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DOI: 10.3791/57812-v
Masaki Shintani1,2,3, Moriya Ohkuma3, Kazuhide Kimbara1
1Applied Chemistry and Biochemical Engineering Course, Department of Engineering, Graduate School of Integrated Science and Technology,Shizuoka University, 2Department of Bioscience, Graduated School of Science and Technology,Shizuoka University, 3Japan Collection of Microorganisms,RIKEN BioResource Research Center
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Com o objetivo de entender os comportamentos dos vários elementos de conjugativo bacterianos DNA sob diferentes condições, descrevemos um protocolo para a detecção de diferenças na frequência de conjugação, com alta resolução, para estimar quanto à eficácia da bactéria doadora inicia a conjugação.
Este método pode ajudar a responder perguntas-chave no campo da microbiologia sobre a frequência com que o DNA plasmídeo pode ser espalhado entre diferentes bactérias. A principal vantagem dessa técnica é que, reduzindo o fundo, podemos detectar pequenas diferenças na frequência de conjugação com alta resolução. Demonstrando o procedimento será Kosuke Yanagiya, um estudante de pós-graduação do meu laboratório.
Para calcular a frequência de conjugação pelo número mais provável, filtrar um mililitro de uma cultura de doadores durante a noite com um mililitro de uma cultura receptora durante a noite por 45 minutos a 30 graus Celsius, como apenas demonstrado. Enquanto a co-cultura está incubando, dilui seriamente as culturas originais de doadores e receptores para chapeamento em triplicado no caldo de Luria doador, ou LB, mais kanamycin, ou lb receptor mais placas de gentamicina para uma cultura de dois dias a 30 graus Celsius. No final da incubação, resuspenque a cultura no filtro em LB estéril contendo kanamycina e gentamicina para diluição serial em uma placa de cultura celular de 96 poços em quadruplicato.
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