Índice competitivo baseado em PCR digital para análise de alta produtividade de aptidão em Salmonella

Esta técnica permite quantificação precisa e precisa de microrganismos de uma população mista de cepas altamente semelhantes usando técnicas de base molecular rápida e de alto rendimento. Em última análise, ao permitir comparações de aptidão a ser feitas entre as cepas. A capacidade de avaliar simultaneamente muitas cepas em uma única piscina reduz substancialmente a variabilidade bem-para-bem ou organismo-organismo-organismo porque todas as cepas estão expostas precisamente às mesmas condições.

A adaptabilidade desta técnica permite que ela seja usada para quase qualquer organismo geneticamente maleável e quase qualquer design experimental que exija quantificação precisa de micróbios. Inicie este procedimento com a engenharia de marcadores genéticos em cromossomos bacterianos, conforme descrito no protocolo de texto. Crie um pool de DNA genômico que contenha todos os códigos de barras, exceto um.