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DOI: 10.3791/54131-v
Rohit R. Jadhav1, Yao V. Wang1, Ya-Ting Hsu1, Joseph Liu1, Dawn Garcia2, Zhao Lai2, Tim H. M. Huang1, Victor X. Jin1
1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children's Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Aqui apresentamos um protocolo para investigar a metilação do DNA do genoma ampla em grande escala estudos de triagem de pacientes clínicos utilizando o Metil-Binding tecnologia de sequenciamento de DNA Captura (MBDCap-seq ou MBD-seq) eo gasoduto análise bioinformática subsequentes.
O objetivo geral desta técnica é investigar sistematicamente o cenário de metilação do DNA em todo o genoma em grandes coortes de pacientes. Este método pode ajudar a responder a questões-chave no campo epigenético, especialmente no que diz respeito a quais regiões no cenário de metilação do DNA são desreguladas em pacientes. A principal vantagem desta técnica é que o grande número de pacientes pode ser investigado de maneira econômica.
Essa tecnologia pode ter implicações positivas na terapia e no diagnóstico do paciente, pois podemos investigar os biomarcadores existentes e também identificar novos biomarcadores. Embora esse método possa fornecer informações sobre a coorte de pacientes, ele também pode ser aplicado a outros sistemas, como a metilação do DNA em células derivadas de linhagens celulares cultivadas de amostras derivadas de camundongos. Demonstrando este procedimento junto com o Dr.Ya-Ting Hsu estará o Sr. Joseph Liu, um técnico em nosso laboratório.
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