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<ol><li>Lawson, T., Blatt, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stomatal+size%2C+speed%2C+and+responsiveness+impact+on+photosynthesis+and+water+use+efficiency%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Stomatal size, speed, and responsiveness impact on photosynthesis and water use efficiency.</a> Plant Physiol. 164 (4), 1556-1570 (2014).</li>
<li>Smith, E. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+photosynthetic+efficiency+toward+food+security%3A+Strategies%2C+advances%2C+and+perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant%22%5BJournal%5D)">Improving photosynthetic efficiency toward food security: Strategies, advances, and perspectives.</a> Mol Plant. 16 (10), 1547-1563 (2023).</li>
<li>Flexas, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((What+can+we+learn+from+the+ecophysiology+of+plants+inhabiting+extreme+environments%3F+from+%26%2334%3Bsherplants%26%2334%3B+to+%26%2334%3Bshercrops.%26%2334%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Botany%22%5BJournal%5D)">What can we learn from the ecophysiology of plants inhabiting extreme environments? from &#34;sherplants&#34; to &#34;shercrops.&#34.</a> J Exp Botany. 76 (17), 4831-4848 (2025).</li>
<li>Wu, S., Zhao, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+clear+nail+polish+to+make+Arabidopsis+epidermal+impressions+for+measuring+the+change+of+stomatal+aperture+size+in+immune+response%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Pattern+Recognit+Recept.%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Using clear nail polish to make Arabidopsis epidermal impressions for measuring the change of stomatal aperture size in immune response.</a> Plant Pattern Recognit Recept.: Methods Protoc. 1578, 243-248 (2017).</li>
<li>Kübarsepp, L., Laanisto, L., Niinemets, Ü, Talts, E., Tosens, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Are+stomata+in+ferns+and+allies+sluggish%3F+Stomatal+responses+to+CO%2C+humidity+and+light+and+their+scaling+with+size+and+density%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">Are stomata in ferns and allies sluggish? Stomatal responses to CO, humidity and light and their scaling with size and density.</a> New Phytol. 225 (1), 183-195 (2020).</li>
<li>Pathoumthong, P., Zhang, Z., Roy, S. J., El Habti, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+non-destructive+method+to+phenotype+stomatal+traits%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Rapid non-destructive method to phenotype stomatal traits.</a> Plant Methods. 19 (1), 36(2023).</li>
<li>Warner, C. A., Biedrzycki, M. L., Jacobs, S. S., Wisser, R. J., Caplan, J. L., Sherrier, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optical+clearing+technique+for+plant+tissues+allowing+deep+imaging+and+compatible+with+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">An optical clearing technique for plant tissues allowing deep imaging and compatible with fluorescence microscopy.</a> Plant Physiol. 166 (4), 1684-1687 (2014).</li>
<li>Petruzzellis, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plasticity+of+functional+traits+of+tree+of+heaven+is+higher+in+exotic+than+in+native+habitats%5BTitle%5D)+AND+%22Trees%22%5BJournal%5D)">Plasticity of functional traits of tree of heaven is higher in exotic than in native habitats.</a> Trees. 33 (2), 411-420 (2019).</li>
<li>Kurihara, D., Mizuta, Y., Nagahara, S., Sato, Y., Higashiyama, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+clearing+of+plant+tissues+for+fluorescence+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Optical clearing of plant tissues for fluorescence imaging.</a> J Vis Exp. (179), e63428(2022).</li>
<li>Hériché, M., Arnould, C., Wipf, D., Courty, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+plant+tissues%3A+advances+and+promising+clearing+practices%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Imaging plant tissues: advances and promising clearing practices.</a> Trends Plant Sci. 27 (6), 601-615 (2022).</li>
<li>Ensikat, H. J., Malekhosseini, M., Rust, J., Weigend, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualisation+of+calcium+oxalate+crystal+macropatterns+in+plant+leaves+using+an+improved+fast+preparation+method%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">Visualisation of calcium oxalate crystal macropatterns in plant leaves using an improved fast preparation method.</a> J Microsc. 290 (3), 168-177 (2023).</li>
<li>Li, Y. M., Fei, T., Zhang, H. X., Xie, Z. S., Li, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observation+of+the+development+of+leaf+vein+and+stomata+and+identification+of+candidate+transcription+factors+related+to+vein%2Fstoma+development+in+grapevine+leaf+%28Vitis+vinifera+L.%29%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Hortic%22%5BJournal%5D)">Observation of the development of leaf vein and stomata and identification of candidate transcription factors related to vein/stoma development in grapevine leaf (Vitis vinifera L.).</a> Sci Hortic. 307, 111-518 (2023).</li>
<li>Richardson, D. S., Lichtman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clarifying+tissue+clearing%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Clarifying tissue clearing.</a> Cell. 162 (2), 246-257 (2015).</li>
<li>Ariel, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+beginner%27s+guide+to+tissue+clearing%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">A beginner's guide to tissue clearing.</a> Int J Biochem Cell Biol. 84, 35-39 (2017).</li>
<li>García-Gutiérrez, E., Ortega-Escalona, F., Angeles, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel%2C+rapid+technique+for+clearing+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">A novel, rapid technique for clearing leaf tissues.</a> Appl Plant Sci. 8 (9), e11391(2020).</li>
<li>Sai, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((StomaAI%3A+an+efficient+and+user-friendly+tool+for+measurement+of+stomatal+pores+and+density+using+deep+computer+vision%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">StomaAI: an efficient and user-friendly tool for measurement of stomatal pores and density using deep computer vision.</a> New Phytol. 238 (2), 904-915 (2023).</li>
<li>Liu, C., Sack, L., Li, Y., Zhang, J., Yu, K., Zhang, Q., He, N., Yu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Relationships+of+stomatal+morphology+to+the+environment+across+plant+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Relationships of stomatal morphology to the environment across plant communities.</a> Nat Commun. 14, 42136(2023).</li>
<li>Lawson, T., Vialet-Chabrand, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Speedy+stomata%2C+photosynthesis+and+plant+water+use+efficiency%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytolt%22%5BJournal%5D)">Speedy stomata, photosynthesis and plant water use efficiency.</a> New Phytolt. 221 (1), 93-98 (2019).</li>
<li>Stein, R. A., Sheldon, N. D., Smith, S. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((comparing+methodologies+for+stomatal+analyses+in+the+context+of+elevated+modern+CO2%5BTitle%5D)+AND+%22Life%22%5BJournal%5D)">comparing methodologies for stomatal analyses in the context of elevated modern CO2.</a> Life. 14 (1), 78(2024).</li>
<li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiji%3A+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nat Methods. 9 (7), 676-682 (2012).</li>
<li>R Core Team. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22R%3A+A+language+and+environment+for+statistical+computing%22">R: A language and environment for statistical computing</a>. , R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. (2025).</li>
<li>Gibbs, J. A., Burgess, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+deep+learning+for+the+analysis+of+stomata%3A+a+review+of+current+methods+and+future+directions%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Application of deep learning for the analysis of stomata: a review of current methods and future directions.</a> J Exp Bot. 75 (21), 6704-6718 (2024).</li>
<li>Wang, J., Renninger, H. J., Ma, Q., Jin, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+stomatal+and+guard+cell+metrics+for+plant+physiology+and+growth+using+StoManager1%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Measuring stomatal and guard cell metrics for plant physiology and growth using StoManager1.</a> Plant Physiol. 195 (1), 378-394 (2024).</li>
<li>Rikisahedew, J. J., Niinemets, Ü, Scodeller, R., Tosens, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+structural+traits+in+Triticum+aestivum+and+Zea+mays+for+C+and+C+photosynthetic+differentiation+using+free-hand+and+semi-thin+sections%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Assessing structural traits in Triticum aestivum and Zea mays for C and C photosynthetic differentiation using free-hand and semi-thin sections.</a> J Vis Exp. (209), e66843(2024).</li>
<li>Poole, I., Weyers, J. D. B., Lawson, T., Raven, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Variations+in+stomatal+density+and+index%3A+implications+for+palaeo+climatic+reconstructions%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Environ%22%5BJournal%5D)">Variations in stomatal density and index: implications for palaeo climatic reconstructions.</a> Plant Cell Environ. 19 (6), 705-712 (1996).</li>
<li>Smith, S., Weyers, J. D. B., Berry, W. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Variation+in+stomatal+characteristics+over+the+lower+surface+of+Commelina+communis+leaves%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Environ%22%5BJournal%5D)">Variation in stomatal characteristics over the lower surface of Commelina communis leaves.</a> Plant Cell Environ. 12 (6), 653-659 (1989).</li>
<li>Niewiadomski, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+illustrated+protocol+for+clearing%2C+mounting%2C+and+imaging+leaf+venation+networks%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">A comprehensive illustrated protocol for clearing, mounting, and imaging leaf venation networks.</a> Appl Plant Sci. 13 (2), (2025).</li>
<li>Wang, J., Renninger, H. J., Ma, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Labeled+temperate+hardwood+tree+stomatal+image+datasets+from+seven+taxa+of+Populus+and+17+hardwood+species%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Data%22%5BJournal%5D)">Labeled temperate hardwood tree stomatal image datasets from seven taxa of Populus and 17 hardwood species.</a> Sci Data. 11 (1), (2024).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Desinfetante líquido limpador NaClO &lt; 5%</td><td>Domestos, GB</td><td>H000023244</td><td>  Queimaduras na pele </td></tr><tr><td>Fosfato de hidrogênio dissódico diidratado (Na2HPO4. 2H2O) </td><td>PENTA, CZ</td><td>10028-24-7</td><td>NA</td></tr><tr><td>Etanol, abs. 100% de a.r.</td><td>Chem-Lab NV, BE</td><td>CL00.0505.1000</td><td>  Altamente inflamável &amp; nbsp;</td></tr><tr><td>Frasco de vidro 2 mL</td><td>VWR Ciências da Vida, EUA</td><td>548-0045</td><td></td></tr><tr><td>Solução de glutaraldeído 50%</td><td>VWR Ciências da Vida, EUA</td><td>23H2856331</td><td>Fatais se inalados. Tóxico se engolido.  Use luvas de proteção,   roupas,   Óculos.</td></tr><tr><td>Lâminas de microscópio</td><td>Normax, PT</td><td>5470308A</td><td>NA</td></tr><tr><td>Camada de limpeza rápida para cuidados com unhas</td><td>B<img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/69615/69615eq3.jpg" style="margin: auto; ">K (INEZA), LT</td><td>LT-02244</td><td>NA</td></tr><tr><td>Nikon Eclipse E600 e Nikon DS0Fi1 5 MP</td><td>Nikon Corporation, JP</td><td>https://www.microscopyu.com/museum/eclipse-e600</td><td>NA</td></tr><tr><td>Pipeta e pontas de pipeta</td><td>Termociência, FI</td><td>KJ16047</td><td>NA</td></tr><tr><td>Lâminas de aço de um solo gume</td><td>Instrumentos Oxford</td><td>51-1625-0182</td><td>NA</td></tr><tr><td>Dihidrogênio fosfato de sódio (NaH2PO4 . 2H2O) puro</td><td>PENTA, CZ</td><td>13472-35-0</td><td>NA</td></tr><tr><td>Pellets de hidróxido de sódio (NaOH) puros</td><td>Merck KGaA, DE</td><td>1310-73-2</td><td>Queimaduras graves.</td></tr><tr><td>Fita transparente para papelaria</td><td>FOROFIS, LV</td><td>91231</td><td>NA</td></tr><tr><td>Azul toluidina, grau de uso geral</td><td>ThermoFisher Scientific, GB</td><td>2045836</td><td>NA</td></tr></tbody></table>

caracterização de características estomáticas e epidérmicas usando peelings, clearing e análise de imagens baseadas em ia

Characterizing Stomatal and Epidermal Traits Using Peels, Clearing, and AI-Based Image Analysis

Caracterização de Características Estomáticas e Epidérmicas Usando Peelings, Clearing e Análise de Imagens Baseadas em IA

Accurate characterization of stomatal morphology and surrounding epidermal traits is essential for understanding stomatal function. A comparative protocol ...

characterizing-stomatal-epidermal-traits-using-peels-clearing-ai

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Biologia do Desenvolvimento

Nós desenvolvemos um protocolo simples e reprodutível para acessar a resposta estomática ao bactérias vivas. Este método minimiza ferimento e manipulação da folha, em comparação com o uso de peelings epidérmicos relatado anteriormente.

Avaliar a resposta estomática ao vivo células bacterianas usando imagens Folha Inteira

Nós descrevemos um protocolo com lâminas de câmara e de mídia para imobilizar cotilédones de plantas para imagem confocal da epiderme durante vários dias de desenvolvimento, documentação diferenciação estomática. Proteínas fluoróforo com a tag pode ser monitorado de forma dinâmica por expressão e localização subcelular, aumentando a compreensão de seus possíveis papéis durante a divisão celular e diferenciação do tipo de célula.

Longo prazo, de alta resolução de imagem Lapse Confocal Tempo de<em&gt; Cotilédone Arabidopsis</em&gt; Epiderme durante a germinação

Desvendando como a fisiologia e morfologia estão ligados permite uma compreensão mais profunda do funcionamento mecanicista das folhas da planta. Nós apresentamos tanto um procedimento para obtenção de parâmetros de regulação dos estômatos a partir de medições de condutância estomática e correlações com características foliares funcionais tradicionais.

Relacionando condutância estomática a Folha atributos funcionais

Este protocolo descreve um método de preparação estomáticas enriquecidas guarda células que é útil para estudos biológicos fisiológicos e outros.

Fita de estomas-casca: Um método melhorado para preparação de amostras de células de guarda

Fornecemos um método para identificar moduladores de transpiração foliar através de triagem em larga escala de uma biblioteca composta.

Identificação de novos reguladores de transpiração vegetal por triagem de imagens térmicas em larga escala em Helianthus Annuus

Este trabalho descreve dois métodos de fenotipagem sem o uso de cascas epidérmicas para caracterizar os genes que controlam o desenvolvimento estomatizante. O primeiro método demonstra como analisar um fenótipo estomatal usando uma epiderme vegetal corada com O azul de toluidina . O segundo método descreve como identificar ligantes estomatáticos e monitorar suas atividades biológicas.

Identificação dos genes envolvidos no desenvolvimento estomático via Epidermal Phenotype Scoring

Vários métodos comumente usados são introduzidos aqui para estudar os eventos de tráfego de membrana de uma quinase do receptor de membrana plasmática. Este manuscrito descreve protocolos detalhados, incluindo a preparação do material vegetal, tratamento farmacológico e configuração de imagens confocais.

Métodos Baseados em Imagem para Estudo de Eventos de Tráfego de Membranas em Células de Linhagem Estomática

Aqui, apresentamos um método simples para observação direta e medida automatizada das respostas estomáticas à invasão bacteriana em Arabidopsis thaliana. Esse método utiliza um dispositivo portátil de imagem estomática, juntamente com um pipeline de análise de imagem projetado para imagens foliares capturadas pelo dispositivo.

Observação Direta e Mensuração Automatizada das Respostas Estomáticas a Pseudomonas syringae pv. tomate DC3000 em Arabidopsis thaliana

Um método é apresentado para imagens de baixo custo de plantas para medir fenótipos, juntamente com as melhores práticas para captura de imagens e um pipeline de análise de imagens para quantificar as características das plantas. Esses métodos foram aplicados para medir os fenótipos do milho (Zea mays) sob condições de calor, seca e estresse abiótico combinado.

Imagem e análise para quantificar fenótipos de estresse abiótico de milho (Zea mays)

O manuscrito aqui fornece um simples conjunto de métodos que permitam analisar a secreção e difusão de ligantes marcados fluorescentes em Xenopus. Isto proporciona um contexto para testar a capacidade de outras proteínas para modificar a distribuição de ligando e permitindo experiências que podem dar uma visão sobre os mecanismos que regulam a gradientes de morfogénio.

Utilizando Análise de confocal<em&gt; Xenopus laevis</em&gt; Para Investigar moduladores de Wnt e Shh morfogénio gradientes

Centre of Estonian Rural Research and Knowledge.  This protocol presents a comparative method to assess stomatal and epidermal traits in two distinct species using epidermal peels, clearing techniques, and AI-assisted image analysis. The goal is to enable high-throughput, reproducible quantification of cellular structures underlying stomatal function for agricultural applications and broad plant research.

Caracterização de Características Estomáticas e Epidérmicas Usando Peelings, Clearing e Análise de Imagens Baseadas em IA

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