Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Karel &#352;imek; Dagmara Sirova

doi:10.3791/59903

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Bactérias rotuladas fluorescently como um Tracer para revelar novas vias de fluxo de carbono orgânico em ecossistemas aquáticos

Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

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Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Bactérias rotuladas fluorescently como um Tracer para revelar novas vias de fluxo de carbono orgânico em ecossistemas aquáticos

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09:35 min

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September 13, 2019

DOI:

10.3791/59903-v

DOI:

10.3791/59903-v

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09:35 min

September 13, 2019

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Karel Šimek¹, Dagmara Sirova¹

¹Department of Aquatic Microbial Ecology, Institute of Hydrobiology,Biology Centre CAS

Transcrição

Essa abordagem é significativa porque nos permite visualizar e estimar fluxos de carbono e energia de procariotes a níveis tróficos mais altos em teias de alimentos microbianos em uma resolução muito alta. Esta é a única técnica disponível atualmente para determinar quais espécies protistas consomem bactérias in situ e, ao mesmo tempo, quantificar a taxa desse processo em um nível unicelular. Uma vez que as bactérias são os únicos micróbios significativos que mudam o carbono orgânico dissolvido para partículas de carbono orgânico, o conhecimento dos atores envolvidos e as taxas em que isso acontece forma a base para a compreensão dos ecossistemas aquáticos em geral. Recomendamos que os pesquisadores se familiarizem com seu sistema de estudo antes de realizarem quaisquer experimentos de pastagem. Isso envolve a luz e a epifluorescência da inspeção de microscopia das amostras, e o conhecimento do principal imposto presente e sua dinâmica sazonal. Demonstrando o procedimento será Jitka Jezberov

Summary

Aqui apresentamos um protocolo para uma única célula, técnica baseada em microscopia de epifluorescência para quantificar as taxas de pastejo em eucariontes predatórios aquáticos com alta precisão e resolução taxonômica.