Embora a detecção precoce de lesões pré-cancerosas do sistema gastrointestinal superior seja vital, variações sutis na mucosa frequentemente limitam o rastreamento endoscópico convencional. Para abordar essa limitação, apresentamos um protocolo padronizado de biópsia direcionada usando endoscopia ampliadora com imagem de banda estreita (ME-NBI). Esse fluxo de trabalho sistemático integra critérios-chave microestruturais e microvasculares — especificamente linhas de demarcação, microsuperfícies irregulares, microvasculatura atípica e distorção glandular marcada — para identificar áreas focais de alto risco para amostragem mucosa. Em uma avaliação clínica prospectiva envolvendo 161 pacientes, esse fluxo de trabalho padronizado ME-NBI foi comparado com uma avaliação endoscópica convencional de luz branca. A aplicação desse protocolo aumentou significativamente a taxa de primeiros positivos, a positividade geral da biópsia e o rendimento diagnóstico de lesões de alto risco por amostra de biópsia, ao mesmo tempo em que reduziu simultaneamente o número total de amostras de biópsia necessárias por paciente. Além disso, o fluxo de trabalho padronizado demonstrou alto desempenho diagnóstico, alcançando uma área sob a curva (AUC) de 0,928, e gerou forte concordância entre observadores. Ao estabelecer critérios objetivos para a seleção do alvo, esse fluxo de trabalho reprodutível reduz a subjetividade do operador, apoia a detecção precoce de neoplasias e fornece uma estrutura prática para a implementação clínica.