Amplification of Near Full-length HIV-1 Proviruses for Next-Generation Sequencing

Bonnie Hiener; John-Sebastian Eden; Bethany A. Horsburgh; Sarah Palmer

doi:10.3791/58016

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Genética

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Amplificação de perto completos provírus HIV-1 para a próxima geração de sequenciamento

Amplification of Near Full-length HIV-1 Proviruses for Next-Generation Sequencing

JoVE Journal
Genética

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Amplification of Near Full-length HIV-1 Proviruses for Next-Generation Sequencing

Amplificação de perto completos provírus HIV-1 para a próxima geração de sequenciamento

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October 16, 2018

DOI:

10.3791/58016-v

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10.3791/58016-v

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October 16, 2018

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Bonnie Hiener¹, John-Sebastian Eden¹, Bethany A. Horsburgh¹, Sarah Palmer¹

¹Centre for Virus Research, The Westmead Institute for Medical Research,University of Sydney

Summary

Sequenciamento proviral individual completo (aletas) fornece um método eficiente e de alta produtividade para a amplificação e sequenciamento de single, perto de provírus completos de HIV-1 (intactos e com defeito) e permite a determinação do seu potencial replicação-competência. FLIPS supera as limitações dos ensaios anteriores projetados para sequenciar o reservatório latente do HIV-1.