NAD⁺) e inibidores (por exemplo, nicotinamida, EX-527 para SIRT1), que são ferramentas cruciais de pesquisa e potenciais agentesterapêuticos 12. Essas proteínas estão localizadas em diferentes compartimentos subcelulares e têm sido implicadas em processos biológicos críticos. Diversos estudos destacaram a importância dos SIRTs na regulação da resposta ao estresse oxidativo, envelhecimento e diferenciação osteogênica nosBMSCs 12,13. As células-tronco mesenquimatosas da medula óssea são células não hematopoéticas derivadas da medula óssea capazes de se diferenciar em vários tipos celulares, como osteoblastos, condrócitos e adipócitos, desempenhando papéis vitais na reparação de tecidos e no tratamento de diversas doenças, incluindo degeneração do disco intervertebral, câncer e distúrbiosimunológicos 2,9,10.

Apesar do crescente corpo de literatura sobre SIRTs e BMSCs, falta uma síntese abrangente de tendências de pesquisa e estruturas de conhecimento. Embora revisões narrativas e sistemáticas tradicionais ofereçam discussões aprofundadas e avaliação crítica, elas podem ser subjetivas e demoradas, especialmente para áreas grandes e em rápida evolução. Em contraste, a análise bibliométrica oferece uma abordagem objetiva quantitativa para analisar grandes volumes de dados de publicação, permitindo a identificação de tendências de pesquisa, principais contribuintes e pontos críticos emergentes por meio da análise estatística e de redes14. O mapeamento do conhecimento aprimora ainda mais isso ao representar visualmente a estrutura intelectual e os desenvolvimentos dinâmicos dentro de um campo de pesquisa, oferecendo uma vantagem única no mapeamento do cenário conceitual e revelando padrões ocultos que podem passar despercebidos em revisõesqualitativas 15, 16, 17.

Este estudo emprega uma abordagem bibliométrica para mapear a estrutura do conhecimento dos SIRTs na pesquisa do BMSC. É importante notar que a análise se baseia exclusivamente em artigos e resenhas em inglês retirados da Web of Science (WOS) Core Collection, que, ao garantir a qualidade e consistência dos dados, pode excluir estudos relevantes publicados em outros idiomas ou indexados em outros bancos de dados. No entanto, ao utilizar o pacote bibliometrix em R, este estudo visa analisar objetivamente o desenvolvimento, as redes de colaboração e os focos temáticos nessa área, fornecendo assim insights valiosos e orientando futuras direções de pesquisa.

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Protocolo

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Este estudo utilizou apenas dados bibliográficos públicos e não envolveu humanos ou animais. Portanto, não era necessária aprovação do comitê de ética.

1. Desenho do estudo

  1. Realizar uma análise bibliométrica retrospectiva da literatura publicada sobre a família SIRTs em pesquisa com células-tronco mesenquimatosas da medula óssea.
  2. Colete literatura do WOS Core e realize recuperação estruturada, triagem, análise quantitativa e visualização de dados bibliográficos.

2. Recuperação de literatura

  1. Abra o Núcleo WOS e selecione o banco de dados SCI-Expandido (todos os códigos de operação e pontos de inspeção são mostrados em Arquivo Suplementar 1).
  2. Use a seguinte estratégia de busca: TS=('Célula-Tronco Mesenquimal*' OU 'Célula Estromal Mesenquimal*' OU 'Célula Estromal da Medula Óssea*' OU 'Célula Estromal Mesíquim Multipotente' OU 'Célula-tronco mesenquimal-medula óssea*') E TS=('SIRT*' OU 'Sirtuin' OU 'Sirtuins' OU 'SIRT1' OU 'SIRT2' OU 'SIRT3' OU 'SIRT6')
  3. Filtre os resultados para incluir apenas artigos de periódicos em inglês e artigos de revisão.
  4. Limite a data de publicação para 1º de novembro de 2024.
  5. Exporte as referências selecionadas como um arquivo de texto simples com registros completos e referências citadas.

3. Triagem de literatura

  1. Use os seguintes critérios de inclusão:
    1. Tipo de estudo: artigos originais de pesquisa e artigos de revisão
    2. Idioma: artigos publicados em inglês
  2. Use os seguintes critérios de exclusão:
    1. Remova publicações duplicadas.
    2. Exclua estudos que não estejam principalmente relacionados a SIRTs e BMSCs (por exemplo, estudos focados em outros alvos de SIRT, outros tipos celulares ou doenças não relacionadas).
    3. Exclua tipos de artigos, como resumos de reuniões, anais de conferências, editoriais, cartas, errátas, capítulos de livros e patentes.
    4. Exclua estudos cujo texto completo não está acessível.

4. Limpeza de dados

  1. Abra o arquivo de texto exportado em R usando o pacote bibliometrix.
  2. Converta o arquivo de texto em um frame de dados usando a função convert2df().
  3. Exclua artigos duplicados.
  4. Filtre os títulos e resumos para remover literatura irrelevante.

5. Análise de dados

  1. Instale os pacotes R, bibliometrix, ggplot2, igraph, factoextra e wordcloud, a partir da Comprehensive R Archive Network usando a função install.packages().
  2. Analise o número de publicações anuais, a produtividade dos autores, as contribuições dos países, os resultados institucionais e as métricas de citação.
  3. Identifique a frequência de palavras-chave e as tendências de crescimento usando a palavra-chave Crescimento().
  4. Construa redes de colaboração entre países e instituições usando networkPlot().
  5. Avalie a distribuição e o impacto dos periódicos usando funções de análise de fontes.

6. Visualização

  1. Use as funções thematicMap() e conceptualStructure() para gerar mapas de evolução temática e estrutura conceitual.
  2. Exporte gráficos em formatos de alta resolução (Portable Document Format [PDF] ou Tagged Image File Format [TIFF]) para apresentação de figuras.

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Resultados

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Dados gerais de publicação

Um total de 580 artigos foram recuperados da Coleção Núcleo WOS usando a estratégia detalhada de busca. Após aplicar os critérios pré-definidos de inclusão e exclusão para remover 84 registros não relacionados (por exemplo, estudos que não focavam principalmente em SIRTs em BMSCs ou tipos de publicação irrelevantes, como resumos de reuniões) ou duplicatas, 496 artigos elegíveis foram incluídos na análise final. Todos...

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Discussão

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Atualmente, existem muitos estudos sobre a família SIRTs e BMSCs, mas falta uma síntese abrangente das tendências de pesquisa. A Sirtuin 6 é um membro único da família conhecida SIRTs e possui diversas funções em diferentes vias moleculares relacionadas à reparação do DNA, glicólise, gluconeogênese, tumorigênese, neurodegeneração e hipertrofia cardíaca18,19. Seus amplos papéis regulatórios destacam seu grande potencial translacio...

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Divulgações

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Os autores não têm conflitos de interesse a revelar.

Agradecimentos

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Agradecemos a todos os membros do nosso grupo de pesquisa por suas contribuições e feedback durante a preparação do manuscrito.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
computador rodando o sistema operacional Windows 11Microsoft Corporation, Redmond, WA, EUA)
Rversão 4.4.1, R Foundation for Statistical Computing, Viena, ÁustriaBibliometrix (versão 4.3.1), ggplot2, igraph, factoextra e wordcloud

Referências

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