Name: Agar-Microcosmos Bloco de decomposição controlada de Tecidos Vegetais por fungos aeróbicos (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-02-03T17:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 34 s
Description: Aprenda a usar microcosmos de blocos de ágar para estudar a degradação de tecidos vegetais por fungos aeróbicos em ambiente controlado. Este método permite medir perda de massa e analisar o papel de substratos exógenos na biodegradação da madeira.

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<ol><li>ASTM D1413-07. Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. . <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Annual+Book+of+ASTM+Standards%22">Annual Book of ASTM Standards</a>. , 185-192 (2007).</li>
<li>Bravery, A. F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBravery%2C+AF+%22A+miniaturized+wood+block+for+the+rapid+evaluation+of+wood+preservative+fungicides%22">A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides</a>. , International Research Group on Wood Protection (IRG/WP 2113). (1978).</li>
<li>Low, G. A., Young, M. E., Martin, P., Palfreyman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+the+relationship+between+the+dry+rot+fungus+Serpula+lacrymans+and+selected+forms+of+masonry%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+Biodeterior.+Biodegrad%22%5BJournal%5D)">Assessing the relationship between the dry rot fungus Serpula lacrymans and selected forms of masonry.</a> Int. Biodeterior. Biodegrad. 46, 141-150 (2000).</li>
<li>Nicolas, D. Volume I (One/1) - Degradation and Protection of Wood (Syracuse Wood Science Series #5). <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNicolas%2C+D+%22Wood+Deterioration+and+Its+Prevention+by+Preservative+Treatments%22">Wood Deterioration and Its Prevention by Preservative Treatments</a>. , Syracuse University Press. (1973).</li>
<li>Schilling, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+calcium-based+materials+and+iron+impurities+on+wood+degradation+by+the+brown+rot+fungus+Serpula+lacrymans%5BTitle%5D)+AND+%22Holzforschung%22%5BJournal%5D)">Effects of calcium-based materials and iron impurities on wood degradation by the brown rot fungus Serpula lacrymans.</a> Holzforschung. 64, 93-99 (2010).</li>
</ol>

Não há conflitos de interesse declarados.

Usando nosso agar-bloco set-up (Figura 1) Serpula lacrymans cresceu em contato direto com as superfícies de gesso e em blocos de madeira (Figura 2), levando a mais de 60% ​​na perda de peso o marrom-apodreceu controle de blocos de pinho (Figura 3 ). Isso facilmente satisfaz o objetivo da norma ASTM&gt; decaimento de 50%, eo coeficiente médio de variação (C V) em decadência na era 0,055 na semana 16. Estes dados estão publicados no Schilling 7. Mais uma vez, outros fungos exigirá mais tempo...

<table><tbody><tr><td>Placas de Petri</td><td>Nalge Nunc international</td><td>4014</td><td>25 x 150 mm</td></tr><tr><td>Ágar, tipo A</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A4550</td><td></td></tr><tr><td>Nitrato de amônio, NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;NO&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;</td><td>Millinckrodt</td><td>3436-12</td><td></td></tr><tr><td>Fosfato de potássio, KH&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;PO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>JT Baker</td><td>3246-01</td><td></td></tr><tr><td>Sulfato de magnésio heptaidratado, MgSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>230391</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-Glicose</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270</td><td>Dextrose</td></tr><tr><td>Ácido bórico, H&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;BO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>2549-04</td><td></td></tr><tr><td>Sulfato de zinco heptaidratado, ZnSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>8880-12</td><td></td></tr><tr><td>Cloreto manganoso tetraidratado, MnCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>JT Baker</td><td>2540-04</td><td></td></tr><tr><td>Sulfato de cobre(II) pentaidratado, CuSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>209198</td><td></td></tr><tr><td>Heptamolibdato de amônio tetraidratado, (NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;)&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt;Mo&lt;sub&gt;7&lt;/sub&gt;O&lt;sub&gt;24&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>431346</td><td></td></tr><tr><td>Cloreto de cálcio diidratado, CaCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;2H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>4160-12</td><td></td></tr><tr><td>Cloreto de sódio, NaCl</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>7581-12</td><td></td></tr><tr><td>Sulfato ferroso heptaidratado, FeSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>5056-12</td><td></td></tr><tr><td>Pipetador</td><td>Drummond Scientific</td><td>4-000-110</td><td>Sem fio&lt;br/&gt;EtOH na superfície</td></tr><tr><td>Pipeta estéril de poliestireno de 10 ml</td><td>BD Biosciences</td><td>357551</td><td></td></tr><tr><td>Protetor de calha</td><td>Thermwell Products Co.</td><td>VX620</td><td>Pré-esfregado com sabão&lt;br/&gt;Loja de material de construção</td></tr><tr><td>Sulfato de cálcio hemi-hidratado, CaSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;0,5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Acros Organics</td><td>385355000</td><td></td></tr><tr><td>Berbequim de cortiça nº 4</td><td>Boekel Scientific</td><td>1601</td><td></td></tr><tr><td>Parafilm &quot;M&quot;</td><td>Pechiney Plastic Packaging</td><td>PM-996</td><td></td></tr></tbody></table>

agar-microcosmos bloco de decomposição controlada de tecidos vegetais por fungos aeróbicos

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

Os dois principais métodos para o estudo de biodegradação por fungos dos tecidos vegetais lignocelulósicas foram desenvolvidos para testes de madeira conservante (solo-bloco; agar-bloco). É bem aceito que o solo-bloco microcosmos rendimento maiores taxas de decomposição, menos problemas de umidade, menor variabilidade entre os estudos, e os limites mais altos de toxicidade conservante. Solo-bloco de teste é, portanto, a técnica mais utilizada e foi padronizado pela American Society for Testing and Materials (ASTM) (método D 1413-07). O projeto solo-bloco tem desvantagens, no entanto, utilizando fontes do solo localmente variável e em limitar o controle de nutrientes externos (exógenos) para os tecidos em decomposição. Estas desvantagens têm emergido como um problema na aplicação deste método para outros, objectivos de investigação cada vez mais popular. Estes objectivos modernos incluem lignocelulose degradante para pesquisa de bioenergia, biorremediação de testes de co-metabolizado tóxicos, avaliando mecanismos oxidativos e acompanhamento de elementos translocada ao longo das redes de hifas. Solo-blocks não se prestam controle suficiente nestas aplicações. Uma abordagem agar-bloco refinado é necessário. Aqui, usamos a podridão parda madeira degradante fungo Serpula lacrymans de degradar a madeira em ágar-bloco microcosmos, utilizando pratos de Petri profunda com o cálcio de baixa agar. Nós testamos o papel do exógeno gesso em decadência em uma série de tempo, para demonstrar a utilidade e variabilidade esperada. Blocos de uma única placa de rip (corte longitudinal) são condicionados, pesado, autoclavado, e introduziu assepticamente em cima de malha de plástico. Inoculações com fungos estão em cada face do bloco, com gesso exógenas adicionadas às interfaces. Colheitas são assépticas até a colheita final destrutivo. Estes microcosmos são projetados para evitar o contacto bloco com agar ou paredes placa de Petri. Condensação é minimizada durante a derrama e placa durante a incubação. Finalmente, inóculo / gesso / madeira espaçamento é minimizada, mas sem permitir contato. Estes aspectos menos técnica do agar-block design são também as causas mais comuns de fracasso e a principal fonte de variabilidade entre os estudos. Publicação de vídeo é, portanto, útil, neste caso, e demonstrar a variabilidade de baixa e de alta qualidade resultados.

Este vídeo demonstra uma abordagem ambiente controlado para estudo de degradação dos tecidos vegetais lignocelulósicas por fungos aeróbicos. A capacidade de controlar fontes de nutrientes e umidade é uma das principais vantagens da ágar-bloco microcosmos, mas a abordagem geralmente produz sucesso misturado. Nós endereço armadilhas fundamental para o rendimento reprodutível, a variabilidade de baixa resultados.

Agar-Microcosmos Bloco de decomposição controlada de Tecidos Vegetais por fungos aeróbicos

Os dois principais métodos para estudar a biodegradação fúngica de tecidos vegetais lignocelulósicos foram desenvolvidos para testes de preservação de madeira (bloco de solo; ...

O objetivo geral deste procedimento é inocular um fungo aeróbico degradador de madeira em um microcosmo de placa de Petri no qual a umidade da madeira e os substratos exógenos são rigorosamente controlados. Isso é realizado primeiramente preparando microcosmos com volumes exatos de meios conhecidos. Em seguida, a madeira a ser degradada, bem como quaisquer substratos sólidos exógenos, são montados sobre uma grade plástica na superfície do ágar, sem permitir contato entre os substratos.O microcosmo é então inoculado e incubado com o fungo teste. Após a incubação, os blocos de madeira são coletados para determinar a perda de massa e para preparar os tecidos para análises. Em última instância, podem ser obtidos resultados que demonstram o grau de biodeterioração da madeira e o papel das fontes exógenas de elementos por meio de medidas de perda de massa, observações da morfologia micelial e análises elementares direcionadas, como espectroscopia de plasma acoplado indutivamente.Olá, meu nome é Brooke Jacobson do laboratório do Dr. Jonathan Schilling do Departamento de Engenharia de Bioprodutos e Biotecnologia do sistema da Universidade de Minnesota. Hoje vamos mostrar um procedimento pa

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Biologia

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Isolamento de microrganismos do solo nativas com potencial para romper as biodegradáveis ​​Palha filmes plásticos usados ​​na agricultura

Este artigo descreve protocolos detalhados para fabricação de ecossistema de dispositivos (EcoFABs) que permitem que os estudos de plantas e as interações planta-micróbio em condições de laboratório altamente controlado.

Protocolos de fabricação (EcoFAB) ecossistema para a construção de ecossistemas de laboratório projetado para estudar interações planta-micróbio

Como os organismos anaeróbios obrigam são incapazes de crescer em cima da exposição de oxigênio, o uso de técnicas de cultivo anaeróbicos é indispensável. Aqui, demonstramos um método simples e efetivo para cultivar uma cultura mista derivada de uma usina de biogás a partir da preparação de mídia para o gás e quantificação de ácidos graxos voláteis.

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Isolamento e Triagem da Biodiversidade do Solo para Fungos Envolvidos na Degradação de Materiais Recalcitrantes

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Produção e Testes de Comportamento à Umidade e Propriedades Térmicas de Biocompósitos de Palha de Colza e Micélio de Ganoderma resinaceum

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Aprenda a usar microcosmos de blocos de ágar para estudar a degradação de tecidos vegetais por fungos aeróbicos em ambiente controlado. Este método permite medir perda de massa e analisar o papel de substratos exógenos na biodegradação da madeira.

Agar-Microcosmos Bloco de decomposição controlada de Tecidos Vegetais por fungos aeróbicos

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