Journal
/
Biologia
/
Genome-wide Kartlegging av narkotika DNA Interactions i Cells med COSMIC (Fornetting av små molekyler å isolere Chromatin)
JoVE Journal
Biologia
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
Genome-wide Mapping of Drug-DNA Interactions in Cells with COSMIC (Crosslinking of Small Molecules to Isolate Chromatin)

Genome-wide Kartlegging av narkotika DNA Interactions i Cells med COSMIC (Fornetting av små molekyler å isolere Chromatin)

DOI:
10.3791/53510-v

•

10:05 min

•

January 20, 2016

•

, , , , ,
1Department of Biochemistry,University of Wisconsin–Madison, 2Department of Electrical and Computer Engineering,University of Wisconsin–Madison, 3Graduate Program in Cellular and Molecular Biology,University of Wisconsin–Madison, 4The Genome Center,University of Wisconsin–Madison

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:48Crosslinking in Live Cells
  • 03:19Isolation of Chromatin
  • 05:14Capture of Ligand-DNA Crosslinks and Isolation of Affinity-purified DNA
  • 07:52Results: COSMIC Indentifies Genome-wide Binding Events of Polyamides
  • 09:21Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Identifisere de direkte målene for genom målretting molekyler er fortsatt en stor utfordring. For å forstå hvordan DNA-bindende molekyler engasjere genomet, har vi utviklet en metode som er avhengig av kryssbinding av små molekyler å isolere kromatin (COSMIC).

Tags

Genome-wide MappingDrug-DNA InteractionsCOSMICCrosslinkingSmall MoleculesChromatinPolyamidesDNA-targetingMechanism Of ActionTherapeutic AgentsDNA-targeting MoleculesPluripotent Stem CellsPhoto-cross-linkingUV RadiationCell DissociationEnzymeE8 Media

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Genome-wide Analysis of Aminoacylation (Charging) Levels of tRNA Using Microarrays

Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Genome-wide Gene Deletions in Streptococcus sanguinis by High Throughput PCR

En In vivo Crosslinking Approach å isolere protein komplekser Fra Drosophila Embryo

Genome-wide Protein-protein Interaksjon Screening av Protein-fragment Komplemente analyse (PCA) i levende celler

Isolering av Spesifikke Genomiske Regioner og Identifisering av Associated Molekyler av enChIP

DamID-seq: Genome-wide Kartlegging av Protein-DNA Interaksjoner med høy gjennomstrømning Sekvensering av adenin-metylert DNA-fragmenter

Forsterkning, Neste generasjons sekvensering, og Genomisk DNA Kartlegging av Retrovirale Integrasjons nettsteder

Read Article