Name: In situ Isolamento e Cultura de Bactérias Recalcitrantes do Solo usando um Chip de Isolamento (iChip) (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-06T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 7 s
Description: Aprenda o isolamento e cultura in situ de bactérias recalcitrantes do solo usando a tecnologia iChip. Este método permite recuperar microrganismos produtores de antimicrobianos diretamente do ambiente natural para bioprospecção.

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<ol><li>Ekkers, D. M., Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Van Elsas, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+great+screen+anomaly-a+new+frontier+in+product+discovery+through+functional+metagenomics%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">The great screen anomaly-a new frontier in product discovery through functional metagenomics.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 93 (3), 1005-1020 (2012).</li>
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<li>Polrot, A., Kirby, J. R., Olorunniji, F. J., Birkett, J. W., Sharples, G. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((iChip+increases+the+success+of+cultivation+of+TBT-resistant+and+TBT-degrading+bacteria+from+estuarine+sediment%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">iChip increases the success of cultivation of TBT-resistant and TBT-degrading bacteria from estuarine sediment.</a> World J Microbiol Biotechnol. 38 (10), (2022).</li>
<li>Jung, D., Liu, L., He, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+in+situ+cultivation+in+marine+microbial+resource+mining%5BTitle%5D)+AND+%22Mar+Life+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Application of in situ cultivation in marine microbial resource mining.</a> Mar Life Sci Technol. 3 (2), 148-161 (2021).</li>
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<li>Piddock, L. J. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Teixobactin%2C+the+first+of+a+new+class+of+antibiotics+discovered+by+ichip+technology%5BTitle%5D)+AND+%22J+Antimicrob+Chemother%22%5BJournal%5D)">Teixobactin, the first of a new class of antibiotics discovered by ichip technology.</a> J Antimicrob Chemother. 70 (10), 2679-2680 (2015).</li>
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<li>Nkanga, E. J., Hagedorn, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+antibiotic-producing+Streptomyces+inhabiting+forest+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">Detection of antibiotic-producing Streptomyces inhabiting forest soils.</a> Antimicrob Agents Chemother. 14, 51-59 (1978).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Impressora 3D</td><td>Protolabs, EUA</td><td>1631-833 Provedor de</td><td>serviços de impressão 3D</td></tr><tr><td>Agarose&nbsp;</td><td>Himedia, Índia</td><td>MB002</td><td>Componente de mídia</td></tr><tr><td>Casamino Acids</td><td>Sisco, Índia</td><td>68806</td><td>Componente de mídia</td></tr><tr><td>Casein Digest&nbsp;</td><td>ASES, Índia</td><td>C5890</td><td>Componente de mídia</td></tr><tr><td>Membrana de policarbonato</td><td>Sterlitech, EUA</td><td>PCT00347100</td><td>Amido</td></tr><tr><td>de batata</td> consumível <td>Himedia, Índia</td><td>GM403</td><td>Componente de mídia</td></tr><tr><td>PowerPoint</td><td>Microsoft, EUA</td><td>N / A</td><td>Usado para a criação de componentes iChip projeto preliminar</td></tr><tr><td>PTC Creo</td><td>PTC, EUA</td><td>N / A</td><td>Usado para 3D auxiliado por computador modelagem de componentes iChip</td></tr><tr><td>Caldo de soja tríptico</td><td>Himedia, Índia</td><td>M011</td><td>Meio de laboratório</td></tr><tr><td>What3Words</td><td>What3Words, Reino Unido N</td><td>/A</td><td>Usado para registrar coordenadas do local de amostragem</td></tr></tbody></table>

in situ isolamento e cultura de bactérias recalcitrantes do solo usando um chip de isolamento (ichip)

In Situ Isolation and Culturing of Recalcitrant Soil Bacteria using an Isolation Chip (iChip)

O iChip usado neste protocolo foi projetado, impresso em 3D e montado conforme mostrado na Figura 1. A visão geral do protocolo descrito é mostrada na Figura 2. A amostra de solo usada para o experimento foi coletada no campus do IIT Jodhpur em Rajasthan, Índia. O endereço exclusivo de três palavras do local era 'comunicar.supervisionar.recorrência'. O local escolhido foi uma zona semiárida com temperatura de 40 °C no dia da amostragem. A amostra de solo foi col...

In situ Isolamento e Cultura de Bactérias Recalcitrantes do Solo usando um Chip de Isolamento (iChip)

Ecosystems harbor millions of environmental microbes, some of them capable of producing biotechnologically relevant products such as enzymes, vitamins, ...

in-situ-isolation-culturing-recalcitrant-soil-bacteria-using-an

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Fonte: Petersen, C. et. al., Isolamento e Caracterização da Microbiota Natural do Nematoide Modelo Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (2022)Este vídeo demonstra o isolamento e o cultivo de espécies bacterianas associadas a Caenorhabditis elegans. Uma lise baseada em contas de C. elegans, seguida de cultivo seletivo, permite o isolamento de diversas cepas microbianas para análise posterior.

Isolamento e Cultivo de Caenorhabditis elegans - Bactérias Associadas

Filmes plásticos rotulados como "biodegradável" estão disponíveis comercialmente para uso agrícola como coberturas. Preparo representa um método de eliminação atraente, mas a degradação sob condições de campo é mal compreendida. O objetivo deste estudo foi desenvolver métodos para isolar fungos de solo nativo e bactérias que colonizam filmes mulch plástico após o enterro de campo.

Isolamento de microrganismos do solo nativas com potencial para romper as biodegradáveis ​​Palha filmes plásticos usados ​​na agricultura

As bactérias produzem compostos secretados que têm o potencial de afetar a fisiologia de seus vizinhos microbianas. Aqui nós descrevemos uma tela de co-cultura, que permite a detecção de tais quimicamente mediadas entre espécies interações misturando os micróbios do solo com cepas repórter transcrição fluorescentes de Bacillus subtilis em meios sólidos.

Usando Coculture detectar quimicamente mediada interespécies Interações

Técnicas de cultivo microbianas no local da enriquecimento ou em situ podem facilitar o isolamento dos táxons de difícil-para-cultura microbianos, especialmente de ambientes de baixa biomassa ou geoquímica extremas. Aqui, descrevemos um set-up eletroquímico sem usar uma fonte de alimentação externa para enriquecer cepas microbianas capazes de transporte de elétrons extracelular (EET).

Self-standing eletroquímica set-up para enriquecer o ânodo-proliferação de bactérias no local

Colônias fúngicas entomopatômicas são isoladas de amostras de solo tropical usando isca tenebrio , isca de Galleria , bem como meio artificial seletivo, ou seja, ágar de dextrose de batata enriquecido com extrato de levedura suplementado com clorofenicol, tiaabzolendae e ciclohexmida (meio CTC).

Comparação de métodos para isolar fungos entomopatômicos de amostras de solo

Este protocolo é um método eficaz e rápido de cultivo de leveduras e o molde Aspergillus fumigatus de grandes conjuntos de amostras de solo em apenas 7 dias. Os métodos podem ser facilmente modificados para acomodar uma gama de mídias de incubação e temperaturas conforme necessário para experimentos.

Isolamento de Leveduras culturais e moldes de solos para investigar estrutura populacional fúngica

Aqui, apresentamos um protocolo de triagem da biodiversidade do solo para procurar cepas fúngicas envolvidas na degradação de materiais recalcitrantes. Primeiro, as cepas fúngicas capazes de crescer em ácidos húlicos ou lignocelulose são isoladas. Sua atividade é então testada tanto em ensaios enzimáticos quanto em poluentes como hidrocarbonetos e plásticos.

Isolamento e Triagem da Biodiversidade do Solo para Fungos Envolvidos na Degradação de Materiais Recalcitrantes

Este protocolo apresenta um resumo detalhado das estratégias para inocular raízes vegetais com micróbios transportados pelo solo. Exemplificados para os fungos Verticillium longisporum e Verticillium dahliae, três diferentes sistemas de infecção radicular são descritos. Potenciais aplicações e possíveis análises a jusante são destacadas, e vantagens ou desvantagens são discutidas para cada sistema.

Estratégias de inoculação para infectar raízes vegetais com microrganismos transportados pelo solo

O foco deste artigo é detalhar as melhores práticas para a fabricação de meios para microrganismos anaeróbios fastidiosos adquiridos de um ambiente. Esses métodos ajudam a gerenciar culturas anaeróbias e podem ser aplicados para apoiar o crescimento de microrganismos indescritíveis não cultivados, a "matéria escura microbiana".

Um conjunto de formatos de meios simulados informados in situ para cultivo de microrganismos anaeróbios ambientalmente adquiridos

A técnica iChip faz uso de um dispositivo de isolamento in-situ simples e barato que aumenta as taxas de descoberta de novos microrganismos do solo. Novos microrganismos podem ser usados para estudos adicionais relativos ao microbioma do solo ou descoberta de produtos naturais, entre outras aplicações.

Isolamento de microrganismos do solo usando a tecnologia iChip

Aprenda o isolamento e cultura in situ de bactérias recalcitrantes do solo usando a tecnologia iChip. Este método permite recuperar microrganismos produtores de antimicrobianos diretamente do ambiente natural para bioprospecção.

In situ Isolamento e Cultura de Bactérias Recalcitrantes do Solo usando um Chip de Isolamento (iChip)

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