Name: Avaliação da segurança microbiana de laticínios usando perfil proteômico bacteriano via abordagem MALDI (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-10-07T13:50:00.000+00:00
Duration: 9 min 31 s
Description: Aprenda a avaliar a composição microbiana em laticínios usando culturomics e MALDI-TOF MS. Este método rápido oferece identificação bacteriana precisa para segurança alimentar.

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<ol><li>Savage, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+three+bacterial+identification+systems+for+species+identification+of+bacteria+isolated+from+bovine+mastitis+and+bulk+tank+milk+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Foodborne+PathogDis%22%5BJournal%5D)">Evaluation of three bacterial identification systems for species identification of bacteria isolated from bovine mastitis and bulk tank milk samples.</a> Foodborne PathogDis. 14 (3), 177-187 (2017).</li>
<li>Holt, J. G., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHolt%2C+JG+%22Bergey%27s+manual+of+determinative+bacteriology%22">Bergey's manual of determinative bacteriology</a>. , 9th ed, Lippincott Williams & Wilkins. Philadelphia, PA. (2000).</li>
<li>Franco-Duarte, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+chemical+and+biological+methods+to+identify+microorganisms-from+past+to+present%5BTitle%5D)+AND+%22Microorganisms%22%5BJournal%5D)">Advances in chemical and biological methods to identify microorganisms-from past to present.</a> Microorganisms. 7 (5), 130(2019).</li>
<li>Czeszewska-Rosiak, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+usefulness+of+the+MALDI-TOF+MS+technique+in+the+determination+of+dairy+samples%27+microbial+composition%3A+Comparison+of+the+new+EXS+2600+system+with+MALDI+Biotyper+platform%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The usefulness of the MALDI-TOF MS technique in the determination of dairy samples' microbial composition: Comparison of the new EXS 2600 system with MALDI Biotyper platform.</a> Arch. Microbiol. 206, 172(2024).</li>
<li>Wilson, D. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Test+agreement+among+biochemical+methods%2C+matrix-assisted+laser+desorption+ionization-time+of+flight+mass+spectrometry%2C+and+16S+rRNA+sequencing+for+identification+of+microorganisms+isolated+from+bovine+milk%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Test agreement among biochemical methods, matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry, and 16S rRNA sequencing for identification of microorganisms isolated from bovine milk.</a> J Clin Microbiol. 57 (3), e01381-e01418 (2019).</li>
<li>Barreiro, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Short+communication%3A+Identification+of+subclinical+cow+mastitis+pathogens+in+milk+by+matrix-assisted+laser+desorption%2Fionization+time-of-flight+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Dairy+Sci%22%5BJournal%5D)">Short communication: Identification of subclinical cow mastitis pathogens in milk by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry.</a> J Dairy Sci. 93 (12), 5661-5667 (2010).</li>
<li>Vithanage, N. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Species-level+discrimination+of+psychrotrophic+pathogenic+and+spoilage+gram-negative+raw+milk+isolates+using+a+combined+MALDI-TOF+MS+proteomics-bioinformatics-based+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">Species-level discrimination of psychrotrophic pathogenic and spoilage gram-negative raw milk isolates using a combined MALDI-TOF MS proteomics-bioinformatics-based approach.</a> J Proteome Res. 16 (6), 2188-2203 (2017).</li>
<li>Ashfaq, M. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+MALDI-TOF+MS+for+identification+of+environmental+bacteria%3A+A+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Environ+Manage%22%5BJournal%5D)">Application of MALDI-TOF MS for identification of environmental bacteria: A review.</a> J Environ Manage. 305, 114359(2022).</li>
<li>Sugajski, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+sources+of+lactic+acid+bacteria+with+potential+antibacterial+properties%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Microbiol%22%5BJournal%5D)">New sources of lactic acid bacteria with potential antibacterial properties.</a> Arch Microbiol. 204 (349), 1-13 (2022).</li>
<li>Lagier, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+rebirth+of+culture+in+microbiology+through+the+example+of+culturomics+to+study+human+gut+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Rev%22%5BJournal%5D)">The rebirth of culture in microbiology through the example of culturomics to study human gut microbiota.</a> Clin Microbiol Rev. 28 (1), 237-264 (2015).</li>
<li>Złoch, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Culturomics+approach+to+identify+diabetic+foot+infection+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Culturomics approach to identify diabetic foot infection bacteria.</a> Int J Mol Sci. 22 (17), 9574(2021).</li>
<li>Bilen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+contribution+of+culturomics+to+the+repertoire+of+isolated+human+bacterial+and+archaeal+species%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">The contribution of culturomics to the repertoire of isolated human bacterial and archaeal species.</a> Microbiome. 6 (94), 1-11 (2018).</li>
<li>Bourassa, L., Butler-Wu, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MALDI-TOF+mass+spectrometry+for+microorganism+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Method+Microbiol%22%5BJournal%5D)">MALDI-TOF mass spectrometry for microorganism identification.</a> Method Microbiol. 42, 37-85 (2015).</li>
<li>Janiszewska, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Implications+of+sample+preparation+methods+on+the+MALDI-TOF+MS+identification+of+spore-forming+bacillus+species+from+food+samples%3A+A+closer+look+at+Bacillus+licheniformis%2C+Peribacillus+simplex%2C+Lysinibacillus+fusiformis%2C+Bacillus+flexus%2C+and+Bacillus+marisflavi%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Omega%22%5BJournal%5D)">Implications of sample preparation methods on the MALDI-TOF MS identification of spore-forming bacillus species from food samples: A closer look at Bacillus licheniformis, Peribacillus simplex, Lysinibacillus fusiformis, Bacillus flexus, and Bacillus marisflavi.</a> ACS Omega. 8 (38), 34982-34994 (2023).</li>
<li>Valentine, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+culture+conditions+on+microorganism+identification+by+matrix-assisted+laser+desorption+ionization+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Effect of culture conditions on microorganism identification by matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry.</a> Appl Environ Microbiol. 71 (1), 58-64 (2005).</li>
<li>Wragg, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+Biolog+GEN+III+MicroStation+semi-automated+bacterial+identification+system+with+matrix-assisted+laser+desorption+ionization-time+of+flight+mass+spectrometry+and+16S+ribosomal+RNA+gene+sequencing+for+the+identification+of+bacteria+of+veterinary+interest%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Methods%22%5BJournal%5D)">Comparison of Biolog GEN III MicroStation semi-automated bacterial identification system with matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry and 16S ribosomal RNA gene sequencing for the identification of bacteria of veterinary interest.</a> J Microbiol Methods. 105, 16-21 (2014).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>70% ácido fórmico</td><td>Chempur</td><td>115676307</td><td></td></tr><tr><td>Acetonitrilo</td><td>Merck KGaA</td><td>1.00014.1011</td><td></td></tr><tr><td>Ágar APT</td><td>Merck KGaA</td><td>1.10453.0500</td><td></td></tr><tr><td>Padrão de Teste Bacteriano</td><td>Bruker Daltonik GmbH</td><td>8255343</td><td></td></tr><tr><td>Ágar CBL (Ágar Azul Lactose da China)</td><td>Merck KGaA</td><td>1.02348.0500</td><td></td></tr><tr><td>Ágaro de sangue da Colômbia&nbsp;</td><td>Oxoide</td><td>CM0331B</td><td></td></tr><tr><td>Ágar M17</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Ágar de Contagem em Placas de Leite (MPCA)</td><td>Oxoide</td><td>CM0681</td><td></td></tr><tr><td>MRS agar (de Man, Rogosa e Sharpe Agar)</td><td>Merck KGaA</td><td>1.10660.0500</td><td></td></tr><tr><td>MSP 96 alvo de aço polido BC</td><td>Bruker Daltonik GmbH</td><td>8280800</td><td></td></tr><tr><td>Água peptona</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>70179</td><td></td></tr><tr><td>Ágar Scheadler</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>91019</td><td></td></tr><tr><td>Sangue de ovelha</td><td>Biomáximos</td><td>SL0160-100</td><td></td></tr><tr><td>Ácido trifluoroacético</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T6508</td><td></td></tr><tr><td>Ágar de Soja Tripta (TSA)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>22091</td><td></td></tr><tr><td>Água</td><td>Merck KGaA</td><td>1.15333.2500</td><td></td></tr><tr><td>&alfa;-Ciano-4-hidroxicinâmico</td><td>Bruker Daltonik GmbH</td><td>8201344</td><td></td></tr></tbody></table>

avaliação da segurança microbiana de laticínios usando perfil proteômico bacteriano via abordagem maldi

Evaluation of Microbial Safety of Dairies using Bacterial Proteomic Profiling via MALDI Approach

Avaliação da segurança microbiana de laticínios usando perfil proteômico bacteriano via abordagem MALDI

We present a protocol using the matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS, hereinafter referred to as ...

evaluation-microbial-safety-dairies-using-bacterial-proteomic

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Os macrófagos são as células-chave envolvidas na patogenicidade do hospedeiro. Os macrófagos apresentam diversidade fenotípica e funcional que pode ser analisada e detectada por análise proteômica. Este artigo descreve como realizar eletroforese 2D de culturas primárias de macrófagos humanos diferenciados em fenótipo M1 ou M2.

Proteômica Profiling de macrófagos por eletroforese 2D

Este protocolo é para a extração e concentração de proteína e DNA de biomassa microbiana coletada da água do mar, seguida pela geração de peptídeos trípticos adequados para análise proteômica baseada em espectrometria de massa em tandem.

Um Aquatic Microbial metaproteômica fluxo de trabalho: a partir de células para Tryptic Peptides adequado para análise baseada em espectrometria de massa em tandem

A espectrometria de massa de tempo de voo de dessorção/ionização a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS) e as técnicas moleculares (sequenciamento do gene 16S rRNA) permitem a identificação de patógenos bacterianos raros em diagnósticos de rotina. O objetivo deste protocolo reside na combinação de ambas as técnicas, o que leva a dados mais precisos e confiáveis.

Identificação de patógenos bacterianos raras, seqüência do gene 16rRNA e MALDI-TOF MS

Massa phyloproteomics à base de espectrometria (MSPP) foi usado para digitar uma coleção de Campylobacter jejuni ssp. Doylei isola a nível da estirpe em comparação com digitação sequência multilocus (MLST).

subtipagem de<em&gt; Campylobacter jejuni</em&gt; Ssp.<em&gt; doylei</em&gt; Isolados Utilizando PhyloProteomics baseados em espectrometria de massa (MSPP)

Acredita-se que as bacteriocinas desempenham um papel fundamental na definição da diversidade microbiana em diferentes nichos ecológicos. Aqui, descrevemos um procedimento eficiente para avaliar como as bacteriocinas afetam a composição da microbiota intestinal em um modelo animal.

Um método para avaliar os efeitos da bacteriocina na microbiota intestinal de ratos

Um fluxo de trabalho semi-automático é apresentado para sequenciamento alvo de 16S rRNA de leite humano e outros tipos de amostras de biomassa de baixo.

Um método para o sequenciamento de alvo 16S das amostras de leite humano

IDBac é um pipeline de Bioinformática baseado em espectrometria de massas de código aberto que integra dados de proteínas intactas e espectros metabólito especializados, coletados em material celular raspado de colônias bacterianas. O pipeline permite que os pesquisadores organizem rapidamente centenas a milhares de colônias bacterianas em grupos taxonômicos putativos e diferenciem-se ainda mais com base na produção de metabólito especializado.

Usando o pipeline de código aberto MALDI TOF-MS IDBac para análise de proteína microbiana e dados metabólito especializados

Este protocolo abrange uma análise detalhada da composição de peptidoglicanos usando cromatografia líquida, espectrometria de massas acoplada com extração avançada de recursos e software de análise bioinformática.

Análise semiquantitativa de peptidoglicanos por cromatografia líquida, espectrometria de massas e bioinformática

Aqui, apresentamos um protocolo de digestão otimizado no filtro com informações detalhadas sobre o seguinte: digestão de proteínas, purificação de peptídeos e análise de aquisição independente de dados. Esta estratégia é aplicada à análise de amostras de urina de secreções prostáticas expressas e permite alta cobertura proteome e perfil livre de rótulos de baixo valor ausente do proteome urinário.

Perfil proteômico de EPS-urina através da Digestão FASP e Análise Independente de Dados

Aqui apresentamos um protocolo para a identificação rápida de proteínas produzidas por bactérias patogênicas genomicamente sequenciadas usando espectrometria de massa maldi-TOF-TOF e análise proteômica de cima para baixo com software desenvolvido internamente. Íons proteicos metastáveis fragmentom por causa do efeito ácido aspartic e essa especificidade é explorada para identificação de proteínas.

Identificação de Proteínas de Imunidade Antibacteriana em Escherichia coli usando MALDI-TOF-TOF-MS/MS e Análise Proteômica De Cima Para Baixo

A metaproteômica clínica oferece insights sobre o microbioma humano e suas contribuições para a doença. Aproveitamos o poder computacional da plataforma Galaxy para desenvolver um fluxo de trabalho de bioinformática modular que facilita a análise metaproteômica complexa baseada em espectrometria de massa e a caracterização de diversos tipos de amostras clínicas relevantes para estudos de doenças.

Um fluxo de trabalho de metaproteômica clínica implementado na plataforma Galaxy Bioinformatics para analisar as interações hospedeiro-microbioma subjacentes à doença humana

Aprenda a avaliar a composição microbiana em laticínios usando culturomics e MALDI-TOF MS. Este método rápido oferece identificação bacteriana precisa para segurança alimentar.

Avaliação da segurança microbiana de laticínios usando perfil proteômico bacteriano via abordagem MALDI

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