Análise histoquímica de genótipos de algodoeiro resistentes e suscetíveis
O exame histoquímico de seções transversais de raiz e caule no estágio da folha verdadeira revelou diferenças visuais entre genótipos resistentes e suscetíveis, conforme demonstrado na Figura 4, Figura 5 e Figura Suplementar 1 (seções transversais de caule). Ampliações maiores (100x–300x) permitiram visualizações detalhadas dessas diferenças (Figura 4A–C e Figura 5A–C para genótipos resistentes e Figura 4D–F e Figura 5D–F para genótipos suscetíveis). Os padrões de coloração da lignina diferiram conforme os tipos de tecido: os genótipos resistentes exibiram padrões de coloração de lignina menores ou semelhantes nos caules, enquanto os genótipos suscetíveis apresentaram visualmente uma lignificação relativamente maior no caule (Supplementary Figure 1A–D).
Análise quantitativa de imagens da coloração da lignina
Deltapine 16, um cultivar suscetível incluído neste estudo, exibiu menor coloração de lignina (Figura 6A–C) com valores percentuais de área colorida de 12, 17,8 e 16,3 (Figura 6D). O genótipo suscetível A2-40 apresentou valores percentuais de área colorida de 25,2, 19,9 e 28,75, enquanto o genótipo resistente, A2-995, mostrou valores percentuais de área colorida de 54,95, 58,71 e 69,85 (Figura 7). No entanto, A2-20 apresentou valores percentuais de área colorida de 16,6, 21,3 e 20,4, enquanto A2-514 mostrou valores percentuais de área colorida de 49,8, 34,1 e 43,38 (Figura 8). A comparação resultou em um valor de p de 0,06. Como esses valores foram gerados utilizando diferentes limiares, foi realizada uma análise no ImageJ com limiar uniforme, utilizando limiares idênticos de matiz, saturação e brilho para garantir a reprodutibilidade entre as réplicas. O genótipo resistente (A2-514) apresentou coloração relativamente maior do que o genótipo suscetível (A2-20). A porcentagem de área colorida foi calculada como a razão entre os pixels positivos para lignina e o total de pixels do tecido na seção. A comparação quantitativa com limiar uniforme entre o genótipo suscetível A2-20 e o genótipo resistente A2-514 é apresentada na Figura 9. No geral, a análise com limiar uniforme demonstra que existem diferenças específicas de genótipo na lignificação entre esses genótipos.
DISPONIBILIDADE DE DADOS:
Os dados brutos são adicionados como um Arquivo Suplementar.

Figura 1: Vista microscópica de nematoides reniformes se alimentando de raízes de algodoeiro. Nematoides reniformes se alimentando de raízes de algodoeiro são mostrados com aumento de 50x após coloração com corante alimentar vermelho. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 2: Preparação do material vegetal para análise histoquímica da lignina. O fluxo de trabalho consiste nas seguintes etapas: (1) embeber sementes de algodão em água; (2) colocar as sementes sobre toalhas de papel úmidas em uma placa de Petri estéril rotulada; (3) permitir a germinação das sementes por 2 dias e transferir as plântulas para vasos rotulados contendo solo; (4) cultivar as plântulas até o estágio de cotilédone; (5) continuar o cultivo das plantas até o estágio de folhas verdadeiras e preparar seções transversais dos caules e raízes; e (6) corar as seções de tecido coletadas e observá-las ao microscópio. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 3: Coleta e coloração de seções de raiz e caule de algodoeiro utilizando ácido floroglucinólico-HCl. O fluxo de trabalho consiste nas seguintes etapas: (1) cultivar três repetições biológicas até o estágio de folhas verdadeiras; (2) remover cuidadosamente as plantas do solo, lavar com água e prepará-las para o corte em seções; (3) utilizar uma lâmina estéril para preparar seções transversais do caule; (4) utilizar uma lâmina estéril para preparar seções transversais da raiz; (5) colorir as seções do caule com ácido floroglucinólico-HCl a 3%, enxaguar com água e observar ao microscópio; (6) colorir as seções da raiz com ácido floroglucinólico-HCl a 3%, enxaguar com água e observar ao microscópio; e (7) observar as seções coradas ao microscópio para visualizar as diferenças na coloração com floroglucinol e registrar as imagens. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 4: Coloração de lignina em seções transversais de raízes dos genótipos de algodão A2-514 e A2-20. Seções transversais de raízes coradas para lignina do genótipo resistente A2-514 em aumento de (A) 100x, (B) 200x e (C) 300x. Seções transversais de raízes coradas para lignina do genótipo suscetível A2–20 em aumento de (D) 100x, (E) 200x e (F) 300x. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 5: Coloração da lignina em seções transversais de raízes dos genótipos de algodão A2-995 e A2-40. Seções transversais de raízes coradas para lignina do genótipo resistente A2-995 em aumento de (A) 100x, (B) 200x e (C) 300x. Seções transversais de raízes coradas para lignina do genótipo suscetível A2-40 em aumento de (D) 100x, (E) 200x e (F) 300x. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 6: Coloração da lignina e análise quantitativa de seções transversais de raiz de Deltapine 16. Seções transversais de raiz coradas para lignina de três repetições biológicas do cultivar suscetível Deltapine 16 em aumento de 100x: (A) repetição biológica 1, (B) repetição biológica 2 e (C) repetição biológica 3. (D) Porcentagem de área corada para as três repetições biológicas determinada por análise quantitativa com ImageJ. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 7: Análise quantitativa da coloração da lignina nos genótipos de algodão A2-40 e A2-995. Área colorida em porcentagem determinada pela análise com o ImageJ para três repetições biológicas do genótipo suscetível A2-40 e do genótipo resistente A2-995. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 8: Análise quantitativa da coloração da lignina nos genótipos de algodão A2-20 e A2-514. Área colorida em porcentagem determinada pela análise com o ImageJ para três repetições biológicas do genótipo suscetível A2-20 e do genótipo resistente A2-514. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 9: Quantificação com limiar uniforme da coloração da lignina em genótipos de algodão A2-20 e A2-514. Porcentagem de área colorida no genótipo suscetível A2-20 e no genótipo resistente A2-514 após análise de imagem com limiar uniforme. A comparação estatística foi realizada utilizando o teste t de Welch (t = −1,52, p = 0,267). Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 10: Visualização da coloração da lignina em diferentes regiões da raiz. Imagens representativas mostrando a coloração da lignina nas regiões de maturação da raiz, alongamento da raiz e ápice radicular. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.
Figura Suplementar 1: Coloração da lignina em seções transversais do caule de genótipos de algodoeiro resistentes e suscetíveis. Seções transversais do caule coradas para lignina em aumento de 100x de (A) A2-20 suscetível, (B) A2-514 resistente, (C) A2-40 suscetível e (D) A2-995 resistente. Clique aqui para baixar este arquivo.