Uma Introdução ao Zebrafish: Danio rerio

An Introduction to the Zebrafish: <i>Danio rerio</i>
JoVE Science Education
Biology II: Mouse, Zebrafish, and Chick
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JoVE Science Education Biology II: Mouse, Zebrafish, and Chick
An Introduction to the Zebrafish: Danio rerio

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08:31 min
April 30, 2023

Overview

Os zebrafish (Danio rerio) são pequenos peixes de água doce que são usados como organismos modelo para pesquisa biomédica. Os muitos pontos fortes desses peixes incluem seu alto grau de conservação genética com humanos e sua manutenção simples e barata. Além disso, a expressão genética pode ser facilmente manipulada em embriões de zebrafish, e sua transparência permite a observação de processos de desenvolvimento.

Este vídeo de visão geral introduz pela primeira vez a biologia básica dos zebrafish, incluindo sua filogenia, ciclo de vida e ambiente natural, antes de apresentar as características que os tornam tão úteis em laboratório. Uma breve história da pesquisa de zebrafish também é fornecida através de uma revisão de grandes descobertas feitas em peixes, que vão desde o estabelecimento precoce de métodos para rastreamento genético eficiente até a descoberta de novas terapêuticas para doenças humanas, como o câncer. Finalmente, algumas das muitas vias de experimentação realizadas em zebrafish são discutidas, incluindo estudos imunológicos e de desenvolvimento.

Procedure

Danio rerio, ou zebrafish, são peixes pequenos que estão fazendo um grande respingo na pesquisa biomédica. O zebrafish põe centenas de ovos que se desenvolvem externamente, permitindo que os cientistas realizem manipulações genéticas e monitorem fenótipos precoces em um organismo complexo. Como eles compartilham grande parte de seu genoma com humanos, a pesquisa de zebrafish está nos ajudando em nosso caminho para entender e tratar doenças humanas. Este vídeo fornecerá uma visão geral do zebrafish, as características que os tornam ótimos modelos, e algumas das maneiras pelas quais eles são usados em laboratórios hoje.

Antes de falarmos sobre toda essa ciência de peixe, vamos conhecer os zebrafish. Como ratos e humanos, os zebrafish são vertebrados, o que significa que possuem uma espinha dorsal.

Especificamente, os zebrafish são peixes ósseos da classe Actinopterygii, caracterizados pela presença de raios ósseos em suas barbatanas. Mais precisamente, os zebrafish pertencem à maior família de vertebrados: Cyprinidae, que contém mais de 2.400 espécies, incluindo o adorável peixe dourado.

Danio rerio está entre os menores membros desta família, com adultos medindo de 30 a 40 milímetros, ou cerca de 1,5 polegadas, de comprimento. Zebrafish recebem seu nome porque se assemelham a zebras. Não, não é bem assim. O nome deriva das listras que executam o comprimento de seus corpos em forma de torpedo.

Os zebrafish são originários da região do Himalaia, onde são encontrados em corpos lentos de água doce. No entanto, você não precisa viajar muito longe para encontrá-los, como Danios são peixes resistentes que são grampos de aquários domésticos.

O ciclo de vida dos zebrafish avança através de 4 grandes estágios de desenvolvimento: embrião, larva, juvenil e adulto. O ciclo começa quando óvulos e espermatozoides são liberados por um par de acasalamento. Após a fertilização, os estágios iniciais de desenvolvimento avançam rapidamente, com embriões eclodindo em larvas por 3 dias após a fertilização, ou dpf. A partir deste ponto, a progressão para um adulto sexualmente maduro requer um adicional de dois a três meses.

Agora que sabemos um pouco sobre zebrafish na natureza, vamos rever por que eles são tão valiosos no laboratório. Primeiro, o zebrafish pode ser alojado em alta densidade e são simples de cuidar, tornando-os menos caros de manter do que outros modelos de vertebrados.

Em seguida, os zebrafish são extremamente férteis. Fêmeas maduras podem colocar centenas de ovos semanalmente.

O desenvolvimento externo de embriões de zebrafish é extremamente conveniente, devido à facilidade com que a expressão genética pode ser manipulada por técnicas de microinjeção. Além disso, uma vez que os embriões são transparentes, processos de desenvolvimento precoce podem ser observados dentro do organismo vivo.

É importante ressaltar que os zebrafish também possuem um alto grau de conservação genética com vertebrados mais altos, incluindo os humanos. O genoma dos zebrafish contém 25 cromossomos e 1,5 bilhão de pares de bases, que é cerca da metade do tamanho do genoma humano. No entanto, aproximadamente 70% de todos os genes humanos, e 80% de todos os genes relacionados à doença humana têm pelo menos uma contrapartida de zebrafish.

Agora que você sabe por que os zebrafish fazem grandes organismos modelo, vamos dar uma olhada em como eles ganharam suas listras no laboratório. Na década de 1970, George Streisinger foi pioneiro no estabelecimento do modelo zebrafish. Na época, vários grupos estavam investigando a base genética do desenvolvimento em moscas e vermes. Como um hobby de peixe, Streisinger reconheceu o potencial do zebrafish como um modelo de desenvolvimento vertebrado. Streisinger desenvolveu técnicas para fazer embriões “ginogéticos”, cujo material genético deriva inteiramente da mãe, reduzindo assim o tempo de geração necessário para obter mutantes homozigosos.

Foi só em 1995 que Charles Kimmel e seus colegas contribuíram com uma caracterização completa do desenvolvimento normal de zebrafish para o campo.

Um ano depois, Christiane Nusslein-Volhard, Mark Fishman e Wolfgang Driever publicaram os resultados da primeira tela genética vertebrada em larga escala, que foi conduzida em Boston, Massachusetts e Tubingen, alemanha. Modelada após o trabalho de Nusslein-Volhard em Drosophila, esta tela de zebrafish foi projetada para identificar genes necessários para o desenvolvimento embrionário. Os resultados incluíram um catálogo de mais de 2.000 zebrafish mutantes. A análise desses mutantes nos ensinou muito sobre nossa própria biologia.

Em 2005, Keith Cheng e colegas clonaram slc24a5: o gene responsável pela pigmentação anormal no mutante de zebrafish dourado. O fenótipo dourado inspirou a descoberta de Cheng de que este gene em particular é necessário em peixes e células da pele humana para síntese do pigmento melanina, e que modificações na proteína estão fortemente ligadas a variações naturais na cor da pele humana.

Em 2011, pesquisadores do laboratório de Leonard Zon usaram embriões de zebrafish para identificar um novo terapêutico para melanoma. Em uma tela química, eles descobriram uma classe de drogas, incluindo Leflunomide, que retardaram o crescimento de células que contribuem para o melanoma. Agora, em ensaios clínicos, Leflunomide é apenas um exemplo da nova terapêutica que provavelmente será descoberta em telas de zebrafish de alto rendimento.

Agora que você tem uma noção do valor do modelo de zebrafish, vamos olhar para algumas das maneiras pelas quais os peixes são usados em laboratórios hoje.

Para começar, os zebrafish são muito úteis para modelar doenças humanas hereitárias. Estados da doença podem ser facilmente reproduzidos pela microinjeção de embriões precoces para alterar a expressão proteica. Isso também pode ser alcançado por mutantes genéticos, como este modelo de distrofia muscular de Duchenne, que exibe uma resposta anormal ao toque.

Uma vez que seu sistema imunológico inato se desenvolve durante os primeiros dias após a fertilização, embriões de zebrafish também são úteis para pesquisas de doenças infecciosas. Neste estudo, as bactérias foram injetadas na corrente sanguínea, e a resposta do hospedeiro foi visualizada em tempo real usando linhas transgênicas com macrófagos fluorescentes.

Graças à sua transparência, os embriões de zebrafish também são favoráveis a uma técnica de neurociência de ponta chamada optogenética. Esses pesquisadores projetaram um embrião que expressa uma proteína em neurônios isolados, o que lhes permite ativar a célula de forma óptica e determinar sua função específica em um circuito neural.

Você acabou de assistir a introdução de JoVE ao zebrafish, Danio Rerio. Neste vídeo, demonstramos que os zebrafish são um organismo modelo de vertebrados único com muitas das vantagens dos sistemas de invertebrados. No futuro, é provável que os zebrafish desempenharão um papel significativo na melhoria da nossa compreensão da doença humana e na descoberta de terapêuticas clinicamente úteis. Obrigado por assistir!

Transcript

Danio rerio, or zebrafish, are small fish that are making a big splash in biomedical research. Zebrafish lay hundreds of eggs that develop externally, allowing scientists to perform genetic manipulations and monitor early phenotypes in a complex organism. Since they share much of their genome with humans, zebrafish research is helping us on our way to understanding and treating human disease. This video will provide an overview of the zebrafish, the features that make them great models, and some of the ways in which they are used in labs today.

Before we talk about all that fishy science, let’s get to know the zebrafish. Like mice and humans, zebrafish are vertebrates, meaning they possess a backbone.

Specifically, zebrafish are bony fish in the class Actinopterygii, characterized by the presence of bony rays in their fins. More precisely, zebrafish belong to the single largest vertebrate family: Cyprinidae, which contains over 2,400 species, including the loveable goldfish.

Danio rerio are among the smallest members of this family, with adults measuring 30 – 40 millimeters, or about 1.5 inches, long. Zebrafish get their name because they resemble zebras. No, not quite like that. The name derives from the stripes running the length of their torpedo-shaped bodies.

Zebrafish originate from the Himalayan region, where they are found in slow-moving bodies of fresh water. However, you don’t need to travel very far to find them, as Danios are hardy fish that are staples of home aquariums.

The zebrafish life cycle advances through 4 major developmental stages: Embryo, larva, juvenile and adult. The cycle begins when eggs and sperm are released by a mating pair. After fertilization, the initial stages of development progress rapidly, with embryos hatching into larvae by 3 days post fertilization, or dpf. From this point, progression into a sexually mature adult requires an additional two to three months.

Now that we know a little bit about zebrafish in the wild, let’s review why they are so valuable in the lab. First, zebrafish can be housed at high density and are simple to care for, making them less expensive to maintain than other vertebrate models.

Next, zebrafish are extremely fertile. Mature females can lay hundreds of eggs on a weekly basis.

The external development of zebrafish embryos is extremely convenient, because of the ease with which gene expression can be manipulated by microinjection techniques. Additionally, since embryos are transparent, early developmental processes can be observed within the living organism.

Importantly, zebrafish also possess a high degree of genetic conservation with higher vertebrates, including humans. The zebrafish genome contains 25 chromosomes and 1.5 billion base pairs, which is about half the size of the human genome. Nevertheless, approximately 70% of all human genes, and 80% of all known human disease related genes have at least one zebrafish counterpart.

Now that you know why zebrafish make great model organisms, let’s take a look at how they’ve earned their stripes in the lab. In the 1970s, George Streisinger pioneered the establishment of the zebrafish model. At the time, several groups were investigating the genetic basis of development in flies and worms. As a fish hobbyist, Streisinger recognized the potential of zebrafish as a vertebrate model of development. Streisinger developed techniques for making “gynogenetic” embryos, whose genetic material derives entirely from the mother, thus reducing the generation time required to obtain homozygous mutants.

It wasn’t until 1995 that Charles Kimmel and colleagues contributed a thorough characterization of normal zebrafish development to the field.

One year later, Christiane Nusslein-Volhard, Mark Fishman and Wolfgang Driever published the results of the first large-scale vertebrate genetic screen, which was conducted in Boston, Massachusetts and Tubingen, Germany. Modeled after Nusslein-Volhard’s work in Drosophila, this zebrafish screen was designed to identify genes required for embryonic development. The results included a catalog of more than 2,000 mutant zebrafish. Analysis of these mutants has since taught us a great deal about our own biology.

In 2005, Keith Cheng and colleagues cloned slc24a5: the gene responsible for abnormal pigmentation in the golden zebrafish mutant. The golden phenotype inspired Cheng’s discovery that this particular gene is required in fish and human skin cells for synthesis of the pigment melanin, and that modifications in the protein are tightly linked to natural variations in human skin color.

In 2011, researchers in Leonard Zon’s lab used zebrafish embryos to identify a novel therapeutic for melanoma. In a chemical screen, they discovered a class of drugs, including Leflunomide, that slowed the growth of cells that contribute to melanoma. Now in clinical trials, Leflunomide is but one example of the novel therapeutics likely to be discovered in high-throughput zebrafish screens.

Now that you have a feel for the value of the zebrafish model, let’s look at some of the ways in which fish are used in labs today.

To begin, zebrafish are very useful for modeling heritable human diseases. Disease states can be easily reproduced by microinjection of early embryos to alter protein expression. This can also be achieved by genetic mutants, such as this model of Duchenne muscular dystrophy, which exhibits an abnormal response to touch.

Since their innate immune system develops during the first few days post fertilization, zebrafish embryos are also useful for infectious disease research. In this study, bacteria were injected into the bloodstream, and the host response was visualized in real time using transgenic lines with fluorescent macrophages.

Thanks to their transparency, zebrafish embryos are also amenable to a cutting edge neuroscience technique called optogenetics. These researchers engineered an embryo that expresses a protein in isolated neurons, which allows them to optically activate the cell and determine its specific function in a neural circuit.

You’ve just watched JoVE’s introduction to the zebrafish, Danio rerio. In this video, we’ve demonstrated that zebrafish are a unique vertebrate model organism with many of the advantages of invertebrate systems. In the future, zebrafish are likely to play a significant role in improving our understanding of human disease and our discovery of clinically useful therapeutics. Thanks for watching!