O estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética do Hospital Hefei BOE (número de aprovação 2021–1), e o consentimento informado por escrito foi obtido de todos os participantes antes da inscrição.
Pacientes e espécimes
Este estudo recrutou 135 pacientes com AR (diagnosticada de acordo com os critérios de classificação ACR/EULAR de 2010) do Departamento de Reumatologia e Imunologia do Hospital Hefei BOE, 130 pacientes com OA do Departamento de Ortopedia (diagnosticados de acordo com os critérios diagnósticos de OA da Associação Médica Chinesa de 2018) e 125 controles saudáveis pareados por idade e sexo do centro de exames médicos do mesmo hospital. Os participantes tinham idade entre 30 e 80 anos. Os controles saudáveis foram confirmados como livres de doenças autoimunes, distúrbios articulares e infecções agudas mediante revisão abrangente do histórico clínico, exame físico e testes laboratoriais. Foram excluídos participantes com doenças autoimunes concomitantes, histórico de infecção ou trauma nos últimos 3 meses, neoplasias ou que estivessem grávidas ou em período de lactação.
Coleta e preparação
Sangue venoso em jejum foi coletado de todos os participantes do estudo. Após a coagulação à temperatura ambiente por 30 min, as amostras de soro foram isoladas por centrifugação a 1500 × g por 15 min. O soro foi armazenado a -80°C até a análise posterior.
Detecção de marcadores clínicos e sorológicos
Para avaliar de forma abrangente o estado da doença e a atividade inflamatória, biomarcadores clínicos e sorológicos foram medidos utilizando métodos laboratoriais clínicos padronizados. A VHS foi medida pelo método de Westergren para avaliar a inflamação sistêmica inespecífica. A PCR foi quantificada por meio de um ensaio imunoturbidimétrico (valor de referência normal: <10 mg/L) para avaliar a resposta inflamatória de fase aguda. O FR foi medido por ensaio imunoenzimático (ELISA), com valor de referência normal de ≤20 UI/mL. Os anticorpos anti-CCP foram medidos por meio de um ELISA de segunda geração para fornecer evidência sorológica para o diagnóstico de AR.
Linhas celulares e cultivo
As células de sinoviócitos semelhantes a fibroblastos humanos afetados por AR (HFLS-RA) foram cultivadas em meio mínimo essencial modificado de Dulbecco (DMEM) suplementado com 10% de soro bovino fetal (FBS) e 1% de penicilina-estreptomicina. As células foram mantidas em incubadora a 37 °C com 5% de CO₂, e foram utilizadas células entre a terceira e a sexta passagem para todos os experimentos.
Extração de RNA e RT-PCR quantitativa em tempo real
O RNA total foi extraído de amostras de soro utilizando um reagente de extração de RNA. A transcrição reversa foi realizada utilizando um kit de síntese de primeira fita para miRNAs e um kit de transcrição reversa para genes-alvo de RNA mensageiro (mRNA), conforme as instruções do fabricante. A reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real (RT-qPCR) foi realizada utilizando um sistema de PCR em tempo real com uma mistura mestra de PCR baseada em SYBR Green. O programa termociclante foi definido para desnaturação prévia a 95 °C por 30 s; seguido por 40 ciclos de amplificação (desnaturação a 95 °C por 5 s e pareamento/alongamento a 60 °C por 30 s). Cada amostra foi analisada em triplicata. O RNA nuclear pequeno U6 (U6 snRNA) e a gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase (GAPDH) foram utilizados como genes de referência endógenos para normalização de miRNA e mRNA, respectivamente. As sequências dos iniciadores foram resumidas na Tabela Suplementar 1. Os níveis relativos de expressão de miR-488-3p e seus genes-alvo foram calculados utilizando o método 2−ΔΔCt. As alterações nos níveis de mRNA dos genes-alvo após superexpressão ou inibição de miR-488-3p também foram analisadas para verificar suas relações regulatórias.
Transfeção de células
Células HFLS-RA foram semeadas em placas de 6 poços com uma densidade de 5 × 105 células/poço. As células foram transfectadas utilizando um reagente de transfeção baseado em lipossomos, conforme as instruções do fabricante. Os grupos de transfeção incluíram grupos de transfeção única e de co-transfeção. Os grupos de transfeção única foram: 1) controle—células não transfectadas; 2) controle negativo do miR (NC)—células transfectadas com o controle negativo do miR-488-3p; 3) miR-488-3p—células transfectadas com o miR-488-3p; 4) controle negativo do inibidor (inibidor NC)—células transfectadas com o controle negativo do inibidor de miR-488-3p; 5) inibidor de miR-488-3p—células transfectadas com o inibidor de miR-488-3p. Os grupos de co-transfeção foram: 1) miR-488-3p + controle de superexpressão (oe-NC)—células co-transfectadas com o miR-488-3p e o controle negativo dos vetores de superexpressão de ROCK1; 2) miR-488-3p + oe-ROCK1—células co-transfectadas com o miR-488-3p e vetores de superexpressão de ROCK1. Todas as sequências de transfeção foram resumidas na Tabela Suplementar 1. O vetor de superexpressão de ROCK1 foi construído pela clonagem da região de sequência codificante (CDS) no plasmídeo pcDNA 3.1. As células transfectadas estiveram disponíveis para os experimentos subsequentes após 48 h de transfeção celular.
Ensaio de função celular
Ensaio de proliferação celular (Kit de contagem de células-8 [CCK-8]): Células HFLS-RA transfectadas foram inoculadas em placas de 96 poços a 5 × 103 células/poço, com três poços replicados por grupo. Após 0, 24, 48 e 72 h da transfeção, adicionou-se 10 µL da solução CCK-8 a cada poço, seguido de incubação a 37 °C por 2 h. A absorbância foi medida a 450 nm (comprimento de onda de detecção) e 630 nm (comprimento de onda de referência) utilizando um leitor de microplacas. A taxa relativa de proliferação foi calculada utilizando o tempo de 0 h como linha de base.
Detecção de apoptose (citometria de fluxo): A apoptose foi avaliada por meio de análise com o ensaio de apoptose Annexina V-fluoresceína isotiocianato (FITC)/iodeto de propídio (PI). As células foram transfectadas com os plasmídeos apropriados e, em seguida, coletadas após a tripsinização. A taxa de apoptose foi determinada por citometria de fluxo.
Dosagem de fator inflamatório (ensaio imunoenzimático [ELISA]): Células HFLS-RA foram semeadas em placas de 24 poços e transfectadas com o mimetizador de miR-488-3p, inibidor de miR-488-3p ou seus controles negativos correspondentes por 48 h. As concentrações de interleucina-6 (IL-6), fator de necrose tumoral-α (TNF-α) e interleucina-1β (IL-1β) nos sobrenadantes do cultivo celular foram quantificadas utilizando kits de ELISA.
Validação do alvo
Previsão de alvo: previu-se que ROCK1 fosse um alvo a jusante do miR-488-3p utilizando o banco de dados TargetScan26. Também foram identificados os sítios de ligação previstos entre o miR-488-3p e a região não traduzida 3′ (3′UTR) de ROCK1.
Ensaio de Gene Repórter Dual-Luciferase: A região 3′UTR selvagem ou mutante de ROCK1 foi clonada no plasmídeo pGL3. Os locais de ligação previstos e os locais mutantes são mostrados na Figura 4. Células HEK-293T foram co-transfectadas com o análogo de miR-488-3p ou com inibidor juntamente com os vetores construídos27. A atividade de luciferase foi medida 48 h após a transfeção com o análogo ou inibidor de miR-488-3p.
Imunoprecipitação de RNA (RIP): Células HFLS-RA foram incubadas com um anticorpo anti-Argonauta 2 (Ago2) (RRID: AB_2882071, diluição 1:200) ou com um anticorpo controle de imunoglobulina G (IgG) (RRID: AB_2819160, diluição 1:5000), seguido pela extração de RNA e PCR quantitativa (qPCR) para enriquecimento de mRNA de ROCK1 conforme descrito acima.
Análise estatística
O estudo foi analisado estatisticamente utilizando o SPSS 23.0 (RRID: SCR_002865) e o GraphPad Prism 9.0 (RRID: SCR_002798). Os dados de medição foram expressos como média ± desvio padrão (DP). Todos os experimentos foram realizados com três réplicas biológicas, e cada réplica biológica foi analisada em triplicata. Os dados brutos foram anexados no material suplementar. Os dados foram avaliados por meio de um gráfico de probabilidade normal (P-P) antes dos testes estatísticos paramétricos. O teste t para amostras independentes foi utilizado para comparar as variáveis contínuas de linha de base (por exemplo, idade, índice de massa corporal [IMC], etc.) e o teste qui-quadrado foi utilizado para as variáveis categóricas (por exemplo, sexo, etc.). Os níveis de expressão gênica foram comparados utilizando o teste t para amostras independentes. As alterações na proliferação celular em diferentes momentos foram analisadas por meio de análise de variância de medidas repetidas (ANOVA), enquanto a ANOVA de um fator foi utilizada para comparar as taxas de apoptose determinadas por citometria de fluxo. A análise de correlação foi realizada utilizando o coeficiente de Spearman (para variáveis que não seguem distribuição normal) e o coeficiente de Pearson (para variáveis que seguem distribuição normal). O desempenho diagnóstico foi avaliado por meio da análise da curva característica de operação do receptor (ROC). O valor de corte ótimo, sensibilidade e especificidade foram determinados utilizando o índice de Youden máximo. Todos os testes estatísticos foram bicaudais, e p < 0,05 foi considerado estatisticamente significativo.