A identificação precoce de pacientes com risco de fratura vertebral incidente permanece desafiadora porque a avaliação clínica rotineira de risco não capta completamente a fragilidade espinhal local. Este estudo de coorte retrospectivo unicêntrico avaliou se características de aprendizado profundo (DL) extraídas de radiografias laterais toracolombares basais melhoram a predição de fratura vertebral incidente em até 2 anos quando combinadas com fatores de risco clínicos. Um total de 2.173 pacientes foi incluído e dividido cronologicamente em uma coorte de derivação (n = 1.449) e uma coorte de validação interna (n = 724). As características de DL foram derivadas das radiografias basais, e a regressão LASSO-Cox foi utilizada para selecionar preditores e construir um modelo clínico, um modelo de DL e um modelo combinado. O desempenho foi avaliado por correção de otimismo bootstrap, validação interna temporal, calibração, análise de curva de decisão, melhoria na reclassificação líquida dependente do tempo (NRI), melhoria na discriminação integrada (IDI) e análises de sensibilidade. De 2.048 características candidatas de DL, 5 foram mantidas para gerar um escore de DL, que permaneceu um preditor independente no modelo combinado (HR 1,64, IC 95% 1,34–2,01; P < 0,001). Na validação interna, o modelo combinado alcançou um índice C de 0,759, uma AUC de 2 anos de 0,774 e um escore de Brier de 2 anos de 0,077, todos superiores ao modelo clínico, com boa calibração (intercepto 0,012; inclinação 0,972). Em comparação com o modelo clínico, o modelo combinado também melhorou a reclassificação (NRI de 2 anos de 0,316 na derivação e 0,241 na validação) e a discriminação (IDI de 2 anos de 0,047 e 0,033, respectivamente; todos P < 0,01) e proporcionou maior benefício líquido na análise de curva de decisão. As análises de sensibilidade foram consistentes com os resultados principais. A combinação de características de DL de radiografias laterais toracolombares com fatores de risco clínicos pode permitir uma predição individualizada mais precisa de fratura vertebral incidente em até 2 anos.