Difração de Raios-X de Monocristais e de Pó
1. Coleta de dados XRD de cristal único
- Cresça cristais adequados para XRD. Para obter mais informações, consulte os vídeos "Growing Crystals for X-ray Diffraction Analysis" na série Essentials of Organic Chemistry e "Preparation and Characterization of a Quadruply Metal-Metal Bonded Compound" na série Química Inorgânica.
- Adicione uma gota de óleo de paratoná a um escorregador de vidro. Usando uma espátula e uma pequena quantidade de óleo de paratona, colher alguns cristais do frasco usado para cultivar os cristais e adicioná-los à gota de óleo na lâmina.
- Sob um microscópio, selecione um cristal que tenha bordas uniformes e bem definidas.
- Pegue o cristal selecionado usando uma montagem adequada (aqui usamos um loop Kapton). Certifique-se de que qualquer óleo preso ao cristal é mínimo uma vez que ele é montado.
- Abra as portas do instrumento.
- Coloque o suporte na cabeça do goniômetro no instrumento.
- Centralizar o cristal com relação à localização do raio-X.
- Feche as portas do instrumento.
- Abra o conjunto de software APEX3, uma interface gráfica de usuário (GUI) para cristalografia de raios-X.
- Execute uma pequena sequência de coleta de dados e determine a célula da unidade.
- Com base nos dados da célula unitária, escolha uma estratégia de coleta de dados e execute uma coleta completa de dados.
- Trabalhe os dados usando um programa adequado. Aqui usamos SHELX na suíte APEX 3.
- Refine a estrutura em uma GUI adequada. Aqui usamos SHELX em OLEX2.
2. Carregando uma amostra de pó no suporte de amostra para XRD em pó
NOTA: Aqui usaremos um suporte de fundo Si crystal zero. Existem uma variedade de porta-amostras alternativos que podem acomodar diferentes quantidades de material. O suporte de fundo si cristal zero não produz ruído de fundo de 20-120 ° (2 φ, usando radiação Cu).
- Coloque uma peneira de malha fina acima do cristal Si.
- Despeje aproximadamente 20 mg da amostra sobre a peneira, certificando-se de que a maior parte da amostra esteja diretamente acima do cristal Si no suporte.
- Toque na peneira na parte superior do banco até que uma monocamada de amostra cubra a superfície de cristal Si.
- Desaparafusar o suporte da amostra e colocar o cristal no suporte.
3. Coletando um padrão XRD em pó
- Abra as portas do instrumento.
- Monte o suporte de amostra no instrumento.
- Abra o conjunto de software Commander (um programa usado para coletar padrões XRD em pó).
- Na guia "Assistente", carregue uma varredura padrão de coleta de dados.
- Selecione a quantidade de tempo para executar a varredura (20 min). Executar uma varredura mais longa sobre a mesma faixa de ângulo gerará um padrão XRD em pó melhor resolvido.
- Selecione a faixa de ângulo (2 φ) que será digitalizada (5-70 °). O alcance de ângulo selecionado depende do material. A faixa de comprimento de onda dada aqui é apropriada para materiais moleculares inorgânicos.
- Aperte o botão "iniciar" para iniciar a coleta de dados.
Fonte: Tamara M. Powers, Departamento de Química da Texas A&M University
A cristalografia de raios-X é uma técnica que usa raios-X para estudar a estrutura das moléculas. Os experimentos de difração de raios-X (XRD) são realizados rotineiramente com amostras de cristal único ou em pó.
XRD de cristal único:
O XRD de cristal único permite a determinação absoluta da estrutura. Com dados XRD de cristal único, as posições atômicas exatas podem ser observadas e, portanto, comprimentos e ângulos de ligação podem ser determinados. Esta técnica fornece a estrutura dentro de um único cristal, que não representa necessariamente a maior parte do material. Portanto, devem ser utilizados métodos adicionais de caracterização em massa para provar a identidade e a pureza de um composto.
Pó XRD:
Ao contrário do XRD de cristal único, o XRD em pó olha para uma grande amostra de material policristalino e, portanto, é considerado uma técnica de caracterização em massa. O padrão em pó é considerado uma "impressão digital" para um determinado material; fornece informações sobre a fase (polimorfo) e a cristalina do material. Tipicamente, o XRD em pó é usado para estudar minerais, zeólitos, estruturas metal-orgânicas (MOFs) e outros sólidos estendidos. O pó XRD também pode ser usado para estabelecer a pureza em massa de espécies moleculares.
Anteriormente, vimos como cultivar cristais de qualidade de raios-X (veja vídeo na série Essentials of Organic Chemistry). Aqui vamos aprender os princípios por trás do XRD. Em seguida, coletaremos dados de cristal único e pó em Mo2(ArNC(H)NAr)4, onde Ar = p-MeOC6H5.
1. Coleta de dados XRD de cristal único
- Cresça cristais adequados para XRD. Para obter mais informações, consulte os vídeos "Growing Crystals for X-ray Diffraction Analysis" na série Essentials of Organic Chemistry e "Preparation and Characterization of a Quadruply Metal-Metal Bonded Compound" na série Química Inorgânica.
- Adicione uma gota de óleo de paratoná a um escorregador de vidro. Usando uma espátula e uma pequena quantidade de óleo de paratona, colher alguns cristais do frasco usado para cultivar os cristais e adicioná-los à gota de óleo na lâmina.
- Sob um microscópio, selecione um cristal que tenha bordas uniformes e bem definidas.
- Pegue o cristal selecionado usando uma montagem adequada (aqui usamos um loop Kapton). Certifique-se de que qualquer óleo preso ao cristal é mínimo uma vez que ele é montado.
- Abra as portas do instrumento.
- Coloque o suporte na cabeça do goniômetro no instrumento.
- Centralizar o cristal com relação à localização do raio-X.
- Feche as portas do instrumento.
- Abra o conjunto de software APEX3, uma interface gráfica de usuário (GUI) para cristalografia de raios-X.
- Execute uma pequena sequência de coleta de dados e determine a célula da unidade.
- Com base nos dados da célula unitária, escolha uma estratégia de coleta de dados e execute uma coleta completa de dados.
- Trabalhe os dados usando um programa adequado. Aqui usamos SHELX na suíte APEX 3.
- Refine a estrutura em uma GUI adequada. Aqui usamos SHELX em OLEX2.
2. Carregando uma amostra de pó no suporte de amostra para XRD em pó
NOTA: Aqui usaremos um suporte de fundo Si crystal zero. Existem uma variedade de porta-amostras alternativos que podem acomodar diferentes quantidades de material. O suporte de fundo si cristal zero não produz ruído de fundo de 20-120 ° (2 φ, usando radiação Cu).
- Coloque uma peneira de malha fina acima do cristal Si.
- Despeje aproximadamente 20 mg da amostra sobre a peneira, certificando-se de que a maior parte da amostra esteja diretamente acima do cristal Si no suporte.
- Toque na peneira na parte superior do banco até que uma monocamada de amostra cubra a superfície de cristal Si.
- Desaparafusar o suporte da amostra e colocar o cristal no suporte.
3. Coletando um padrão XRD em pó
- Abra as portas do instrumento.
- Monte o suporte de amostra no instrumento.
- Abra o conjunto de software Commander (um programa usado para coletar padrões XRD em pó).
- Na guia "Assistente", carregue uma varredura padrão de coleta de dados.
- Selecione a quantidade de tempo para executar a varredura (20 min). Executar uma varredura mais longa sobre a mesma faixa de ângulo gerará um padrão XRD em pó melhor resolvido.
- Selecione a faixa de ângulo (2 φ) que será digitalizada (5-70 °). O alcance de ângulo selecionado depende do material. A faixa de comprimento de onda dada aqui é apropriada para materiais moleculares inorgânicos.
- Aperte o botão "iniciar" para iniciar a coleta de dados.
A difração de raios X é uma técnica analítica comum usada em ciência de materiais e bioquímica para determinar as estruturas dos cristais.
Ele traça os caminhos dos raios-X através de cristais para sondar a estrutura. Existem duas técnicas principais. A difração de raios X em pó determina as fases e a pureza de uma espécie cristalina. A difração de raios-X simples identifica os átomos em um cristal e suas localizações, bem como densidades eletrônicas, comprimentos de ligação e ângulos.
Este vídeo ilustra a operação de um difratômetro de raios X, procedimentos para difração de raios X de cristal único e pó e discute algumas aplicações.
Começaremos examinando o conceito de estrutura cristalina e explorando como os raios-X interagem com os cristais.
Um cristal é uma configuração periódica de átomos, ou seja, um padrão geométrico de átomos que se repetem em intervalos regulares. O menor elemento repetitivo de um cristal é chamado de "célula unitária". É descrito por sua estrutura de empacotamento, dimensões e ângulos de ligação. "Índices de Miller" descrevem quaisquer seções transversais planares fictícias da célula unitária.
Os raios X são uma forma de ondas eletromagnéticas cujos comprimentos de onda são semelhantes ao espaçamento atômico dos cristais. Quando um único raio-X atinge um átomo individual, ele é difratado. Quando dois raios-X coerentes atingem átomos em planos diferentes, os raios-X difratados interferem, resultando em sinais construtivos ou destrutivos.
O padrão de difração de uma amostra cristalina de pó é composto por manchas intensas, que formam anéis de interferência construtiva. Os ângulos em que esses pontos ocorrem correspondem ao espaçamento dos átomos nesse plano. O espaçamento pode ser determinado usando a Lei de Bragg.
Agora que aprendemos sobre cristais e padrões de difração de raios-X, vamos ver como funciona um difratômetro de raios-X.
Um difratômetro de raios X consiste em três componentes básicos: uma fonte de raios X, uma amostra e um detector. Todos os componentes são orientados em um arranjo circular coplanar com o suporte de amostra no centro. A fonte geralmente contém um alvo de cobre que, quando bombardeado por elétrons, emite um feixe de raios-X colimados. O feixe é direcionado para a amostra, que refrata os raios-X. A amostra e o detector são então girados em direções opostas, até que os ângulos de intensidade dos raios X sejam determinados.
A alta intensidade de raios-X corresponde à interferência construtiva de um plano cristalográfico em difração de raios-X de cristal único e de pó. A difração de raios X em pó revela a estrutura cristalina da amostra, enquanto a difração de raios X de cristal único revela adicionalmente o conteúdo químico e a localização dos átomos.
Agora, vejamos um exemplo prático de difratometria de raios-X.
A difração de raios X de cristal único requer cristais de alta qualidade sem impurezas, limites de grão ou outros defeitos interfaciais. Traga os cristais do composto de organo-molibdênio ao microscópio óptico para analisá-lo.
Comece adicionando uma gota de óleo de paratona a uma lâmina de vidro limpa. Em seguida, adicione uma pequena quantidade de óleo de paratona a uma espátula e coloque alguns cristais do frasco de cristalização em uma lâmina.
Examine os cristais ao microscópio e selecione um cristal com bordas uniformes e bem definidas. Depois que um cristal ideal for escolhido, use um laço Kapton para pegar o cristal, garantindo que um pouco de óleo grude no cristal.
Em seguida, abra as portas do difratômetro para carregar a amostra. Prenda o loop Kapton à cabeça do gonômetro, centralizando o cristal em relação ao feixe de raios-X. Em seguida, feche as portas.
Abra o software de cristalografia de raios-X e execute uma curta sequência de coleta de dados que estabelece a estrutura da célula unitária. Com base nesses dados, selecione uma estratégia de coleta de dados e execute a coleta completa de dados. Depois que um conjunto de dados completo for coletado, trabalhe os dados usando um programa adequado e refine-os.
Em comparação com a difração de raios X de cristal único, a difração de raios X em pó é uma técnica de caracterização em massa que não requer cristais únicos.
Escolha um suporte de amostra de tamanho apropriado e uma placa de difração que não afete as leituras nos ângulos de interesse.
Colocar uma peneira de malha fina sobre a placa de difração. Adicione cuidadosamente 20 mg de amostra à peneira, mantendo a amostra sobre a placa. Bata a peneira na bancada até formar uma monocamada de pó.
Fixar a placa de difração no suporte de amostras. Abra as portas do difratômetro e monte a amostra. Se o sample montagem tiver pinos de travamento, certifique-se de que os pinos estejam engatados e o sample suporte está seguro antes de fechar as portas.
Usando um software adequado, carregue um método de coleta de dados padrão. Insira uma variedade de ângulos de varredura adequados para o material. Em seguida, insira o tempo de verificação; Um tempo de varredura mais longo permite uma melhor resolução. Em seguida, pressione "iniciar".
Agora, vamos comparar os resultados obtidos com a difração de raios X de cristal único e pó do complexo organo-molibdênio.
A partir dos dados de raios-X de cristal único, é gerado um modelo estrutural do mapa de densidade de elétrons, que é usado para obter comprimentos e ângulos de ligação determinados experimentalmente dentro da estrutura.
Além disso, o XRD em pó fornece informações adicionais sobre o composto. A linha de base plana do espectro indica que a amostra usada é altamente cristalina, enquanto as linhas de base curvas são indicativas de materiais amorfos.
A difração de raios X é uma ferramenta de caracterização valiosa em praticamente todos os campos da ciência dos materiais e, portanto, desempenha um papel em diversas aplicações.
Um componente importante da conservação da arte patrimonial inclui a compreensão de como as obras de arte foram produzidas e por que elas corroem. Desenvolvimentos recentes na difração de raios X estudam a corrosão testando destrutivamente menos de 1 mg de amostra. Como os produtos de corrosão raramente são monocristalinos, a difração de raios X em pó é necessária. As análises típicas ocorrem em 2? entre 5-85? graus acima de 20 horas. As localizações dos átomos dentro do cristal podem ser otimizadas algoritmicamente, fornecendo informações sobre a localização e a natureza dos ataques químicos.
Filmes de materiais que variam de nanômetros a micrômetros de espessura têm habilidades protetoras, elétricas e ópticas únicas que diferem daquelas de materiais a granel. A difração de raios X fornece informações sobre a espessura, densidade e textura da superfície do filme. É usado para determinar a tensão do filme e a probabilidade de falha e quebra do filme. Também ajuda a caracterizar o comportamento óptico dos filmes, uma vez que a absorção depende em grande parte da estrutura cristalina. Portanto, é usado para caracterizar sensores de luz de filme fino e células fotovoltaicas.
Você acabou de assistir à introdução da JoVE à difração de raios-X de cristal único e pó. Agora você deve estar familiarizado com os princípios da difratometria de raios X, um procedimento para obter padrões de difração e algumas aplicações. Como sempre, obrigado por assistir!
Por que raios-X?:
Ao medir a distância, é importante selecionar uma unidade de medida que esteja na escala do objeto que está sendo medido. Por exemplo, para medir o comprimento de um lápis, não se gostaria de usar uma vara de quintal que só tem gradações de pés. Da mesma forma, se alguém quisesse medir o comprimento de um carro, seria inapropriado usar uma régua de 12 polegadas com marcas cm. Portanto, para estudar as ligações em moléculas, é importante usar um comprimento de onda de luz que corresponda ao comprimento dessas ligações. Raios-X têm comprimentos de onda na faixa Å, que combina perfeitamente com distâncias típicas de ligação (1-3 Å).
A célula unitária:
Imagine tentar descrever todas as moléculas na ponta de uma caneta. Se alguém se aproximar de que é composto de 6,02 × 1023 moléculas (ou 1 toupeira), pareceria quase impossível descrever esse objeto no nível molecular. A complexidade de um objeto é simplificada quando existe como um cristal, onde o conteúdo de uma célula unitária pode ser usado para descrever toda a estrutura. A célula unitária de um cristal é o menor volume contendo uma unidade repetitiva de um sólido. É definida como uma "caixa" 3D com comprimentos a, b e c, e ângulos α, β e γ(Figura 1). A célula unitária permite que os químicos descrevam o conteúdo de um cristal usando uma fração ou um pequeno número de átomos ou moléculas(s). Repetindo a célula unitária no espaço, pode-se gerar uma representação 3D do sólido.
Figura 1. Parâmetros de células unitárias.
Configuração experimental:
O XRD de cristal único e pó tem configurações de instrumentação semelhantes. Para xrd de cristal único, um cristal é montado e centrado dentro do raio-X. Para o XRD em pó, uma amostra de policristalino é moída em pó fino e montada em uma placa. A amostra (monocristalino ou policristalino) é irradiada com raios-X e os raios-X difundidas atingem um detector. Durante a coleta de dados, a amostra é girada em relação à fonte e detector de raios-X.
Experimento de fenda dupla:
Lembre-se que a luz tem propriedades semelhantes a ondas e partículas. Quando a luz monocromática entra em duas fendas, a propriedade de luz em forma de onda resulta em luz emanando de forma esférica de cada fenda. Quando as ondas interagem, elas podem se unir (se as ondas tiverem o mesmo comprimento de onda e fase) ou cancelar umas às outras (se as ondas tiverem o mesmo comprimento de onda, mas tiverem fases diferentes), o que é chamado de interferência construtiva e destrutiva, respectivamente. O padrão de luz resultante é feito de uma série de linhas, onde as áreas de luz representam interferência construtiva, enquanto as áreas escuras são resultado de interferência destrutiva.
Padrões típicos de difração: mono cristal versus pó:
Após a irradiação de um cristal por raios-X, a radiação é difundida após interação com a densidade eletrônica dentro do cristal. Assim como as ondas de água no clássico experimento de dupla fenda da física, os raios-X difundados interagem, resultando em interferência construtiva e destrutiva. Em XRD, o padrão de difração representa a densidade eletrônica devido a átomos e ligações dentro do cristal. Um padrão típico de difração para um único cristal é mostrado em(Figura 2). Observe que o padrão de difração é composto de manchas em vez de linhas como no experimento de fenda dupla. Na verdade, esses "pontos" são fatias 2D de esferas tridimensionais. Os cristalógrafos usam um programa de computador para integrar as manchas resultantes, a fim de determinar a forma e intensidade dos raios-X difundidas. Em uma amostra de pó, os raios-X interagem com muitos cristais minúsculos em orientações aleatórias. Portanto, em vez de ver manchas, observa-se um padrão de difração circular(Figura 3). As intensidades dos círculos difrracados são então plotadas contra os ângulos entre o anel do eixo do feixe (denotado 2φ) para dar uma trama bidimensional conhecida como padrão de pó.
Aqui, coletaremos dados XRD de cristal e pó únicos no Mo2(ArNC(H)NAr)4 onde Ar = p-MeOC6H5, que foi sintetizado no módulo "Preparação e Caracterização de um Composto Quadruplicado de Metal-Metal".
Figura 2. Padrão de difração de cristal único.
Figura 3. Pó XRD: Padrão de Difração Circular.
Figura 4. Estrutura de cristal único de Mo2(ArNC(H)NAr)4 onde Ar = p-MeOC6H5.
Figura 5. Pó padrão XRD de Mo2(ArNC(H)NAr)4 onde Ar = p-MeOC6H5.
Neste vídeo, aprendemos sobre a diferença entre o único cristal e o XRD em pó. Coletamos dados de cristal único e pó em Mo2(ArNC(H)NAr)4, onde Ar = p-MeOC6H5.
XRD de cristal único é uma poderosa técnica de caracterização que pode fornecer a estrutura absoluta de uma molécula. Embora a determinação da estrutura seja a razão mais comum pela qual os químicos usam XRD, existem uma variedade de técnicas especiais de raios-X, como dispersão anômala e fotocristalografia, que fornecem mais informações sobre uma molécula.
Dispersão anômiosa pode distinguir entre átomos de pesos moleculares semelhantes. Esta técnica é particularmente valiosa para caracterização de complexos metálicos heteropopolinucleares (compostos que têm mais de um átomo de metal com diferentes identidades). A dispersão anômiosa também tem sido usada na cristalografia proteica como método para ajudar a resolver a fase do feixe difrracado, que é importante para a determinação da estrutura.
A fotocristalografia envolve XRD de cristal único acoplado à fotoquímica. Irradiando uma amostra com luz no estado sólido, podemos observar pequenas mudanças estruturais e monitorar essas alterações por XRD. Exemplos dessa técnica incluem observar a isomerização de uma molécula pela luz, bem como a caracterização de intermediários reativos.
Powder XRD é um método de caracterização não destrutivo que pode ser usado para obter informações sobre a cristalinalidade de uma amostra. Além disso, é uma técnica útil para analisar misturas de diferentes materiais. Como mencionado anteriormente, padrões de pó são como impressões digitais: o padrão resultante de um composto depende de como os átomos são dispostos dentro do material. Portanto, um padrão de pó experimentalmente determinado pode ser comparado a uma coleção de padrões conhecidos de difração de materiais no Centro Internacional de Dados de Difração. Isso não só fornece informações sobre a identidade do produto isolado, mas também permite que os cientistas comentem sobre o número de compostos presentes na amostra. Enquanto a maioria dos padrões de difração listados no banco de dados estão na família de sólidos estendidos, como minerais e zeólitos, podem ser encontrados exemplos de moléculas inorgânicas.
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