Name: Análise quantitativa da arborização dendrítica Neuronal complexidade em Drosophila (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-01-07T14:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 13 s
Description: Aprenda a analisar a complexidade da arborização dendrítica neuronal em Drosophila usando microscopia confocal e traçado de neuritos. Este método quantifica alterações morfológicas induzidas pelo gene SOX5 para estudar doenças neurodegenerativas.

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Gostaríamos de agradecer William A. Eimer para assistência técnica de imagem. Este trabalho foi financiado pelo fundo a cura a doença de Alzheimer [a R.E.T], o Instituto Nacional de saúde [R01AG014713 e R01MH60009 para R.E.T; R03AR063271 e R15EB019704 para A.L.] e a National Science Foundation [NSF1455613 para A.L.].

1. preparação experimental
<ol><li>Preparem-se os seguintes reagentes: tampão fosfato de Dulbecco salino (PBS); Triton X-100; 0,2% PBST (PBS + 0,2% Triton X-100); 32% paraformaldeído (PFA), diluído em 4% antes do uso; base de elastômero de silicone e agente de cura; meio de montagem antidesgaste (por exemplo, prolongar a ouro); e unha polonês.</li>
	<li>Preparar os seguintes equipamentos: microscópio de dissecação, dois afiada fórceps e um par de tesouras para microdissection, um número de pinos para microdissection, uma placa de Petri para fazer o prato de dissecação, corrediças do microscópio e lamelas, um microscópio confocal e um computador com software ImageJ Fiji instalado.</li>
</ol>2. larvas coleção
<ol><li>Mate moscas UAS-Sox102F-RNAi com UAS-GFP, ppk-GAL4 ou W1118 selvagem tipo moscas, respectivamente. Moscas de cultura em condições padrão a 25 ° C.</li>
	<li>~ 5-6 dias, recolher as terceiro ínstar larvas de RNAi-Sox102F-UAS / ppk-GAL4, UAS-GFP ou UAS-GFP e ppk-GAL4 / + controle cuidadosamente com a pinça para dissecação.</li>
</ol>3. dissecação de larvas
Nota: Todos os procedimentos nesta seção são operados sob um microscópio microdissection. A ampliação é até os investigadores. Tente ajustar para o modo de exibição de visão ideal. Recomenda-se a ampliação de X ~ 4-6.
<ol><li>Coloque uma larva em um prato de dissecação feito de elastômero de silicone base e uma placa de Petri de cultura de tecidos.</li>
	<li>Pin o gancho de boca de larva para permitir que o lado dorsal de face para cima, e em seguida coloque o rabo de larva. Coloque o lado dorsal no meio tanto quanto possível para expor a linha média, que será o marco de abertura-alto.</li>
	<li>Adicione 200 µ l de PBS para a larva para manter a umidade do corpo.</li>
	<li>Fazer um corte com uma tesoura ao longo da linha média dorsal entre os dois tracheas, de caudal para rostral. Faça um pequeno corte em cada um dos quatro cantos do corpo da larva.</li>
	<li>Coloque um alfinete em cada um dos quatro cantos do corpo para que o corpo encontra-se plana.</li>
	<li>Consertar a parede do corpo de larva em 4% PFA para 25 min à temperatura ambiente.</li>
	<li>Lavar em PBST 5 min. repetir mais duas vezes.</li>
	<li>Remova os pinos do tecido. Em seguida, transferir o tecido numa lâmina de vidro, cobrir com meio de montagem antidesgaste e montar com uma lamela. Ar seco por 1 h e selar as bordas com esmalte de unha.</li>
</ol>4. processamento de imagens
Nota: Imagens foram tiradas usando um sistema de microscópio confocal invertido. O usuário pode fotografar a amostra usando um objectivo de X 20 (recomendado).
<ol><li>Capture imagens de Z-series. Abra a caixa de diálogo "Capturar Z-series" no software do microscópio confocal. Determine o intervalo para capturar as imagens da série Z.<ol>
<li>Clique no botão "Superior e inferior". Determinar a parte superior e inferior posição e os valores de entrada "inferior:" e "Top:" caixas. Defina o "passo" na caixa de diálogo "Capturar Z-series" como 0.5 µm. Clique no botão "Executar agora" para adquirir as imagens de Z-series.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Salve as imagens obtidas como arquivos *.tiff ou *.nd2.</li>
	<li>Armazene os slides em um suporte escuro a 4 ° C, após a imagem.</li>
</ol>5. dendrito avaliação
Nota: A proteína GFP foi co-overexpressed em UAS-GFP e ppk-GAL4 voa nos neurônios para fluorescência de GFP, análise de imagem. O comprimento, ramificação e estrutura dos neurônios no terceiro ínstar larvas foram quantificados. Parâmetros de análise incluem comprimento de dendrites (µm), área de superfície (µm2), número total de galhos e estrutura de ramificação (%). A Figura 1 mostra os parâmetros de análise em detalhe.
<ol><li>
Comprimento de Dendrites Nota: O comprimento dos dendritos é a soma de todos os dendritos rotulado no plugin de traçador.<ol>
<li>Configurar e executar o software de20 Fiji ImageJ (https://fiji.sc/). Em seguida, dividi imagens em canais separados, se existem vários canais de imagens. Nota: A imagem no presente protocolo só tem um canal de GFP.</li>
		<li>Executar "imagem | Pilhas | Projeto Z"para obter uma projeção de Z; uma nova janela aparecerá com o nome 'Z-projeção.' Clique em "intensidade máxima" para o tipo de projeção e organizar números entre fatia de arranque e paragem fatia dependendo em cima de preferências individuais. Clique em "Okey". Uma imagem de Z-projeção aparecerá apresentando a projeção dendrito claramente.</li>
		<li>Rastrear os neuritos.<ol>
<li>Selecione "Plugins | Segmentação | Simples Tracer neuritos"na janela para rastrear os dendritos. Encontrar o soma do neurônio e em seguida, clique em um ponto em um dendrito a partir do corpo celular e outro ponto na ponta deste dendrito. Nota: O programa irá se conectar os dois pontos com uma linha azul.</li>
			<li>Pressione "Y" na janela do plug-in, se o caminho está livre; o caminho do dendrito é rastreado até os pontos de extremidade do caminho selecionado nas imagens visíveis. Clique em "caminho completo" na mesma janela do plugin; o segmento está concluído (Figura 2). Nota: Alguns dendritos terminaram mais longe os pontos de partida, a via foi dividida em segmentos menores. Os segmentos foram combinados para fornecer um caminho completo para o tracer.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Depois que um caminho é concluído, volte-se para um novo ponto de onde são os ramos. O novo caminho pode ser construído em; caixa de janela "Todos os caminhos" mostrará os valores de comprimento de todos os caminhos (Figura 3). Salve o arquivo de rastreamento e continuar com traços inacabados, como mostrado na Figura 2.</li>
		<li>Exportar os dados de comprimento dendrito clicando, "arquivo | Exportar como CVS"na janela 'Plugin'. Então resumir todos os comprimentos de caminho e exportar os dados para um software de análise/planilha de dados. (Figura 3).</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Área de superfície dos neurônios da
	<ol>
<li>Selecione a ferramenta de desenho à mão livre na janela 'Fiji ImageJ'. Rastrear o caminho e em seguida, ligue os pontos de extremidade. No menu 'Analisar', selecione "Set medições | Área." Clique em "medida" do menu 'Analisar'. O resultado é exibido em uma nova caixa com o valor para a área selecionada (Figura 4). Copie-o para o software de análise de dados.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Total do número de filiais e estrutura de ramificação dos neurônios da
	<ol>
<li>Calcular o número total de filiais através da abertura de "Análise" e depois "Render | Analisar Skeletonized caminhos"na janela do plugin de rastreamento (Figura 5). Nota: A estrutura do caramanchão é a soma dos níveis dos ramos. O caminho foi definido entre o corpo da célula e as dicas do dendrito, e um caminho pode incluir vários ramos, tais como os mandris primários são os dendritos do neurônio corpo celular. Os mandris secundários são ramos do primário e assim por diante com os mandris de terciário, quaternário e quinário. A estrutura de ramificação dendrito é separada dependendo dos níveis dos ramos. Por exemplo, o principal % é o número de ramos, divididos pelo número total de ramificação e assim por diante.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

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<li>MacNeil, M. A., Masland, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Extreme+diversity+among+amacrine+cells%3A+implications+for+function%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Extreme diversity among amacrine cells: implications for function.</a> Neuron. 20 (5), 971-982 (1998).</li>
<li>Losonczy, A., Makara, J. K., Magee, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Compartmentalized+dendritic+plasticity+and+input+feature+storage+in+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Compartmentalized dendritic plasticity and input feature storage in neurons.</a> Nature. 452 (7186), 436-441 (2008).</li>
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<li>Copf, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Importance+of+gene+dosage+in+controlling+dendritic+arbor+formation+during+development%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Importance of gene dosage in controlling dendritic arbor formation during development.</a> Eur J Neurosci. 42 (6), 2234-2249 (2015).</li>
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</ol>

Os autores não têm nada para divulgar.

Dendritos que inervam a epiderme são as regiões de entrada dos neurônios, e suas morfologias determinam como a informação é recebida e processada pelos neurônios individuais. Morfologia do dendrito de desenvolvimento reflete a modulação de gene da organização dendrito. Larval da drosófila neurônio do sistema nervoso periférico é um modelo importante para estudar o desenvolvimento dendrito por causa de: 1) a similaridade funcional com mamíferos11,12; 2) q...

Dendrites, que são as projeções ramificadas de um neurônio, cobrem o campo que engloba do neurônio sensorial e sináptica insumos de outros neurônios1,2. Dendritos são um componente importante da formação de sinapse e desempenham um papel fundamental na integração de entradas synaptic, bem como a propagação do estímulo eletroquímico em um neurônio. Arborização dendrítica (da) é um processo pelo qual os neurônios formam novas árvores dendríticas e galhos para criar novas sinapses. O desenvolvimento e a morfologia da da, tais como a densidade de ramo e padrões de agrupamento, resultam de processos biológicos de várias etapas e estão altamente correlacionados com a função neuronal. O objetivo do presente protocolo é fornecer um método de análise quantitativa de complexidade de arborização dendritric neuronal em drosófila.
A complexidade dos dendritos determina os tipos sinápticos, conectividade e entradas de neurônios do parceiro. Padrões de ramificação e a densidade dos dendritos estão envolvidos no processamento dos sinais que convergem para o campo dendríticas3,4. Dendrites têm a flexibilidade para o ajuste no desenvolvimento. Por exemplo, sinalização sináptica tem um efeito sobre a organização do dendrito no neurônio somatossensorial durante a fase de desenvolvimento e no sistema nervoso maduro5. O estabelecimento de conectividade neuronal baseia-se na morfogênese e maturação dos dendritos. Malformação de dendrites está associada com compromisso da função neuronal. Estudos têm mostrado que a anormalidade da morfogênese de neurônio da pode contribuir para as etiologias de várias doenças neurodegenerativas, incluindo a doença de Alzheimer (AD), a doença de Parkinson (PD), a doença de Huntington (HD) e doença de Gehrig / Esclerose lateral amiotrófica (ela)6,7,8. Sinápticas alterações aparecem na fase inicial do AD, em concerto com o declínio e o comprometimento da função de neurônio7,8. No entanto, os detalhes de como patologia dendrito contribui para a patogênese nestas doenças neurodegenerativas continua elusiva.
O desenvolvimento dos dendritos é regulado por genes que codificam uma complexa rede de reguladores, como a família de Wnt de proteínas9,10, fatores de transcrição e ligantes de receptores de superfície de célula11,12 . Neurônios da drosófila consistem em quatro classes (classe I, II, III, IV), de qual classe IV da neurônios têm os padrões mais complexos de ramificação e têm sido empregados como um poderoso sistema experimental para melhor compreensão morfogênese13, 14. Durante a morfogênese cedo, superexpressão e/ou RNAi silenciamento de genes nos neurônios da classe IV resulta em alterações nos padrões de ramificação e dendrito poda13. É importante desenvolver um método prático de análise quantitativa da arborização dendrítica neuronal.
Anteriormente mostramos que silenciar da Drosophila ortholog de SOX5, Sox102F, levou a menores dendritos de neurônios da e complexidade reduzida em classe IV de neurônios da15. Aqui, apresentamos o procedimento de análise quantitativa para a complexidade de arborização dendrítica neuronal (NDAC) em Drosophila. Este protocolo, adaptado a partir da metodologia descrita anterior, fornece um método breve para ensaiar o desenvolvimento de neurônios sensoriais da. Ele ilustra a imagem robusta a rotulagem e o neurônio no terceiro ínstar larval parede corporal16,17,18,19. É um protocolo valioso para pesquisadores que desejam investigar o NDAC as diferenças no desenvolvimento e na vivo.

<table><tbody><tr><td>Solução salina tamponada com fosfato(PBS)</td><td>Gibco Life Sciences</td><td>10010-023</td><td></td></tr><tr><td>TritonX-100</td><td>Fisher Scientific</td><td>9002-93-1</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldeído(PFA)</td><td>Microscopia Eletrônica Sciences</td><td>15714-S</td><td></td></tr><tr><td>Sylgard 184 base de elastômero de silicone e agente de cura</td><td>Dow Corning Corportation</td><td>3097366-0516; 3097358-1004</td><td></td></tr><tr><td>ProLong Gold Antifade Mountant</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>P36931</td><td></td></tr><tr><td>Esmalte para unhas&nbsp;</td><td>CVS</td><td>72180</td><td></td></tr><tr><td>Microscópio estéreo</td><td>Nikon</td><td>SMZ800</td><td></td></tr><tr><td>Microscópio confocal</td><td>Nikon</td><td>Eclipse Ti-E</td><td></td></tr><tr><td>Placa de Petri</td><td>Fórceps</td><td>Falcon 353001</td><td></td></tr><tr><td>Dumont</td><td></td><td>11255-20</td><td></td></tr><tr><td>Tesoura&nbsp;</td><td>Roboz Surgical Instrument Co</td><td>RS-5611</td><td></td></tr><tr><td>Alfinetes de Insetos&nbsp;</td><td>Roboz Surgical Instrument Co</td><td>RS-6082-25</td><td></td></tr><tr><td>Lâminas de microscópio e lamínulas</td><td>Fisher Scientific</td><td>15-188-52</td><td></td></tr></tbody></table>

análise quantitativa da arborização dendrítica neuronal complexidade em drosophila

Quantitative Analysis of Neuronal Dendritic Arborization Complexity in Drosophila

Dentritos são as projeções ramificadas de um neurônio, e morfologia dendrítica reflete organização sináptica durante o desenvolvimento do sistema nervoso. Drosófila larval neuronal dendrítica arborização (da) é um modelo ideal para o estudo de morfogênese de dendrites neurais e função dos genes no desenvolvimento do sistema nervoso. Existem quatro classes de neurônios da. Classe IV é a mais complexa, com um padrão de ramificação que cobre quase toda a área da parede do corpo larval. Nós anteriormente têm caracterizado o efeito de silenciamento da Drosophila ortholog de SOX5 na classe de complexidade de arborização dendrítica neuronal de IV (NDAC) usando quatro parâmetros: o comprimento de dendrites, a área de superfície de cobertura dendrito, o número total de galhos e a estrutura de ramificação. Este protocolo apresenta o fluxo de trabalho de análise quantitativa NDAC, consistindo de dissecação larval, microscopia confocal e procedimentos de análise de imagem usando o software ImageJ. Mais introspecção da desenvolvimento neuronal e seus mecanismos subjacentes irá melhorar a compreensão da função neuronal e fornecem pistas sobre as causas fundamentais da neurológicas e transtornos do desenvolvimento neurológico.

Os dendritos dos neurônios da foram rotulados por co-superexpressão GFP (UAS-GFP; ppk-GAL4) no da soma neural e dendríticas mandris para fluorescência de GFP, análise de imagem. A morfologia dos dendritos do neurônio da foi fotografada por um microscópio confocal invertido (Figura 2).
Os dendritos dos neurônios da foram rastreados usando software ImageJ Fiji. O arquivo foi usado para estimar o compr...

Este protocolo centra-se na análise quantitativa de complexidade arborização dendrítica neuronal (NDAC) em Drosophila, que pode ser usado para estudos da morfogênese dendrítica.

Análise quantitativa da arborização dendrítica Neuronal complexidade em Drosophila

Dendrites are the branched projections of a neuron, and dendritic morphology reflects synaptic organization during the development of the nervous system. ...

O objetivo geral deste procedimento é observar o impacto do gene SOX5 na complexidade dos neurônios de arborização dendrítica durante o desenvolvimento neuronal em Drosophila. Este método pode ajudar a estudar a morfogênese de neurodndritos, e a função genética no desenvolvimento do sistema nervoso, para entender melhor os genes da doença neurodegenerativa. Em última análise, esta técnica fornece uma análise quantitativa da complexidade dos dendritos, que pode ser usada em muitos tipos diferentes de neurodíritos.As implicações dessa técnica se estendem para o mecanismo genético da doença neurodegenerativa, pois a mutação é a chave para entender a função genética. Cruzes de configuração de UAS-GFP;ppk-GAL4 com a cepa UAS-Sox102F-RNAi voa ou controles W118. Cultura as moscas sob condições padrão a 25 graus Celsius.Em cerca de cinco a seis dias, use fórceps para coletar cuidadosamente a terceira larva instar para dissecção. Coloque uma larva em uma placa de dissecção feita de base de elastômero de silício, e uma placa de Petri de cultura tecidual. Em seguida, coloque o prato sob o microscópio de dissecção.Agora fixe a cauda da larva para expor a linha média. Em seguida, fixar os ganchos da boca larva para que o lado dorsal da larva esteja para cima. Agora adicione 200 microliters de PBS ao prato para imergir a larva na solução.Em seguida, corte a cauda e a boca da larva com pequenas incisões. Em seguida, corte a larva aberta ao longo da linha dorsal e entre as duas traqueias, indo de caudal para rostral. Em seguida, coloque um alfinete em cada um dos quatro cantos do corpo para que o corpo fique plano.Agora conserte a parede do corpo da larva em 4% de PFA por 25 minutos em temperatura ambiente. Em seguida, lave a larva com PBS três vezes por cinco minutos por lavagem. Após as lavagens, remova os pinos e transfira o tecido para uma lâmina de vidro.Em seguida, mergulhe o tecido em meio de montagem antifado e monte-o com um deslizamento de tampa. Deixe o tecido montado secar por uma hora antes de selar o deslizamento da tampa com polimento das unhas. Armazene esses slides no escuro a quatro graus Celsius.Capture imagens da série Z com um microscópio confocal usando um objetivo de 20X. Primeiro, defina o alcance dos passos z para incluir todos os neurônios da DA na parede do corpo da larva, e defina o tamanho do passo para meio micrômetro. Em seguida, armazene as imagens como arquivos TIF ou ND2 para processamento.Em seguida, avalie o número e a morfologia dos dendritos nos neurônios da promotoria. Comece avaliando seus comprimentos. Primeiro, em Fiji ImageJ, divida as imagens em canais separados, se necessário.Apenas o canal GFP precisa ser avaliado. Em seguida, faça uma projeção z. Na nova janela, selecione a intensidade máxima para o tipo de projeção e escolha as fatias de partida e parada.Em seguida, clique em OK para produzir uma imagem de projeção z com projeções claras de dendrite. Agora rastreie os neurites usando a ferramenta plug-in. Primeiro, vá para a soma do neurônio de interesse e clique onde um dendrite emerge do corpo celular.Em seguida, clique na ponta deste dendrite. Se a linha azul que liga os dois pontos correr o comprimento do neurite, pressione Y para sim. Em seguida, se esta linha se encaixa no caminho completo do neurite, clique em caminho completo.Se a linha não se encaixar no caminho, clique em pontos mais ao longo deste neurite para dobrar o caminho em vários segmentos de linha que se encaixarão no comprimento do neurite. Em seguida, clique em caminho completo e proceda com a marcação do caminho para o próximo neurite. Depois de completar todos os caminhos de rastreamento, selecione a opção Analisar caminhos, medir caminhos para exportar os caminhos para um arquivo CSV.Use esses dados para calcular e o valor médio dos comprimentos do caminho para análise. Em seguida, calcule a área da superfície do neurônio. Primeiro, selecione a ferramenta de desenho manual livre na janela Fiji ImageJ.Em seguida, conecte os pontos finais do neurônio de interesse. Em seguida, selecione a opção Medir na janela Analisar. O resultado aparece em uma nova caixa com o valor para a área selecionada.Copie esse valor para o software de análise de dados. Finalmente, calcule o número total de ramos usando o plugin Analyze Skeletonized Paths. Os dendritos dos neurônios da DA foram rotulados por co-superexpressão GFP em suas arbors soma e dendrito para análise de imagens de floresnce GFP.A morfologia dos dendritos foi imagem usando um microscópio confocal invertido. Os dendritos dos neurônios da promotoria foram rastreados como descrito. O arquivo foi usado para estimar o comprimento do dendrite.O silenciamento de Sox102F em neurônios da na terceira larva instar levou a uma redução significativa no número total de dendritos com cerca de metade do comprimento do ramo e com uma estrutura mais simples, mostrando apenas metade do número de ramos. Logicamente, isso levou à redução da área da superfície da árvore. Este protocolo fornece um método rápido para avaliar o desenvolvimento de neurônios sensoriais da DA.Ao tentar este procedimento, certifique-se de tirar um grande número de imagens de cada grupo de neurônios da promotoria para obter uma boa cobertura. Após este procedimento, outros métodos como a análise de dendrite podem ser realizados a fim de responder a perguntas adicionais sobre o desenvolvimento dendrite. Desde o seu desenvolvimento, essa técnica tem ajudado pesquisadores do campo das neurociências a fazer inferências em doenças neurodegenerativas, como o Alzheimer usando sistemas modelo.

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Research

JoVE Journal

Neuroscience

Neurociência

Numerosos estudos recentes identificaram mutações em proteínas sinápticas associada a patologias cerebrais. Primários cultivados neurônios corticais oferecem grande flexibilidade para examinar os efeitos destas proteínas doenças associadas na morfologia e motilidade espinha dendrítica.

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A arborização dendrítica de neurônios sensoriais...

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Analisando a morfologia dendrítica em camadas e colunas de medula de Drosophila

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Análise quantitativa da arborização dendrítica Neuronal complexidade em Drosophila

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