Name: Extração de Ácido Desoxirribonucleico de Genoma Integral de Espécies de Mycobacterium via Técnica de Brometo de Cetiltrimetilamônio (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-12T12:40:00.000+00:00
Duration: 6 min 46 s
Description: Aprenda a extrair DNA genômico de alta qualidade de espécies de Mycobacterium usando o método CTAB. Esta técnica robusta supera as paredes celulares resistentes para pesquisas genéticas avançadas.

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<ol><li>FBouso, J. M., Planet, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Complete+non-tuberculous+mycobacteria+whole+genomes+using+an+optimized+DNA+extraction+protocol+for+long-read+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Complete non-tuberculous mycobacteria whole genomes using an optimized DNA extraction protocol for long-read sequencing.</a> BMC Genomics. 20 (1), 793(2019).</li>
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</ol>

<table><tbody><tr><td>Pontas de pipeta de 1 mL</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>10 & micro; Pontas da pipeta em L</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Dodecilsulfato de Sódio 10% (SDS)</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>71736-100 ML</td><td></td></tr><tr><td>Tubos de polipropileno de 15 mL</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tubos de 2 ml e tubos de 1,5 ml</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>200 & micro; Pontas de pipeta l</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>2-PROPANOL, BIOREAGENTE, PARA B MOLECULAR &</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>I9516-1L&nbsp;</td><td>Armazene em -20 & deg; C</td></tr><tr><td>37&deg; Incubadora C</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>5 M NaCl</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>S6546 - 100 ML</td><td></td></tr><tr><td>65&º; Incubadora C</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Gel de agarose</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sistema de documentação em gel UV Bio-Rad,</td><td>BioRad</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Centrífuga (para tubos de 15 ml de 50 ml) e Microfuge (para tubos de 2 ml)</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>CLOROFÓRMIO PARA ANÁLISE EMPARTA &reg; ACS</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>1070242500</td><td></td></tr><tr><td>Álcool clorofórmio/isoamílico (24:1)</td><td></td><td></td><td>Em uma exaustor, misture 384 ml de clorofórmio e 16 ml de álcool isoamílico</td></tr><tr><td>Solução CTAB/NaCl</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>52370-100 G</td><td>Dissolva 4,1 g de NaCl em 80 ml de água destilada. Enquanto mexe, adicione 10 g de CTAB. Solução térmica a 65°Deg; Incubadora C. Ajuste o volume para 100 ml com água destilada. Armazene em temperatura ambiente por até 6 meses.</td></tr><tr><td>Escada de DNA 1 Kb</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>ÁLCOOL ETÍLICO, PURO, 200 PROOF, PARA MOL&</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>E7023-500ML</td><td>Misture 75 ml de etanol absoluto e 25 ml de água destilada</td></tr><tr><td>Lisozima (10 mg/ml)</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>10837059001</td><td>Reconstitua a lisozima liofilizada (levada à temperatura ambiente) com água destilada para 10 mg/ml</td></tr><tr><td>Mídia Middlebrook 7H9</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>M0178</td><td>Siga as diretrizes do fabricante para preparar o meio líquido</td></tr><tr><td>ENRIQUECIMENTO MIDDLEBROOK OADC 6 x 100 ml F&nbsp;</td><td>BD</td><td>212240</td><td></td></tr><tr><td>Mídia do Tubo Indicador de Crescimento de Micobactérias (MGIT)</td><td>BD</td><td>245122</td><td></td></tr><tr><td>Sistema NanoDrop</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pipeta P10</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pipeta P1000</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pipeta P200</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Proteinase K, recombuste, PCR grd 2x250mg & nbsp;</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>3115801001</td><td>Reconstitua o frasco da Proteinase K liofilizada com água destilada para 10 mg/ml. Congelar alíquotas em tubos de 2 ml a -20 & deg; C</td></tr><tr><td>Seguro para SYBR</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Filtro tampão Tris/EDTA (TE) pH 8,0</td><td>Merck (Sigma-Aldrich)</td><td>8890-OP ou 382499997</td><td></td></tr><tr><td>Vórtice</td><td>Qualquer fornecedor</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

extração de Ácido desoxirribonucleico de genoma integral de espécies de mycobacterium via técnica de brometo de cetiltrimetilamônio

Whole-Genome Deoxyribonucleic Acid Extraction from Mycobacterium Species via the Cetyltrimethylammonium Bromide Technique

Extração de Ácido Desoxirribonucleico de Genoma Integral de Espécies de Mycobacterium via Técnica de Brometo de Cetiltrimetilamônio

Efficient and reliable DNA extraction is a fundamental step in molecular biology, providing high-quality genetic material for downstream applications such ...

whole-genome-deoxyribonucleic-acid-extraction-from-mycobacterium

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Nós descrevemos um método para extração de DNA genômico de alto peso molecular a partir da biomassa planctônica concentrou-se em 0,22 mM filtros Sterivex, seguido por centrifugação em gradiente de cloreto de césio densidade para purificação.

Extração de DNA de 0,22 mM Sterivex Filtros e Césio cloreto de centrifugação em gradiente de densidade

Uma metodologia para isolar alto peso molecular e DNA genômico de alta qualidade da comunidade microbiana do solo é descrito.

Extração de DNA genômico de alto peso molecular de solos e sedimentos

Este vídeo demonstra o protocolo para a extração de DNA a partir de material fixado em formalina parafina. Este é um procedimento multi-dia em que as secções de tecido são desparafinizadas com xilol, reidratados com etanol e tratados com proteinase K para purificar e isolar DNA para análise de genes específicos ou genome-wide subseqüentes.

Extração de DNA de material parafinado Embedded para análises genéticas e epigenéticas

Nós fornecemos um protocolo melhorado para a extração de DNA de alto peso molecular de tapetes microbianos hipersalinos. Células microbianas são separados da matriz mat antes da extração e purificação DNA. Isso aumenta a concentração, qualidade e tamanho do DNA. O protocolo pode ser usado para outras amostras refratário.

Extração de DNA de alto peso molecular de Esteiras Microbianas

Preparação de amostras de<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Extractos para Estudos Nucleares metabolômica Ressonância Magnética

Aqui nós apresentamos uma nova abordagem para identificar a planta vírus com genoma de DNA dobro-costa. Utilizamos métodos padrão para extrair o DNA e RNA de folhas contaminadas e realizar o sequenciamento de próxima geração. Ferramentas de Bioinformatic montam sequências em contigs, identificam contigs representando genomas do vírus e atribuir genomas de grupos taxonômicos.

Combinando a análise de DNA em uma extração do Virion bruto com a análise do RNA das folhas infectadas para descobrir novos vírus de genomas

Descrito aqui é um protocolo de extração de DNA usando contas magnéticas para produzir extrações de DNA de alta qualidade de mosquitos. Essas extrações são adequadas para uma abordagem de sequenciamento de próxima geração a jusante.

Um protocolo de extração de DNA de mosquito baseado em contas magnéticas para sequenciamento de próxima geração

Apresentamos o processo de isolamento, propagação e caracterização de bactérias degradadoras de hidrocarbonetos de habitats aquáticos. O protocolo descreve o isolamento bacteriano, a identificação pelo método 16S rRNA e o teste de seu potencial degradador de hidrocarbonetos. Este artigo ajudará os pesquisadores na caracterização da biodiversidade microbiana em amostras ambientais e, especificamente, na triagem de micróbios com potencial de biorremediação.

Isolamento, Propagação e Identificação de Espécies Bacterianas com Propriedades Metabolizadoras de Hidrocarbonetos de Habitats Aquáticos

Este protocolo mostra que o batimento de contas combinado com a purificação de esferas de captura de DNA fornece um método rápido e consistente para extrair DNA de amostras de Mycobacterium tuberculosis , tornando-o uma escolha eficaz para aplicações de sequenciamento de próxima geração.

Extração de DNA micobacteriano usando batimento de grânulos em tampão personalizado seguido de fluxo de trabalho NGS

Apresentamos um método otimizado para extração de DNA de escarro descontaminado usando um método de extração baseado em matriz combinado com uma purificação de esferas magnéticas para sequenciamento de próxima geração direcionado a jusante de Mycobacterium tuberculosis.

Extração de DNA baseada em matriz para sequenciamento de próxima geração direcionado em amostras de escarro descontaminadas

Aqui, apresentamos um método de chip de microarray de DNA para identificar espécies de Mycobacterium , o que melhorará a precisão diagnóstica e a eficiência de doenças relacionadas para uso clínico.

Identificação de espécies de micobactérias pelo método de chip de microarranjo de DNA

Aprenda a extrair DNA genômico de alta qualidade de espécies de Mycobacterium usando o método CTAB. Esta técnica robusta supera as paredes celulares resistentes para pesquisas genéticas avançadas.

Extração de Ácido Desoxirribonucleico de Genoma Integral de Espécies de Mycobacterium via Técnica de Brometo de Cetiltrimetilamônio (Vídeo) | JoVE Journal

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