Segmentação e Medição Linear para Análise de Composição Corporal usando Slice-O-Matic e Horos

A degeneração muscular da fita em uma sarcopenia tem se mostrado um fator prognóstico para a sobrevivência do câncer e o sucesso do tratamento. A análise de composição da terceira região lombar é de interesse, pois fornece caracterização quantitativa do músculo esquelético e dentro das tomografias fornece informações qualitativas do tecido adiposo. Os seguintes procedimentos fornecem protocolo e vertical segmentado no software sliceOmatic, bem como seus protocolos de medição para análise de composição em imagens de TOMOGRAFIA e Ressonância Magnética.

A seleção do protocolo de vértebras L3 é concluída dentro da centricidade GE. Esteja ciente de que se usar um software diferente, as ferramentas podem variar. Abra as imagens de tomografia ou ressonância magnética do paciente feitas dentro do prazo de interesse.

Selecione regiões do monitor, exibição de janela 2V. Selecione a visão coronal ou sagital na tela esquerda navegando para séries e, em seguida, selecionando as imagens coronais ou sagiais. Selecione a exibição axial na tela direita navegando para séries e, em seguida, selecione as imagens axiais.

Clique em conn, cruze referência para vincular as duas imagens e, em seguida, role as imagens na visão coronal ou sagital para garantir que as vértebras da coluna vertebral sejam facilmente visíveis. Em seguida, role através das imagens de exibição axial para encontrar as vértebras L1. O L1 é a primeira vértebra a não ter um acessório de costela.

Conte do L1 até as vértebras L3. Certifique-se de usar a visão sagital ou coronal para referência para localizar o centro das vértebras L3. Exporte a imagem L3 navegando para o menu do exame, selecione imagens de exportação, imagens selecionadas.

Certifique-se de que o formato é DICOM. Em seguida, selecione o local para o que a imagem deve ser salva. Clique duas vezes no arquivo DICOM para abrir sliceOmatic.

Uma vez que o programa tenha carregado, arraste a imagem DICOM para qualquer lugar na tela sliceOmatic. Vá para os modos, região crescendo para iniciar a segmentação. Selecione ferramentas, bloqueio de etiquetas.

Este recurso será usado em etapas subsequentes. Clique no vermelho sob a região crescendo para definir os limites de H.U.para músculos. Em seguida, clique no botão desligado ao lado do limite inferior.

Isso vai colocá-lo em diante. Ajuste o limite com o controle deslizante para estar o mais próximo possível de 29 negativos. Em seguida, use a roda do mouse para configurá-la exatamente para 29 negativos.

Em seguida, clique no botão desligado ao lado do limite superior para configurá-lo. Use o controle deslizante e a roda do mouse para definir o limite H.U.para positivo 150 Em seguida, clique no verde dois para definir os limites H.U.para I.M.A.T.e definir os limites inferiores e superiores da mesma forma, mas definindo o limite inferior para 190 negativo e o limite superior para 30 negativos. Clique no amarelo cinco para definir os limites para V.A.T., desta vez definido no limite inferior para 150 negativos e o limite superior para 50 negativos.

Finalmente, clique no ciano sete para definir os limites de H.U.para S.A.T.definindo o limite inferior para 190 negativo e o limite superior para 30 negativos. Pressione as teclas mais e menos no teclado para ampliar a imagem conforme necessário. Ajuste o zoom conforme necessário durante todo o processo de segmentação.

Selecione o vermelho e certifique-se de que a opção de pincel está definida para pintar. Use o tamanho da escova que é mais eficiente para a imagem e comece a pintar clicando no tecido muscular. Pinte sobre as psoas, grupos musculares paraspinais e grupos musculares oblíquos.

Tome cuidado nas bordas dos músculos que estão próximos da coluna vertebral, órgãos internos ou fluidos, para ter certeza de que estes não estão marcados como músculo. Se alguma coisa estiver marcada falsamente, selecione nenhuma e apaguei o erro. Uma vez que todos os músculos foram marcados, selecione um no menu de bloqueio de tag.

Isso garantirá que nenhum músculo seja acidentalmente apagado ou remarcado à medida que a segmentação prossegue. Selecione os dois verdes e pinte sobre o tecido I.M.A.T.dentro da fáscia muscular. Note, a maioria das lacunas dentro do músculo em si será I.M.A.T.Note que as bordas da fáscia muscular são muitas vezes mais leves na aparência do que o tecido circundante.

Este pode ser um guia útil, particularmente nas regiões onde os grupos musculares oblíquos encontram os grupos musculares paraspinais e na região abaixo do spinae eretor, mas acima da linha fascial. Uma vez que tudo o que eu .M.A.T. tenha sido marcado, selecione os dois sob o menu de bloqueio de tag. Em seguida, selecione os cinco amarelos do menu de crescimento da região para começar a segmentar V.A.T.One ainda pode usar a opção de escova, mas para muitas imagens, pode ser mais fácil e rápido usar a opção crescer para D em vez disso.

Se usar crescer até D, certifique-se de selecionar o menor tamanho da escova, em seguida, clique no tecido V.A.T.dentro da imagem para marcá-lo. Certifique-se de que os tecidos ou gorduras dentro do limite de intestinos ou outros órgãos não estejam marcados como V.A.T.Uma vez que todos os V.A.T.is marcados, selecione cinco do menu de bloqueio de etiquetas. Finalmente, selecione o ciano sete do menu de cultivo da região para marcar tecido S.A.T..

Novamente, dependendo da imagem, o tecido S.A.T.é muitas vezes mais fácil de marcar com a opção crescer para D. Uma vez que o tecido S.A.T.é marcado, verifique sobre as bordas, particularmente ao redor da pele, para ter certeza de que apenas a gordura subcutânea é marcada como S.A.T.Uma vez que todos os tecidos tenham sido marcados, olhe sobre a imagem para ter certeza de que não há erros ou tecido mal marcado. Quando completa, ferramentas go-to, tag surface volume.

Clique no botão de valores da janela e regise a área de superfície de cada tecido e os valores médios do H.U.. Finalmente, vá para o arquivo, salve arquivos de tag. Isso salvará um arquivo de tag onde a imagem DICOM está localizada.

Para iniciar a segmentação da ressonância magnética, vá para os modos, a região crescendo. Olhando na janela de visualização, podemos ver um histograma de valores de H.U., onde o primeiro pico é o ar, o próximo é o músculo esquelético, e se os seguintes picos forem perceptíveis, eles serão ossos seguidos por tecido adiposo. Note-se, ao usar imagens de ressonância magnética, geralmente apenas músculo esquelético pode ser segmento com confiança devido à má discriminação tecidual.

Selecione o vermelho e gire o limite inferior ao deixá-lo definido como zero. Em seguida, ligue o limite superior e mude a opção da roda do mouse para o limite superior. Em seguida, selecione a tinta e uma grande opção de escova, em seguida, mova o cursor sobre o músculo psoas para que a região do cursor inclua tanto músculo quanto osso.

Para ter certeza de que o osso não é marcado como músculo, defina o limite superior conservadoramente movendo a roda do mouse até que o limite superior não inclua nenhum dos tecidos ósseos externos. Em seguida, segmente o tecido muscular imediatamente adjacente à coluna vertebral. Em seguida, mova o cursor para a linha alba ou em qualquer outro lugar no scan onde tecido adiposo e músculo são fáceis de diferenciar.

Aumente o limite superior o mais alto possível sem incluir qualquer tecido adiposo. A partir daqui, pode-se proceder segmentando todos os músculos esqueléticos restantes. Note que, para algumas imagens, o limite superior pode precisar ser continuamente ajustado.

Note que, embora a definição do limite superior com este procedimento de duas etapas seja conservadora, ele otimizará a quantidade de músculo esquelético a ser marcado sem ter que se preocupar com uma marcação errônea significativa do tecido ósseo ou adiposo. Quando completa, ferramentas de go-to, marcam volume de superfície e selecionam valores de janela para registrar a área da superfície e os valores médios de H.U.do músculo esquelético. A medição linear da região das vértebras L3 mostrou-se intimamente correlaciona-se com a massa muscular total.

A vantagem da medição linear é sua facilidade e velocidade, bem como o fato de que pode ser feito em qualquer software com uma ferramenta de régua ou ferramenta de caixa. Este protocolo é demonstrado usando o aplicativo Horace Medical Imaging. Se estiver usando um software diferente, esteja ciente de que as ferramentas específicas podem muito.

Importe a imagem para o visualizador clicando em importação e navegando até o local da imagem e selecionando aberto. Uma vez importado, clique na imagem ou nome do paciente para exibir a imagem na parte inferior. Clique duas vezes na imagem para maximizá-la, o que também abrirá as opções da ferramenta.

Identifique os psoas e os grupos musculares paraspinais. Note que o quadratus lumborum não deve ser considerado ao determinar as bordas dos grupos musculares paraspinais. Selecione a ferramenta régua.

Desenhe uma linha vertical dos pontos mais altos do grupo muscular até a parte inferior do grupo muscular. Em seguida, desenhe uma linha horizontal da borda mais larga do grupo muscular para a outra borda mais larga do grupo muscular. Repita este processo tanto para os psoas direito quanto para a esquerda e paraspinal direita e esquerda.

Note que as linhas desenhadas devem se cruzar a 90 graus. Note que, se as bordas das linhas desenhadas fossem conectadas, essa conexão deve criar uma caixa que abrange a totalidade do grupo muscular. No Horace Medical Viewer, é difícil usar a ferramenta régua para garantir que as linhas se cruzem a 90 graus.

Por essa razão, a ferramenta de desenho da caixa deve ser usada em vez disso. Selecione a ferramenta retângulo. Desenhe uma caixa em torno de cada grupo muscular, agora tomando nota que as bordas da caixa tocam as partes mais altas e mais baixas do músculo, bem como as partes mais largas do músculo.

Desde que a ferramenta da caixa exiba suas dimensões verticais e horizontais, ela pode ser preferível sobre a ferramenta régua, uma vez que permite uma visualização fácil dos limites musculares. Uma imagem de tomografia ou ressonância magnética devidamente segmentada não deve ter marcação muscular além das linhas fasciais, e para imagens de tomografia computadorizada, não deve haver marcação adiposa dentro da fáscia muscular ou na pele. Regissocular a área da superfície muscular ao lado da altura do paciente para calcular o índice muscular esquelético.

Para tomografias, as áreas da superfície do tecido adiposo podem ser registradas com base em pesquisas específicas ou questões clínicas de interesse. Além disso, os valores médios de H.U.podem ser registrados para o controle de qualidade L3 medição linear deve ter as medidas da régua ou caixa abrangendo todo o músculo. Regissos horizontais e as alturas verticais de cada músculo, bem como a altura do paciente.

Multiplique as larguras e alturas para cada músculo, do que somar essas áreas para obter a área muscular total. Calcule o índice de medida linear dividindo a área total pela altura do paciente ao quadrado. O protocolo demonstrado permite que médicos e pesquisadores utilizem tomografias L3 ou ressonância magnética para obter informações quantitativas rápidas e confiáveis para a avaliação da sarcopenia.