Baseados em CRISPR-Cas9 genoma engenharia para gerar modelos Jurkat repórter para a infecção de HIV-1 com Sites selecionados Proviral integração

Este método pode ajudar a responder à questão de como a integração do provírus do HIV influencia a expressão genética andrógina, e por que certos locais de integração genômica estão sendo selecionados em células ultimamente infectadas pelo HIV. A principal vantagem dessa técnica é que podem ser produzidos modelos in vitro para infecção pelo HIV, que carregam repórteres pró-virais direcionados aos locais de integração escolhidos usando a engenharia de genoma baseada em CRISPR/Cas9. Demonstrando o procedimento estarão Thomas Walther, um estudante de doutorado, e Julia Bialek, uma pós-doutora do meu laboratório.

Comece usando o Navegador de Genoma UCSC para extrair in-silico-extraindo a sequência genômica do lócus genômico desejado para ser alvo. Para escolher o guia RNAs de 20 nucleotídeos para direcionamento do lócus genômico escolhido, use a ferramenta web E-CRISP. Em seguida, selecione, Homo Sapiens Genoma Humano do Consórcio de Referência do Genoma:Construa 38.