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DOI: 10.3791/63666-v
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
This study presents a technique combining laser capture microdissection with the CEL-Seq2 protocol for generating transcriptomic data from small individual tissue samples. The method facilitates detailed gene expression analysis in C. elegans and can be adapted for non-model species, bypassing the need for species-specific genetic tools.
Um protocolo é descrito que usa microdissecção a laser para isolar tecidos nematoides individuais para sequenciamento de RNA. O protocolo não exige kits de ferramentas genéticas específicos para espécies, permitindo que perfis de expressão genética sejam comparados entre diferentes espécies ao nível de amostras de tecido único.
Combinamos microdisseção de captura a laser com um protocolo de busca de RNA de célula única chamado CEL-Seq2 para gerar conjuntos de dados transcriômicos para pequenas amostras de tecido individual. Esta técnica nos permite estudar a expressão genética em tecidos ou espécies que não podem ser estudadas usando métodos tradicionais de classificação celular. Além disso, fornece mais especificidade do que uma abordagem RNA-seq em massa.
Aqui demonstramos esta técnica para as quatro pontas de cauda celular de C.elegans quarto estágio machos e hermafroditas. Mas a beleza dessa abordagem é que ela pode até ser aplicada a espécies não modelo. Demonstrando o procedimento estarão a Sra. Raya Jallad, doutoranda do meu laboratório e dr. Antonio Herrera, atualmente cientista biomédico líder na escola Baylor em Chattanooga, Tennessee.
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