A eletroacupuntura melhora a função cardíaca e atenua a lesão miocárdica em ratos com insuficiência cardíaca crônica
Para avaliar os efeitos da AE na IC, o modelo de rato foi estabelecido por ligadura da artéria coronária DA, seguido de intervenções específicas de AE ou AE Simulada. Foram realizadas avaliações sistemáticas, incluindo ecocardiografia, ensaios bioquímicos e coloração histológica (Figura 2A). Funcionalmente, o grupo com IC apresentou dilatação ventricular e comprometimento da contratilidade. O tratamento com AE atenuou as reduções na FEVE e na DFSV observadas nos ratos com IC, enquanto o grupo com AE Simulada exibiu níveis de função cardíaca comparáveis aos do grupo com IC (Figura 2B e Figura 2C).
Além disso, a AE reduziu os níveis séricos de NT-proBNP e cTnT, indicando menor sobrecarga cardíaca e atenuação da lesão miocárdica. Em contraste, o grupo AE Simulado apresentou parâmetros bioquímicos semelhantes aos do grupo ICC (Figura 2E,F). A análise histológica mostrou que o grupo ICC exibia dano estrutural miocárdico e fibrose. O tratamento com AE melhorou a arquitetura miocárdica e reduziu a FVC, enquanto o grupo AE Simulado manteve alterações patológicas e níveis de FVC semelhantes aos do grupo ICC (Figura 2D). No geral, a AE exerceu efeitos cardioprotetores contra a ICC, enquanto a intervenção com AE Simulado não produziu resultados terapêuticos semelhantes.
A eletroacupuntura ativa neurônios no núcleo do trato solitário de ratos com insuficiência cardíaca crônica
Para determinar se o NST media a resposta central ao tratamento com EA, a ativação neuronal foi avaliada por meio da marcação para c-Fos, um marcador de excitação neural. A imagem de imunofluorescência (Figura 3A) e a contagem quantitativa de células (Figura 3B) revelaram que o número de neurônios positivos para c-Fos no NST foi menor no grupo CHF em comparação com o grupo Sham. No entanto, o tratamento com EA aumentou a expressão de c-Fos a níveis comparáveis à linha de base do grupo Sham. Paralelamente aos resultados funcionais periféricos, o grupo Sham EA exibiu níveis de expressão de c-Fos semelhantes aos do grupo CHF.
Para avaliar o estado funcional desses neurônios do NST, foram registrados sinais eletrofisiológicos in vivo. Os traçados da descarga de potenciais de ação (Figura 3C) e a taxa média de disparo quantitativa (Figura 3D) estavam alinhados com os achados histológicos. A frequência de disparo espontâneo dos neurônios do NST foi reduzida nas condições de ICC. Em contraste, a intervenção com AE aumentou a taxa de disparo neuronal, enquanto o procedimento de AE Simulado não produziu essas alterações eletrofisiológicas.
Esse padrão de ativação neural foi confirmado pela análise do potencial de campo local. Conforme ilustrado nos espectrogramas de escala de cores do PCL 2D e nos mapas tridimensionais de densidade espectral de potência (Figura 3E), a energia oscilatória neural dentro do NST foi atenuada durante o estado de ICC. Após o tratamento com AE, houve um aumento na intensidade da potência ao longo do espectro de frequência neural, indicando a ativação da rede, o que não foi observado no grupo controle de AE simulada.
Para examinar a relevância fisiológica dessa ativação central, foi realizada uma análise de correlação de Pearson, integrando métricas cardíacas periféricas com a atividade neuronal central no NTS (Figura 3F). A análise demonstrou que a frequência média de disparos e a expressão de c-Fos no NTS apresentaram correlação positiva com a FEVE. Por outro lado, esses indicadores de atividade neural central exibiram correlação negativa com o marcador sérico de insuficiência cardíaca NT-proBNP. Essas correlações indicam que a ativação neural do NTS modulada pela EA está associada à sua eficácia cardioprotetora periférica.
A eletroacupuntura altera o perfil proteômico global no núcleo do trato solitário
Devido à falta de eficácia terapêutica observada no grupo EA Sham durante as avaliações funcionais anteriores, a fase de proteômica incluiu apenas os grupos Sham, CHF e EA. Antes da coleta dos tecidos, 12 ratos por grupo foram submetidos à avaliação ecocardiográfica para avaliar os efeitos terapêuticos da EA, e esses resultados são apresentados na Figura Suplementar 1A. Após essa avaliação, 6 réplicas biológicas de cada grupo foram submetidas à análise proteômica quantitativa baseada em espectrometria de massas.
Foram realizadas análises de controle de qualidade e multivariadas para avaliar a confiabilidade e a distribuição geral dos dados proteômicos. O número total de proteínas identificadas foi de 5.914 no grupo Sham, 5.980 no grupo CHF e 5.836 no grupo EA, indicando detecção comparável de proteínas entre os três grupos experimentais (Figura 4A e Tabela Suplementar 1). A análise de discriminação por mínimos quadrados parciais demonstrou separação clara entre os grupos Sham, CHF e EA, indicando perfis proteômicos globais distintos associados ao estado da doença e à intervenção com EA (Figura 4B).
A análise discriminante de mínimos quadrados parciais por pares ortogonais demonstrou ainda mais a separação entre os grupos Sham e CHF (Figura 4C) e entre os grupos CHF e EA (Figura 4D). Os testes de permutação correspondentes apoiaram a confiabilidade dos modelos respectivos. Além disso, o mapa de calor da correlação de Pearson mostrou altas correlações intragrupo e padrões distintos entre grupos entre as amostras proteômicas, o que apoia a reprodutibilidade dos replicados biológicos (Figura 4E). Em conjunto, essas análises de controle de qualidade e multivariadas indicaram que o conjunto de dados proteômicos era suficientemente robusto para a identificação subsequente e análise bioinformática de proteínas diferencialmente expressas.
A eletroacupuntura modula proteínas diferencialmente expressas e vias de sinalização centrais no núcleo do trato solitário
Para explorar os alvos moleculares da AE, foram analisadas as alterações proteicas. Os gráficos de dispersão exibiram a distribuição das proteínas reguladas para cima e para baixo nas comparações Sham versus CHF e CHF versus AE (Figura 5A, Tabela Suplementar 2 e Tabela Suplementar 3). Para identificar os alvos terapêuticos, foi realizada uma análise de interseção. Conforme ilustrado nos diagramas de Venn, identificaram-se 58 proteínas reguladas para cima no grupo CHF, mas reguladas para baixo após o tratamento com AE, juntamente com 27 proteínas reguladas para baixo no grupo CHF e reguladas para cima pela intervenção com AE (Figura 5B e Tabela Suplementar 4). Esta triagem resultou em um total de 85 proteínas diferencialmente expressas centrais. O mapa térmico de agrupamento hierárquico demonstrou que a intervenção com AE modulou os padrões anormais de expressão dessas 85 proteínas, deslocando seus perfis em direção à linha de base Sham (Figura 5C).
Para determinar as funções biológicas desses alvos centrais, foram realizadas análises de enriquecimento GO e KEGG separadamente para os dois subconjuntos distintos de proteínas. Para o subconjunto de 58 proteínas reguladas negativamente pelo EA, o gráfico em bolhas GO demonstrou enriquecimento significativo em processos biológicos, incluindo organização da matriz extracelular e organização da estrutura extracelular, juntamente com componentes celulares como estrutura encapsulante externa e trímero de colágeno, e funções moleculares, incluindo ligação ao colágeno e ligação ao receptor de glutamato (Figura 5D e Tabela Suplementar 5). A análise subsequente de vias KEGG, visualizada por meio de diagramas de acordes e Sankey, revelou que essas 58 proteínas participam de cascatas incluindo digestão e absorção de proteínas, o citoesqueleto em células musculares e a via de sinalização TGF-β (Figura 5E e Tabela Suplementar 6). Essas visualizações topológicas destacaram proteínas específicas, incluindo COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN e DPF2, como nós proeminentes que conectam múltiplas vias patológicas.
Por outro lado, foi realizada a anotação funcional para o subconjunto de 27 proteínas reguladas positivamente pela intervenção com EA. A análise de enriquecimento de GO indicou envolvimento em processos biológicos como a regulação do crescimento celular e a regulação positiva da alongamento da transcrição com molde de DNA, bem como funções moleculares incluindo ligação proteica dependente de cálcio e ligação de tetrapirrol (Figura 5F e Tabela Suplementar 7). Os diagramas de cordas e Sankey do KEGG correspondentes mapearam essas proteínas em vias críticas, incluindo remodelação da cromatina dependente de ATP e o complexo repressor policombo (Figura 5G e Tabela Suplementar 8). Notavelmente, esse mapeamento de rede isolou proteínas-chave como YY1, E2F2 e ENTPD5, conectando essas redes de sinalização centrais. Essa estratificação funcional abrangente estabeleceu a base estrutural para a validação subsequente dos alvos principais.
A topologia da rede e o perfil de expressão identificam YY1 como um alvo candidato associado aos efeitos da intervenção com eletroacupuntura
Para determinar o gene central entre as 85 proteínas diferencialmente expressas, foi construída uma rede de interação proteína-proteína. A análise topológica identificou 18 nós com altos escores de conectividade (Figura 6A e Tabela Suplementar 9). Posteriormente, foi realizada a análise de vias KEGG especificamente para essas 18 proteínas centrais. Os diagramas de cordas e de Sankey correspondentes mapearam as relações complexas entre esses centros e as cascatas de sinalização enriquecidas, incluindo remodelamento da cromatina dependente de ATP, o complexo repressor policombo e a via de sinalização TGF-β (Figura 6A e Tabela Suplementar 10). Com base nesse perfil funcional, as 10 proteínas mais proeminentemente enriquecidas foram selecionadas para triagem adicional. Como o alvo terapêutico do EA está localizado no sistema nervoso central, esses 10 candidatos foram avaliados utilizando a base de dados de expressão tecidual humana GTEx (Figura 6B e Figura Suplementar 1B–J). Os resultados indicaram que apenas YY1 (Figura 6B), DMAP1 (Figura Suplementar 1C) e DPF2 (Figura Suplementar 1D) foram expressos em tecidos cerebrais.
Para isolar o alvo candidato altamente responsivo da AE, foram realizados experimentos moleculares in vivo utilizando tecidos do SNT. A PCR quantitativa em tempo real foi utilizada para avaliar a resposta transcricional dos três candidatos enriquecidos no cérebro. A expressão de mRNA de YY1 foi reduzida nas condições de ICC e aumentada após o tratamento com AE, enquanto os níveis de expressão de mRNA de DPF2 e DMAP1 não apresentaram alterações estatisticamente significativas entre os grupos experimentais (Figura 6C). Esta triagem transcricional excluiu DPF2 e DMAP1 da validação adicional e indicou YY1 como o principal candidato responsivo. A análise subsequente por Western blot indicou que os níveis proteicos de YY1 foram reduzidos no grupo de ICC em relação à linha de base Sham, enquanto a intervenção com AE contrabalançou essa tendência, aumentando a expressão proteica de YY1 (Figura 6D e Figura 6E). Esses resultados experimentais indicam que a AE regula positivamente a expressão de YY1 dentro do SNT.
Para investigar os mecanismos regulatórios upstream que controlam a expressão de YY1, foram analisadas suas modificações histônicas relacionadas e fatores de transcrição. É importante observar que essas descobertas baseiam-se exclusivamente em previsões computacionais de bioinformática derivadas do Cistrome Data Browser e não representam validação experimental direta por ChIP-seq. A previsão epigenética destacou modificações histônicas, incluindo H3K27ac, H3K27me3 e H3K4me3, com altos escores de potencial regulatório para o locus YY1 (Figura 6F). Concomitantemente, a pontuação de potencial regulatório identificou fatores de transcrição como CDK9, PRDM1 e ELL2 como reguladores upstream de YY1 (Figura 6G). Essas previsões de bioinformática delineiam as possíveis redes epigenéticas e transcricionais que controlam a expressão de YY1 no SNT.
Em resumo, os dados apresentados demonstram que a intervenção com AE melhora efetivamente a função cardíaca sistêmica e atenua a lesão miocárdica em ratos com ICC. Esses efeitos cardioprotetores periféricos são acompanhados centralmente pela restauração da atividade de disparo neuronal e da energia oscilatória neural no SNT. Além disso, a triagem proteômica quantitativa identificou 85 proteínas diferencialmente expressas centrais e destacou o fator de transcrição YY1 como um alvo candidato altamente responsivo. Em conjunto, esses achados sugerem que a eficácia terapêutica da AE contra a ICC está estreitamente associada à restauração da função neural do SNT e que a superexpressão de YY1 pode estar envolvida nesse processo neurobiológico central.
Disponibilidade de Dados
Todos os dados gerados e analisados para apoiar as descobertas deste estudo estão incluídos no manuscrito e no seu Arquivo Suplementar 1. Para cumprir o requisito de acessibilidade pública dos dados, todos os dados brutos disponíveis que sustentam esta pesquisa foram depositados no repositório público Zenodo e são livremente acessíveis por meio do seguinte link: https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. Dados complementares de apoio estão disponíveis mediante solicitação razoável aos autores correspondentes.

Figura 1: Desenho experimental, estabelecimento do modelo de rato com insuficiência cardíaca crônica e intervenção com eletroacupuntura. (A) Fluxograma geral do experimento, incluindo cronograma e alocação dos grupos para as duas séries experimentais independentes. (B) Registros representativos de eletrocardiograma antes e após a ligadura da artéria coronária descendente anterior (LAD), com setas indicando a elevação do segmento ST que confirma a isquemia miocárdica. (C) Análise quantitativa da FEVE 4 semanas após a cirurgia para confirmar o sucesso do modelo (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham. (D) Intervenção com EA nos pontos de acupuntura HT7 bilaterais. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 2: A eletroacupuntura melhora a função cardíaca e atenua a lesão miocárdica em ratos com insuficiência cardíaca crônica. (A) Ecocardiogramas representativos em modo M ao lado de imagens de coloração com hematoxilina e eosina e tricrômio de Masson de tecidos miocárdicos nas quatro grupos experimentais (barra de escala = 50 µm). (B) Análise quantitativa da FEVE entre os grupos (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (C) Análise quantitativa da FVVE entre os grupos (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (D) Análise quantitativa da FVC entre os grupos (réplicas biológicas n = 3, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ##p < 0,01 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (E) Análise quantitativa dos níveis séricos de NT-proBNP entre os grupos (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (F) Análise quantitativa dos níveis séricos de cTnT entre os grupos (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. Clique aqui para visualizar uma versão ampliada desta figura.

Figura 3: A eletroacupuntura restaura a atividade neuronal no núcleo do trato solitário em ratos com insuficiência cardíaca crônica. (A) Imagens representativas de imunofluorescência da expressão de c-Fos no NTS entre os grupos. Os núcleos foram contraestainados com DAPI, e as células positivas para c-Fos foram coradas em verde. As linhas tracejadas delimitam a região anatômica, e as setas brancas indicam neurônios representativos positivos para c-Fos (barra de escala = 30 µm). (B) Análise quantitativa do número de células positivas para c-Fos entre os grupos (réplicas biológicas n = 3, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (C) Traçados representativos de descargas de potenciais de ação no NTS registrados por eletrofisiologia in vivo entre os grupos. (D) Análise quantitativa da taxa média de disparo neuronal entre os grupos (réplicas biológicas n = 3, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (E) Espectrogramas locais representativos de campo potencial bidimensionais e topografias tridimensionais de densidade espectral de potência ilustrando a energia oscilatória neural no NTS. (F) Matriz de correlação que avalia as relações entre fenótipos cardiovasculares periféricos e parâmetros de atividade neural central. Círculos vermelhos e azuis indicam correlações positivas e negativas, respectivamente. **p < 0,01; ***p < 0,001. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 4: Controle de qualidade e avaliação estatística multivariada dos perfis proteômicos no núcleo do trato solitário. (A) Visão geral quantitativa das proteínas identificadas nos três grupos experimentais (réplicas biológicas n = 6). (B) Gráfico de escores da análise discriminante de mínimos quadrados parciais ilustrando a distribuição espacial geral e a separação entre os grupos. (C) Gráfico de escores da análise discriminante de mínimos quadrados parciais ortogonais e o teste de permutação correspondente validando a confiabilidade do modelo para a comparação entre Sham e CHF (200 permutações). (D) Gráfico de escores da análise discriminante de mínimos quadrados parciais ortogonais e o teste de permutação correspondente validando a confiabilidade do modelo para a comparação entre CHF e EA (200 permutações). (E) Mapa de calor da análise de agrupamento hierárquico dos coeficientes de correlação de Pearson avaliando a reprodutibilidade intra-grupo e a variância inter-grupos em todas as amostras proteômicas. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 5: Identificação e análise de enriquecimento funcional das proteínas moduladas diferencialmente pela eletroacupuntura no núcleo do trato solitário. (A) Gráficos de vulcão ilustrando a distribuição de proteínas reguladas para cima e para baixo nas comparações Sham versus CHF e CHF versus EA. (B) Diagramas de Venn representando a análise de interseção para identificar as proteínas centrais reguladas para baixo e para cima após a intervenção com EA. (C) Mapa térmico de agrupamento hierárquico dos perfis de expressão das proteínas centralmente expressas de forma diferencial. (D) Gráficos de bolhas de GO detalhando os processos biológicos, componentes celulares e funções moleculares enriquecidos no subconjunto de proteínas reguladas para baixo. (E) Diagramas de acordes e de Sankey do KEGG representando as vias de sinalização enriquecidas pelas proteínas reguladas para baixo. (F) Gráficos de bolhas de GO detalhando os processos biológicos, componentes celulares e funções moleculares enriquecidos no subconjunto de proteínas reguladas para cima. (G) Diagramas de acordes e de Sankey do KEGG representando as vias de sinalização enriquecidas pelas proteínas reguladas para cima. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.

Figura 6: A topologia da rede, o perfil de expressão tecidual e a validação molecular identificam YY1 como um alvo candidato associado à eletroacupuntura. (A) Rede de interação proteína-proteína, diagrama de cordas e diagrama de Sankey das proteínas centrais identificadas. (B) Perfil de expressão tecidual humana de YY1 derivado do banco de dados GTEx, com a caixa vermelha destacando os tecidos cerebrais. (C) Análise quantitativa da expressão de mRNA de YY1, DPF2 e DMAP1 no NTS entre os grupos (réplicas biológicas n = 6, média ± DP). **p < 0,01, ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF; ns, não significativo em comparação com o grupo CHF. (D) Bandas representativas de Western blot de YY1 e β-actina no NTS entre os grupos. (E) Análise quantitativa da expressão proteica de YY1 entre os grupos (réplicas biológicas n = 3, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; #p < 0,05 em comparação com o grupo CHF. (F) Previsão bioinformática de modificações epigenéticas de histonas regulando o locus YY1 com base em escores de potencial regulatório. (G) Previsão bioinformática de fatores de transcrição upstream regulando o locus YY1 com base em escores de potencial regulatório. Clique aqui para visualizar uma versão ampliada desta figura.

Figura 7: Modelo proposto da associação entre eletroacupuntura no ponto HT7, superexpressão de YY1, restauração da atividade neuronal no núcleo do trato solitário e melhora na insuficiência cardíaca crônica. (Esquerda) Estado Patológico: No modelo de ICC induzido pela ligadura da artéria coronária descendente anterior (LAD), a atividade neuronal dentro do NTS está reduzida, acompanhada pela supressão do fator de transcrição YY1. Essa inibição neural central está associada ao remodelamento cardíaco patológico, manifestado por diminuição da FEVE, aumento da fibrose miocárdica e elevação dos marcadores séricos de insuficiência cardíaca. (Direita) Tratamento com EA: A intervenção com EA no ponto de acupuntura HT7 aumenta a expressão de YY1 no NTS e restaura a atividade elétrica neuronal. Essa neuromodulação central exerce efeitos cardioprotetores, atenuando o remodelamento patológico e melhorando a função cardíaca sistêmica. Clique aqui para visualizar uma versão maior desta figura.
Figura Suplementar 1: Avaliação da função cardíaca da coorte proteômica e perfis de expressão tecidual humana de genes centrais candidatos. (A) Análise quantitativa da FEVE e da DFSV entre os grupos (réplicas biológicas n = 12, média ± DP). ***p < 0,001 em comparação com o grupo Sham; ###p < 0,001 em comparação com o grupo CHF. (B-J) Perfis de expressão tecidual humana de genes centrais candidatos derivados do banco de dados GTEx, incluindo COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH11 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I) e COL14A1 (J).Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 1: Matriz abrangente de identificação e quantificação do proteoma global no núcleo do trato solitário. Esta tabela apresenta o conjunto completo de dados de proteômica quantitativa em todos os grupos experimentais. Colunas importantes incluem ID da Proteína (número de acesso UniProt), Gene (símbolo do gene), Primeira.Descrição.Proteína (anotação funcional) e os valores normalizados de intensidade proteica para cada réplica biológica nos grupos Sham, CHF e EA (n = 6 por grupo).Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 2: Pontuações de importância da variável na projeção (OPLS-DA) para proteínas na comparação entre Sham e CHF. Esta tabela lista as características que distinguem os grupos Sham e CHF de acordo com o modelo OPLS-DA. As colunas principais incluem característica (representando o identificador da proteína/gene específica) e o valor VIP (Importância da Variável na Projeção), que indica a contribuição de cada característica para a separação dos grupos (limiar VIP > 1,0).Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 3: Escores de importância variável na projeção OPLS-DA para proteínas na comparação entre CHF e EA. Esta tabela lista as características que distinguem os grupos CHF e EA com base no modelo OPLS-DA. Semelhante à Tabela S2, inclui a coluna de características e o respectivo valor VIP, destacando as características mais responsivas à intervenção EA.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 4: Lista detalhada dos 85 proteínas centrais diferencialmente expressas moduladas pela eletroacupuntura. Esta tabela fornece a interseção das proteínas que foram significativamente alteradas pela ICC e posteriormente revertidas pela intervenção com EA. Colunas importantes incluem Protein_ID, Gene, log2FC (log2 da variação da razão, indicando variação na expressão), P_value para significância estatística (limite p < 0,05) e VIP_value, que avalia a contribuição do modelo.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 5: Análise de enriquecimento da Ontologia Genética do subconjunto de proteínas centrais subreguladas. Esta tabela exibe a anotação funcional da Ontologia Genética (GO) para as 58 proteínas subreguladas pelo EA. Colunas importantes incluem ONTOLOGIA (categorizada em Processo Biológico [BP], Componente Celular [CC] e Função Molecular [MF]), Descrição funcional, p.adjust (valor p ajustado para testes múltiplos) e geneID, que corresponde aos genes específicos enriquecidos em cada termo.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 6: Análise de enriquecimento de vias da Enciclopédia de Kyoto de Genes e Genomas para o subconjunto de proteínas centrais subreguladas. Esta tabela ilustra as cascatas de sinalização enriquecidas para as 58 proteínas subreguladas. As colunas principais incluem o Termo da via, o valor de p ajustado que indica a significância estatística do enriquecimento e os genes específicos envolvidos em cada via.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 7: Análise de enriquecimento da Ontologia Genética do subconjunto de proteínas centrais reguladas para cima. Esta tabela exibe a anotação funcional da Ontologia Genética (GO) para as 27 proteínas reguladas para cima por EA. O formato e as definições das colunas (ONTOLOGIA [BP, CC, MF], Descrição, p.adjust, geneID) são idênticos aos detalhados na Tabela S5.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 8: Análise de enriquecimento de vias do Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes para o subconjunto de proteínas centrais superexpressas. Esta tabela ilustra as cascatas de sinalização enriquecidas para as 27 proteínas superexpressas. O formato e as definições das colunas (Termo, valor de p ajustado, Genes) são idênticos aos descritos na Tabela S6.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 9: Pontuações de conectividade topológica das 18 proteínas centrais derivadas da rede de interação proteína-proteína. Esta tabela resume os parâmetros topológicos da rede utilizados para identificar os genes centrais. As colunas principais incluem o nome do gene e métricas centrais da rede, como Grau, Centralidade de Intermediação e Centralidade de Proximidade, que quantificam a importância relativa e a conectividade de cada nó dentro da rede biológica.Clique aqui para baixar este arquivo.
Tabela Suplementar 10: Análise de enriquecimento de vias do Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes para as 18 proteínas centrais da rede. Esta tabela apresenta as vias de sinalização específicas enriquecidas exclusivamente pelas 18 proteínas centrais identificadas. As colunas principais incluem o Termo da via, o valor de p ajustado para significância e os respectivos Genes responsáveis pelo enriquecimento funcional.Clique aqui para baixar este arquivo.
Arquivo Suplementar 1: Scripts R utilizados para análise e visualização de dados e imagens de Western blot sem recorte. O arquivo suplementar contém os scripts R utilizados para análise de correlação de Pearson, geração de gráficos de duplo vulcão e identificação de proteínas revertidas pelo EA, análise de enriquecimento de Ontologia Genética (GO), geração de mapa térmico de agrupamento hierárquico, visualização de enriquecimento na Enciclopédia de Kyoto de Genes e Genomas (KEGG), análise discriminante de mínimos quadrados parciais ortogonais (OPLS-DA) e teste de permutação, análise discriminante de mínimos quadrados parciais (PLS-DA), geração de mapa térmico de correlação de amostras proteômicas e análise de diagrama de Venn.Clique aqui para baixar este arquivo.