Os mecanismos precisos subjacentes à patogênese da doença de Parkinson (DP) permanecem incompletamente compreendidos, particularmente em relação ao papel da inflamação microglial e da sobrevivência dos neurônios da serotonina. Este protocolo delineia uma estrutura abrangente para elucidar como a metiltransferase 3 (Mettl3) modula o fator nuclear eritróide 2 relacionado ao fator 2 (Nrf2) por meio da modificação de N6-metiladenosina (m6A), atenuando assim a piroptose microglial e preservando os neurônios da serotonina em modelos de DP in vitro e in vivo . O objetivo principal é fornecer aos pesquisadores metodologias reprodutíveis para dissecar a regulação epitranscriptômica das vias neuroinflamatórias, começando com a ativação microglial induzida por lipopolissacarídeo (LPS) em células BV2 para simular cascatas inflamatórias, seguida por PCR quantitativo de imunoprecipitação de RNA metilado (MeRIP-qPCR) para análise de m6A. In vivo, detalhamos o estabelecimento de um modelo de camundongo com DP induzido por MPTP, complementado pela entrega estereotáxica de vetores do sorotipo 9 do vírus adeno-associado (AAV9) para modulação Nrf2 direcionada no estriado. As avaliações comportamentais abrangem a colocação do membro anterior, a aceleração do rotarod e os testes de campo aberto para quantificar os deficits motores, enquanto os ensaios moleculares incluem Western blotting para marcadores de piroptose (por exemplo, NLRP3, caspase-1 clivada), ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA) para citocinas e coloração de diidroetídio (DHE) para detecção de espécies reativas de oxigênio (ROS) em neurônios de serotonina. Técnicas avançadas de microscopia, como imuno-histoquímica para Iba1 e TPH2, permitem a visualização da dinâmica microglial e da integridade serotoninérgica. Os resultados comprovam que a deficiência de Mettl3 exacerba a regulação negativa de Nrf2, a hiperativação do inflamassoma NLRP3, a morte celular piroptótica e a consequente degeneração do neurônio serotoninérgico. Este método não apenas fornece um andaime experimental robusto para sondar a neuroproteção mediada por m6A, mas também destaca possíveis caminhos terapêuticos para mitigar a progressão da DP por meio da modulação direcionada do eixo Mettl3 / Nrf2 em contextos neurodegenerativos.