A citometria de fluxo é uma poderosa e amplamente utilizada ferramenta analítica que permite a avaliação quantitativa da expressão proteica em resolução de única célula, facilitando assim o exame de populações celulares heterogêneas e raras1,2,3. Embora as abordagens convencionais de citometria de fluxo utilizem principalmente anticorpos direcionados a antígenos de superfície celular, muitas proteínas funcionalmente importantes, como fatores de transcrição, reguladores do processamento de RNA e receptores que sofrem internalização induzida por ligante, estão localizados em compartimentos intracelulares. Consequentemente, essas proteínas citoplasmáticas e nucleares são inacessíveis utilizando protocolos padrão de marcação de superfície. A incorporação de métodos de marcação intracelular, que envolvem fixação e permeabilização das membranas celulares, expandiu substancialmente a utilidade da citometria de fluxo, permitindo a avaliação quantitativa de proteínas intracelulares, citocinas e intermediários de sinalização, ao mesmo tempo em que preserva as capacidades de alto rendimento e multiparamétricas da análise convencional de citometria de fluxo4,5,6,7.
Uma limitação importante na detecção de proteínas associadas à superfície e intracelulares por citometria de fluxo é a disponibilidade de anticorpos adequados e, em muitos casos, o conhecimento incompleto das sequências de epítopos ou imunógenos8,9. Uma vez que as estratégias de imunofenotipagem baseiam-se principalmente em marcadores de superfície celular, a maioria dos anticorpos comercialmente disponíveis e validados para citometria de fluxo são monoclonais, reconhecem um único epítopo extracelular e são pré-conjugados a fluoróforos. Em contraste, os anticorpos policlonais são capazes de reconhecer múltiplos epítopos dentro de uma proteína alvo e são comumente utilizados em western blot, imunohistoquímica ou imunofluorescência. No entanto, esses anticorpos geralmente não são conjugados e, portanto, não são diretamente compatíveis com os fluxos de trabalho padrão de citometria de fluxo. O uso de anticorpos primários não conjugados em combinação com anticorpos secundários conjugados a fluoróforos oferece uma alternativa flexível que amplia o leque de alvos detectáveis e pode permitir a amplificação do sinal, o que pode ser vantajoso para proteínas de baixa abundância.
Para superar essas limitações, otimizamos um protocolo para coloração de proteínas em células de eritroleucemia humana K56210. A coloração intracelular requer fixação para preservar a estrutura e o estado celulares, bem como permeabilização para permitir que os anticorpos acessem compartimentos intracelulares. Neste protocolo, as células são fixadas com paraformaldeído (PFA), um fixador de reticulação comumente utilizado que mantém a morfologia celular e pode aumentar a permeabilidade da membrana celular sob condições específicas11,12,13,14. A permeabilização com etanol (EtOH) permite a entrada de anticorpos em compartimentos intracelulares, incluindo o acesso a alvos nucleares5,13,15. Após a permeabilização, realiza-se a coloração com anticorpos primários policlonais não conjugados e anticorpos secundários conjugados a fluoróforos. Utilizando este fluxo de trabalho, o tratamento com PFA isoladamente é empregado para detecção de imunorreatividade não superficial, enquanto um passo adicional de permeabilização com EtOH é utilizado para detecção de alvos nucleares. A avaliação da especificidade da coloração nuclear por competição com peptídeo mostrou inibição dependente da dose do ligante do anticorpo pelo peptídeo correspondente, mas não por um controle não específico. No geral, o uso de anticorpos primários policlonais não conjugados amplia a aplicabilidade da citometria de fluxo além da análise convencional de marcadores superficiais com anticorpos conjugados a fluoróforos e fornece uma abordagem flexível para avaliar a expressão proteica intracelular com resolução em nível de célula única.