Name: Abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-08-17T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 21 s
Description: Aprenda abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar usando técnicas de escavação e imagem digitalizada. Este método auxilia pesquisadores a compreender características de raízes para melhoramento genético.

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1. Escavação de campo por amostragem de valas
<ol>
	<li>Cultivar híbridos comerciais de cana-de-açúcar (doravante denominados "variedades") no campo a partir de pegamentos de duas gemas plantados em espaçamento de 120 cm, com 90 cm dentro das linhas, seguindo o pacote de práticas (POP) recomendado para garantir o bom estabelecimento e crescimento da cultura.</li>
	<li>No final da fase de maturação da cultura, contrate uma escavadeira para cavar uma trincheira (1,5 m de profundidade e 1,0 m de largura) no campo. Por meio de jato de água contínuo, certifique-se de que os solos das zonas radiculares sejam limpos sem danificar as raízes (Figura 1).</li>
	<li>Quando o solo aderente se soltar, arranque a cana junto com o sistema radicular e leve-a ao laboratório para medição manual do número de raízes, comprimento, volume e peso da raiz.</li>
</ol>
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig01.jpg"> 
Figura 1: Método de amostragem de trincheira para a escavação de raízes em campo. (A) Vala lateral cavada ao longo do campo, (B) jato de água e (C) vista interna mostrando a profundidade da trincheira. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig01large.jpg" target="_blank">Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a>
2. Amostrador de núcleo raiz para reduzir erros de amostragem
<ol>
	<li>Utilizar um amostrador de núcleo de raiz cilíndrica de 61 cm de altura e 16 cm de diâmetro pesando 8 kg, fabricado com material de aço macio (MS) para amostragem de raízes de cana-de-açúcar no campo. Forneça uma borda afiada na borda inferior do amostrador para facilitar a penetração ao inseri-lo no solo. Fornecer colares de 3 cm de diâmetro para levantar o amostrador (figura 2).</li>
	<li>Cultivar variedades de cana-de-açúcar no campo a partir de pegamentos de duas gemas plantados em espaçamento de 120 cm, com 90 cm dentro das linhas, seguindo o POP recomendado para garantir o bom estabelecimento e crescimento da cultura.</li>
	<li>Na fase de maturação da cultura, fixe a borda superior do amostrador ao broto primário / cana e martele continuamente para atingir a profundidade de solo desejada (45 cm). Levante toda a massa de solo para o amostrador e lave cuidadosamente em água corrente para separar as raízes aderentes.</li>
	<li>Após a lavagem completa das raízes, registre o volume, a área de superfície, o comprimento e o peso por medição manual, bem como espalhando as raízes em bandejas transparentes para digitalizar e analisar as imagens digitalizadas correspondentes usando o software referenciado (consulte a Tabela de Materiais).</li>
</ol>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig02.jpg"> 
Figura 2: Amostrador de núcleo raiz. (A) Dimensões, (B) vista superior e (C) local de amostragem. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig02large.jpg" target="_blank">Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a>
3. Estrutura de fenotipagem radicular para facilitar a amostragem em diferentes fenofases
<ol>
	<li>Construa uma estrutura de fenotipagem radicular composta por três compartimentos adjacentes de dimensões 4,5 m x 10,1 m para amostragem das raízes da cana-de-açúcar, com provisões para desmontar manualmente as paredes laterais para revelar o sistema radicular subterrâneo (até uma profundidade de 80-100 cm) (Figura 3). Construa as paredes laterais com lajes pré-moldadas de dimensões de 1,8 m de comprimento, 30 cm de largura e 4 cm de espessura.</li>
	<li>Preencher e compactar a estrutura com solo de campo, deixando um espaço livre de ~20 cm, com orifícios de drenagem adequados para facilitar a aeração do solo.</li>
	<li>Semear as lascas de gemas de clones de germoplasma compreendendo Saccharum officinarum L., Saccharum spontaneum L., Saccharum barberi Jesw., Saccharum sinense Roxb. e Saccharum robustum Brandes e Jeswiet ex Grassl. (a seguir denominados "clones de Saccharum spp.") e deixá-los germinar durante 30 dias em bandejas compostas por suportes de enraizamento (solo vermelho: esterco de quintal: areia = 2:2:1). Transplante assentamentos uniformes e saudáveis para a estrutura em um espaçamento entre linhas de 90 cm, com 60 cm dentro das linhas, seguindo o POP recomendado para garantir um bom estabelecimento e crescimento da cultura.</li>
	<li>Durante as fases formativa (60-120 dias após o plantio [DAP]) e de grande crescimento (120-150 DAP), remova manualmente as paredes laterais feitas das placas pré-moldadas, seguidas de pulverização contínua do jato de água para expor as raízes.</li>
	<li>Arranque todo o sistema radicular e leve-o ao laboratório para medição manual do comprimento, volume e peso, e espalhe as raízes em bandejas transparentes para escanear e analisar as imagens digitalizadas correspondentes no software referenciado (consulte a Tabela de Materiais).</li>
	<li>Imponha o estresse hídrico retendo a irrigação em um dos compartimentos e tampe os orifícios de drenagem no segundo compartimento para manter a saturação do solo e simular o estresse de alagamento. Irrigar o terceiro compartimento de acordo com o POP recomendado para manter a capacidade de campo e servir de controle.</li>
</ol>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig03.jpg"> 
Figura 3: Estrutura de fenotipagem da raiz. (A) Dimensões, (B) visão geral dos três compartimentos e (C) vista de um compartimento. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig03large.jpg" target="_blank">Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a>
4. Cultivo hidropônico de plantas para estudar a biologia da rizosfera
<ol>
	<li>Fabricar um sistema hidropônico interno em uma estufa com controle de ambiente, propícia ao cultivo de cana-de-açúcar para estudar os detalhes mais sutis da biologia das raízes. Adicione ~ 15 L de solução nutritiva de Hoagland modificada (Tabela 1) a tanques de vidro de dimensões 20 cm x 20 cm x 50 cm, com aeração fornecida por bombas de aquário (Figura 4).</li>
	<li>Semear os brotos de variedades de cana-de-açúcar e clones de Saccharum spp. e deixá-los germinar por 30 dias em protrays compreendendo medula de coco compostada. Transplante decantações uniformes e saudáveis para tanques hidropônicos na frequência de três decantações por tanque, tendo o cuidado de colocar toda a raiz na solução nutritiva. Cubra os tanques com um pano preto para garantir que as raízes não sejam expostas à luz. Use uma malha de plástico (20 cm x 20 cm) na borda dos tanques de vidro para apoiar as plantas na posição vertical.</li>
	<li>No final da fase de germinação (60 dias), colete os exsudatos radiculares imergindo as raízes das plantas intactas em 50 mL de solução armadilha (água bidestilada estéril) por 4 h (0800 h a 1200 h) durante o período de pico de atividade fotossintética. Filtrar a solução recolhida através de papel de filtro Whatman e, em seguida, passá-la através de colunas de vidro cheias de permuta aniónica seguida de resinas permutadoras catiónicas12. Evaporar as fracções eluídas até à secura e conservar a -20 °C até ao processamento posterior.</li>
	<li>Analisar as amostras de exsudato radicular processadas por HPLC para a determinação de ácidos orgânicos12 e por espectrofotometria para a estimativa de fenólicos totais13, proteínas14, açúcares15 e aminoácidos16 de acordo com o protocolo padrão.</li>
	<li>Monitore o crescimento da raiz em intervalos semanais para registrar a pigmentação da ponta da raiz e a densidade do cabelo da raiz. Avaliar a atividade das enzimas, peroxidase17 e superóxido dismutase18, e o conteúdo fenólico total19 no 3º mês de acordo com o protocolo padrão.</li>
	<li>Avalie a resposta à lesão radicular infligindo uma fatia longitudinal na raiz primária até a ponta da raiz usando uma lâmina cirúrgica estéril e monitore as alterações periodicamente.</li>
</ol>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Químico</td>
			<td>Concentração final</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nitrato de potássio</td>
			<td>0,608 g· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nitrato de cálcio</td>
			<td>1.415 g· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Di-hidrogenofosfato de potássio</td>
			<td>0.164 gr· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sulfato de magnésio</td>
			<td>0,560 g· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sal monossódico EDTA-férrico</td>
			<td>6,00 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ácido bórico</td>
			<td>1,43 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cloreto de manganês tetra-hidratado</td>
			<td>0,91 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sulfato de zinco</td>
			<td>0,11 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Suphate cúprico</td>
			<td>0,04 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ácido molibdico</td>
			<td>0,01 g250L-1</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
Tabela 1: Composição da solução nutritiva modificada para a cultura hidropônica de cana-de-açúcar.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig04.jpg"> 
Figura 4: Configuração da hidroponia. A configuração (A) personalizada para o cultivo de cana-de-açúcar e (B) safra de 5 meses (pano preto removido apenas para fins fotográficos). Essa figura foi modificada de Hari et al.9. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig04large.jpg" target="_blank">Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a>

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 <a target="_blank" href="http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC">http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC</a> (2019).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studies+of+sugarcane+roots+at+different+stages+of+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Studies of sugarcane roots at different stages of growth.</a> Agricultural Journal of India. 23, 166-176 (1928).</li>
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<li>Sharma, S., Borah, P., Meena, M. K., Bindraban, P., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+genotypic+variation+for+growth+of+rice+seedlings+under+optimized+hydroponics+medium%5BTitle%5D)+AND+%22Indian+Journal+of+Genetics+and+Plant+Breeding%22%5BJournal%5D)">Evaluation of genotypic variation for growth of rice seedlings under optimized hydroponics medium.</a> Indian Journal of Genetics and Plant Breeding. 78 (3), 292-301 (2018).</li>
<li>Soumya, P. R., Singh, D., Sharma, S., Singh, A. M., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+diverse+wheat+%28Triticum+aestivum%29+and+triticale+%28%C3%97+Triticosecale%29+genotypes+for+low+phosphorus+stress+tolerance+in+soil+and+hydroponic+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Soil+Science%22%5BJournal%5D)">Evaluation of diverse wheat (Triticum aestivum) and triticale (× Triticosecale) genotypes for low phosphorus stress tolerance in soil and hydroponic conditions.</a> Journal of Soil Science. 21, 1236-1251 (2021).</li>
<li>Ganie, A. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolite+profiling+and+network+analysis+reveal+coordinated+changes+in+low-N+tolerant+and+low-N+sensitive+maize+genotypes+under+nitrogen+deficiency+and+restoration+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">Metabolite profiling and network analysis reveal coordinated changes in low-N tolerant and low-N sensitive maize genotypes under nitrogen deficiency and restoration conditions.</a> Plants. 9 (11), 1459(2020).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simple+contrivances+for+studying+root+development+in+agricultural+crops%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Simple contrivances for studying root development in agricultural crops.</a> Agricultural Journal of India. 18, 509-514 (1923).</li>
<li>Clark, R. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+two-dimensional+root+system+phenotyping+platform+facilitates+genetic+analysis+of+root+growth+and+development%5BTitle%5D)+AND+%22Plant%2C+Cell+and+Environment%22%5BJournal%5D)">High-throughput two-dimensional root system phenotyping platform facilitates genetic analysis of root growth and development.</a> Plant, Cell and Environment. 36 (2), 454-466 (2013).</li>
<li>Chopart, J. L., Rodrigues, S. R., Azevedo, M. C. B., Medina, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimating+sugarcane+root+length+density+through+root+mapping+and+orientation+modelling%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Estimating sugarcane root length density through root mapping and orientation modelling.</a> Plant and Soil. 313, 101-112 (2008).</li>
<li>Chopart, J. L., Azevedo, M. C. B., Le Mezo, L., Marion, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+relationship+between+sugarcane+root+biomass+and+length+for+cropping+system+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Functional relationship between sugarcane root biomass and length for cropping system applications.</a> Sugar Tech. 12 (3-4), 317-321 (2010).</li>
<li>De Silva, A. L. C., De Costa, W. A. J. M., Bandara, D. M. U. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+of+root+system+and+the+patterns+of+soil+moisture+utilization+in+sugarcane+under+rain-fed+and+irrigated+conditions+in+Sri+Lanka%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Growth of root system and the patterns of soil moisture utilization in sugarcane under rain-fed and irrigated conditions in Sri Lanka.</a> Sugar Tech. 13 (3), 198-205 (2011).</li>
<li>Otto, R., Silva, A. P., Franco, H. C. J., Oliveira, E. C. A., Trivelin, P. C. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+soil+penetration+resistance+reduces+sugarcane+root+system+development%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+and+Tillage+Research%22%5BJournal%5D)">High soil penetration resistance reduces sugarcane root system development.</a> Soil and Tillage Research. 117, 201-210 (2011).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Bomba de aeração com acessórios de tubulação</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Utilizado para cultivo hidropônico de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Ácido bórico</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>80266</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Nitrato de cálcio</td><td>Central Drug House, Índia</td><td>27606</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Medula de coco compostada</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Usado para germinar pegamentos de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Sulfato cúprico</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>38869</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>DEAE-celulose</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>10529</td><td>resina de troca aniônica para processamento de exsudatos radiculares</td></tr><tr><td>Sal monossódico EDTA-férrico</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>59389</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Estrume de quintal</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Usado para germinar pegamentos de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Tanques de vidro</td><td>Fabricado internamente</td><td>NA</td><td>Utilizado para cultivo hidropônico de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>HPLC</td><td>Tecnologias Agilent</td><td>1200 Infinito</td><td>Quantificação de ácidos orgânicos em exsudatos radiculares</td></tr><tr><td>Sulfato de magnésio</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>29117</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Cloreto de manganês</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>75113</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Ácido molibdico</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>49664</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Di-hidrogenofosfato de potássio</td><td>Central Drug House, Índia</td><td>29608</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Nitrato de potássio</td><td>Central Drug House, Índia</td><td>29638</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr><tr><td>Protrays</td><td>Fabricado internamente</td><td>NA</td><td>Usado para germinar pegamentos de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Solo vermelho</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Usado para germinar pegamentos de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Amostrador de núcleo raiz</td><td>Fabricado internamente</td><td>NA</td><td>Usado para amostragem de raiz in situ</td></tr><tr><td>Areia</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Usado para germinar pegamentos de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Seralite-120</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>14891</td><td>resina de troca catiônica para processamento de exsudatos radiculares</td></tr><tr><td>Estrutura de suporte</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Utilizado para cultivo hidropônico de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Bomba de motor de água</td><td>Comprado de fontes locais</td><td>NA</td><td>Utilizado para cultivo hidropônico de cana-de-açúcar</td></tr><tr><td>Papel de filtro Whatman grau 1</td><td>Científico Universal</td><td>1001090</td><td>Processamento de exsudatos de raiz</td></tr><tr><td>WinRhizo PRO (software)</td><td>Regent Instruments Inc., Canadá</td><td>STD4800</td><td>Scanner de raiz bidimensional com software para análise de raízes</td></tr><tr><td>Sulfato de zinco</td><td>Sisco Research Laboratories, Índia</td><td>76455</td><td>Preparação da solução de Hoagland modificada</td></tr></tbody></table>

abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar

Multipronged Phenotyping Approaches to Characterize Sugarcane Root Systems

Variação nas características morfológicas radiculares de variedades de cana-de-açúcar Imagens representativas do sistema radicular em Co 62175, escavadas do campo por amostragem de trincheiras e cultivadas em uma configuração hidropônica, são apresentadas na Figura 5A, B. Raízes longas (~ 100 cm) foram observadas nas variedades Co 62175 e Co 99006, enquanto Co 99006 registrou o maior peso de raiz (127 g · aglomerado − 1). As características rad...

Abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar

Roots are the primary conductors of water and nutrients and play a vital role in sustaining growth and yield under stressful environments. The study of ...

multipronged-phenotyping-approaches-to-characterize-sugarcane-root

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Este protocolo descreve um processo para cobrança rápida de imagens de plântulas de Arabidopsis que respondem a um estímulo gravidade usando scanners de mesa disponíveis comercialmente. O método permite a baixo custo, a captura de grandes volumes de imagens de alta resolução passíveis de algoritmos de análise a jusante.

Usando scanners de mesa para coletar imagens de alta resolução tempo decorrido da Arabidopsis Root gravitrópico Response

Este artigo demonstra como a cultura de plântulas de Arabidopsis thaliana em uma plataforma de dois-camada microfluidic que restringe a raiz principal e cabelos de raiz para um único plano ótico. Esta plataforma pode ser usada para a imagem latente de óptica em tempo real da morfologia da raiz bem bem como quanto à geração de imagens de alta resolução por outros meios.

A raiz do cabelo morfologia de plântulas de Arabidopsis em uma plataforma Microfluidic de duas camadas de imagem

Um protocolo experimental é apresentado para avaliação do solo cultivado sistemas de raiz de planta com RGB e geração de imagens hiperespectrais. Combinação de tempo de imagem RGB série com informações quimiométricas de hiperespectrais verifica otimiza insights sobre a dinâmica de raiz da planta.

RGB e raiz Spectral Imaging para fenotipagem de planta e pesquisa fisiológica: instalação Experimental imagem e protocolos

Um sistema de análise de imagem baseado em software fornece um método alternativo para estudar a morfologia das espécies rizomatosas e stoloniferous. Este protocolo permite a medição do comprimento e diâmetro de raízes adventícias e rizomas e pode ser aplicado para amostras com uma grande quantidade de biomassa e uma grande variedade de espécies.

Medição de raízes adventícias e rizomas de Turfgrasses usando um sistema de análise de imagem Digital

Nós fornecemos um método inovador para melhorar o contraste de absorção de raio-x do milho tecido apropriado para digitalização de tomografia computadorizada de microcomputed comum. Com base em imagens de CT, apresentamos um conjunto de fluxos de trabalho de processamento de imagem para diferentes materiais de milho que efetivamente extrair fenótipos microscópicos de feixes vasculares de milho.

Técnicas de fenotipagem mícron-escala de milho feixes vasculares, com base na tomografia computadorizada de Microcomputed de raio-x

Visualizar e medir raiz crescimento em situ são extremamente desafiador. Apresentamos um método rhizobox personalizável para controlar o desenvolvimento radicular e proliferação ao longo do tempo em resposta ao enriquecimento de nutrientes. Este método é usado para analisar diferenças genotípicas milho na plasticidade da raiz em resposta a uma fonte de nitrogênio orgânico.

Um protocolo otimizado de Rhizobox para visualizar o crescimento da raiz e receptividade aos nutrientes localizadas

Parasponia andersonii é uma árvore tropical de rápido crescimento que pertence à família cannabis (Cannabaceae) e pode formar nódulos radiculares de fixação de nitrogênio em associação com o Rhizobium. Aqui, descrevemos um protocolo detalhado para análises genéticas reversas em P. andersonii com base na transformação estável mediada por Agrobacterium tumefaciense na edição do GENOMA baseado em crispr/Cas9.

Transformação, edição do genoma e fenotipagem do nitrogênio-fixação tropical Cannabaceae Tree Parasponia andersonii

O protocolo aqui descreve os métodos para a avaliação dos padrões de colonização micorrízica arbuscular e a estratégia em raízes para duas espécies: Zea mays e Festuca rubra. O uso do método MycoPatt permite o cálculo de parâmetros, a conversão de estruturas micorrízicas em dados digitais e o mapeamento de sua posição real nas raízes.

Mapas micorrízicos como ferramenta para explorar padrões de colonização e estratégias fúngicas nas raízes de Festuca rubra e zea mays

Usamos ferramentas laboratoriais simples para examinar a arquitetura do sistema radicular (RSA) de Arabidopsis e Medicago. As plântulas são cultivadas hidroponicamente sobre malha e espalhadas usando um pincel de arte para revelar a RSA. As imagens são tiradas usando digitalização ou uma câmera de alta resolução e, em seguida, analisadas com o ImageJ para mapear traços.

Um Protocolo Simples para Mapear as Características da Arquitetura do Sistema Radicular da Planta

Projetamos um protocolo de fenotipagem baseado em imagem para determinar as respostas morfológicas e fisiológicas a tratamentos únicos e combinados de calor, seca e alagamento. Essa abordagem permitiu a identificação de respostas precoces, tardias e de recuperação em todo o nível da planta, particularmente nas partes acima do solo, e destacou a necessidade de usar vários sensores de imagem.

Fenotipagem baseada em imagem de alto rendimento para determinar respostas morfológicas e fisiológicas a estresses únicos e combinados em batata

Aprenda abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar usando técnicas de escavação e imagem digitalizada. Este método auxilia pesquisadores a compreender características de raízes para melhoramento genético.

Abordagens de fenotipagem multifacetada para caracterizar sistemas radiculares de cana-de-açúcar

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