Name: In Situ Caracterização de Shewanella oneidensis MR1 biofilmes por SALVI e ToF-SIMS (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-08-18T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 56 s
Description: Aprenda a cultivar biofilmes de Shewanella oneidensis MR-1 em reator microfluídico para análise química por ToF-SIMS em estado hidratado. Este método permite visualizar a distribuição químico-espacial de biofilmes vivos.

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Agradecemos ao laboratório nacional Noroeste Pacífico (PNNL) terra e ciências biológicas (EBD) missão semente laboratório dirigido a investigação e desenvolvimento (LDRD) fundo de apoio. Acesso instrumental foi fornecido através de uma proposta de usuário geral W. R. Wiley ambiental Molecular Sciences Laboratory (EMSL). EMSL é uma instalação de usuário científico nacional patrocinada pelo escritório de biológicos e pesquisa ambiental (BER) em PNNL. Os autores agradecer Dr. Yuanzhao Ding prova lendo o manuscrito e fornecendo feedback útil. PNNL é operado pela Battelle para o DOE sob contrato DE-AC05-76RL01830.

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</ol>

Os autores não têm nada para divulgar.

Após inocular em fase de registro, é importante testar o número de dias e a temperatura na qual o biofilme deve crescer antes que seja saudável e grossa o suficiente para a imagem latente, conforme descrito na etapa 3.1. Este procedimento abrange especificamente cultivo um S. oneidensis MR1 biofilme à temperatura ambiente; no entanto, diferentes temperaturas de quarto pode influenciar a taxa de crescimento. Portanto, é fundamental usar imagens ópticas para entender se o biofilme está pronto antes de proceder à análise de...

Biofilmes bacterianos são comunidades associadas a superfície que evoluíram ao longo do tempo como uma defesa para que as bactérias sobrevivem variando adversos estímulos físicos e mecânicos, em que células são capazes de unir e sobreviver em muitos ambientes de possíveis. 1 , 2 biofilmes são vastamente investigados e têm aplicações em muitos campos tais como biomedicina, Engenharia Biomédica, agricultura e investigação industrial e desenvolvimento. 1 , 2 compreender o mapeamento químico dessas comunidades microbianas complexas, incluindo suas auto-produzido substâncias poliméricas extracelulares (EPS) e o seu ambiente de cluster de água local, é essencial para ganhar uma exata e detalhada Descrição de suas atividades biológicas. 2
Biofilmes existirem e crescem dentro de um estado altamente hidratado. Isto representa um grande desafio na utilização de técnicas de análise de superfície baseada em vácuo como espectrometria de massa de iões secundário de tempo-de-voo (ToF-SIMS) devido à dificuldade em estudar líquidos voláteis no vácuo. Como resultado, técnicas de análise de superfície baseada em vácuo tem sido limitadas quase exclusivamente ao estudo de amostras de biofilme em apenas seu estado seco. No entanto, estudar um biofilme no seu estado seco inibe a investigação exata de sua verdade biológica microambiente. Muitas vezes provoca mudanças drásticas para a morfologia de integridade e biofilme EPS, que demonstrou-se depois de comparar resultados massa espectral biofilme seco em situ estudos líquido. 3 , 4 este artigo apresenta uma solução para o estudo de biofilmes dentro de seu estado hidratado natural empregando o uso de nosso sistema para análise na Interface líquido de vácuo (SALVI),5,6 um reator microfluidic que contém líquido sob sua membrana de nitreto (pecado) de silicone fina em um microchannel feita de polidimetilsiloxano (SPDM), proporcionando acesso directo ao feixe de íon secundário de sonda, mantendo a integridade estrutural da matriz líquido dentro de um vácuo Câmara. 7 , 8
S. oneidensis MR-1 mutado para expressar a proteína fluorescência verde (GFP) foi escolhido como um organismo modelo para esta ilustração do procedimento de biofilme devido à sua versatilidade metabólica e uso comum em microbiologia ambiental e aplicada, que foi baseado fortemente na sua capacidade única para redução de metal e a transferência de elétrons extracelular. 9 , 10 , 11 além disso, a presença de GFP permitido para fácil espessura biofilme contínua monitoramento através de microscopia de fluorescência, utilizando um filtro (FITC) de isotiocianato de fluoresceína. Nossos estudos anteriores mostraram evidências desta bactéria, favorecendo o apego à janela pecado utilizando em operando imagens de fluorescência para o crescimento do biofilme para uma espessura de até 100 micrômetros. 4 , 12 enquanto este artigo discutirá apenas a confirmação da presença do biofilme através de microscopia de fluorescência, a SALVI é compatível com outros métodos de imagem ópticos como super-resolução fluorescência imagem latente (ou seja, estruturada iluminação microscopia (SIM),9) e laser confocal, microscopia (CLSM) imagem4). Imagem latente ótica pode servir para medir a espessura do biofilme e obter uma imagem 3D, da forma do biofilme como parece, confirmando a sua espessura e a sua fixação para a janela do pecado. 9 enquanto GFP foi usado na análise SIMS, s. oneidensis sem GFP foi utilizado para a curva de crescimento, como esta única medida necessária de densidade óptica e não exigem qualquer imagem fluorescente. Geralmente, a diferença entre o GFP marcados e espécies não marcados na curva de crescimento é insignificante. Além disso, enquanto este protocolo usa S. oneidensis MR-1 GFP como um organismo modelo para descrever o procedimento, este procedimento é projetado para qualquer estirpe bacteriana que pode ser necessário para o cultivo dentro SALVI. Embora, dado o conhecimento da estirpe bacteriana necessária, algumas condições de crescimento, tais como tempo, temperatura e oxigênio ambiente talvez precise ser modificado para acomodar a cepa de bactérias para ser usado. Por meio de crescimento, este procedimento usa "nanofios" médio, tryptic soy caldo de carne (TSB) sem glicose e tryptic soy agar (TSA) sem glicose para cultivo. A composição do meio de "nanofios", foi especialmente formulada para o crescimento e para o monitoramento de extensões da membrana e periplasm de S. oneidensis que parecem tomar a forma de pequenos fios e a composição média tem sido estabelecida na pesquisa anterior. 13 , 14
Nosso protocolo anterior em in situ ToF-SIMS líquido ilustrou o benefício que SALVI tem para oferecer para imobilização de proteínas e acessório para o pecado, bem como um protocolo detalhado na redução de dados e análise de ToF-SIMS. 12 em vez de reiterar as etapas de redução de dados, este documento servirá para em vez disso, focar a abordagem única de criação e cultivando biofilmes dentro nosso microchannel SALVI, bem como as etapas de imagem para detectar a presença de biofilme e espessura prévia a análise de ToF-SIMS. Enquanto biofilmes têm sido anteriormente limitados a apenas secas amostras dentro da câmara de técnicas analíticas de superfície baseada em vácuo, mapeamento detalhado EPS e biofilme químico de biofilmes ao vivo agora pode ser obtido em situ por causa deste novo recurso.

<table><tbody><tr><td>ToF-SIMS</td><td>IONTOF</td><td>TOF. Resolução do SIMS 5</td><td>:>10.000 m/&Delta; m para resolução em massa; >4.000 m/&Delta; m para Sistema</td></tr><tr><td>de Análise na Interface de Vácuo Líquido (SALVI)</td><td>Laboratório Nacional do Noroeste do Pacífico</td><td>N / A</td><td>SALVI é uma ferramenta analítica única, autônoma e portátil que, pela primeira vez, permite que instrumentos científicos baseados em vácuo, como espectrometria de massa de íons secundários por tempo de voo (ToF-SIMS), analisem superfícies líquidas em seu estado natural no nível molecular.</td></tr><tr><td>-80&deg; C Freezer</td><td>New Brunswick Scientific</td><td>N/A</td><td>U410 Premium Energy Efficient Ultra-Low Temperature Freezer</td></tr><tr><td>4&deg; C Refrigerador</td><td>BioCold Scientific</td><td>N/A</td><td>COLDBOX1</td></tr><tr><td>Agitador Orbital</td><td>New Brunswick Scientific</td><td>N/A</td><td>Innova 4900 Multi-Tier Environmental Shaker, ajustado a 30 graus Celsius para cultivo de frasco e frasco de soro, ajustado a 150rpm.</td></tr><tr><td>Bomba de Seringa</td><td>Cole-Parmer</td><td>EW-74905-02</td><td>Bomba de Seringa Cole-Parmer, Apenas Infusão, Controle de Tela Sensível ao Toque 74905-02, usada para injetar líquido no sistema de tubulação e SALVI a uma vazão constante.</td></tr><tr><td>Incubadora</td><td>Barnstead International</td><td>LT1465X3</td><td>incubadora Lab-Line, ajustada a 30 graus Celsius para cultivo de placas.</td></tr><tr><td>Autoclave</td><td>Getinge</td><td>533LS</td><td>Usado para esterilizar conexões PEEK, sistemas de tubulação, frascos de soro e meio. Espectrofotômetro de esterilizador a vapor a vácuo modelo 533LS</td></tr><tr><td></td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>4001-000</td><td>Espectrofotômetro GENESYS 20 para leituras OD600 de cubetas para curvas de crescimento.</td></tr><tr><td>Gabinete de Segurança Biológica</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>1385</td><td>Série 1300 AZ Gabinete de Segurança Biológica</td></tr><tr><td>Microscópio de Fluorescência</td><td>Nikon</td><td>N/A</td><td>Microscópio de fluorescência Nikon OPTIPHOT-2 com câmera e fonte de alimentação de lâmpada de mercúrio de super alta pressão.</td></tr><tr><td>Medidor de pH</td><td>Mettler Toledo</td><td>51302803</td><td>Usado para testar o pH do " nanofios" meio depois de terminado e antes da autoclavagem.</td></tr><tr><td>PEEK Union</td><td>Valco</td><td>ZU1TPK</td><td>Para conectar a entrada e saída do SALVI, a seringa ao sistema de tubulação e a entrada do SALVI à câmara de gotejamento do sistema de tubulação.</td></tr><tr><td>Estágio de amostra de 5 eixos</td><td>IONTOF</td><td>N / A</td><td>Stage é feito por você mesmo para montagem de SALVI em ToF-SIMS.</td></tr><tr><td>Sistema de Purificação de Água Nanopure Barnstead</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>D11921</td><td>ROpure LP Módulo de filtração por osmose reversa (D2716)</td></tr><tr><td>Pipeta</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>21-377-821</td><td>Faixa: 100 a 1.000 &micro;L.</td></tr><tr><td>Ponteira</td> de <td>Pipeta Neptune</td><td>2112.96.BS</td><td>1.000 &micro; Pontas de pipeta L</td></tr><tr><td>Cabo de lâmina de barbear</td><td>Stanley</td><td>N/A</td><td>Raspador de lâmina de barbear Stanley Bostitch com 5 lâminas de borda única, usado para cortar tubos de PTFE</td></tr><tr><td>Seringa</td><td>BD</td><td>309659</td><td>Seringa de 1 mL</td></tr><tr><td></td><td>BD</td><td>309657</td><td>Seringa de 3 mL</td></tr><tr><td></td><td>BD</td><td>309646</td><td>5 mL; Usada para fazer a câmara de gotejamento</td></tr><tr><td>Seringa</td><td>BD</td><td>309604</td><td>Seringa de 10 mL</td></tr><tr><td></td><td>BD</td><td>302830</td><td>20 mL</td></tr><tr><td>Pipeta</td><td>Descartável Thermo Fisher Scientific</td><td>13-678-11</td><td>25 mL Marca Fisher&trade; Pipetas sorológicas descartáveis de poliestireno estéril com lupa</td></tr><tr><td>Enchimento de pipetas eléctricas</td><td>Pipeta-auxiliar</td><td>P-57260</td><td>Enchimento de pipetas serológicas eléctricas de pressão de vácuo</td></tr><tr><td>Frasco de soro</td><td>Sigma</td><td>33109-U</td><td>Contém aproximadamente 69 mL de líquido para o crescimento da cultura, óptimo para a utilização de 20mL de cultura por frasco.</td></tr><tr><td>Tubo de cultura anaeróbica</td><td>VWR</td><td>89167-178</td><td>Tubos anaeróbicos, 18 x 150 mm, fornecidos com rolha de borracha butílica azul de 20 mm e vedação de alumínio.</td></tr><tr><td>Rolha de borracha</td><td>Sigma</td><td>27235-U</td><td>Rolha de silicone, usada para selar frascos de soro e para criar o sistema de tubulação/câmara de gotejamento.</td></tr><tr><td>Vedação de Crimpagem de Alumínio (sem septo)</td><td>Sigma</td><td>27227-U</td><td>Vedação de alumínio para topo do frasco de soro para uso com crimpador de frasco de soro.</td></tr><tr><td>Crimper de vedação de alumínio para frasco de</td><td>soro Wheaton</td><td>224307</td><td>crimpador de 30 mm com vedação padrão.</td></tr><tr><td>Tubulação de PTFE</td><td>Supelco</td><td>58697-U</td><td>1,58 mm OD x 0,5 mm ID 50 ft. Tubulação de Teflon PTFE, usada para criar o sistema de tubulação.</td></tr><tr><td>Cuvetes descartáveis</td><td>GMBH</td><td>759085D</td><td>1,5 Ml para uso com espectrofotômetro.</td></tr><tr><td>Agulha</td><td>BD</td><td>303015</td><td>22G; usada para injeção de frasco de soro.</td></tr><tr><td>Agulha</td><td>BD</td><td>305120</td><td>23G; usado para perfurar a rolha de borracha para criar um sistema de tubulação de gotejamento.</td></tr><tr><td>Shewanella oneidensis MR-1 com GFP</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Matthysse AG, Stretton S, Dandie C, McClure NC, & Goodman AE (1996) Construção de vetores GFP para uso em bactérias Gram-negativas que não sejam Escherichia coli. FEMS Microbiol Lett 145(1):87-94.&nbsp;</td></tr><tr><td>Etanol</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>&nbsp; S25310A</td><td>95%</td></tr><tr><td>de ágar de soja tríptico TSA</td><td>BD</td><td>212305</td><td>desnaturado para cultura do organismo modelo (S. oneidensis) usado neste protocolo</td></tr><tr><td>PIPES Buffer</td><td>Sigma</td><td>P-1851</td><td>Usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Hidróxido de sódio</td><td>Sigma</td><td>S-5881</td><td>Usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de amônio</td><td>Sigma</td><td>A-5666</td><td>Usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de potássio</td><td>Sigma</td><td>P-4504</td><td>usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Fosfato de sódio Monobasic</td><td>Sigma</td><td>S-9638</td><td>Usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de sódio</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>S271-3</td><td>Usado para " nanofios" e usado para fazer solução mineral usada para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Lactato de sódio</td><td>Sigma</td><td>L-1375</td><td>60% (p / p) xarope @ 98% puro, d = 1,3 g / mL, 7M, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Bicarbonato de sódio</td><td>Sigma</td><td>S-5761</td><td>Usado para fazer solução férrica de NTA, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sal trissódico de ácido nitrilotriacético</td><td>Sigma</td><td>N-0253</td><td>Usado para fazer solução férrica de NTA, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de ferro (III)</td><td>Sigma</td><td>451649</td><td>Usado para fazer solução férrica de NTA, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sulfato de magnésio</td><td>Sigma</td><td>208094</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sulfato de manganês (II) monohidratado</td><td>Sigma</td><td>M-7634</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sulfato de Ferro (II) Heptahidratado</td><td>Sigma</td><td>215422</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de cálcio di-hidratado</td><td>Sigma</td><td>223506</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de cobalto(II)</td><td>Sigma</td><td>60818</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de zinco</td><td>Sigma</td><td>229997</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sulfato de cobre (II) pentahidratado</td><td>Sigma</td><td>C-8027</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Sulfato de Potássio de Alumínio Dodecahidratado</td><td>Sigma</td><td>237086</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Ácido bórico</td><td>Sigma</td><td>B-6768</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Molibdato de sódio di-hidratado</td><td>Sigma</td><td>331058</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloreto de níquel (II)</td><td>Sigma</td><td>339350</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Tungstato de sódio di-hidratado</td><td>Sigma</td><td>14304</td><td>Usado para fazer solução mineral, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>D-Biotina</td><td>Sigma</td><td>47868</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Ácido fólico</td><td>Sigma</td><td>F-7876</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloridrato de piridoxina</td><td>Sigma</td><td>P-9755</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Riboflavina (B2)</td><td>Sigma</td><td>47861</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Cloridrato de tiamina</td><td>Sigma</td><td>T-4625</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Ácido nicotínico</td><td>Sigma</td><td>N4126</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>D-Pantothenic Acid Hemicalcium Salt</td><td>Sigma</td><td>21210</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Vitamina B12</td><td>Sigma</td><td>V-2876</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Ácido 4-aminobenzóico</td><td>Sigma</td><td>A-9878</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" meio {Hill, E.A. 2007}</td></tr><tr><td>Ácido tióctico</td><td>Sigma</td><td>T-1395</td><td>Usado para fazer solução vitamínica, usado para " nanofios" médio {Hill, E.A. 2007}</td></tr></tbody></table>

in situ caracterização de shewanella oneidensis mr1 biofilmes por salvi e tof-sims

In Situ Characterization of Shewanella oneidensis MR1 Biofilms by SALVI and ToF-SIMS

Biofilmes bacterianos são comunidades de superfície associadas que são vastamente estudadas para entender suas auto-produzido substâncias poliméricas extracelulares (EPS) e seus papéis em microbiologia ambiental. Este estudo descreve um método para cultivar apego de biofilme no sistema para análise na Interface líquido de vácuo (SALVI) e alcançar em situ mapeamento químico de um biofilme vivos por espectrometria de massa de iões secundário de tempo-de-voo (ToF-SIMS). Isto é feito através do cultivo de bactérias tanto fora como dentro do canal SALVI com nossa instalação especializada, bem como através de técnicas de imagem ópticas para detectar a presença de biofilme e espessura antes da análise de ToF-SIMS. Nossos resultados mostram os Picos característicos de biofilme a Shewanella em seu estado natural e hidratado, destacando em seu ambiente de cluster de água localizadas, bem como EPS fragmentos, que são drasticamente diferentes do biofilme a mesma desidratado Estado. Estes resultados demonstram a capacidade de descoberta de SALVI que permite em situ biofilme de imagem com um instrumento de imagem químico baseada em vácuo.

Estes resultados representativos servem para mostrar como o perfil químico do biofilme anexado pode ser identificado e interpretado, como obtidas por ToF-SIMS. Após a plotagem de espectros de massa de aquisição de dados de ToF-SIMS, destacada-se brevemente na seção procedimentos, identificação de pico deve ser conduzida para atribuir as identidades para cada valor de m/z respectivos. Isso pode ser feito através da revisão de literatura extensa na espectrometria de massa em bactérias e fra...

Este artigo apresenta um método para o cultivo de um biofilme para em situ íon secundário de tempo-de-voo espectrometria de massa para mapeamento químico em seu estado hidratado, habilitado por um reator microfluídicos, sistema para análise na Interface líquido do vácuo. A Shewanella oneidensis MR-1 com proteína de fluorescência verde foi usado como um modelo.

In Situ Caracterização de Shewanella oneidensis MR1 biofilmes por SALVI e ToF-SIMS

Bacterial biofilms are surface-associated communities that are vastly studied to understand their self-produced extracellular polymeric substances (EPS) ...

O objetivo geral deste procedimento é cultivar bactérias no sistema para análise na interface líquido-vácuo, ou SALVI, com a finalidade de posterior obtenção de imagens de biofilmes em seu estado hidratado natural por meio de técnicas baseadas em vácuo, como a Espectrometria de Massas por Íons Secundários com Tempo de Voo. Apresentamos um método que auxilia na resposta a questões fundamentais em microbiologia ambiental, ao permitir a visualização da distribuição químico-espacial de biofilmes vivos utilizando espectrometria de massas por imagem, como a SIMS. A principal vantagem desta técnica é que podemos introduzir biofilmes vivos em um espectrômetro de massas e em muitas outras plataformas analíticas para obter medições multiplexadas.Embora Shewanella oneidensis seja usada neste vídeo, este método também pode ser aplicado a câmaras anaeróbias para o crescimento de biofilmes. Este último exige um ambiente de crescimento mais rigoroso. A demonstração visual deste método é essencial, pois os passos de montagem da tubulação são difíceis de aprender.A colocação específica da tubulação e os cuidados necessários são essenciais ao transferir para a câmara de segurança biológica. Usando u

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Research

JoVE Journal

Chemistry

Química

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Uma ferramenta analítica-box para avaliação bioquímica, estrutural e Transcriptoma abrangente de Biofilmes Oral Mediada por estreptococos do grupo mutans

Nós fornecer um método simples, semi-quantitativa para investigar a formação de...

Uma abordagem semi-quantitativa para avaliar formação de biofilmes usando o desenvolvimento da colônia enrugado

Fonte: Tokunou, Y. et al., Detecção Eletroquímica do Efeito Cinético de Isótopos de Deutério no Transporte Extracelular de Elétrons em Shewanella oneidensis MR-1. J. Vis. Exp. (2018)Este vídeo demonstra a montagem e operação de um modelo de reator eletroquímico projetado para simular a formação de biofilmes em superfícies de eletrodos. A estimulação eletroquímica controlada promove a adesão microbiana, levando ao desenvolvimento gradual de um biofilme bacteriano monocamada.

Desenvolvendo um biofilme monocamada bacteriano usando um reator eletroquímico

O crescimento cronoamperométrico de biofilmes microbianos eletroativos anódicos em um reator de batelada alimentada usando uma configuração de três eletrodos, controlado por um potenciostato, é demonstrado. A transferência extracelular de elétrons é caracterizada por voltametria cíclica na presença do doador de elétrons e na ausência do doador de elétrons. A análise fundamental dos dados é demonstrada.

Biofilmes Microativos Eletroativos Derivados de Águas Residuais: Crescimento, Manutenção e Caracterização Básica

Os biofilmes têm interações complexas com o ambiente circundante. Para investigar de forma abrangente as interações biofilme-ambiente, apresentamos aqui uma série de métodos para criar um ambiente químico heterogêneo para o desenvolvimento do biofilme, quantificar a velocidade do fluxo local e analisar o transporte de massa dentro e ao redor das colônias de biofilme.

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Este estudo apresenta o desenvolvimento de metodologias reprodutíveis para estudar inibidores de biofilme e seus efeitos sobre a multicelularidade de Bacillus subtilis.

Metodologias para o estudo<em&gt; B. subtilis</em&gt; Os biofilmes como um modelo para a caracterização de pequena molécula biofilme Inibidores

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Formação de biofilmes induzida por sais biliares em patógenos entéricos: técnicas para identificação e quantificação

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Eletroquímico deteção de deutério cinética efeito isotópico no transporte de elétrons extracelular em Shewanella oneidensis MR-1

Propomos um protocolo otimizado de Microscopia Eletrônica de Varredura para visualização de amostras altamente heterogêneas e delicadas contendo biomassa vegetal e fúngica, juntamente com microbiota e biofilme. Este protocolo permite descrever as dimensões espaciais da organização da microbiota.

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Aprenda a cultivar biofilmes de Shewanella oneidensis MR-1 em reator microfluídico para análise química por ToF-SIMS em estado hidratado. Este método permite visualizar a distribuição químico-espacial de biofilmes vivos.

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